(11)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(38)
TESTES

Sense strand
TGACTGCTACACTTCAGCCAGAGGCTGCACTGCCACCCTGGGCAACTTTGGTAGGTATCTCACAATTAACTGTGGCCTCTCTTAGCTCTGCTGGATCACACAGGTCCAGTGTGTGGTTGGTGTCTTTTTGTTTGTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTCAAACCGAAATCTGCCTGCCTCTGTCTCCCAAGTGTGTGCGCCACTATGCCCGGCTTAGGTTGCATGGCAGACCTGCCCCAAGGTGGCTTCTCTGTTCCTAGGATTGCAACAGCACCTTGGTGGGCAGGACTCTAATGAAGCCACCAACCCTCTTACTATTTTACAGCTAAGGCCACCTTTGATGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCCC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCC. 26 1 7.00 7.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCC. 28 1 6.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGACTTACAGCTACCTGACTC.. 22 1 6.00 6.00 - 1.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGTATCTCACAATTAACTGTGGCC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCCC 27 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................GTAGGTATCTCACAATTAACTGTGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGAGGCTGCACTGCCACCCTGGGCAACa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCTGGCat............................................................................................................................................................................................................................................................ 22 at 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCCC 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGACTTACAGCTACCTGACTCCC 24 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGAGACTGGC........................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGAGGCTGCACTGCCACCCTGGGCAca...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGCCATCTCCAAGACTTACAac............ 25 ac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGGGTTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGAta......................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........CACTTCAGCCAGAGGCTGCACTGCCcccc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 cccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTCAAA..................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTCAAA..................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAAGACTTACAGCTACCTGACTC.. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAAGACTTACAGCTACCTGACTCCC 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGTATCTCACAATTAACTGTGcct....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGGTGTCTTTTTGTTTGTTTGAGACAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCTCTGTATAGTCCTGGCTGAtca........................................................................................................................................................................................................................................................ 24 tca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTC........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTCTGTAGACCAGAGACTGGC........................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TCTGCCTGCCTCTGTCTCaga.......................................................................................................................................................................................... 21 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCTGGCata........................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAAATCTGCCTGCCTCTGTCTCaa........................................................................................................................................................................................... 24 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGttt... 31 ttt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTCTGTAGACCAGAGACTGG............................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTC.. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTGGAACTCACTCTGTAGACCAGAGACTG............................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGGAACTCACTCTGTAGACCAGAGACTGGC........................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCCC 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAAGACTTACAGCTACCTGACTCCCgt 28 gt 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGCCATCTCCAAGACTTACAccca.......... 27 ccca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCagcc.............................................................................................................................................................................................................................................................. 20 agcc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGGGCAGGACTCTAATGAAGC........................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGACTTACAGCTACCTGACTCC. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGATTGCAACAGCACCTTGGTGGGCA.......................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGAta......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGgct... 31 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGTGGCTTCTCTGTTCCTAGGATTGC............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCC. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTC........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TCAGCCAGAGGCTGCACTGCCACCCTtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTCA....................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTCga...................................................................................................................................................................................................................... 29 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTAAGGCCACCTTTGATGCCATCTt......................... 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTCAAg..................................................................................................................................................................................................................... 30 g 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GTCCTGGCTGACCTGGAACggta............................................................................................................................................................................................................................................... 23 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCg. 26 g 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TCAGCCAGAGGCTGCACTGCCACCCTt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGCCATCTCCAAGACTTACAGCTccc........ 29 ccc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTa........................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTACAGCTACCTGACTCCC 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGACCTG....................................................................................................................................................................................................................................................... 27 14 0.21 0.21 0.07 - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGACCTGGAA.................................................................................................................................................................................................................................................... 30 14 0.14 0.14 - - - - - 0.07 - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGGAACTCACTCTGTAGACCAGAGA................................................................................................................................................................................................................................ 25 11 0.09 0.09 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TCTGTATAGTCCTGGCTGACCTGGAA.................................................................................................................................................................................................................................................... 26 14 0.07 0.07 - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTCTCTGTATAGTCCTGGCTGACCTGGA..................................................................................................................................................................................................................................................... 28 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGACCTGG...................................................................................................................................................................................................................................................... 28 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TGTATAGTCCTGGCTGACCTGGAAC................................................................................................................................................................................................................................................... 25 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCTCTGTATAGTCCTGGCTGACCTG....................................................................................................................................................................................................................................................... 25 15 0.07 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................CTGTATAGTCCTGGCTGACCTGG...................................................................................................................................................................................................................................................... 23 15 0.07 0.07 - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGAC.......................................................................................................................................................................................................................................................... 24 17 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGACTGCTACACTTCAGCCAGAGGCTGCACTGCCACCCTGGGCAACTTTGGTAGGTATCTCACAATTAACTGTGGCCTCTCTTAGCTCTGCTGGATCACACAGGTCCAGTGTGTGGTTGGTGTCTTTTTGTTTGTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGTCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGAGACTGGCCTCAAACCGAAATCTGCCTGCCTCTGTCTCCCAAGTGTGTGCGCCACTATGCCCGGCTTAGGTTGCATGGCAGACCTGCCCCAAGGTGGCTTCTCTGTTCCTAGGATTGCAACAGCACCTTGGTGGGCAGGACTCTAATGAAGCCACCAACCCTCTTACTATTTTACAGCTAAGGCCACCTTTGATGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTCCC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.................................................................................................................................................................TGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAt......................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 6.00 0.00 2.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGg...... 29 g 4.00 0.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAtt......................................................................................................................................................................................................................................... 29 tt 4.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAttt......................................................................................................................................................................................................................................... 30 ttt 3.00 0.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACCTGa...... 29 a 2.00 0.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GCTGACCTGGAACTCACTCTGTAGAtgt....................................................................................................................................................................................................................................... 28 tgt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAta......................................................................................................................................................................................................................................... 27 ta 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTtt.......................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................................................................................................................................................GCTGACCTGGAACTCACTCTGTAaca......................................................................................................................................................................................................................................... 26 aca 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CTCTCTTAGCTCTGCTGGATCACACA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CTGGCTGACCTGGAACTCACtcta............................................................................................................................................................................................................................................... 24 tcta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................ACCTGGAACTCACTCTGTAGACCAagtt.................................................................................................................................................................................................................................... 28 agtt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CTGACCTGGAACTCACTCTGTAacaa......................................................................................................................................................................................................................................... 26 acaa 2.00 0.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAttt......................................................................................................................................................................................................................................... 31 ttt 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACt......... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCTGTCTCCCAAGTGTGTGCGCCACTA.......................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AATCTGCCTGCCTCTGTCTCCCAAataa......................................................................................................................................................................................... 28 ataa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCACCTTTGATGCCATCTCCAAGACa................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCTCCAAGACTTACAGCTa........... 22 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CGAAATCTGCCTGCCTtag.................................................................................................................................................................................................... 19 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATCTCCAAGACTTACAGCTAa.......... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAcat......................................................................................................................................................................................................................................... 27 cat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAa......................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ATCTGCCTGCCTCTGTCTCCCAaaag.......................................................................................................................................................................................... 26 aaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGACCTGGAACTCACTCTGTAta......................................................................................................................................................................................................................................... 23 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACat......... 27 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GCTGACCTGGAACTCACTCTGTAtaat......................................................................................................................................................................................................................................... 27 taat 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CTGACCTGGAACTCACTCTGTAaccg......................................................................................................................................................................................................................................... 26 accg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATCTCCAAGACTTACAGCTACCa........ 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTtttt............................................................................................................................................................................................................................................ 28 tttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TGACCTGGAACTCACTCTGTAGAttt....................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGATGCCATCTCCAAGACTTcggt................. 25 cggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAtat......................................................................................................................................................................................................................................... 27 tat 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTActt......................................................................................................................................................................................................................................... 30 ctt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAcgt......................................................................................................................................................................................................................................... 27 cgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAtttt......................................................................................................................................................................................................................................... 29 tttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTTTGATGCCATCTCCAAGACTTt................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTCCAAGACTTACAGCTACCa........ 24 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTctaa............................................................................................................................................................................................................................................ 28 ctaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGCCATCTCCAAGACTTACAGCTAt.......... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCCCAAGGTGGCTTCTCTGTTCCTAc.................................................................................................................... 29 c 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGACCTGGAACTCACTCTGTAaaat......................................................................................................................................................................................................................................... 25 aaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GCTGACCTGGAACTCACTCTGTAac......................................................................................................................................................................................................................................... 25 ac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGCCATCTCCAAGACTTACAGCTAtt.......... 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................ACCTGGAACTCACTCTGTAGACCAgt.................................................................................................................................................................................................................................... 26 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
............................................................................................................................................................GTCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTgt.......................................................................................................................................................................................................................................... 30 gt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAtt......................................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAtta......................................................................................................................................................................................................................................... 29 tta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGCCATCTCCAAGACTTACAGCTct........... 28 ct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCAAGACTTACAGCTACCTGACTC.. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTTTGATGCCATCTCCAAGACTTAa................ 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAcggc......................................................................................................................................................................................................................................... 28 cggc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTtat.......................................................................................................................................................................................................................................... 29 tat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GAAATCTGCCTGCCTCTGTCTCCCttaa........................................................................................................................................................................................... 28 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GAAATCTGCCTGCCTCTGTCTCCCAaa.......................................................................................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CTGACCTGGAACTCACTCTGTAGAactg....................................................................................................................................................................................................................................... 28 actg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AGTCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAttt......................................................................................................................................................................................................................................... 33 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAtag......................................................................................................................................................................................................................................... 29 tag 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTCCTGGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAgaga......................................................................................................................................................................................................................................... 33 gaga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGCTGACCTGGAACTCACTCTGTAttt......................................................................................................................................................................................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CTGTGGCCTCTCTTAGCTCTGCTGGATCA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................GATCACACAGGTCCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -