chr17:6600912 6601161 +
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(50)
TESTES

Sense strand
CGGGCGAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGGAGGTAACCTCGGGTTGGACTGTGAGAGGGAGGGTGGCGGCGGAGATCCGGGTGTGGCGGGGCCCGGTCTGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGGCCACCTGGCCCGAGGCTGATGAGCCTACACACAATTTGTCAAAAATCCCACACAATTTGTCAAAAACAATAATAATAAAACCCTAACACTTCCTCTTTTGACATTTCT


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
........GGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCC...................................................................................................................................................................................................................... 28 6 5.83 5.83 1.67 1.17 0.83 - - - - - - 1.17 - - - - - - - - 0.17 - 0.67 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 27 6 3.33 3.33 0.67 0.67 1.17 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGGAG........................................................................................................................................................................................................ 26 7 3.14 3.14 1.00 0.29 1.57 - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CGGGTTGGACTGTGAGAG............................................................................................................................................................................... 18 2 3.00 3.00 - - - - - 0.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGGACTGTGAGAGGGAGGGTGGCGG................................................................................................................................................................... 25 2 2.50 2.50 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 26 6 2.00 2.00 0.50 0.17 0.17 - - - - - - 0.50 - - - - - 0.17 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGGA......................................................................................................................................................................................................... 25 7 1.57 1.57 0.14 0.29 0.14 - - - - - 0.57 0.29 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCGGGTTGGACTGTGAGAGGGA............................................................................................................................................................................ 22 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAACCTCGGGTTGGACTGTGAGAG............................................................................................................................................................................... 24 2 1.50 1.50 - - - 0.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 28 6 1.50 1.50 0.33 0.50 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTT........................................................................................................................................................................................................................ 27 6 1.33 1.33 0.50 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGGCaa......................................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CTCCGAGGAGGTAACCTCGGGTTGGACTGT.................................................................................................................................................................................... 30 2 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTGGACTGTGAGAGGGAGGGTGGCGt................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTC............................................................................................................................................................................................................... 26 8 1.00 1.00 0.25 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - 0.12 - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCCGGTCTGGGAAcca............................................................................................................................. 16 cca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AACCTCGGGTTGGACTGTGAGAtgg............................................................................................................................................................................. 25 tgg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGAa.......................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAACCTCGGGTTGGACTGTGAGAGG.............................................................................................................................................................................. 25 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGGCC.......................................................................................................... 28 6 1.00 1.00 0.33 - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTccc...................................................................................................................................................................................................................... 28 ccc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................TCCTCTTTTGACATgggt 18 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGGAt........................................................................................................................................................................................................ 26 t 0.71 1.57 0.14 - 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACT......................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.67 0.67 0.33 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCA..................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.67 0.67 - 0.33 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGG................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.67 0.67 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTC............................................................................................................................................................................................................... 25 8 0.62 0.62 - - - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - - 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................CTCGGGTTGGACTGTGAGAGGG............................................................................................................................................................................. 22 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTGGACTGTGAGAGGGAG........................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................CTCGGGTTGGACTGTGAGAGGGA............................................................................................................................................................................ 23 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CTGTGAGAGGGAGGGTGG...................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ACTGTGAGAGGGAGGGT........................................................................................................................................................................ 17 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................CTCGGGTTGGACTGTGAG................................................................................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GCCTCCGAGGAGGTAACCTCGGGTTGGACTGT.................................................................................................................................................................................... 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AACCTCGGGTTGGACTGTGAG................................................................................................................................................................................. 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GGACTGTGAGAGGGAGGGT........................................................................................................................................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GAGGAGGTAACCTCGGGTTGGACTG..................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGGACTGTGAGAGGGAGGG......................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AACCTCGGGTTGGACTGTGAGAGGG............................................................................................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................ACCTCGGGTTGGACTGTGAGAGGGAG........................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTAACCTCGGGTTGGACTGTGA.................................................................................................................................................................................. 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGGAGGTAACCTCGGGTTGGACTGTG................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTAACCTCGGGTTGGACTGTG................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................ACCTCGGGTTGGACTGTGAGAGG.............................................................................................................................................................................. 23 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCGGGTTGGACTGTGAGAGGGAGGGTGGCGGC.................................................................................................................................................................. 32 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AACCTCGGGTTGGACTGTGAGAGG.............................................................................................................................................................................. 24 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCC.............................................................................................................................................................................................................. 26 7 0.43 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCT................................................................................................................................................................................................................ 26 7 0.43 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCG............................................................................................................................................................................................................. 27 7 0.43 0.43 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGAGCCTACACACAATTTGTCAAAAATCCC........................................................... 30 7 0.43 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - 0.14 - - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCAGGCC................................................................................................................................................................................................................. 23 8 0.38 0.38 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CGAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAG............................................................................................................................................................................................................................ 26 6 0.33 0.33 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - -
..........AGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGC.................................................................................................................................................................................................................. 30 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 30 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACT......................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.33 0.33 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACT......................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGGCCACC....................................................................................................... 31 6 0.33 0.33 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCA..................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTGGACTGTGAGAGGGA............................................................................................................................................................................ 17 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGGAGGTAACCTCGGGTTG.......................................................................................................................................................................................... 19 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CGAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGA........................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGG............................................................................................................ 26 6 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCGA............................................................................................................................................................................................................ 28 7 0.29 0.29 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - -
........................TGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGG.......................................................................................................................................................................................................... 24 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - -
...................AAAGATGGAAGACTTCCAGGC.................................................................................................................................................................................................................. 21 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCAG.................................................................................................................................................................................................................... 20 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 -
.................TTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCC................................................................................................................................................................................................................. 24 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCA..................................................................................................................................................................................................................... 19 8 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTC............................................................................................................................................................................................................... 24 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AAAGATGGAAGACTTCCAGGCCT................................................................................................................................................................................................................ 23 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GAGGGAGGGTGGCGGCGGAGATCCG......................................................................................................................................................... 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GCGGCGGAGATCCGGGTGTGG.................................................................................................................................................. 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GACGCGTTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTaa....................................................................................................................................................................................................................... 28 aa 0.17 0.67 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GACGCGTTAAAGATGGAAGACTT........................................................................................................................................................................................................................ 23 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGAC.......................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................GAGGTAACCTCGGGTTGG......................................................................................................................................................................................... 18 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCT................................................................................................................................................................................................................ 29 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGAC.......................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............ACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGG................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CGCGTTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - -
.....GAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGA........................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GACGCGTTAAAGATGGAAGAC.......................................................................................................................................................................................................................... 21 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTT........................................................................................................................................................................................................................ 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGACGCGTTAAAGATGGAAGA........................................................................................................................................................................................................................... 21 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GCGAAGGAGACGCGTTAAAGATGG............................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCC...................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCaa..................................................................................................................................................................................................................... 29 aa 0.17 3.33 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GAAGACACAGCTTCTGCTCA............................................................................................................... 20 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CCGGTCTGGGAAGACACAG......................................................................................................................... 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GGGCCCGGTCTGGGAAGACA............................................................................................................................ 20 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGGCCA......................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CGGTCTGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACG............................................................................................................. 30 6 0.17 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAG.................................................................................................................................................................................................................... 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CGAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACT......................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGa.................................................................................................................................................................................................................. 29 a 0.17 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCC................................................................................................................................................................................................................. 32 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CCGGTCTGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACG............................................................................................................. 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTT........................................................................................................................................................................................................................ 28 6 0.17 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGACGCGTTAAAGATGGA.............................................................................................................................................................................................................................. 18 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GACGCGTTAAAGATGGAA............................................................................................................................................................................................................................. 18 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ATGGAAGACTTCCAGGCCTCC.............................................................................................................................................................................................................. 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAG........................................................................................................................................................................................................... 27 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCGt............................................................................................................................................................................................................ 28 t 0.14 0.43 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGC.................................................................................................................................................................................................................. 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - -
.........................................................................AGGGAGGGTGGCGGCGGAG.............................................................................................................................................................. 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GAGGGAGGGTGGCGGCGGAG.............................................................................................................................................................. 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AAGACTTCCAGGCCTCCGAG........................................................................................................................................................................................................... 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AGAGGGAGGGTGGCGGCGGAGATCC.......................................................................................................................................................... 25 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGGAAGACTTCCAGGCCTCC.............................................................................................................................................................................................................. 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCC.............................................................................................................................................................................................................. 27 7 0.14 0.14 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CGTTAAAGATGGAAGACTT........................................................................................................................................................................................................................ 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGGAGt....................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.14 3.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GAGGGAGGGTGGCGGCGGA............................................................................................................................................................... 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................ACAGCTTCTGCTCACGGCCAC........................................................................................................ 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCG............................................................................................................................................................................................................. 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGAGCCTACACACAATTTGTCAAAAATCC............................................................ 29 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACTTCCAGGCCTCCGAGG.......................................................................................................................................................................................................... 18 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGGAca....................................................................................................................................................................................................... 27 ca 0.14 1.57 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCGA............................................................................................................................................................................................................ 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CTTCCAGGCCTCCGAGGAG........................................................................................................................................................................................................ 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCC................................................................................................................................................................................................................. 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................AGGGAGGGTGGCGGCGGAGAT............................................................................................................................................................ 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - -
.................TTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCT................................................................................................................................................................................................................ 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AAAGATGGAAGACTTCCAGG................................................................................................................................................................................................................... 20 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GAAGACTTCCAGGCCTCC.............................................................................................................................................................................................................. 18 8 0.12 0.12 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGATGGAAGACTTCCAGGCCT................................................................................................................................................................................................................ 21 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AAAGATGGAAGACTTCCAGGCC................................................................................................................................................................................................................. 22 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTAAAGATGGAAGACTTC....................................................................................................................................................................................................................... 18 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGATGGAAGACTTCCAGGCCTC............................................................................................................................................................................................................... 23 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - -
...........................AAGACTTCCAGGCCTCCG............................................................................................................................................................................................................. 18 8 0.12 0.12 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTAAAGATGGAAGACTTCCAGGC.................................................................................................................................................................................................................. 23 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12
....................AAGATGGAAGACTTCCAGG................................................................................................................................................................................................................... 19 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGATGGAAGACTTCCAG.................................................................................................................................................................................................................... 17 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CGGGCGAAGGAGACGCGTTAAAGATGGAAGACTTCCAGGCCTCCGAGGAGGTAACCTCGGGTTGGACTGTGAGAGGGAGGGTGGCGGCGGAGATCCGGGTGTGGCGGGGCCCGGTCTGGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGGCCACCTGGCCCGAGGCTGATGAGCCTACACACAATTTGTCAAAAATCCCACACAATTTGTCAAAAACAATAATAATAAAACCCTAACACTTCCTCTTTTGACATTTCT


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
...............................................................................................................................................................GATGAGCCTACACACAATTTGTCAAA................................................................. 26 7 2.71 2.71 - - - - - - 1.29 - - - - - 1.14 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GCTGATGAGCCTACACACAATTTGTCA................................................................... 27 7 1.14 1.14 - - - 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - 0.14 - - - - - 0.57 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ACAATTTGTCAAAAATCCCACACAAa..................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CACAATTTGTCAAAAATCCCACACAAa..................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GCCTACACACAATTTGTCAAAAATCCCA.......................................................... 28 7 0.43 0.43 - - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CCGGTCTGGGAAGACACAGCTTCTGCTCA............................................................................................................... 29 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................ACACACAATTTGTCAAAAATCCCACA........................................................ 26 7 0.29 0.29 - - - 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TTTGTCAAAAATCCCACA........................................................ 18 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................ATCCCACACAATTTGTCAAAAACAATAATA.................................. 30 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GGGAAGACACAGCTTCTGCTCACGGCCA......................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCCGGTCTGGGAAGACACAGCTTCTGCTCA............................................................................................................... 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - -
...............................................................................................................CGGTCTGGGAAGACACAGCTTCTGCTCA............................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AAGACTTCCAGGCCTCCGAGGAGG....................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GTCAAAAATCCCACACAATTTGTCAAAAA.......................................... 29 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGATGAGCCTACACACAATTTGTCA................................................................... 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GAGGCTGATGAGCCTACACACAATTTt....................................................................... 27 t 0.14 0.00 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TCAAAAATCCCACACAATTTGTCAAAAAC......................................... 29 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CACACAATTTGTCAAAAATCCCACACAA..................................................... 28 7 0.14 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CACACAATTTGTCAAAAATCCCACAC....................................................... 26 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GTCAAAAATCCCACACAATTTGTCA.............................................. 25 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGTCAAAAATCCCACACAATTTGTCA.............................................. 26 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ATTTGTCAAAAATCCCACACAATTTG................................................. 26 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GAGGCTGATGAGCCTACACACAATTT....................................................................... 26 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CCTGGCCCGAGGCTGATGAGCCTACA............................................................................... 26 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ACAATTTGTCAAAAATCCCAC......................................................... 21 7 0.14 0.14 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGAGCCTACACACAATTT....................................................................... 18 7 0.14 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TTTGTCAAAAATCCCACACAATTTGTCA.............................................. 28 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................CTACACACAATTTGTCAAAAATCCCA.......................................................... 26 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................ACCCTAACACTTCCTCTTTTGACA..... 24 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AATAATAATAAAACCCTAACACTTCCT.............. 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AAACCCTAACACTTCCTCTTTTGACA..... 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCCACACAATTTGTCAAAAACAATAA.................................... 27 10 0.10 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCCACACAATTTGTCAAAAACAATAATA.................................. 29 10 0.10 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ACACAATTTGTCAAAAAC......................................... 18 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCCACACAATTTGTCAAAAACAATAATA.................................. 28 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -