Gene: AK006941

ID: uc008axx.1_intron_0_0_chr17_24856553_r

SPECIES: mm9

chr17:24856503 24856854 -

(11) OTHER.mut

(2) OVARY

(8) PIWI.ip

(4) PIWI.mut

(45) TESTES

Sense strand

GGGCCGTCCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGGCGTGTTCGGGTAAGTCGCTCCTCACGGGCTTCTCCAGGCTTACGCAGTTGATCCAGTAAATGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTTGGCTTGTAGCCGGGGGTGAGATTCGGCGCCCAGAGCCACAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCGCTGCCCCGGTGTGGGAGGGTGAAACCCAGGCCCCTACATTCCAGAGCGACTCTGCTGCCCCGCGGTCCGCCCTGTGGCCACAGTCTTAACCGCCTCATTTATTTCGCAGGTTCCCCTGGATATGGACGTTGCCGCCGCCTCCCGCAAGAATTGTCCTCT ................................................................................................((...(((((((....((((..((((((((((((.........))))))))))))..)))))))))))..))...((.(((((....(((((.(((((.((....)))))))..))))).....))))).))............................................................................................................................ ...............................................................................................96........................................................................................................................................234....................................................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)	SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTTGGCTTGTAGCCGGGGGTGAGA.......................................................................................................................................................................................................	52	1	134.00	134.00	116.00	18.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................ATGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTTGGCTTGTAGCCGGGGGTGAG........................................................................................................................................................................................................	52	1	53.00	53.00	-	53.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAA..........................................................................................................................................................................................................................................	17	1	22.00	22.00	-	-	15.00	-	-	-	3.00	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCC................................................................................................................................................................	22	1	12.00	12.00	-	-	1.00	1.00	3.00	-	-	-	-	-	2.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAAT.........................................................................................................................................................................................................................................	18	1	11.00	11.00	-	-	4.00	-	-	-	1.00	-	-	1.00	2.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACC.....................................................................................................................................................................................................................................	22	1	9.00	9.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	1.00	-	-	2.00	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGC...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	8.00	8.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	5.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................ACCCGTGGCGACGTTGGCG.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	8.00	8.00	-	-	-	2.00	-	5.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCC.................................................................................................................................................................	21	1	8.00	8.00	-	-	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................GTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGGCGTGTT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	31	1	7.00	7.00	-	-	-	-	7.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTT............................................................................................................................................................................................................................	31	1	6.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCGCTG............................................................................................................................................................	26	1	5.00	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGC..................................................................................................................................................................	20	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................GTGAAACCCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	23	1	4.00	4.00	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTT.............................................................................................................................................................................................................................	30	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
........................ACCCGTGGCGACGTTGGCGTG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGC...............................................................................................................................................................................................................................	28	1	4.00	4.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................AGGAACCCGTGGCGACGTTGGCatg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	atg	4.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................AGGAACCCGTGGCGACGTTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCA.......................................................................................................................................................................................................................................	20	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAA...........................................................................................................................................................................................................................................	16	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............TGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCC....................................................................................................................................................................................................................................	23	1	3.00	3.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................ACCCGTGGCGACGTTGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	18	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCT..............................................................................................................................................................................................................................	29	1	3.00	3.00	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCttt.............................................................................................................................................................	25	ttt	3.00	12.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCAC......................................................................................................................................................................................................................................	21	1	3.00	3.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................GGTGAAACCCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	24	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................GAAACCCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	21	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGCGACGTTGGCGTGTT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	18	1	3.00	3.00	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCCGTGGCGACGTTGGCG.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	18	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	22	1	3.00	3.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................GAGATTCGGCGCCCAGAGCCACAG...................................................................................................................................................................................	24	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTTG...........................................................................................................................................................................................................................	32	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCT...................................................................................................................................................................................................................................	24	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCCGTGGCGACGTTGGCGTGTTCGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCta..............................................................................................................................................................	24	ta	2.00	12.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-
...............................................................................................................................................................................................................GAGGGTGAAACCCAGGCCCCTAt..........................................................................................................................	23	t	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................ATGGGCGTTCGTTGAAAATCACC.....................................................................................................................................................................................................................................	23	1	2.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCta................................................................................................................................................................	22	ta	2.00	4.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................TGAAACCCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............TTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................TTGAAAATCACCCTCGGCTTTGGC.........................................................................................................................................................................................................................	24	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGt................................................................................................................................................................................................................................	27	t	2.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCG...................................................................................................................................................................	19	1	2.00	2.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCCGTGGCGACGTTGGCGTGTT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TCCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGC...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........GCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................GCGACGTTGGCGTGTTCGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	20	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CGTGGCGACGTTGGCGTGTTCGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............TGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGGCa.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	a	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAA............................................................................................................................................................................................................................................	15	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................CCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	16	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................GAGGGTGAAACCCAGGCCCCTA...........................................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................AACCCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	19	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGG................................................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCa................................................................................................................................................................	22	a	2.00	8.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................GAGGCCTCAGCTCACCGCCCGCTGCC..........................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................GTTGGCGTGTTCGGGTAAGTCGC.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CAGGAACCCGTGGCGACGTTGGCGTG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................TCCAGGAACCCGTGGCGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................GGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTT............................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCtat.............................................................................................................................................................	25	tat	1.00	12.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................AGGCTTACGCAGTTGATCCAG...............................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........GCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTT.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATATGGACGTTGCCGCCGCCcc..................	25	cc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................TGGGAGGGTGAAACCCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................AATCACCCTCGGCTTTGGCTTGTA....................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGtc...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	tc	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................CGGGCTTCTCCAGGCTTACGCAGTTGA....................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................CAGCTCACCGCCCGCTGCCCC........................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................TGAGATTCGGCGCCCAGAGCCACAGAGGCCTC............................................................................................................................................................................	32	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAgag.........................................................................................................................................................................................................................................	18	gag	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................CTCGGCTTTGGCTTGTAGC..................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................GTTCGTTGAAAATCACCCTCGGttt.............................................................................................................................................................................................................................	25	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCt...............................................................................................................................................................	23	t	1.00	12.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................TGGCGTGTTCGGGTAAGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................GGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGC...............................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................CCGTGGCGACGTTGGCG.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	17	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCa...............................................................................................................................................................	23	a	1.00	12.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........CCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................GGCGACGTTGGCGTGTTCG...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCatt.............................................................................................................................................................	25	att	1.00	12.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................GTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................ATGGGCGTTCGTTGAAAA..........................................................................................................................................................................................................................................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCaat..............................................................................................................................................................	24	aat	1.00	8.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................................................GCGACTCTGCTGCCCCGCGG..............................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........CTTGTGTCCAGGAACCCGTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................TTTGGCTTGTAGCCGGGGGTGAGA.......................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTc.............................................................................................................................................................................................................................	30	c	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........GCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............TGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................TGGCTTGTAGCCGGGGGTGAGATTCGGt.................................................................................................................................................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................GCGACGTTGGCGTGTTCGG..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACGTTGCCGCCGCCTCCCGCAAG...........	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................AAACCCAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCaa..............................................................................................................................................................	24	aa	1.00	12.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTTCGCAGGTTCCCCTGGATATGGAC................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-
............TTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGT..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGa................................................................................................................................................................................................................................	27	a	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................TTGGCTTGTAGCCGGGGG............................................................................................................................................................................................................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCCGTGGCGACGTTGGCGTGTTCGGaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	aa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CAGGAACCCGTGGCGACGTTGGCatg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	atg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GCGCCCAGAGCCACAGAGG................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................GAACCCGTGGCGACGTTGGCG.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGATATGGACGTTGCCGCCGCCTCC.................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAga..........................................................................................................................................................................................................................................	17	ga	1.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........CCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGgg..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	gg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................ATTCGGCGCCCAGAGCCACAGAGG................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCCGTGGCGACGTTGGCGTGTTCGtg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	tg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................GAGGGTGAAACCCAGGCCCCTAC..........................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................GTTGGCGTGTTCGGGTAAGTCG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00
....................................................................................................................................................................................................CCCCGGTGTGGGAacca...........................................................................................................................................	17	acca	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCCGTGGCGACGTTGGCGTG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................GCTTTGGCTTGTAGCC.................................................................................................................................................................................................................	16	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCCGCCGCCTCCCGCAAGAATTGTCCTt.	30	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATATGGACGTTGCC..........................	16	2	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............TGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTT.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACGTTGCCGCCGCCTCCCGCAAGA..........	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
................................CGACGTTGGCGTGTTCGGGTAAGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................GAGGGTGAAACCCAGGCCCCTAtt.........................................................................................................................	24	tt	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................GAACCCGTGGCGACGTTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGCG..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................CGGGCTTCTCCAGGCTTACG...........................................................................................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......CCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAta..........................................................................................................................................................................................................................................	17	ta	1.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............TTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTT.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................AGGAACCCGTGGCGACGTTGGCG.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTTGG..........................................................................................................................................................................................................................	33	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................AGAGCGACTCTGCTGCac...................................................................................................	18	ac	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................CGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTTGGC.........................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCCGTGGCGACGTTGGCGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CAGGAACCCGTGGCGACGTTGGCGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................TCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........CGCTTGTGTCCAGGAACCCGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGGGCGTTCGTTGAAAATCACtctt..................................................................................................................................................................................................................................	25	tctt	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................ATGGGCGTTCGTTGAA............................................................................................................................................................................................................................................	16	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................ACCCGTGGCGACGTTGGCt.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	t	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................GCGTGTTCGGGTAAGTCGCTCCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CGTGGCGACGTTGGCGTGTTCGG..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................GAAAATCACCCTCGGCTTTGG..........................................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........CCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGC...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............TGTCCAGGAACCCGTGGCGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................TTGGCTTGTAGCCGGGGGTGAGATTCGG..................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................TCACCCTCGGCTTTGGCTTGTAGCC.................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............TGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................GGGGTGAGATTCGGCGCCCAGA..........................................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................GTTGAAAATCACCCTCGGCTT.............................................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................TCCAGTAAATGGGCGTTCGTTGAAAATC........................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................ATGGGCGTTCGTTGAAAAT.........................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................ATGGGCGTTCGTTGA.............................................................................................................................................................................................................................................	15	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................................AGGCCCCTACATTCC.....................................................................................................................	15	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................CAGGCCCCTACATTC......................................................................................................................	15	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

GGGCCGTCCCGCTTGTGTCCAGGAACCCGTGGCGACGTTGGCGTGTTCGGGTAAGTCGCTCCTCACGGGCTTCTCCAGGCTTACGCAGTTGATCCAGTAAATGGGCGTTCGTTGAAAATCACCCTCGGCTTTGGCTTGTAGCCGGGGGTGAGATTCGGCGCCCAGAGCCACAGAGGCCTCAGCTCACCGCCCGCTGCCCCGGTGTGGGAGGGTGAAACCCAGGCCCCTACATTCCAGAGCGACTCTGCTGCCCCGCGGTCCGCCCTGTGGCCACAGTCTTAACCGCCTCATTTATTTCGCAGGTTCCCCTGGATATGGACGTTGCCGCCGCCTCCCGCAAGAATTGTCCTCT ................................................................................................((...(((((((....((((..((((((((((((.........))))))))))))..)))))))))))..))...((.(((((....(((((.(((((.((....)))))))..))))).....))))).))............................................................................................................................ ...............................................................................................96........................................................................................................................................234....................................................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)	SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)
........................................................................................................................................................................................................................ACCCAGGCCCCTACAT........................................................................................................................	16	3	1.67	1.67	-	-	-	-	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCTGCCCCGCGGTCCG..........................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-
........................................................................................................................................................................................................................ACCCAGGCCCCTACA.........................................................................................................................	15	6	0.33	0.33	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-