| Gene: NR_003519 | ID: uc008aed.1_intron_6_0_chr17_3081035_r.3p | SPECIES: mm9 |
|
|
(8) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(5) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(27) TESTES |
| ACTTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAATGCCTGCTGGAACTCTTTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAGCTTGCTGGGGGTGAGGGGGCAGGGTAGGGGTAGGGAGCAGGACCGGCACTGGCTGAGGGGTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGCCACGTGTGGACATGTGTCCTGCAGGTTGTACTTTCTCCAGCTGGCCCTATGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGAGCT |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............TAGAATGGAATGGGCACTGCAATGCCTGC................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 2 | 9.00 | 9.00 | - | 4.00 | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - |
| ....GAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACT............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 2 | 9.00 | 9.00 | - | 3.00 | - | - | 1.50 | 2.50 | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGC............................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 6.50 | 6.50 | 3.50 | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
| ....GAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 6.50 | 6.50 | - | 1.50 | 2.00 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGa.......................................................................................................................................................................................................................... | 30 | a | 6.00 | 0.00 | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACT............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 2 | 4.50 | 4.50 | - | 1.50 | 0.50 | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - |
| ...........................................................TTGGAGAGAGAGGCAGCTTGCTGGG...................................................................................................................................................................... | 25 | 3 | 4.00 | 4.00 | 2.67 | 0.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAGC.............................................................................................................................................................................. | 25 | 3 | 3.67 | 3.67 | 2.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCA.............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 3.50 | 3.50 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 3.50 | 3.50 | - | 1.50 | 0.50 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCAC............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCAC............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAAT....................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTG........................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 0.50 | 1.00 | - | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........TGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAA........................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 1.00 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GTTAGAATGGAATGGGCACTGCAATGCCTGC................................................................................................................................................................................................................. | 31 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | 0.50 | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................CTCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCACTG.................................................................................. | 27 | 3 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........TGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAATG...................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGG................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCA......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................TGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGAGC. | 24 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TAGAATGGAATGGGCACTGCAATGCCT................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGC............................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCcacg.................................................................................. | 26 | cacg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............AGAATGGAATGGGCgtaa........................................................................................................................................................................................................................... | 18 | gtaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................TGGAGAGAGAGGCAGCTTGCTGGGt..................................................................................................................................................................... | 25 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAA........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TATGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGAGt. | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGGAATGGGCACTGCAATGCCTGCTGa.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGa.......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCA......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAGt.............................................................................................................................................................................. | 25 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TAGAATGGAATGGGCACTGCAATGCCTGCT................................................................................................................................................................................................................ | 30 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TAGAATGGAATGGGCACTGCAATGC..................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................TGCAATGCCTGCTGGAACTCTTTGG.................................................................................................................................................................................................... | 25 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TATGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGAGg. | 26 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CTTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGC............................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TTTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCA................................................................................................................................................................................ | 25 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | 0.33 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................GACATGTGTCCTGCAag................................................. | 17 | ag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTG........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................TGCAATGCCTGCTGGAACTCTTggt.................................................................................................................................................................................................... | 25 | ggt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TATGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGAGa. | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GTTAGAATGGAATGGGCACTGCgct....................................................................................................................................................................................................................... | 25 | gct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCAC............................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGCCACG...................................................................... | 29 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................CCACGTGTGGACATGTGTCCTGCAGG................................................. | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TTTGGTTCCATTGGAGAGAGAGG.................................................................................................................................................................................. | 23 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................TTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAGC.............................................................................................................................................................................. | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................TCTTTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGC................................................................................................................................................................................. | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TAGGCACTGACCCAGGCCACGTGTGGAC............................................................... | 28 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................TTGGAGAGAGAGGCAGCTTGCTGGGG..................................................................................................................................................................... | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
| ............................................................................................................................................................................................TGTGTCCTGCAGGTTGTACT.......................................... | 20 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACa............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | a | 0.50 | 3.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GTTAGAATGGAATGGGCACT............................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TTGGTTAGAATGGAATGGGCACTG........................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCA.............................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GAGTTGGTTAGAATGGAATGG................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTa........................................................................................................................................................................................................................... | 29 | a | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........GGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAATG...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TTAGAATGGAATGGGCACTGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................ATGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGA... | 23 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................GGGGCAGGGTAGGGGTAGGG............................................................................................................................................ | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TATGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGAGC. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACT............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GTTAGAATGGAATGGGCACTGCAATGC..................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGG................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....AGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GAATGGAATGGGCACTGCAATGC..................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GTTGGTTAGAATGGAATGGG................................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............AATGGAATGGGCACTGCAATGCCTGCT................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..TTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGG................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGAGTTGGTTAGAATGGAATGGG................................................................................................................................................................................................................................ | 23 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........TGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAAT....................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................TTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAGCTT............................................................................................................................................................................ | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................TCCATTGGAGAGAGAGGCAGCTTGCT......................................................................................................................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................AGGCCACGTGTGGACATGTGTCCTGC.................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TCCAGACTTAGGCACTGACCCAGG........................................................................... | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................GTGGACATGTGTCCTGCAGGTTGTACTT......................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAGCTT............................................................................................................................................................................ | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................TTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCA................................................................................................................................................................................ | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGCCA........................................................................ | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGCCACGT..................................................................... | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................GGTTCCTCCAGACTTAGGCACTGACCCAGG........................................................................... | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................CCATTGGAGAGAGAGGCAGCTTGCTGG....................................................................................................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................TCTTTGGTTCCATTGGAGA........................................................................................................................................................................................ | 19 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................TGGACATGTGTCCTGCAGGTTGTACTT......................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................TCCTCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGC.......................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGC.......................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................GGTTCCTCCAGACTTAGGCACTGACCCAG............................................................................ | 29 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGCCAC....................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................TTGGTTCCATTGGAGAGA...................................................................................................................................................................................... | 18 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................TTGGAGAGAGAGGCAGCTTGCTGG....................................................................................................................................................................... | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................GTGGACATGTGTCCTGCAGGTTGTAC........................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................GTTCCATTGGAGAGAGAGGC................................................................................................................................................................................. | 20 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................TTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAG............................................................................................................................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TGCCTGCTGGAACTC......................................................................................................................................................................................................... | 15 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ACTTGAGTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAATGCCTGCTGGAACTCTTTGGTTCCATTGGAGAGAGAGGCAGCTTGCTGGGGGTGAGGGGGCAGGGTAGGGGTAGGGAGCAGGACCGGCACTGGCTGAGGGGTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCACTGACCCAGGCCACGTGTGGACATGTGTCCTGCAGGTTGTACTTTCTCCAGCTGGCCCTATGGCGGAGGCTAGGCCAGCTGAGCT |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .........................................................................................................................................GCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 24 | 3 | 48.67 | 48.67 | 20.00 | 5.67 | 7.67 | 8.33 | 1.33 | 2.67 | - | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | 0.67 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GGTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 28 | 3 | 15.00 | 15.00 | 12.33 | 1.00 | 0.67 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GGGTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 29 | 2 | 9.50 | 9.50 | 9.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................GTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 27 | 3 | 6.00 | 6.00 | 4.67 | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 21 | 3 | 4.00 | 4.00 | 3.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................TGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 25 | 3 | 3.67 | 3.67 | 2.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 23 | 3 | 3.00 | 3.00 | 2.00 | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCAC.................................................................................... | 29 | 3 | 1.67 | 1.67 | 1.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TCCTCAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 22 | 3 | 1.33 | 1.33 | 1.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAG........................................................................................ | 25 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAGG....................................................................................... | 25 | 3 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................GTGTCCTGCAGGTTGTACTTTCTCCA................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................TGTCCTGCAGGTTGTACTTTCTCCA................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAa......................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................TGTGTCCTGCAGGTTGTACTTTCTCCA................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................CAGGTTCCTCCAGACTTA......................................................................................... | 18 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTa.......................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CCTCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCAC.................................................................................... | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAa......................................................................................... | 28 | a | 0.67 | 0.00 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GTTGGTTAGAATGGAATGGGCACTGCAA........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................AGGGGTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGA............................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCACTG.................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................CAATGCCTGCTGGAACTCTTTGGTTCCA............................................................................................................................................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CTCCTCAGGTTCCTCCAGACTTAG........................................................................................ | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GGTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGAC............................................................................................ | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................ACGTGTGGACATGTGTCCTGCAGGTT............................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................GTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGAC............................................................................................ | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................GAACTCTTTGGTTCCATTGGAGAGAGA.................................................................................................................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CCTCAGGTTCCTCCAGACTTAGGCA..................................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................GTTGCTCCTCAGGTTCCTCCAGACT........................................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |