chr15:80080521 80080770 +
(1)
OTHER.ip 		(9)
OTHER.mut 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(48)
TESTES

Sense strand
CTCTACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGGGCAGGTAAAGGCCCAGTCTCTCCGTTAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGGTGCCTCACAGGGTCCCTAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGTAATTGTCCTGGTCACTTCATGCTGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACCCACCCCTATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACTTGCCGCCTTACTCTAGGCTGAG
...................................................................((((..((((((...(((.((.(((..((.((((....))))))))).)))))...))))))...((....((((((.((((........)))).))...)))).))..))))......................................................................
..................................................................67......................................................................................................................187.............................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTT................................................................... 26 1 109.00 109.00 30.00 32.00 11.00 5.00 3.00 9.00 1.00 4.00 6.00 2.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCC............................................................... 27 1 37.00 37.00 15.00 11.00 2.00 3.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTA.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 29.00 29.00 10.00 6.00 2.00 3.00 3.00 - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCC.......................... 28 1 29.00 29.00 10.00 6.00 2.00 - - 3.00 - 2.00 - - 2.00 - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTT.................................................................... 25 1 22.00 22.00 6.00 1.00 1.00 3.00 3.00 1.00 - - 4.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGC........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 22.00 22.00 11.00 8.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCC................................................................ 26 1 15.00 15.00 3.00 5.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................... 26 1 14.00 14.00 3.00 5.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCC......................... 29 1 14.00 14.00 3.00 4.00 - 2.00 - - - - - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCT.......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 14.00 14.00 4.00 5.00 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTG...................................................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 4.00 5.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTG......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 3.00 2.00 3.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGGT......................................................................................................................................................... 26 1 12.00 12.00 1.00 4.00 - - 1.00 - 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCC......................... 27 1 11.00 11.00 3.00 6.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGC........................................................................................................................................................................................................................... 25 1 11.00 11.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TTCATGCTGATGAGATTGACGTCCCT.......................................................................... 26 1 9.00 9.00 2.00 1.00 - - - 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCA........................ 30 1 7.00 7.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCAC............................................................. 29 1 7.00 7.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCC........................... 27 1 7.00 7.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACT...................... 28 1 6.00 6.00 2.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGCTGCAGACGTAGGGCAGGTAAAGG................................................................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACTT..................... 27 1 6.00 6.00 2.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTG............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGGTG........................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 - - - - - 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGCTGATGAGATTGACGTCCCTGCGG...................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 1.00 - - 2.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGC........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 6.00 6.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTT.................................................................... 26 1 5.00 5.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCC............................................................... 30 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCA........................ 28 1 5.00 5.00 1.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACC............................................................ 30 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACC............................................................ 28 1 5.00 5.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGA.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 - - 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGAC................................................................................................................................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 1.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGA.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGG.............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGt.................................................................................................................................................................................................................. 27 t 4.00 4.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGTAATT............................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAG................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTC.................................................................. 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGG.......................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGCTGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTT.................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCT....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGCTGATGAGATTGACGTCCCTGCG....................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCAC....................... 28 1 3.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCAC....................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCATGCTGATGAGATTGACGTCCCTGC........................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGGG........................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTa.................................................................. 27 a 3.00 109.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTt.............................................................................................................................................................................................................. 27 t 3.00 14.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGAAACACTTGGCTACGTGGctgg.......................................................................................................................................................... 25 ctgg 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CATGCTGATGAGATTGACGTCCCTGC........................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACG................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............TCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACt................................................................................................................................................................................................................ 27 t 2.00 5.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TCCTGTTTTGCTGGTAATTGTCCTGGT....................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAG................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAAGGCCCAGTCTCTCCGTTAGAAAC............................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCAC....................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCC............................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGTGCTGCTGCAGACGTAGGGCAG........................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTG...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TGGTAATTGTCCTGGTCACTTCATGC............................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGT............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGga.............................................................................................................................................................................................................. 27 ga 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGGTGCC...................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TCCTGTTTTGCTGGTAATTGTCCTGGTC...................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....ACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGt........................................................................................................................................................................................................................... 27 t 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................ATGCTGATGAGATTGACGTCCCTGC........................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGC..................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGCTGATGAGATTGACGTCCCTGCGGT..................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGCTGATGAGATTGACGTCCCTGC........................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGAC................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGCTACGTGGTTGGTGCCTCACAGG............................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCAC............................................................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCACTTCATGCTGATGAGATTGACGTC............................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACT...................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAt............................................................................................................................................................................................................. 28 t 2.00 29.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACT...................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGt............................................................................................................................................................................................................ 29 t 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGC........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTTTTGCTGGTAATTGTCCTGGTCACT................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCA.................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCT....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGG............................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCCTAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGT................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCACTTCATGCTGATGAGATTGACGTCC............................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCCTAGGTGCCTCCggg............................................................................................................................ 17 ggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGAagg............................................................................................................................................................................................................... 28 agg 1.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAG............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AGTCTCTCCGTTAGAAACACTTGGCT.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCATGCTGATGAGATTGACGT.............................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCa....................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCACTTCATGCTGATGAGATTGACGT.............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TCCCTAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGG.................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGAagta.............................................................................................................................................................................................................. 27 agta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCC.......................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAa............................................................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGTAAT................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACCCA.......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCTACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAG............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TCTCCGTTAGAAACACTTGGCTACGTGc.............................................................................................................................................................. 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGAaaaa.............................................................................................................................................................................................................. 27 aaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TCTCTCCGTTAGAAACACTTGGCTAC.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGCCTCCTGTTTTGCTGGTAATTGTCCT.......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCcccc.......................... 28 cccc 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTat................................................................... 26 at 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................................................................TAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGTAA................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GATGAGATTGACGTCCCTGCGGTT.................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...............................TGCTGCAGACGTAGGGCAGGTAAAGGCCCA............................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCC................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAa............................................................................................................................................................................................................. 28 a 1.00 29.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGAC................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCT....................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTT................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGa........................................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGGGC.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCC................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGGggc....................................................................................................................................................... 28 ggc 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCA.............................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GTCTCTCCGTTAGAAACACTTGGCTA................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGaa........................................................................................................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................ATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCC................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTa............................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CCAGTCTCTCCGTTAGAAACACTTGGC..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TTGTCCTGGTCACTTCATGCTGATGAGATT................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTG......................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................................ATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCt............................................................... 28 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................ACACTTGGCTACGTGGTTGG.......................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGt........................................................................................................................................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGTA.................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGCAGACGTAGGGCAGGTAAAGGCCCA............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TTGTCCTGGTCACTTCATGCTGATGAG...................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGC.............................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CATGCTGATGAGATTGACGTCCCTtc........................................................................ 26 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................ACTTGGCTACGTGGTTGGTGCCTCA................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TCCCTAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGT................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTTTTGCTGGTAATTGTCCTGGTt...................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGggc........................................................................................................................................................................................................................... 25 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CGTGGTTGGTGCCTCACAGGGTCCCTA........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACt............................................................ 30 t 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GAGATTGACGTCCCTGCGGTTT................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................................................................................................................................................................GATTGACGTCCCTGCGGTTT................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGT..................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................TGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGG............................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACTT..................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGcgc........................................................................................................................................................................................................................... 28 cgc 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TTGTCCTGGTCACTTCATGCTGATGcg...................................................................................... 27 cg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGcttt................................................................... 26 cttt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TGGTAATTGTCCTGGTCACTTCATGCT............................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCtc.......................... 28 tc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACC............................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAGATTGACGTCCCTGCGGTTT................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACG................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTG...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GAAACACTTGGCTACGTGGTTGGTGCCTC.................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACCC........................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTGTTTTGCTGGTAATTGTCCTGGTC...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCAC............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGCAGACGTAGGGCAGGTAAAGGCCCAt............................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAt................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGGTGCCT..................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CTGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTT................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACTTCATGCTGATGAGATTGACGTC............................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTt.................................................................. 27 t 1.00 109.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CCGTTAGAAACACTTGGCTACGTGG.............................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGTAATTG.............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................ATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACCC........................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTa................................................................... 26 a 1.00 22.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGTGCTGCTGCAGACGT............................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TTGTCCTGGTCACTTCATGCTGATGAGAT.................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCC......................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGCTGATGAGATTGACGTCCCTGCGt...................................................................... 26 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGCTGGTAATTGTCCTGGTCACTTCAT............................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGCTGCAGACGTAGGGCAGGTAAAGac................................................................................................................................................................................................ 27 ac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACT...................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAa................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTTCATGCTGATGAGATTGACGTCCCcgc........................................................................ 29 cgc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCA.................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACCC........................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACT...................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GAAACACTTGGCTACGTGGTTGGT......................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TAGGTGCCTCCTGTTTTG........................................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCTACTGCTCGCTGTCTGAGCCGGAGGTGCTGCTGCAGACGTAGGGCAGGTAAAGGCCCAGTCTCTCCGTTAGAAACACTTGGCTACGTGGTTGGTGCCTCACAGGGTCCCTAGGTGCCTCCTGTTTTGCTGGTAATTGTCCTGGTCACTTCATGCTGATGAGATTGACGTCCCTGCGGTTTCCCCACCCACCCCTATTTTTGTAACCAAGCACTGTGCTCCCCACTTGCCGCCTTACTCTAGGCTGAG
...................................................................((((..((((((...(((.((.(((..((.((((....))))))))).)))))...))))))...((....((((((.((((........)))).))...)))).))..))))......................................................................
..................................................................67......................................................................................................................187.............................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
......................................................................................................................................................................................TCCCCACCCACCCCTATTTTTGTA............................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................GGGCAGGTAAAGGCCCAGTCTCTCCGTTAGA............................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTAAAGGCCCAGTCTCTCCGTTA................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -