| Gene: Scrib | ID: uc007wig.1_intron_26_0_chr15_75895258_r | SPECIES: mm9 |
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(10) OTHER.mut |
(3) OVARY |
(4) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(31) TESTES |
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| ...........................................................................AATGGTGGGCGGTGAAACAGAGt.................................................................................... | 23 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................CTCTGCCTCCCACAGtaat.............................................. | 19 | taat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................GGTGGGCGGTGAAACAGAGAGa.................................................................................. | 22 | a | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................TCTGACTCTGCCTCCCACAGtat............................................... | 23 | tat | 0.50 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................TCTGACTCTGCCTCCCACAGta................................................ | 22 | ta | 0.50 | 2.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| AAAGGTGCTCACCTGCTACCTGCTGCCCCAGCAGCCCCTGCCAAGTCTCGGTAGGTTGCTGTTGGCTGGGCCCTGAATGGTGGGCGGTGAAACAGAGAGCTTAGCATGGGTCTCTGACTCTGCCTCCCACAGAAGACGCTGGACAGCAGAGCAGTCCCTCAGAGAGCTGTAGTGATGCCCCT ...............................................................................(((((.(((((..((((((.((......)).))))))..)).))).))))).................................................... .......................................................................72..........................................................132................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) |
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