(10)
OTHER.mut
(4)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
GGCGGGGAACTGCAGCACGCTGACCGTGCGGGACCCCAGCGCCACCCTGGGTGAGTGTGGCCGGCAAGGAAGTCCTAGCGTGTCTCCGGGAACCGGCGGGCGGGCTCACGTGGGACGGGGTGGGACTTCCTGAGCGCGGGGCACGCCGGGAAGGGGAGCGCCAGGCGGAAGGTCCGGCCTGGATAGTGTGGCATGAGGATTGCTGGCAAGCGCCTGGGCTTCGCCGTGACTGTGCTGGAACAGGAGAGCA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.....................................................................................................................................................................CGGAAGGTCCGGCCTGGATAGTGTGGCATGAG..................................................... 32 1 10.00 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGTGTGGCATGAGGATTG................................................ 18 1 6.00 6.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGGGCTTCGCCGTGACTGTGCTGGA........... 25 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AGGATTGCTGGCAAGCGC..................................... 18 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TAGCGTGTCTCCGGGAACCGGCGGG...................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GGGCTTCGCCGTGACTGTGCTGGAA.......... 25 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TGACCGTGCGGGACCCCAGCGCCACCC........................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................................................................CTGGATAGTGTGGCATGAG..................................................... 19 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GGATAGTGTGGCATGAGGATTGCTGGC........................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ATGAGGATTGCTGGCAAG........................................ 18 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GCCGGGAAGGGGAGCGCCAGGC.................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................ATAGTGTGGCATGAGGAT.................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGAGGATTGCTGGCAAGCGCCTGGG................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ATGAGGATTGCTGGCAAGCGC..................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGGGCTTCGCCGTGACTGTGCTGGAAC......... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGACTGTGCTGGAACAGGAGAGC. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GTGGCATGAGGATTGCTGGCAAGCGC..................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AGGTCCGGCCTGGATAGgg.............................................................. 19 gg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GGAACTGCAGCACGCTGACCGTGCGGGAC........................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................CCGTGACTGTGCTGGAACAGGAa.... 23 a 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TGACCGTGCGGGACCCCAGCGCCACCCT.......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GGGTGGGACTTCCTGAGCGCGGGGCcc.......................................................................................................... 27 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GGGAACTGCAGCACGCTGACCGTGCGGGACC....................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGAGGATTGCTGGCAAGCGCCTGGGCT.............................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGGCATGAGGATTGCTGG............................................ 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GGATAGTGTGGCATGAGGATTGCTG............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGGCATGAGGATTGCTGGCAAGCGCCT................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCCGTGACTGTGCTGGAACAGGAGAG.. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CGTGACTGTGCTGGAACAGGAGA... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TAGTGTGGCATGAGGATTGCTGGC........................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGAGGATTGCTGGCAAGCGCCTG.................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GGTGGGACTTCCTGAGCGCGGGGC............................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGGCATGAGGATTGCTGGCAAGCGCCTG.................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GGATAGTGTGGCATGAGGATTG................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........................................................................................................................................................................AAGGTCCGGCCTGGATAGTGTGGCA......................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GCATGAGGATTGCTGGCAAG........................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGTGTGGCATGAGGATTGCTGGCAAGCGt..................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTGCTGGCAAGCGCCTGGG................................ 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGCGGAAGGTCCGGCCTGGATAGTGTGG........................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AACTGCAGCACGCTGACCG................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................CCGTGACTGTGCTGGAACAGGA..... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GGATAGTGTGGCATGAGGATTGCTGG............................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GTGGCATGAGGATTGCTGGCAAG........................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGGATAGTGTGGCATGAGGATTGCT.............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GAGGATTGCTGGCAAGC....................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GGGCACGCCGGGAAGGGGAGCGCCAGG..................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GCATGAGGATTGCTGGCAAGCGC..................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................................................................................................................AGGATTGCTGGCAAGCGCCTGGGCTTCGCC......................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CCGGCCTGGATAGTGTGGCATGAG..................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GGGTGGGACTTCCTGAGCGCGGGGCAC.......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................ATTGCTGGCAAGCGCCTG.................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTGCTGGCAAGCGCCTGGGCT.............................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ATGAGGATTGCTGGCAAGCGCCTGGG................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GGATAGTGTGGCATGAGGATTGCTGaa........................................... 27 aa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GGTCCGGCCTGGATAGT............................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................CTGTGCTGGAACAGGAGAGCA 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..........TGCAGCACGCTGACCGTGCGGGACCCCAGt.................................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TCGCCGTGACTGTGCTGGAACAGGAGA... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGTGTGGCATGAGGATTGC............................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGTGTGGCATGAGGATTGCT.............................................. 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GAGGATTGCTGGCAAGCGCCTGGGCT.............................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGTGTGGCATGAGGATTGCTGG............................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GGGCTTCGCCGTGACTGTGCT.............. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GAGGATTGCTGGCAAGCcctg................................... 21 cctg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GAGGATTGCTGGCAAGCG...................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................ATAGTGTGGCATGAGGATTG................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -

Antisense strand
GGCGGGGAACTGCAGCACGCTGACCGTGCGGGACCCCAGCGCCACCCTGGGTGAGTGTGGCCGGCAAGGAAGTCCTAGCGTGTCTCCGGGAACCGGCGGGCGGGCTCACGTGGGACGGGGTGGGACTTCCTGAGCGCGGGGCACGCCGGGAAGGGGAGCGCCAGGCGGAAGGTCCGGCCTGGATAGTGTGGCATGAGGATTGCTGGCAAGCGCCTGGGCTTCGCCGTGACTGTGCTGGAACAGGAGAGCA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.............................GGGACCCCAGCGCCACCCT.......................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CAAGGAAGTCCTAGCGTGTCTCCGGGA............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GGCCGGCAAGGAAGTCCT.............................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CAGCACGCTGACCGTGCGGGACCCCA.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GCAAGGAAGTCCTAGCGTGTCTCCGGGA............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GCCGGCAAGGAAGTCCTAGCGTGTC...................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GCAGCACGCTGACCGTGCGGGACCCCA.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GCCGGCAAGGAAGTCCTA............................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GGACCCCAGCGCCACCCT.......................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GCAAGGAAGTCCTAGCGTGTCTCCG.................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........................................................................CCTAGCGTGTCTCCGGGAAC............................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -