| Gene: Rpl3 | ID: uc007wvb.1_intron_3_0_chr15_79909239_r.3p | SPECIES: mm9 |
![]() |
|
(5) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(8) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(35) TESTES |
| TTACCTTTGTCCCAAGTTCTAGAACAGAGTTCCAGCAAATAGTGTTTTAATCTGGCCCATTACATGGGAAAACACAATTATAGACCTCCCACTTTATGCTGATTTGGGTAACAGGCCAGTCACTGACATTCAGGGTTTCTACCTGACTTTGGATGCTGGTTCTCAGGACTGACTTCTCAGTTGTTGACTCTCATGTGCAGATTTACAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATCAAGGATGGCAAACTGATCAA |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
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| .............................................................................................................................................................................................................................TACCTCATCAAGGATGGCAAACTGATCAA | 29 | 7 | 1.71 | 1.71 | - | 0.29 | 0.57 | 0.43 | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................AAGATTGGTCAAGGCTACCTCcta.................... | 24 | cta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGGCAAACTGATCAAgaaa | 26 | gaaa | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................CCTCATCAAGGATGGCAAACTGATa.. | 25 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GATTTACAAGATTGGTCAAGGCTACCac....................... | 28 | ac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................ACCTCATCAAGGATGGCAAACTGATa.. | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................CCATTACATGGGAAActga............................................................................................................................................................................... | 19 | ctga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................AAGATTGGTCAAGGCTACCTCATa.................... | 24 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................TCATCAAGGATGGCAAACTGATCAAgat | 28 | gat | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................................................................TGACATTCAGGGgatt............................................................................................................... | 16 | gatt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGGCAAACTGATCAAgata | 26 | gata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................TACCTCATCAAGGATGGCAAACTGA.... | 25 | 7 | 0.86 | 0.86 | - | 0.14 | - | 0.29 | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................TACCTCATCAAGGATGGCAAACTGAT... | 26 | 7 | 0.86 | 0.86 | - | - | 0.29 | 0.29 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................TACCTCATCAAGGATGGCAAACTGATCt. | 28 | t | 0.86 | 35.57 | - | 0.14 | 0.14 | - | - | 0.29 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................TACAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATC.................... | 27 | 10 | 0.70 | 0.70 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | 0.10 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................................................................................................................................................................ACCTCATCAAGGATGGCAAACTGATCA. | 27 | 7 | 0.57 | 0.57 | - | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................................................................................................................................................................ACCTCATCAAGGATGGCAAACTGATC.. | 26 | 7 | 0.57 | 0.57 | - | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................................................................................................................................................ATCAAGGATGGCAAACTGATC.. | 21 | 8 | 0.38 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................................................................................................................................................ACAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATC.................... | 26 | 10 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................CAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATC.................... | 25 | 10 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | 0.10 | - | - | - |
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| ................................................................................................................................................................................................................................CTCATCAAGGATGGCAAACTGATCAA | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................CTCATCAAGGATGGCAAACTGATCA. | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................................................................................................................TCATCAAGGATGGCAAACTGATC.. | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................................................................................................................................CTCATCAAGGATGGCAAACTG..... | 21 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................................................................................................................................CTCATCAAGGATGGCAAACTGA.... | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................................................................................................CCTCATCAAGGATGGCAAACTG..... | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................AAGGATGGCAAACTGATCAA | 20 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATCAAGGATGGCAAACTGATa.. | 21 | a | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGGCAAACTGATC.. | 20 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................CAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATCAAGGATGGCA.......... | 35 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATCAAGGATGGCAAACTGAT... | 20 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................CAAGGATGGCAAACTGATCAA | 21 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................AGGATGGCAAACTGATCA. | 18 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................AAGGATGGCAAACTGATC.. | 18 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................TTGGTCAAGGCTACCTCATCAAGGA............... | 25 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................ATTGGTCAAGGCTACCTCATCAAGGA............... | 26 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................CAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATCAAG................. | 28 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................TTGGTCAAGGCTACCTCATCAAGGAT.............. | 26 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................CAAGATTGGTCAAGGCTACCTCAT..................... | 24 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................CAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATCA................... | 26 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................AAGATTGGTCAAGGCTACCTCATC.................... | 24 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GATTTACAAGATTGGTCAAGGCTACCTC....................... | 28 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................ACAAGATTGGTCAAGGCTACCTC....................... | 23 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................CAAGGATGGCAAACTG..... | 16 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - |
| ................................................................................................................................................................................................................GATTGGTCAAGGCTACCT........................ | 18 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................TTACAAGATTGGTCAAGGCTACC......................... | 23 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................ATTTACAAGATTGGTCAAGGC............................. | 21 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 |
| ......................................................................................................................................................................................................AGATTTACAAGATTGGTCAAGGCTA........................... | 25 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................ATTGGTCAAGGCTACCT........................ | 17 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................TACAAGATTGGTCAAGGCTA........................... | 20 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................AAGATTGGTCAAGGCTAC.......................... | 18 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................ACAAGATTGGTCAAGGCTACCT........................ | 22 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TTACCTTTGTCCCAAGTTCTAGAACAGAGTTCCAGCAAATAGTGTTTTAATCTGGCCCATTACATGGGAAAACACAATTATAGACCTCCCACTTTATGCTGATTTGGGTAACAGGCCAGTCACTGACATTCAGGGTTTCTACCTGACTTTGGATGCTGGTTCTCAGGACTGACTTCTCAGTTGTTGACTCTCATGTGCAGATTTACAAGATTGGTCAAGGCTACCTCATCAAGGATGGCAAACTGATCAA |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
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