| Gene: Rpl30 | ID: uc007vlq.1_intron_1_0_chr15_34371118_r.5p | SPECIES: mm9 |
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(10) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(9) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(40) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
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| ........................................................................................................................................................................................................................AATGATACACGCAGACTGGGG............. | 21 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTG.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 11 | 7.55 | 7.55 | 0.09 | 3.82 | - | 2.27 | - | - | 0.09 | - | 0.27 | - | 0.09 | - | - | 0.18 | - | - | - | - | 0.18 | - | - | 0.18 | - | - | 0.18 | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................................AATAATGATGGTTGCTTTC.............................................................................................................. | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 24 | 11 | 1.18 | 1.18 | - | 0.45 | - | 0.36 | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGtga..................................................................................................................................................................................................... | 28 | tga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTccg.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | ccg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................................................................................................................................................................TTTGTAAATGTACCTTTGA............................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................AATAATGATGGTTGCTTTCT............................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........AGCGAAGTTGGTTATCCTTGaca........................................................................................................................................................................................................................... | 23 | aca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................ACACGCAGACTGGGGGA........... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGt....................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................AATAATGATGGTTGCTTTCTGATGTTTG..................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................AATAATGATGGTTGCTT................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTT........................................................................................................................................................................................................... | 25 | 11 | 1.00 | 1.00 | - | 0.27 | - | 0.27 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - |
| ....................TATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTT........................................................................................................................................................................................................... | 27 | 11 | 0.91 | 0.91 | - | 0.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.27 | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................TATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTG.......................................................................................................................................................................................................... | 28 | 11 | 0.82 | 0.82 | - | 0.45 | - | 0.09 | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................TATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 26 | 11 | 0.82 | 0.82 | - | 0.18 | - | 0.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGGaat.................................................................................................................................................................................................... | 29 | aat | 0.36 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.27 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......AAGCGAAGTTGGTTATCCTTGCCAAC......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGc......................................................................................................................................................................................................... | 27 | c | 0.18 | 7.55 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTG.......................................................................................................................................................................................................... | 24 | 11 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTG.......................................................................................................................................................................................................... | 23 | 11 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 20 | 11 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGGat..................................................................................................................................................................................................... | 27 | at | 0.18 | 0.55 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGtgg..................................................................................................................................................................................................... | 27 | tgg | 0.18 | 0.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGG....................................................................................................................................................................................................... | 26 | 11 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................TTATCCTTGCCAACAACTGT................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 11 | 0.18 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................CAACTGTCCAGCTTTGAGG....................................................................................................................................................................................................... | 19 | 12 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................CAACAACTGTCCAGCTTTGAGG....................................................................................................................................................................................................... | 22 | 12 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...GGCAAAGCGAAGTTGGTTATCCTTGCC............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....CAAAGCGAAGTTGGTTATCCTTGCCAAC......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..AGGCAAAGCGAAGTTGGTTATCCTTGCC............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......AAGCGAAGTTGGTTATCCTTGCCAA.......................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..AGGCAAAGCGAAGTTGGTTATCCTTG.............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......AAGCGAAGTTGGTTATCCTTGCCAACA........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........GCGAAGTTGGTTATCCTTG.............................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........AGCGAAGTTGGTTATCCTTGCCAACAAC...................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..AGGCAAAGCGAAGTTGGTTATCCTTGC............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...GGCAAAGCGAAGTTGGTT..................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .AAGGCAAAGCGAAGTTGGTTATCC................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - |
| ...............TTGGTTATCCTTGCCAACAACTGTCCA................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGGac..................................................................................................................................................................................................... | 27 | ac | 0.09 | 0.55 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCT............................................................................................................................................................................................................. | 20 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................ATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAG........................................................................................................................................................................................................ | 29 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGGga..................................................................................................................................................................................................... | 28 | ga | 0.09 | 0.18 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................TATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTc........................................................................................................................................................................................................... | 27 | c | 0.09 | 0.82 | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGtggc.................................................................................................................................................................................................... | 28 | tggc | 0.09 | 0.45 | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................ATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 25 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - |
| ................TGGTTATCCTTGCCAACAACTGTCCAGt.............................................................................................................................................................................................................. | 28 | t | 0.09 | 0.27 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTag.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | ag | 0.09 | 1.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TTGGTTATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 31 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGGat..................................................................................................................................................................................................... | 28 | at | 0.09 | 0.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGC.............................................................................................................................................................................................................. | 18 | 11 | 0.09 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................CCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAG........................................................................................................................................................................................................ | 27 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAaaa...................................................................................................................................................................................................... | 30 | aaa | 0.09 | 7.73 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGaaa..................................................................................................................................................................................................... | 27 | aaa | 0.09 | 0.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTca......................................................................................................................................................................................................... | 27 | ca | 0.09 | 1.00 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGC.............................................................................................................................................................................................................. | 22 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCcc............................................................................................................................................................................................................ | 24 | cc | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCcttg.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | cttg | 0.09 | 0.09 | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTaag........................................................................................................................................................................................................ | 28 | aag | 0.09 | 1.00 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGG....................................................................................................................................................................................................... | 27 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCcctc.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | cctc | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGGatt.................................................................................................................................................................................................... | 29 | att | 0.09 | 0.18 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCctt........................................................................................................................................................................................................... | 25 | ctt | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CTTGCCAACAACTGTCCAGC.............................................................................................................................................................................................................. | 20 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGt....................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 0.09 | 0.27 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGA......................................................................................................................................................................................................... | 24 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................GCCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 19 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCgttg.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | gttg | 0.09 | 0.09 | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTt.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 0.09 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................ATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGt......................................................................................................................................................................................................... | 28 | t | 0.09 | 0.27 | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TGCCAACAACTGTCCAGCTTTGA......................................................................................................................................................................................................... | 23 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - |
| .........................TTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAa........................................................................................................................................................................................................ | 25 | a | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTcg.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | cg | 0.09 | 1.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CCAACAACTGTCCAGCTTTGA......................................................................................................................................................................................................... | 21 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................AACAACTGTCCAGCTTTG.......................................................................................................................................................................................................... | 18 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................TATCCTTGCCAACAACTGT................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................AACAACTGTCCAGCTTTGAGG....................................................................................................................................................................................................... | 21 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - |
| ..............GTTGGTTATCCTTGCCA........................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CAAGGCAAAGCGAAGTTGGTTATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTTTGAGGTAATGGAGGGAACCTGGATGTGTGCAGCCTATTGTAAATTCACTGTGCAGTATCCAGCATTGGGAAGAAGAATAATGATGGTTGCTTTCTGATGTTTGGACCTTGCTTTGTGTGTGTTTTTTGTAAATGTACCTTTGAGGCACGTTGTGTGACAGGAGGTATACAAATGATACACGCAGACTGGGGGAAGCCCGATCCC .......................................................................................................((((((((..(((((...(((.......))).)))))..))))).)))...(((((((.(((..(((.....)))..)))...)))))))......................................................... ....................................................................................................101................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
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| ..................GTTATCCTTGCCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 28 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............AGTTGGTTATCCTTGCCAACAACTGTCCA................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CCAACAACTGTCCAGCTT............................................................................................................................................................................................................ | 18 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................GGTTATCCTTGCCAAC......................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |