| Gene: Ddx17 | ID: uc007wtq.1_intron_2_0_chr15_79366447_r.5p | SPECIES: mm9 |
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|
(5) OTHER.mut |
(7) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(31) TESTES |
| GTGTATCCATGGAGACAAGAGTCAACCAGAAAGAGATTGGGTACTTAATGGTAAGAACAAAACTGAGCTGCTACTTTTTTTTGAGATAGGATTTCACTGTGTGGATCAGGCAGGCCTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCTGCCTCCCGGGTGTTATCTGGGAATAAAAGTATGTGCTTCTATGCCTAACACAATAAAGGCTTTTGACAACTGTCATCTTAGCCACTGCATGTGTGCCTCCCCCCAA ..................................................((.(((.(((((..(((......)))..))))).....(((((((.((((.((...)).))))...(((....))).))))))).......)))))........................................................................................................ ..................................................51..............................................................................................147..................................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTC........................................................................................................... | 28 | 2 | 29.00 | 29.00 | 5.50 | 3.00 | 5.00 | 4.00 | 1.50 | 2.00 | 3.00 | 0.50 | 1.00 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCT............................................................................................................ | 27 | 2 | 13.50 | 13.50 | 1.50 | 1.50 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | 1.50 | 1.00 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTAC.............................................................................................................. | 25 | 2 | 10.50 | 10.50 | 2.00 | 0.50 | 2.00 | 0.50 | - | 3.50 | 0.50 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaaa........................................................................................................ | 29 | aaa | 7.50 | 3.00 | 0.50 | 2.00 | - | - | 2.00 | 0.50 | - | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaat........................................................................................................ | 29 | aat | 7.00 | 3.00 | - | 3.50 | - | - | 2.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTC........................................................................................................... | 27 | 2 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | 0.50 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTAC.............................................................................................................. | 23 | 2 | 4.00 | 4.00 | 1.50 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACC............................................................................................................. | 26 | 2 | 4.00 | 4.00 | 1.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACC............................................................................................................. | 24 | 2 | 4.00 | 4.00 | 0.50 | - | - | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................AACCAGAAAGAGATTGGGTACTTAATG........................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTA............................................................................................................... | 24 | 2 | 3.50 | 3.50 | - | - | - | 1.50 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTC........................................................................................................... | 26 | 2 | 3.00 | 3.00 | 0.50 | - | 1.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGAAAGAGATTGGGTACTTAATGagt..................................................................................................................................................................................................... | 26 | agt | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaat........................................................................................................ | 30 | aat | 3.00 | 6.00 | - | 0.50 | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCT............................................................................................................ | 25 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTa........................................................................................................... | 28 | a | 2.50 | 13.50 | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaaa........................................................................................................ | 30 | aaa | 2.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCat......................................................................................................... | 28 | at | 2.00 | 3.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................AGATTGGGTACTTAATG........................................................................................................................................................................................................ | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACt............................................................................................................. | 26 | t | 1.50 | 10.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaatt....................................................................................................... | 30 | aatt | 1.50 | 3.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCT............................................................................................................ | 26 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTAC.............................................................................................................. | 24 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTAta............................................................................................................. | 25 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................AACCAGAAAGAGATTGGGTACTTAAT......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTACC............................................................................................................. | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................AAGAGTCAACCAGAAAGAGATTGGGTA............................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTAAGAACAAAACTGAGCTGCTACTTTTTTTTG....................................................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCata........................................................................................................ | 29 | ata | 1.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................ATGGTAAGAACAAAACTGAGCT..................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AGAAAGAGATTGGGTACTTAATGagtt.................................................................................................................................................................................................... | 27 | agtt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCaaa.......................................................................................................... | 29 | aaa | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGGAGACAAGAGTCAACCAGA............................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTAa.............................................................................................................. | 25 | a | 1.00 | 3.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................CAGAAAGAGATTGGGTACTTAATGa....................................................................................................................................................................................................... | 25 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................ACCAGAAAGAGATTGGGTACTTAATG........................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................TGGGAATAAAAGTATGTGCTTCTATGCC............................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................GATTGGGTACTTAATGaga..................................................................................................................................................................................................... | 19 | aga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACata............................................................................................................... | 24 | ata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTaaa......................................................................................................... | 28 | aaa | 1.00 | 2.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GAAAGAGATTGGGTACTTAATGagtt.................................................................................................................................................................................................... | 26 | agtt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................AAGAGTCAACCAGAAAGAGATTGGG................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCata........................................................................................................ | 30 | ata | 0.50 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCatt........................................................................................................ | 29 | att | 0.50 | 3.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaaaa....................................................................................................... | 32 | aaaa | 0.50 | 29.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTAactc........................................................................................................... | 28 | actc | 0.50 | 3.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTAg.............................................................................................................. | 25 | g | 0.50 | 3.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTa........................................................................................................... | 26 | a | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTA............................................................................................................... | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCatg........................................................................................................ | 29 | atg | 0.50 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCattt....................................................................................................... | 31 | attt | 0.50 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaaa........................................................................................................ | 31 | aaa | 0.50 | 29.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCaa........................................................................................................... | 28 | aa | 0.50 | 4.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCata.......................................................................................................... | 27 | ata | 0.50 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaag........................................................................................................ | 29 | aag | 0.50 | 3.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaata....................................................................................................... | 30 | aata | 0.50 | 3.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCaaaa....................................................................................................... | 30 | aaaa | 0.50 | 3.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACCT................................................................................................................ | 23 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................CTTGAACTCAAAGAAATCCACC................................................................................................................. | 22 | 8 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................AGGCAGGCCTTGAACTCAAA........................................................................................................................... | 20 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 |
| GTGTATCCATGGAGACAAGAGTCAACCAGAAAGAGATTGGGTACTTAATGGTAAGAACAAAACTGAGCTGCTACTTTTTTTTGAGATAGGATTTCACTGTGTGGATCAGGCAGGCCTTGAACTCAAAGAAATCCACCTACCTCTGCCTCCCGGGTGTTATCTGGGAATAAAAGTATGTGCTTCTATGCCTAACACAATAAAGGCTTTTGACAACTGTCATCTTAGCCACTGCATGTGTGCCTCCCCCCAA ..................................................((.(((.(((((..(((......)))..))))).....(((((((.((((.((...)).))))...(((....))).))))))).......)))))........................................................................................................ ..................................................51..............................................................................................147..................................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................................................................TCCACCTACCTCTGCCTctta...................................................................................................... | 21 | ctta | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................CAGGCCTTGAACTCAgtta............................................................................................................................. | 19 | gtta | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TCCACCTACCTCTGCCTcttt...................................................................................................... | 21 | cttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................AAGAAATCCACCTACCTCTGCCTCCC................................................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |