chr14:65435924 65436173 -
(1)
OTHER.ip 		(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(50)
TESTES

Sense strand
ATTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACTTCATTTTTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACC
.....................................................................((((((((..((((....)))))))).))))....((..((.....))..)).................................................................................................................................
..................................................51.......................................................................124............................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTC.... 27 1 144.00 144.00 - 42.00 39.00 2.00 7.00 8.00 - 3.00 10.00 9.00 10.00 3.00 4.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGT..... 26 1 38.00 38.00 - 9.00 14.00 1.00 3.00 1.00 2.00 - 1.00 3.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCATTTTTCTTTATGCATCTGTGCCT...................................................................................................................................................................... 27 1 33.00 33.00 15.00 - - 15.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGT.............. 28 1 29.00 29.00 2.00 8.00 7.00 - - - 2.00 - 1.00 1.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCC........................................................................................................................... 27 1 22.00 22.00 5.00 - - 4.00 2.00 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCC... 25 1 20.00 20.00 6.00 - - 2.00 3.00 - - - - 1.00 - 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGT..... 27 1 16.00 16.00 1.00 6.00 3.00 1.00 - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCC... 28 1 16.00 16.00 1.00 4.00 5.00 - - - - 1.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGG...... 25 1 14.00 14.00 - 4.00 4.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCT.......................................................................................................................... 28 1 13.00 13.00 - - - 1.00 2.00 3.00 1.00 2.00 - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGA.................................................................................. 29 1 13.00 13.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 5.00 - 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTT.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 12.00 12.00 4.00 - - 1.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCA.. 26 1 11.00 11.00 2.00 3.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTC.... 28 1 11.00 11.00 1.00 3.00 - - - - 3.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGATT.......................... 27 1 11.00 11.00 3.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCG............... 28 1 10.00 10.00 2.00 - 2.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTC............. 29 1 9.00 9.00 - 1.00 1.00 - 3.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTG......................................................................................................................................................................................................... 26 1 9.00 9.00 - - - - 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGC................ 27 1 9.00 9.00 1.00 1.00 3.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCATTTTTCTTTATGCATCTGTGCCTT..................................................................................................................................................................... 28 1 9.00 9.00 6.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCAC. 27 1 9.00 9.00 - 1.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCG............... 27 1 8.00 8.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCT............................................................................................................................. 27 1 8.00 8.00 1.00 - - 2.00 - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAACTAGGAGCTGCAGAACTCACTAGC................................................................................................ 27 1 8.00 8.00 - - - - 2.00 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGC................ 26 1 8.00 8.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGTC....................................................................................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 - - - - 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGC................ 28 1 7.00 7.00 2.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGG...... 26 1 7.00 7.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGC................................................................................................................................................................ 26 1 7.00 7.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCC.............................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 1.00 - - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCAC............................................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTTTGCAGGAGCCTTGATTCAATT..................... 26 1 6.00 6.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCC................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGT.............. 29 1 6.00 6.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACC 27 1 6.00 6.00 - 2.00 1.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCA............................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 2.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGT............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................TGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACTT............................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGC..................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTC............................................................................................................................ 28 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTA......................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAGT................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - - - - 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGG................................................................................... 29 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTC............. 26 1 5.00 5.00 - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGT........................................................................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACT............................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTGTC......................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................ATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCC... 26 1 5.00 5.00 1.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCAC................................................................................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTT........................................................................ 26 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGGTTCCTGGTTCTTCTGAAGTCATG................................................................................................................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAGCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTT........................................................................ 28 1 4.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTT.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTG................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCA............................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGATTC......................... 28 1 4.00 4.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TCTCCAGCGGATGCTTAGTTTGGACTT.................................................................. 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCgggt 27 gggt 4.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACTTC.............................................................................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTG............................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TCTCCAGCGGATGCTTAGTTTGGACT................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
................................TGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACT................................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...................................................................................................................................TAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTC........................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTC............................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCC... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................TTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGG............................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCggt 26 ggt 3.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GGATGCTTAGTTTGGACTTTTTCTTT........................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCC.................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................CACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGC................................................................................................................ 31 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAG................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTTC............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTTTTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAG.................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGCGGATGCTTAGTTTGGACTTTTTCTTTT.......................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTTTTCTTTATGCATCTGTGCCTTCA................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTA......................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGATGC............................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGC............................................................................................................. 32 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................TCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAG.............................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGA.................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTCAGGCAGGTGTCATATAATCTTC.............................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGA.................. 25 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCAC............................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCATTTTTCTTTATGCATCTGTGCCTT..................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGA.................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTTCT............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................AGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGC................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CAGGATGGGTTCCTGGTTCTTCTGAAG..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTT.............................................................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTG........................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTCAG........... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATAATCTTCACAGCCTGTAGA.................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCC............................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACC 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACT...................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............................................................................................TGTCATATAATCTTCACAGCCTGTAGA.................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTGTCA........................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................ACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGC................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCTGTGCCTTCAGGCAGGTGTCATAT..................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTC............. 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACT................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CTGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGT........................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAG................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGC..................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................CATGTACTCTGTCCCCCACTTCATTTT......................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTT.............................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGAT................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTTG....................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGT.............. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGG................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGG............................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGG................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGT................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTC............. 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCA............................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTG........................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTC............. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGG....... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGC............................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTTC............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................AACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGATGC............................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTTTTTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCC................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAGCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTTG....................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACTT............................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGTC................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGT............................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCA.................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCAt. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCgaga 26 gaga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTG............................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CAGGATGGGTTCCTGGTTCTTCTGA....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGGGTTCCTGGTTCTTCTGAAGTCA.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCggt 31 ggt 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................ACTAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCC............................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCAGGATGGGTTCCTGGTTCTTCTGA....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGA............................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCTCC........................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAG........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCa.............................................................................................................................. 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGTCC...................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGGGTTCCTGGTTCTTCTGAAGTCAT................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CCTTCAGGCAGGTGTCATATAATCTTt.............................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGtagg....... 25 tagg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCgggc 26 gggc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCCAGCGGATGCTTAGTTTGGACTTTT................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GTCATGTACTCTGTCCCC.................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAG........ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTC.... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................AACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGA.................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCACA........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTG........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCata......................................................................................................................... 26 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACT...................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCAC. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGCA............................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCa............................................................................................................................. 27 a 1.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGc..... 26 c 1.00 14.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCTTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCC.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTTCTTTTTTTTCTAGTCA............................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCCTAACTAGGAGCTGCAGAACTCACTA.................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGGTTCCTGGTTCTTCTGAAGTCA.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAAC....................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTCTTTTTTTTCTAGTCATCCTTTGCAGG.................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTatg......................................................................................................................................................................................................... 26 atg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCgga 25 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGC................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCAC. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTTGGA..................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................AACTAGGAGCTGCAGAACTCACTA.................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCCTTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTA.................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTA................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTTG....................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAACTAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCC............................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGATT.......................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGCAG........................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGC............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACTTCA............................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCACAGC......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTC.... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACTTC.............................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAGCCACTCTCCAGCGGATGCc.............................................................................. 22 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTCAGGCAGGTGTCATATAATCTcc.............................................................................................................................................. 25 cc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCATTTTTCTTTATGCATCTGTGC........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GCGGATGCTTAGTTTGGACTTTTTCTT............................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCATTTTTCTTTATGCATCTGTtcct...................................................................................................................................................................... 27 tcct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGt................................................................................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAGAACTCACTAGCCACT............................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAACTAGGAGCTGCAG........................................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCC.................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAAC....................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCC.............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CTTCATTTTTCTTTATGCATCTGTGCCTTC.................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAG................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCt.. 26 t 1.00 20.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCTCC........................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGta................................................................................. 30 ta 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGg............................................................................................................................................................ 30 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCggaa 27 ggaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGA.................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTTGGAC.................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................AATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTC............................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GAACTCACTAGCCACTCTCCAG...................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCG............... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGTCATC............................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTC............. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAG................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTG.............................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTa............................................................................................................................ 28 a 1.00 8.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGag............... 29 ag 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAGT................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGG................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTt.... 28 t 1.00 16.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGCAG........................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCTGTCAGGATGGGTTCC................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGTCC...................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGga.... 19 ga 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GCCTTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGG...... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAACTAGGAGCTGCAGAACTCACcagc................................................................................................ 27 cagc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGAT........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCAGAACTCACTAGCCACTCTC......................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAA........................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTact.......................................................................................................................... 28 act 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGA.................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCAC................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCATATAATCTTCACAGCCTGTA.................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCTC......................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCTC......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGATTC......................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGTC................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAG................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGGCAGGTGTCATATAATCTTC.............................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCcctt............................................................................................................................................................................................... 27 cctt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCAtt................................................................................................................................................................................................ 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGT............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAG...................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAGCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTT......................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTCAGg.......... 28 g 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................ATATAATCTTCACAGCCTGTAGAG................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGCCTTGATTCAATTAGAGCGT.............. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCaa 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................CTTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCA.................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CTGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCT.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAA........................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGT................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAGGAGCCTTGATTCAATTAG................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTG............................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCTCCTAACTAGGAGCTGCAGAACTCACT................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGA.................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGAAGTCATGTACTCTGTCCCC.................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCAGGATGGGTTCCTGGTTCTTCTG........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCCAC............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGagtc.... 27 agtc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCCTGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGT........................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCT.......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTa.... 27 a 1.00 38.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTGTa......................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCa... 28 a 1.00 144.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGAT................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGgc.... 27 gc 1.00 14.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGA............................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCTCC........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................TAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCgggt 26 gggt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTC........................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TTTTTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGC................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGtgcg............... 29 tgcg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACC 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACCgga 26 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CTGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGC..................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCATTTTTCTTTATGCATCTGTGCCc...................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGG................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................AGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGC............................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................GTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGTC................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTCAGAcg........ 30 cg 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGT.............. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAtgc................................................................................................................................................................ 27 tgc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGC................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCATTTTTCTTTATGCATCTGTacct...................................................................................................................................................................... 27 acct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGG................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTTTCTTTTTTTTCTAGTCATCCTTT......................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CGGATGCTTAGTTTGGACTTTTTttt............................................................ 26 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AGGATGGGTTCCTGGTTCTTC.......................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGt.................................................................................. 29 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCCTAACTAGGAGCTGCAGAACTCACT................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCACTAGCCACTCTCCAGCGGATG................................................................................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTTTTCTTTATGCATCTGTGCCT...................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTTTTTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGC................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTCAGA.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGCAGA.......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TATAATCTTCACAGCCTGTAGAG................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGttc.... 27 ttc 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GATGCTTAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTT...................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCaa.. 29 aa 1.00 144.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTa.............................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGctac......................... 28 ctac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCATATAATCTTCACAGC......................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTT......................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTTCTTC.......................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTG............................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGAT................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGAAGTCATGTACTCTGTCC...................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAG.............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTGTCAT....................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGTCCA.. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCCAGCGGATGCTTAGTTTGGctt................................................................... 24 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTTTCTTTTTTTTCTAGTCATCCTTTG........................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTA..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGa................................................. 29 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGG................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGCGTCAGAAGGGTCCAaagg 25 aagg 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCT.......................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGA............................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGG....... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGttt..... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGct.............................................................................................................................................................................................................................. 26 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................TTCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCACA........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TCTCCAGCGGATGCTTAGTTTGGAC.................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GAGCTGCAGAACTCACTAG................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGT.............. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CTGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTG......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGTCAGGATGGGTTCC................................................................................................................................................................................................................................... 16 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ATTCTGCTGTCAGGATGGGTTCCTGGTTCTTCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACTTCATTTTTCTTTATGCATCTGTGCCTTCAGGCAGGTGTCATATAATCTTCACAGCCTGTAGAGTCCTCCTAACTAGGAGCTGCAGAACTCACTAGCCACTCTCCAGCGGATGCTTAGTTTGGACTTTTTCTTTTTTTTCTAGTCATCCTTTGCAGGAGCCTTGATTCAATTAGAGCGTCAGAAGGGTCCACC
.....................................................................((((((((..((((....)))))))).))))....((..((.....))..)).................................................................................................................................
..................................................51.......................................................................124............................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
...............................................................................................................GCCTGTAGAGTCCTCCTAACTA..................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCTGAAGTCATGTACTCTGTCCCCCACT................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTTTCTAGTCATCCTTT......................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50