chr15:102035265 102035709 +
(1)
OTHER.ip 		(9)
OTHER.mut 		(7)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(45)
TESTES

Sense strand
GAACTTCTGAACTTTTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGTAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAAGACCGTTCACTGGGAAGCCTCTTTGCAGTGTCACCCTTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCACAGCCCCTGCCTTCAGGGAGCTTCCAGTCAAATGAAGGAGGTAGGCTATATATCACGTCACAGGCACTGATGGGCCATTGGCAAAGCACCTTGTACCCGGTGTACTTTTGGTACGTGAAGTACTCGGGCATAAGGGAGTGTATAGTCTGGTGAATGCTTCATTTGTTTTTTTTTCCCAACAGGAATTTTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTGTGTTTGGAATACAA
................................................................................................................................................................(((........)))(((((.(((((.(((....(((((..(((.....(((....)))))).)))))..))).)))))..................((((...(((((.((.....))..))))))))).)))))......................................................................................................................................................
...............................................................................................................................................................160.....................................................................................................................................296...................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 386.00 386.00 139.00 138.00 44.00 44.00 13.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATT............... 27 1 314.00 314.00 103.00 92.00 55.00 54.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 205.00 205.00 87.00 56.00 22.00 23.00 9.00 - - 3.00 - - 2.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCAT................ 26 1 146.00 146.00 40.00 41.00 23.00 33.00 1.00 - - 2.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 119.00 119.00 28.00 39.00 18.00 16.00 16.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCAT................ 28 1 98.00 98.00 32.00 22.00 17.00 17.00 1.00 - - 1.00 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 73.00 73.00 17.00 25.00 7.00 4.00 3.00 - - - 4.00 2.00 1.00 - - 6.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTA............................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 48.00 48.00 13.00 15.00 5.00 6.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 44.00 44.00 22.00 10.00 8.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 43.00 43.00 15.00 9.00 4.00 5.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATT............... 29 1 36.00 36.00 9.00 12.00 6.00 5.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCA................. 27 1 27.00 27.00 11.00 5.00 1.00 3.00 - - - 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATT............... 26 1 23.00 23.00 8.00 5.00 6.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 20.00 20.00 6.00 6.00 5.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATCT................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 16.00 16.00 3.00 1.00 1.00 2.00 4.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 15.00 15.00 3.00 5.00 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 15.00 15.00 - - - - - 7.00 7.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 14.00 14.00 - - - - - 4.00 9.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACCATC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 12.00 12.00 - - - - - 3.00 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 2.00 2.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TATTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGCT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 11.00 11.00 1.00 6.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTG.............. 28 1 10.00 10.00 4.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACCAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 10.00 10.00 - - - - - 4.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..............................................................................................................................TAGCCAACAGTATTGACCATCCCCAGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 4.00 - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 7.00 7.00 3.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAG.............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 c 7.00 11.00 - 2.00 1.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 1.00 2.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTG.............. 27 1 6.00 6.00 2.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGG................... 28 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATa............... 27 a 5.00 146.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGC.................. 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - 1.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCAC....................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCAT................ 27 1 4.00 4.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAGA............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TATCACGTCACAGGCACTGATGGGCCATT......................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGG................... 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTGT............. 28 1 4.00 4.00 - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATT............... 28 1 3.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGC.................. 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCC......................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 3.00 73.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAAGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TATTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGCTC......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTGT............. 29 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAt.............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 3.00 48.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAG.............................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCAGG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTTGCAGTGTCACCCTTGAATTCTGCCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCAT................ 29 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................................................................................................................................TCTGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATC................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTCCTGTTACATGCACGGCA................. 24 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TTTTTGGGTTCGTTAAGTGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAGCCAACAGTATTGACCATCCCCAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGGAAGGAAAGGAGACAGGCCACAGCCCC................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCTTCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCA........................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGC.................. 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CAGTGTCACCCTTGAATTCTGCCTTAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TTCAGGGAGCTTCCAGTCAAATGAAGGA................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TTCAAGACCGTTCACTGGGAAGCCTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 aa 2.00 11.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAGAGG........................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGCCTTCAGGGAGCTTCCAGTCAAAT....................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TCCTTCAAGACCGTTCACTGGGAAGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAGAG............................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGG................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................CTCAGGTAAAAAGCTCTCGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCA................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGaat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 aat 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAGAGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAGCCAACAGTATTGACCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................................................................................................................GTGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCC............................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CGAGCTCTGTATTAAGCGCCAGGGGG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGTTCGTTAAGTGAGAAGTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CGTTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TTAGCCAACAGTATTGACCATCCCCAGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCCCCAGTGAGCCGAGCTCTGTATTAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGataa...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ataa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CATGGCTCAGGTAAAAAGCTCTCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAACTTTTTGGGTTCGTTAAGTGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGACCATCCCCAGTGAGCCGAGCTCTGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCACA...................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCCCCAGTGAGCCGAGCTCTGTATTAAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGAacat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 acat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCA................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGCCTTAGCCAACAGTATTGACCATCCC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGCCTTCAGGGAGCTTCCAGTCAAA........................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCgt................ 26 gt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACCATt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 10.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGTACTCGGGCATAAGGGAGTGT........................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTt............................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 16.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................CTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCAtt...................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................ATCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGG........................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................AAGGAAAGGAGACAGGCCACAGCCCCa................................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACATGCACGGCATTGTGTTTGGAAT.... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCAC....................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCAGt......................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTACATGCACGGCATTGTGTTTGGAA..... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................CTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCAC....................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATTAAGCGCCAGGGGGAGctct................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ctct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGcc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cc 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 386.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TTCAGGGAGCTTCCAGTCAAATGAAGGAc................................................................................................................................................................................................ 29 c 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ACTTTTTGGGTTCGTTAAGTGAta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TTAGCCAACAGTATTGACCATCCCCc...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCA........................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TATATCACGTCACAGGCACTGATGGGC............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGt.................. 26 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGg......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 11.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGcaa....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 caa 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGTAA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................AAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAAGACCGTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGCCTTCAGGGAGCTTCCAGTCAAATG...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAGCCAACAGTATTGACCATCCCaagt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATAGTCTGGTGAATGCTTCATTTGTTT................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GTATTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTACATGCACGGCATTGTGTTTGGAAT.... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGGAGTGTATAGTCTGGTGAATG............................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTa.............. 28 a 1.00 314.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATgg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 gg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................GGAGATCTAGAGGAAGGAAAGGAGA............................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CCGAGCTCTGTATTAAGCGCCAGGGG....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCCCCAGTGAGCCGAGCTCTGTATTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................AGTCCTCCTTCAAGACCGTTCACTGGGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTaagc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aagc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCtgca................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tgca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCAt....................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CACCCTTGAATTCTGCCTTAGCCAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCAGG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGCT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAGGTAGGCTATATATCACGTCA............................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tt 1.00 43.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAGGTAGGCTATATATCACGTC............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................GATCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAG............................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GCATGGCTCAGGTAAAAAGCTCTCGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGtat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 tat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAAAAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCACAGCC................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................AAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAAGACCGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTGGGTTCGTTAAGTGAGAA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTGTGT........... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGCTC......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TATCACGTCACAGGCACTGATGGGCC............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................AGAAGTCAGCATGGCTCAGGTAAAAAGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCCCCAGTGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCG.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAGAGGt.......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................GTCAAATGAAGGAGGTAGGCTATATAT................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AAAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAAGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCTCCTGTTACATGCACGGCAT................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CAGTGTCACCCTTGAATTCTGCCTTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GTGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCA........................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CAAGACCGTTCACTGGGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTTTTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGCCTTAGCCAACAGTATTGACCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................AGATCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAG............................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TTTTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGga................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATTAAGCGCCAGGGGG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGaa................. 27 aa 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATa............... 29 a 1.00 98.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................AGATCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGG........................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGTGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGC............................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGAGGTAGGCTATATATCACGTC............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 15.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGAGCTCCTGTTACATGCACGG................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AGGAAGGAAAGGAGACAGGCCACAGCCCCT................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCGGGCATAAGGGA............................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................ATCTAGAGGAAGGAA..................................................................................................................................................................................................................................................... 15 11 0.18 0.18 - - - - - - - - 0.09 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAACTTCTGAACTTTTTGGGTTCGTTAAGTGAGAAGTCAGCATGGCTCAGGTAAAAAGCTCTCGAGTCCTCCTTCAAGACCGTTCACTGGGAAGCCTCTTTGCAGTGTCACCCTTGAATTCTGCCTTAGCCAACAGTATTGACCATCCCCAGTGAGCCGAGCTCTGTATTAAGCGCCAGGGGGAGATCTAGAGGAAGGAAAGGAGACAGGCCACAGCCCCTGCCTTCAGGGAGCTTCCAGTCAAATGAAGGAGGTAGGCTATATATCACGTCACAGGCACTGATGGGCCATTGGCAAAGCACCTTGTACCCGGTGTACTTTTGGTACGTGAAGTACTCGGGCATAAGGGAGTGTATAGTCTGGTGAATGCTTCATTTGTTTTTTTTTCCCAACAGGAATTTTATTGAGCTCCTGTTACATGCACGGCATTGTGTTTGGAATACAA
................................................................................................................................................................(((........)))(((((.(((((.(((....(((((..(((.....(((....)))))).)))))..))).)))))..................((((...(((((.((.....))..))))))))).)))))......................................................................................................................................................
...............................................................................................................................................................160.....................................................................................................................................296...................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.............................................................................................................................................................................................................ACAGGCCACAGCCCCTGCCT............................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................AGCTTCCAGTCAAAT....................................................................................................................................................................................................... 15 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -