| Gene: Tmem41a | ID: uc007yrs.1_intron_3_0_chr16_21946228_r.3p | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(4) OTHER.mut |
(3) OVARY |
(6) PIWI.ip |
(1) PIWI.mut |
(25) TESTES |
| AGGGTGCCAGCCCAGGGCACTTGTTCCCACTCCAGGGCTCTCCTGTCTGCCTCTGTTGTTTTATCTTGGGTCAGCTGTCATCTTGAGTTCTTTCAATGTCTGGTGGCCAGATGACCTGTTTACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGACACACTTCGAACTTTCTCTGGAACCCACGCCTCCACCTGATTTCCCAAACTCTAGGTCGCTGTGGTTCCCCTCCGATCTGGCAGAGCTGCGGGAGCTCTCTGAAG ............................................................................................................................................((((.....))))................................................................................................. ...................................................................................................................116..............................................165................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ........................................................................................................................TACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGACA....................................................................................................... | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TTACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGAC........................................................................................................ | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TAACTCTGCAAGGAAGACACACTTCGAAC............................................................................................. | 29 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TTAACTCTGCAAGGAAGACACACTTC................................................................................................. | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................ACTTAACTCTGCAAGGAAGACACACT................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................TACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGAC........................................................................................................ | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TTACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGACA....................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................TGATTTCCCAAACTCTAGGTCGCTGTG......................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................................TAACTCTGCAAGGAAGACACACTTCGAA.............................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TTACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGACAgact................................................................................................... | 32 | gact | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TGTTTACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGAC........................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................................................................CCTGTTTACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGAC........................................................................................................ | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................................................................................AGACACACTTCGAACgca.......................................................................................... | 18 | gca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TAACTCTGCAAGGAAGACACACTTCG................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................CGCCTCCACCTGATTTCCCAAACTCTA................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TAACTCTGCAAGGAAGACACACTTCGA............................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................TAGGTCGCTGTGGTTCCCCTCCGATC........................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TCCGATCTGGCAGAGCTGCGGGAGCT........ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................TACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGACAC...................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TCTTGAGTTCTTTCAATGTCTGGTGGCC.............................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| AGGGTGCCAGCCCAGGGCACTTGTTCCCACTCCAGGGCTCTCCTGTCTGCCTCTGTTGTTTTATCTTGGGTCAGCTGTCATCTTGAGTTCTTTCAATGTCTGGTGGCCAGATGACCTGTTTACAAACTTAACTCTGCAAGGAAGACACACTTCGAACTTTCTCTGGAACCCACGCCTCCACCTGATTTCCCAAACTCTAGGTCGCTGTGGTTCCCCTCCGATCTGGCAGAGCTGCGGGAGCTCTCTGAAG ............................................................................................................................................((((.....))))................................................................................................. ...................................................................................................................116..............................................165................................................................................... |
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| .................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCtaat....................................................................... | 18 | taat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCAtatt...................................................................... | 18 | tatt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCACgc..................................................................... | 18 | gc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCAtat...................................................................... | 17 | tat | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCAtcc...................................................................... | 17 | tcc | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................ACCCACGCCTCCACctta..................................................................... | 18 | ctta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ...................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCAgtt...................................................................... | 17 | gtt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCAacag...................................................................... | 18 | acag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCgga....................................................................... | 17 | gga | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCAaaaa...................................................................... | 18 | aaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCAC..................................................................... | 15 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCACat..................................................................... | 17 | at | 0.67 | 0.00 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCACtttt..................................................................... | 19 | tttt | 0.67 | 0.00 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCACttt..................................................................... | 18 | ttt | 0.33 | 0.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCACtta..................................................................... | 18 | tta | 0.33 | 0.00 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCACta..................................................................... | 17 | ta | 0.33 | 0.00 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................AACCCACGCCTCCACg..................................................................... | 16 | g | 0.33 | 0.00 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCA...................................................................... | 15 | 16 | 0.19 | 0.19 | - | 0.06 | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAgaaa...................................................................... | 19 | gaaa | 0.19 | 0.00 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAgcat...................................................................... | 19 | gcat | 0.12 | 0.00 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAggat...................................................................... | 19 | ggat | 0.12 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAt...................................................................... | 16 | t | 0.12 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAgtat...................................................................... | 19 | gtat | 0.12 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAgga...................................................................... | 18 | gga | 0.12 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAgcc...................................................................... | 18 | gcc | 0.06 | 0.00 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAattg...................................................................... | 19 | attg | 0.06 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAgccg...................................................................... | 19 | gccg | 0.06 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................GAACCCACGCCTCCAgtt...................................................................... | 18 | gtt | 0.06 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |