chr17:25929076 25929325 -
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(50)
TESTES

Sense strand
GATCGCAGCGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAGCGGGGAGGGCAACCGCTTCCATTACCGGCCGGGAGCCTTGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTGTCTGTCAATCATGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCTTGCTGGAGATAGTGCAAGCGGCGGCA
....................................................(((((.....(((.........(((((.((((((.((.(((((.........))))).))....))))))..))))).((((..((....(((((...(((.((.....)).)))....)))))))..)))).))).)))))........................................................
..................................................51...................................................................................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGC....................................................................................................................................................................... 27 1 149.00 149.00 30.00 34.00 22.00 21.00 10.00 11.00 - - - 3.00 2.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - 3.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGG........................................................................................................................................................................ 26 1 115.00 115.00 34.00 30.00 10.00 8.00 2.00 6.00 1.00 - 2.00 6.00 1.00 4.00 4.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTT....................................................... 28 1 52.00 52.00 7.00 13.00 5.00 7.00 2.00 - 7.00 - 4.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGT........................................................ 27 1 37.00 37.00 9.00 7.00 2.00 4.00 2.00 - 5.00 5.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCT...................................................................................................................................................................... 28 1 31.00 31.00 11.00 10.00 2.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAG......................................................................................................................................................................... 25 1 17.00 17.00 5.00 6.00 - - - - - - - - 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAG.............................................................................................................................................................. 26 1 13.00 13.00 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCA.......................................................................................................................................................................... 24 1 9.00 9.00 - - - - - - - - - 3.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGG............................. 27 1 9.00 9.00 - 2.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATA...................................................................................................................................................................................... 26 1 9.00 9.00 1.00 2.00 2.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGTCAATCATGGATCAGGACGACCCAGC................................................................ 28 1 9.00 9.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGt........................................................................................................................................................................ 26 t 8.00 17.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAt.............................................................................................................................................................. 26 t 7.00 3.00 3.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTGT............................................................................................. 27 1 7.00 7.00 - - - - 1.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGC................................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 2.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGG.................................................................................................................................................................. 25 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................ATTACCGGCCGGGAGCCTTGGGAAGTAGGAC........................................................................................................... 31 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGG.................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGt....................................................................................................................................................................... 27 t 6.00 115.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCT..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - - - - - - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGt.................................................................................................................................................................... 30 t 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCG......................................................... 26 1 6.00 6.00 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAGt............................................................................................................................................................. 27 t 5.00 13.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGC................................................................................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGC...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCAAGC........................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTGTC............................................................................................ 28 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00
..............................................................................................................................................................TGTCAATCATGGATCAGGACGACCCAGCC............................................................... 29 1 4.00 4.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCTT......................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CTGCGGTTGGCTGGCGTA..................................................................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTt...................................................... 29 t 4.00 52.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GTTGACTGAGCTACGCGA........................................ 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTG.............................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AGCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGG................................. 28 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACTTAGATTTCTGCAGTTG.......................................................................................................................................................................................................................... 19 2 3.50 3.50 - - - - - - - - - - - - - 3.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCAA............................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCATGGATCAGGACGACCCAGCCGAAG........................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ACCTGGAACTGAGTGTCTGTCAATCATGG................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTG.............................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCA............................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGt............................ 28 t 3.00 9.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGC.......................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGA..................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCT..................................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGG................................................................................................................................................................. 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGg................................................................................................................................................................................................................... 27 g 3.00 0.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGg........................... 25 g 3.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........ATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCT..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAGTGTCTGTCAATCATGGATCAGG.......................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGGAACTGAGTGTCTGTCAATCATGGA............................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGG.................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCATGGATCAGGACGACCCAGCCGAA............................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGG.................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GCTGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCA.............................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAGTGTCTGTCAATCATGGATCAGGA......................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGtt...................................................................................................................................................................... 28 tt 2.00 115.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGT............................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGAT....................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTC........................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGGAACTGAGTGTCTGTCAATCATGGAT.............................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................AGGACCTGGAACTGAGTGT............................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGG.................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATAGAGT.................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTG..................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................AGCCGAAGCGTTGACTGAGCTACGCGAG....................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAa.............................................................................................................................................................. 26 a 2.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TACGCTGCAAGCGGATAGAGTTTGGCT............................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GTGTCTGTCAATCATGGATCAGGACGAC..................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCT.......................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAGTGTCTGTCAATCATGGATCAGGAC........................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTa....................................................... 28 a 2.00 37.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGCGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGC...................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGG................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGggg......................... 32 ggg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................CGGATAGAGTTTGGCTCAGG........................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTG.............................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCTGTCAATCATGGATCAGGACGACC.................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGCGG................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAacg......................................................... 26 acg 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGGt................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTCCATTACCGGCCGGGAGCCTTGGGA................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATAG..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCT...................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................GCGTACGCTGCAAGCGGATAGAG................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGG.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGCGGg................................................................................................................................................................................................................ 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGt.......................................................... 25 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTG..................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GAACTGAGTGTCTGTCAATCATGGATC............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAA............................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AAGTAGGACCTGGAACTGAGTGTCTGTC........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACTTAGATTTCTGCAGTTGC......................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAta............................................................................................................................................................. 27 ta 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGC................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GCGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGC......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTtt..................................................... 30 tt 1.00 52.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCGGCTGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGt............................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TTTCTGCAGTTGCGGCTG.................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGaa................................................................................................................................................................ 24 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGG......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGGCGTACGCTGCAAGCGGATAGAGTT................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGa........................................................................................................................................................................ 26 a 1.00 17.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGa........................................................ 27 a 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCT...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CTGCGGTTGGCTGGCGTACGCT................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGAC.................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................GCCGAAGCGTTGACTGAGCTACGCGA........................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGCGGTT............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGC................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCGGCTGCGGTTGGCTGGCGTA..................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAG......................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTG..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AGCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGC................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATAGAG................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGATTTCTGCAGTTGCGGCTG.................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGgt..................................................................................................................................................................................................................... 27 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTGAGTGTCTGTCAATCATGGATCAGGA......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGAta................................................... 32 ta 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTGTCTG.......................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ATAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAGC............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGC....................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................ACCGGCCGGGAGCCTTGGGAAGTAGGACCT......................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................GTTGCGGCTGCGGTTGG............................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTt.............................................................................................. 26 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGC........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCATGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGC.......................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GCGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGC...................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CGGATACTTAGATTTCTGC............................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GGTTGGCTGGCGTACGCTGCAAGC........................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ACGCGAGAAGCGGCTGGGCTTGCTG..................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AGCGGCTGGGCTTGCTGGAGA................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TACGCTGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGG........................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGC................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCATGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGT........................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTt..................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 31.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGCGGTTG.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCGGCTGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGG......................................................................................................................................................................................... 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGa....................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 115.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTG..................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAG................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CCATTACCGGCCGGGAGCCTTGGGA................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AAGCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGG................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GATAGAGTTTGGCTCAGGC....................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGACT................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGC...................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GTAGGACCTGGAACTGAGTGTCT........................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AAGCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGC........................... 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TACGCTGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAG......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AGTGTCTGTCAATCATGGATCAGGACGAC..................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................CAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGACTGAG................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TTGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGT............................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCc...................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 149.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGAGATAGTGCAAGCGGCGGCA 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCG........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGt..................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GCAAGCGGATAGAGTTTGGC............................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGg........................... 29 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCTTt........................ 28 t 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCT.......................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTG..................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AGCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGt................................ 29 t 1.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CGCGAGAAGCGGCTGGGCTTGCTGGg................... 26 g 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGACT................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTG............................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGAGATAGTGCAAGCGGCGGC. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................GCCGAAGCGTTGACTGAGCTA............................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAGC............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CCGAAGCGTTGACTGAGCTACGCGAG....................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CCTGGAACTGAGTGTCTGTCAATC.................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCT...................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGG....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCttt....................................................... 28 ttt 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCTTGC....................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGG................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGG............................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGt.................................................................................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TACGCTGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGt........................................................................................................................................................................ 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................CGGATAGAGTTTGGCTCAGGC....................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATAGA.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCatt.................................................................................................................................................................... 30 att 1.00 149.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATA...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGG.................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TACGCGAGAAGCGGCTGGGCTTGC....................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGATCAGGACGACCCAGCCGAAG........................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGC........................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAtt............................................................................................................................................................. 27 tt 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAt......................................................................................................................................................................... 25 t 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTTGGGAAGTAGGACCTGG....................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCTTG........................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCAAG............................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAc.............................................................................................................................................................. 26 c 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGG........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TTGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTG.............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTtg............................. 27 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TACCGGCCGGGAGCCTTGGGAAGTAG.............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGAGTTTGGCTCAGGCT...................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TTGGGAAGTAGGACCTGG....................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AAGTAGGACCTGGAAC.................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTAGATTTCTGCAGT............................................................................................................................................................................................................................ 15 8 0.12 0.12 - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GATCGCAGCGGATACTTAGATTTCTGCAGTTGCGGCTGCGGTTGGCTGGCGTACGCTGCAAGCGGATAGAGTTTGGCTCAGGCTGGGGGCAGCGGGGAGGGCAACCGCTTCCATTACCGGCCGGGAGCCTTGGGAAGTAGGACCTGGAACTGAGTGTCTGTCAATCATGGATCAGGACGACCCAGCCGAAGCGTTGACTGAGCTACGCGAGAAGCGGCTGGGCTTGCTGGAGATAGTGCAAGCGGCGGCA
....................................................(((((.....(((.........(((((.((((((.((.(((((.........))))).))....))))))..))))).((((..((....(((((...(((.((.....)).)))....)))))))..)))).))).)))))........................................................
..................................................51...................................................................................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.............................................................................................................................................ACCTGGAACTGAGTGTCTGTCAATCA................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GCAACCGCTTCCATTACCGGCCGGGA............................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTGAGTGTCTGTCAATCATGGATCA............................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCAGTTGCGGCTGCGGTTGG............................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GACCTGGAACTGAGTGTCTGTCAATCA................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTCTGTCAATCATGGATCAGG.......................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCAGCGGGGAGGGCAACC................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................................................AGGACCTGGAACTGAGTGTCTGTCAATCA................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -