chr17:12886981 12887230 -
(1)
OTHER.ip 		(8)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(45)
TESTES

Sense strand
GTATGTCTTCGCTATTCCCAGGAAAGAATATGGTGGATCTTGTCCTCACACGGTGGTTTTTAAGACTAATGTTTTTCACCAGTTGTGGTGGCTTACACCGGTAGAATGTGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAGATCGAGGCAAACCTGGGCTACACATTTTTTAAAAAGACTCATGTTTTTCTTGGCCACAGGGAACTCCTAAGCTGATAAGGACCAATGACTGCGACTTTGTGTTTGAGTG
..........................................................................................................((((((..(((..((....)).....((((....))))........))).))).))).......................................................................................
..........................................................................................................107..................................................................176........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTTTTA.............................................................................. 20 1 27.00 27.00 - 2.00 - - - 6.00 1.00 2.00 2.00 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTTTA.............................................................................. 19 1 19.00 19.00 - 3.00 2.00 - - 3.00 - 1.00 - - 2.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATa.................................................................................................................. 25 a 13.00 0.00 3.00 - 1.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATt.................................................................................................................. 25 t 10.00 0.00 - 1.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGt........................................................................................................................ 19 t 10.00 0.00 - - 2.00 - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATa.................................................................................................................. 24 a 9.00 0.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGGCTACACATTTTTTA.............................................................................. 18 1 9.00 9.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTcttt............................................................................... 19 cttt 9.00 0.00 - - - - - 2.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTTTAA............................................................................. 20 1 8.00 8.00 1.00 1.00 - - - - 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTTgaa............................................................................. 20 gaa 7.00 0.00 - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGt..................................................................................................................... 25 t 7.00 0.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATt.................................................................................................................. 28 t 6.00 0.00 - 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATa.................................................................................................................. 28 a 6.00 0.00 3.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATa.................................................................................................................. 23 a 6.00 0.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGt.................................................................................................................... 23 t 5.00 0.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATta................................................................................................................. 26 ta 5.00 0.00 1.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCAtt............................................................................................................... 28 tt 4.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTTTTAA............................................................................. 21 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAaa.................................................................................................................. 25 aa 4.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGt..................................................................................................................... 22 t 4.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GGGCTACACATTTTTTA.............................................................................. 17 2 3.50 3.50 0.50 - 2.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTTTTAAA............................................................................ 22 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATa.................................................................................................................. 27 a 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATtt................................................................................................................. 26 tt 3.00 0.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATt.................................................................................................................. 26 t 3.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGt........................................................................................................................ 22 t 3.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAcga.................................................................................................................... 26 cga 3.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTTTTAg............................................................................. 21 g 3.00 27.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATa.................................................................................................................. 26 a 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGt........................................................................................................................ 21 t 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCca................................................................................................................ 28 ca 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAaa..................................................................................................................... 25 aa 2.00 0.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GGAGGATCACGAGAaaaa........................................................................................................ 18 aaaa 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAaaa................................................................................................................. 29 aaa 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATat................................................................................................................. 26 at 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGta.................................................................................................................... 25 ta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGta....................................................................................................................... 20 ta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCc................................................................................................................. 28 c 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTgaa.............................................................................. 19 gaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATaa................................................................................................................. 26 aa 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GCAGAGGCAGGAGGATCACGAGgtc.......................................................................................................... 25 gtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAtt........................................................................................................................ 22 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAca..................................................................................................................... 25 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCtggg.............................................................................................................. 28 tggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGtaga..................................................................................................................... 22 taga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGtagg..................................................................................................................... 23 tagg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTattt............................................................................. 20 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGattc.................................................................................................................. 26 attc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAGCTGATAAGGACCAATGACTGCG................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATaa................................................................................................................. 25 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGggt.................................................................................................................. 28 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TAAGCTGATAAGGACCAATGACTGCGACT............. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGttt................................................................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAcgtt................................................................................................................... 27 cgtt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTcttc............................................................................... 19 cttc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGtttt................................................................................................................. 26 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATattt............................................................................................................... 29 attt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAaa............................................................................................................ 28 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGGCTACACATTTaata.............................................................................. 18 aata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AAGGACCAATGACTGCGACTTT........... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
............................................................................................................................................................................................................................GACCAATGACTGCGACTTTGT......... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTgaag............................................................................. 20 gaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAcgaa................................................................................................................... 24 cgaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGta............................................................................................................. 28 ta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAgca................................................................................................................. 26 gca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTTTTAAAA........................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATttat............................................................................................................... 28 ttat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAGATCG......................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GAGGCAGGAGGATCACGAGgt........................................................................................................... 21 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAaagt................................................................................................................ 27 aagt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATaa................................................................................................................. 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCtgt............................................................................................................... 29 tgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTTTAAAA........................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGGCTACACATTTTTTAAA............................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGtac.................................................................................................................. 25 tac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGcgga.................................................................................................................... 25 cgga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCTAAGCTGATAAGGACCAATGACTGC................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTctt................................................................................ 18 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGGCAGAGGCAGGAGGATCccga.............................................................................................................. 23 ccga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCtgaa.............................................................................................................. 30 tgaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAaaaa................................................................................................................... 23 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGGCTACACATTTTTTAA............................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAcg..................................................................................................................... 25 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATtt................................................................................................................. 27 tt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGt..................................................................................................................... 21 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGgtga................................................................................................................. 26 gtga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GCAGAGGCAGGAGGATCACGAGAaaa......................................................................................................... 26 aaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAta..................................................................................................................... 24 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAcga....................................................................................................................... 23 cga 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CTGATAAGGACCAATGACTGCGACT............. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGtt................................................................................................................... 25 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAtt..................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGtt.................................................................................................................... 23 tt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTctt.............................................................................. 19 ctt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTataa............................................................................... 18 ataa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GGATCACGAGATCGAGGCcat.................................................................................................. 21 cat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATtta................................................................................................................ 28 tta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGGCTACACATTTTTct.............................................................................. 18 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GAGGCAGGAGGATCACGAGATCGAGGCc.................................................................................................... 28 c 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGtagt..................................................................................................................... 22 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTagaa.............................................................................. 20 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGc........................................................................................................................ 20 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTact.............................................................................. 19 act 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GTGCTGAAGGAGGCAGAGGCA.......................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGgg................................................................................................................... 23 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAGg............................................................................................................ 30 g 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGt.............................................................................................................. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CAGAGGCAGGAGGATCACGAGgt........................................................................................................... 23 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTcttt............................................................................. 20 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAcgat................................................................................................................... 27 cgat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCCTAAGCTGATAAGGACCAATGACTGC................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GCAGGAGGATCACGAGAaaat........................................................................................................ 21 aaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATtttt............................................................................................................... 28 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGt.................................................................................................................... 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAaa.................................................................................................................. 26 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTTTgat............................................................................. 21 gat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CAGAGGCAGGAGGATCACGtaa............................................................................................................ 22 taa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGc..................................................................................................................... 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTTTAAAAAa......................................................................... 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAaa............................................................................................................ 29 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGTGCTGAAGGAGGCAGAGGCAG......................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TAAGCTGATAAGGACCAATGACTGCGAC.............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTTTAta............................................................................ 21 ta 1.00 19.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGtagg..................................................................................................................... 21 tagg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGGCTACACATTTTgt............................................................................... 17 gt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGgtt.................................................................................................................. 27 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCtaa............................................................................................................... 28 taa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AGAGGCAGGAGGATCACGAGAaa.......................................................................................................... 23 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAaaaa.......................................................................................................... 29 aaaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAcaa................................................................................................................. 25 caa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATaacg............................................................................................................... 26 aacg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATattt............................................................................................................... 26 attt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATt.................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTTTgaa.............................................................................. 20 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGt.................................................................................................................... 24 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCctt............................................................................................................... 29 ctt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAcga.................................................................................................................... 22 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATtcgt............................................................................................................... 28 tcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAcg..................................................................................................................... 21 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGATAAGGACCAATGcga................... 18 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCctgg....................................................................................................................... 23 ctgg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAGCTGATAAGGACCAATGACTGCGA............... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGta.................................................................................................................... 21 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCccg............................................................................................................... 26 ccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATtg................................................................................................................. 27 tg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAcga.................................................................................................................... 25 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAGAa........................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGgtg.................................................................................................................. 24 gtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGGGCTACACATTTTTTAg............................................................................. 20 g 1.00 19.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCccga.............................................................................................................. 27 ccga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAcgat................................................................................................................... 23 cgat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATta................................................................................................................. 27 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCAat............................................................................................................... 31 at 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GGGCTACACATTTgaac.............................................................................. 17 gaac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCccg............................................................................................................... 30 ccg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGtag...................................................................................................................... 21 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TACACATTTTTTAAAAAGta....................................................................... 20 ta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCc................................................................................................................. 24 c 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGggca................................................................................................................. 25 ggca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATaat................................................................................................................ 27 aat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CTTGGCCACAGGGAACTtc.......................................... 19 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGgta.................................................................................................................. 28 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAttt....................................................................................................................... 20 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAaat................................................................................................................. 26 aat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GCAGGAGGATCACGAGAgaaa........................................................................................................ 21 gaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACtt.............................................................................................................. 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCAaa............................................................................................................... 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................TGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCga................................................................................................................ 27 ga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCTGGGCTACACATTaca................................................................................ 18 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGAaa.................................................................................................................. 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAc...................................................................................................................... 24 c 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGGGCTACACATTTTgaaa............................................................................. 19 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GGCAGGAGGATCACGAGATCGAGGC..................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AACCTGGGCTACACATTTTT................................................................................ 20 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGCTACACATTTTTTA.............................................................................. 16 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GTATGTCTTCGCTATTCCCAGGAAAGAATATGGTGGATCTTGTCCTCACACGGTGGTTTTTAAGACTAATGTTTTTCACCAGTTGTGGTGGCTTACACCGGTAGAATGTGCTGAAGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCACGAGATCGAGGCAAACCTGGGCTACACATTTTTTAAAAAGACTCATGTTTTTCTTGGCCACAGGGAACTCCTAAGCTGATAAGGACCAATGACTGCGACTTTGTGTTTGAGTG
..........................................................................................................((((((..(((..((....)).....((((....))))........))).))).))).......................................................................................
..........................................................................................................107..................................................................176........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.....CGCTATTCCCAGGAggtg................................................................................................................................................................................................................................... 18 ggtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CACGGTGGTTTTTAggat............................................................................................................................................................................................ 18 ggat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAAGGAGGCAGAGggac............................................................................................................................. 17 ggac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -