| Gene: Psmd2 | ID: uc007yqq.1_intron_5_0_chr16_20655485_f | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(1) OTHER.ip |
(4) OTHER.mut |
(7) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(32) TESTES |
| CTCAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTTCCTGCAAAGATGTGTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAAGATGAGTCTGTGTATGTGCTTTGTGTAAAAATCAGAGACGTAGCAGTTTCTGATGCGACACAGAGGCTTTTCTGTCTCATAGTGGCTAAGAGTGAGCAGGTGTGACCGCTTCCCCCACAGGGTGGTCCAGAAGCAGATGGCATTCATGCTGGGTCGGCATGGAGTGTTCC .....................................................(((.((....)).)))...............((((.(((((.(((((.........))))))))))))))............................................................................................................................ ..................................................51........................................................................125........................................................................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAA........................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 25.00 | 25.00 | 8.00 | 3.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGACA........................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 25.00 | 25.00 | 8.50 | 8.50 | 5.00 | - | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTC...................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 20.00 | 20.00 | 4.00 | 3.00 | 3.50 | 1.50 | 1.50 | 2.50 | - | - | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGACAT.......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 19.50 | 19.50 | 5.00 | 3.50 | 5.50 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAGACATT......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 14.50 | 14.50 | 2.00 | 2.00 | 4.00 | 0.50 | 1.50 | 2.50 | 0.50 | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATT......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 14.00 | 14.00 | 4.50 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 2.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAA.......................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 10.00 | 10.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAGAC............................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 2 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 4.00 | 2.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAGACAT.......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 6.00 | 6.00 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | 1.00 | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........TGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTTC................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 2 | 5.00 | 5.00 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | 1.00 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................AGATGGCATTCATGCTGGGTCGGCAT.......... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGAC............................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 2 | 4.50 | 4.50 | 0.50 | - | 1.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAtt............................................................................................................................................................................................................................. | 17 | tt | 3.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTT....................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 3.00 | 3.00 | 1.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................AGATGGCATTCATGCTGGGTCGGCA........... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAAG......................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGAAGACA........................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................AGATGGCATTCATGCTGGGTCGGC............ | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGA............................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAttca........................................................................................................................................................................................................................... | 19 | ttca | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAGACATTTTC...................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CATGGAACTGGTAGAAGACATT......................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAAG......................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TCAATGACATGGAACTGGTAGAAGACA........................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGAAGAC............................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGAC............................................................................................................................................................................................................................ | 23 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......ACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCAC.................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 1.50 | 1.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGACATT......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......ACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTC...................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAGAC............................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTC...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGACA........................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........TGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTTCC................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - |
| .......ACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACT................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGAAGA............................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACA........................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGACAT.......................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAAGt........................................................................................................................................................................ | 29 | t | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CATAGTGGCTAAGAattt........................................................................... | 18 | attt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACATT......................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAttc............................................................................................................................................................................................................................ | 18 | ttc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................GATGTGTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGG............................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAtt......................................................................................................................................................................... | 28 | tt | 1.00 | 25.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGAC............................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAAt......................................................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 10.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................TGGGTCGGCATGGAGTGTTCC | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGTGCTTTGTGTAAAAATCAGAGACGTAGC.............................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACATcttc...................................................................................................................................................................................................................... | 28 | cttc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................TGTGTAAAAATCAGAGACGTAGCAGTTT......................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGA................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGG.................................................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAA.......................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TCAATGACATGGAACTGGTAGAAGACAT.......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TCAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATT......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCA.................................................................................................................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTC...................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................TGTAAAAATCAGAGACGTAGCAGTTT......................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACT................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 2 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAt.......................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 25.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........TGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTT.................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCA..................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTT....................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAG................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAGACA........................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAGACATaa........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | aa | 0.50 | 6.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTT.................................................................................................................................................................................................................. | 32 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TCAATGACATGGAACTGGTAGAAGAC............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTT....................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TCAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATa......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | a | 0.50 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTC...................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TGGTAGAAGACATTTTCACTTCCTGC............................................................................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........GGAACTGGTAGAAGACATTTT....................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............GAACTGGTAGAAGACATTTT....................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TGACATGGAACTGGTAGAAGA............................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TCAATGACATGGAACTGGTA.................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTT.................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAGACAa.......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........GGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTTCC................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTA.................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTT.................................................................................................................................................................................................................. | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....ATGACATGGAACTGGTAGAAGA............................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........GGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTTCCTGC............................................................................................................................................................................................................. | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......ACATGGAACTGGTAGAAGA............................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........TGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTTCCT............................................................................................................................................................................................................... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................GGTAGAAGACATTTTCACTTCCTGC............................................................................................................................................................................................................. | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAGACA........................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AATGACATGGAACTGGTAGAAG.............................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAATGACATGGAACTGGTAGAAGA............................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCA..................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........GGAACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............AACTGGTAGAAGACATTT........................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| .........ATGGAACTGGTAGAAGA............................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GACATGGAACTGGTAGA................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
| CTCAATGACATGGAACTGGTAGAAGACATTTTCACTTCCTGCAAAGATGTGTATGTAGAGAAATTGGCAAAAGGAAAGATGAGTCTGTGTATGTGCTTTGTGTAAAAATCAGAGACGTAGCAGTTTCTGATGCGACACAGAGGCTTTTCTGTCTCATAGTGGCTAAGAGTGAGCAGGTGTGACCGCTTCCCCCACAGGGTGGTCCAGAAGCAGATGGCATTCATGCTGGGTCGGCATGGAGTGTTCC .....................................................(((.((....)).)))...............((((.(((((.(((((.........))))))))))))))............................................................................................................................ ..................................................51........................................................................125........................................................................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|