(10)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(38)
TESTES

Sense strand
TTAAGGATCAGATCTATGAGATTTTCCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGTAAAGTTTATTTCTTCTATTTATTTGGGGTTAGGTTTCATGCAGGTACAGTTACAATAAAACTGAAGTGTTCTATTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAGCATTTGATACATTACTATCTCTGCCTAGCTCTACCATACTAAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTTTCCCGTCTAGCATTTGCTAAAAAGATTATACAAACTAAACAGATAAAGACAAGCATTTTATTTTTTAAAGGTTGTGTTGCTTTCTGCCACAATGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGACCAA
....................................................................................((((...(((((...((..((((((.(((......))).))))))..))...)))))...)))).(((((.((.......(((((((((((..........))).))))))))......)).))))).............................................................................................................................
...................................................................................84......................................................................................................................................220..................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
........................................................................................CATGCAGGTACAGTTACAATAA.................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 9.00 9.00 - - - - - - 5.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................AGCTCTACCATACTAAGGC................................................................................................................................................ 19 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 25 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................................................ACATTACTATCTCTGCCTAGCT............................................................................................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................AGCTCTACCATACTAAGGCAG.............................................................................................................................................. 21 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CTTGGTTTCAAACATTTT....................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 17 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ATCTCTGCCTAGCTCTACCATACTAAG.................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTCTATTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAGC............................................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GAAATTAAATACAAGCATTCAGGTtg.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tg 3.00 0.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GCTCTACCATACTAAGGC................................................................................................................................................ 18 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCTGCCTAGCTCTACCATACTAAGGC................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATGCAGGTACAGTTACAATAA.................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................................................................................................AAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGACC.. 26 2 2.50 2.50 - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
..........................................................................................................................................................................................TAAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................ATTACTATCTCTGCCTAGCTCTACCATACTAAGGCA............................................................................................................................................... 36 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GCTCTACCATACTAAGGCAGAGACGCTTGGT................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TTTGATACATTACTATCTCTGCCTAGC................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CATGCAGGTACAGTTACAATAAAACTGAA........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................AGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGATACATTACTATCTCTGCCTAGCTCTACCATACT..................................................................................................................................................... 36 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CATGCAGGTACAGTTACAATAAAA................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TATCTCTGCCTAGCTCTACCATACTAAG.................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................CATACTAAGGCAGAGACGCT....................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CTAGCTCTACCATACTAAGGCAG.............................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATGCAGGTACAGTTACAATAAAACTGAA........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AAAACTGAAGTGTTCTATTGTCGTT........................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................AGTGTTCTATTGTCGTTCCCCCTGCTTA................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGAC... 25 2 1.50 1.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTCTGCCACAATGCCAACTGATGT............... 28 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50
.............................................................................................................................TTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAGCATTTGATA.................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACTGATGTGCTAGAAGT...... 18 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGATCAGATCTATGAGATTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................................................CATGCAGGTACAGTTACAATAAAACT.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............ATGAGATTTTCCAGAAATTAAATACAAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GCTCTACCATACTAAGGCAGA............................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CATGCAGGTACAGTTACAATAAA................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGACCAA 28 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................CATACTAAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................ATAAAACTGAAGTGTTCTATTGTCGT............................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................TTCCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTCCAGAAATTAAATACAAGCATTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CTCTGCCTAGCTCTACCATACT..................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGATCAGATCTATGAGATTTTCCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................AAGACAAGCATTTTATTTTTTAAA................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................GTCGTTCCCCCTGCTTAAA.............................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TATTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAGCATT......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................CCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CCTAGCTCTACCATACTAAGGCAGAGACGCT....................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATGCAGGTACAGTTACAATAAAACTGAAG.......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CCATACTAAGGCAGAGAC.......................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................ATACATTACTATCTCTGCCTAGC................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TATTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAGCA........................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TACTAAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAAGGATCAGATCTATGAGATTTTCCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TAAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTTT....................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ATCTCTGCCTAGCTCTACCATACTA.................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GAAGTGTTCTATTGTCGTT........................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CCATACTAAGGCAGAGACGCTT...................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGAGATTTTCCAGAAATTAAATACAAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................TTCCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................AGAGACGCTTGGTTTCAAACATTTT....................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTCCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGat........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 at 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGTt........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................ATTAAATACAAGCATTCAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................AGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................AGCTCTACCATACTAAGGCAGA............................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGTt........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CATGCAGGTACAGTTACAATAAAAC............................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................ATGCAGGTACAGTTACAATAAA................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................AAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTTT....................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GATACATTACTATCTCTGCCTAGCTCTACCATAC...................................................................................................................................................... 34 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TACATTACTATCTCTGCCTAG................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TTGATACATTACTATCTCTGCCTAGC................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CTAAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTATTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAGCATTTGAT..................................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ATCTCTGCCTAGCTCTACC.......................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAATGCCAACTGATGTGCTAGAAGT...... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGACC.. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTGCCACAATGCCAACTGATGTGCTA........... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTCTGCCTAGCTCTACC.......................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TACTATCTCTGCCTAGCTCT............................................................................................................................................................. 20 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGACC.. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAAATACAAGCATTCAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATGCCAACTGATGTGCTAGAAGTG..... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CTCTGCCTAGCTCTACCATA....................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTCTGCCACAATGCCAACTGA.................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGATGTGCTAGAAGTGACCA. 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGACCAAt 29 t 0.50 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCTGCCTAGCTCTACC.......................................................................................................................................................... 16 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTGGTTTCAAACATTT........................................................................................................................ 16 8 0.12 0.12 - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTAAGGATCAGATCTATGAGATTTTCCAGAAATTAAATACAAGCATTCAGGTAAAGTTTATTTCTTCTATTTATTTGGGGTTAGGTTTCATGCAGGTACAGTTACAATAAAACTGAAGTGTTCTATTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAGCATTTGATACATTACTATCTCTGCCTAGCTCTACCATACTAAGGCAGAGACGCTTGGTTTCAAACATTTTCCCGTCTAGCATTTGCTAAAAAGATTATACAAACTAAACAGATAAAGACAAGCATTTTATTTTTTAAAGGTTGTGTTGCTTTCTGCCACAATGCCAACTGATGTGCTAGAAGTGACCAA
....................................................................................((((...(((((...((..((((((.(((......))).))))))..))...)))))...)))).(((((.((.......(((((((((((..........))).))))))))......)).))))).............................................................................................................................
...................................................................................84......................................................................................................................................220..................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
.....................................................................................................................................................................................................CGCTTGGTTTCAAACATTTTCCCGTCTA............................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTCTGCCACAATGCCAACT.................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -