chr14:65435654 65435903 -
(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(51)
TESTES

Sense strand
TGCTAAGTGGCCTTTTATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTGA
......................................................................................(((((((.(((((...((.(((.....)))))...))))).)).....)))))...((((.((((.(((........(((.((((.....)))))))........))).))))))))...............................................
......................................................................................87......................................................................................................................207.........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
..............................................................................................................................................................................................TCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGC............................... 29 1 85.00 85.00 - 31.00 24.00 - - 6.00 5.00 7.00 2.00 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCT.............................. 30 1 59.00 59.00 - 29.00 14.00 - - 1.00 - 5.00 1.00 - 5.00 - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGC..................................................................................................................................... 26 1 46.00 46.00 - 1.00 - 1.00 - 17.00 6.00 - 9.00 - - 1.00 - - 3.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAACAC............................................... 29 1 39.00 39.00 18.00 - 1.00 7.00 9.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCC.................................................................................................................................... 27 1 37.00 37.00 - - - 3.00 - 13.00 7.00 - 7.00 - - 3.00 - - 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGA.................................. 29 1 34.00 34.00 - 9.00 8.00 - - 1.00 - 6.00 - 1.00 3.00 - 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATG................................ 28 1 30.00 30.00 - 9.00 14.00 - - - - 4.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTA............................................................................................................................................................................................... 26 1 27.00 27.00 2.00 9.00 9.00 - 1.00 - - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAAC................................................. 27 1 24.00 24.00 11.00 - - 4.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGT................................................................................................................................................................................................. 24 1 23.00 23.00 2.00 - 2.00 - 3.00 3.00 - - - 12.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTG............................................................................................................................. 27 1 21.00 21.00 9.00 - - 5.00 1.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTG. 26 1 21.00 21.00 - 6.00 6.00 - - - - 2.00 1.00 1.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTG............................. 28 1 20.00 20.00 - 6.00 4.00 - - - - 4.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCT.............................. 28 1 17.00 17.00 - 8.00 6.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAG................................... 28 1 15.00 15.00 - 5.00 3.00 - - - 2.00 2.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGA................................................... 25 1 14.00 14.00 9.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGA................................................... 27 1 14.00 14.00 5.00 - - 1.00 6.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAG................................................................................................................................................................. 27 1 11.00 11.00 - - - - - 3.00 1.00 - 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGT...................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 3.00 - 1.00 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAA.............................................................................................................................................................................................. 27 1 10.00 10.00 - 4.00 2.00 - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTG........................................................................................................................... 27 1 10.00 10.00 - - - 5.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTC.................................................................................. 27 1 9.00 9.00 5.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTG................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 4.00 - - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTG....................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAACT............................................................................................................................................................................................ 29 1 8.00 8.00 - 1.00 4.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCT................................................................................. 28 1 8.00 8.00 4.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAA.................................... 27 1 8.00 8.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAG...................................................................................................................................... 25 1 8.00 8.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAA....... 27 1 7.00 7.00 - - - 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTC................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 5.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAACACT.............................................. 30 1 7.00 7.00 1.00 - - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTG............................. 29 1 7.00 7.00 - 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGT.................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 3.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGA........ 26 1 7.00 7.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGT.......................................................................................................................................................................... 30 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTG............................. 30 1 7.00 7.00 - 2.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGA........................................................................ 27 1 6.00 6.00 1.00 - - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCCTC.......................................................... 26 1 6.00 6.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGC............................... 32 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GATGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGA........ 28 1 6.00 6.00 - - - - - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCT................................................................................. 26 1 6.00 6.00 2.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGT.................................................................... 29 1 6.00 6.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGT........................................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 - - - - - 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GATGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGG......... 27 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAA.................................................. 26 1 6.00 6.00 1.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGT............................................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..........................................................................................................TAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTG..................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................CTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGC..................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 - - - - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGT.............................................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGC............................... 30 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTT...................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGC............................... 27 1 5.00 5.00 - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACT................................................................................... 28 1 5.00 5.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAAC............................................................................................................................................................................................. 28 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGT.................................................................... 27 1 4.00 4.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGAT................................. 30 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................CACTGTGGGATTAGTTAGTAGC..................................................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGT.................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTTTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGT............................................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TTCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCAC........................................................ 25 1 4.00 4.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAG.................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTG............................. 31 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTG................................................................... 28 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGTA....................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCT.. 26 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTG............................. 27 1 4.00 4.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTT................................................................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TAACCAACCAAGATGCTGGTTCCAGCTC................... 28 1 4.00 4.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGC............................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTG......................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAGGCT.............................................................................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGT............................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATA.......................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTTT............................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCT............................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAt.............................................................................................................................................................................................. 27 t 3.00 27.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTC.................................................................................. 28 1 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCAA............................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTGTC................................................................. 30 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGT........................... 28 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGaaa................................................................................................ 27 aaa 3.00 0.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGT............................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGC............................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TCTTTTTCAGGCTGGACACTGTGGGA................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCA..................................................................................... 26 3 2.67 2.67 0.33 - - 1.00 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTt........................................................................................................................... 29 t 2.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCAAGAC............................................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTCC........................ 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAA...... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGaa................................................................................................. 26 aa 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGTT........................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GGTTAACTTGAGTTCAAGAGCC.............................................................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...............................................................................................................................................TGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTT................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CAGAACACTAACCAACCAAGAT................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTT................................................................................ 31 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCACCCAGAACACTAACCAACCAAGA.................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCC...................................................... 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCAC.................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................CACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAG............................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAAGTGGCCTTTTATAAGTTCTTCTGCC........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCA................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCAAGACT........................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCTG............................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGG.................................................................................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCaaa.................................................................................................. 27 aaa 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TCTTTTTCAGGCTGGACACTGTGGGAT................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAAC................................................. 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTG........................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAG......................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATG................................ 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAA....................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AGACTCAGGTGAGGTTAACTTGA......................................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................CTCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAA.................................... 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGt..................................................................... 30 t 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTG....................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGCTGGACACTGTGGGATTA.............................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTT..................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTGA 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGT........................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTG..................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCA..................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACT................................................................................... 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTA....................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCT.............................. 29 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCAAGA............................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTaatt........................................................................................ 29 aatt 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTG. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTg................................................................................................................. 27 g 2.00 7.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCa................................................................................. 30 a 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTGTGTGTGTCTTCACTCTTcact............................................................................ 25 cact 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTtt.......................................................................................................................................................................... 30 tt 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TTCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAG.................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGC..................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................AGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAGGCTGG............................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGATGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGT........... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTGTC................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TTCTGCCCATGAGGCTCAAGACTCA......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTt.................................................................................. 25 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CAGGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGg........................................................................................................................................ 28 g 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTC.................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGA........................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGt............................... 31 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTTATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTC................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAG................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................TTCTGCCCATGAGGCTCAAGACTCAGGT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAA.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACT................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTCT........................................................................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTG........................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTC......................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGttt...... 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTataa.............................................................................................. 29 ataa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGt................................................................................................................................................................................................................... 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAt....... 27 t 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCT.............................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAG......................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGcgga........ 26 cgga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAG............................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGTCTTCACTCTTTCTATAGAAG...................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTCCAG...................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGC............................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTaa............................................................................................................................................................................................... 26 aa 1.00 23.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTTTCa............................................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAACTT........................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TCTTTTTCAGGCTGGACACTGTGG................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTTTTTCAGGCTGGACACT....................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTa............................. 31 a 1.00 59.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCACCCAGAACACTAACCAACCAAGAT................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TTCTGCCCATGAGGCTCAAGACTCAGG....................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGTCTTTTTCAGGCTGGACACTGTGGGt................................................................................................................................................. 28 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ACTGTGGGATTAGTTAGTAG...................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................AGTTGTGTGGAAAGGCT.. 17 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGcg..................................................................................................................... 27 cg 1.00 9.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCC...................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGTT.......................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCC.................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GCCCTGTCTTTTTCAGGCTGGACA......................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTC......................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCT................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTT.................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAAtt............................................................................................................................................................................................ 29 tt 1.00 10.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGT............................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTt......................................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGa........................................................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAG......................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGcgtg................................................................................................................... 25 cgtg 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAt...... 28 t 1.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTtaa.................................................................................... 27 taa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTTCAGGCTGGACACTGTGGGATTA.............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAGGC............................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAG......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACT................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAG............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCAC........................................................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGA.................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCAC.................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCTGTG............................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACCCAGAACACTAACCAACCAAGATG................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGgag...................................................................................................................................... 25 gag 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTTTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGa............................................................................................................................................ 28 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGTTt.......................................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................GTGGGATTAGTTAGTAGC..................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGT.................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGc................................................... 25 c 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCT................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTa................................................................................................................... 29 a 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CAAAAGTGTGTGTGTGTGTCTGgg............................................................................................................. 24 gg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCAC........................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGcact................................................ 28 cact 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................GACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAA.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTat............................................................................................................................................................................................... 26 at 1.00 23.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTC................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCC............................................................ 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................ATGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTA............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTTa............................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTC.................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGcac................................................. 27 cac 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGC... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CTCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCCT........................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCC.................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CTGCCCATGAGGCTCAAGACTCAGGTGt.................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGT........................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCT................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAA................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCTG............................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTAAGTGGCCTTTTATAAGTTCTTCTGCCC.......................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TTTCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCAC........................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTCCAGC..................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGA................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAG.................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CACTAACCAACCAAGATtctt............................. 21 tctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................CACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAA................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCAC........................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGT.............................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTC.................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CTATAGAAGGTGTCCCTCCTCAC........................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTTATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCA................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TTTTTCAGGCTGGACACTGTGGGA................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCACTCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCa............................................................ 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTG....................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTa.................................................................................. 27 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTTTCAGGCTGGACACTGTG.................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGaa................................................................................................. 25 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAAa................................................. 26 a 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGCCCATGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGg................................................................................................................................................................................................. 30 g 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CAGAACACTAACCAACCAAGATG................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCA..................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGT............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGTCTTTTTCAGGCTGGACACTG...................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTGAag 29 ag 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CTATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAG.................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................GACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAA................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAG................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTttg..................................................................................................................... 27 ttg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGC... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGt........ 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TTTTTCAGGCTGGACACTGTGG................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCAAGACT........................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAG...................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAA.................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAACAC............................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGcgtg........................................................................................................................... 27 cgtg 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAt...................................................................... 29 t 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGat.................................................................... 29 at 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCAGAACACTAACCAACCAAGATGCT.............................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAACTTG.......................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTC................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGT...................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAGG................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTGAGGTTAACTTGAGaa...................................................................................................................................................................................... 21 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGT...................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTG........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGgaa................................................................................................ 27 gaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTCC........................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTGc.................................................................. 31 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGT.............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCat............................................................................................................................................................................ 28 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAA................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTaa..................................................................................... 25 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGa..................................................................................................................................... 26 a 1.00 8.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGG..................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAaa..................................................................................................................................... 26 aa 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGc.................................................................................................................... 24 c 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTG................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTc...................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTG............................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCC.................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGT.................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTGA 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAG......................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCA................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GAACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTCCAGC..................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGG............................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCA.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAGGC............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACa................................................................................... 26 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGc................................................... 27 c 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTTTCAGGCTGGACACTGTGGGATT............................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGC... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TCTTTTTCAGGCTGGACA......................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CACCCAGAACACTAACCAACCAAGATG................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCT................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCcga................................................... 25 cga 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTa................................................................................................................................................................................................ 25 a 1.00 23.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTAAGTGGCCTTTTATAAGTTC.................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGA.................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGactg................................................................................................................... 25 actg 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGt.................................. 29 t 1.00 15.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CTGTCTTTTTCAGGCTGGACACTGTG.................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAG......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CCCATGAGGCTCAAGACTC.......................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGcgca............................................................................................... 26 cgca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TTCACTCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCC............................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TAACCAACCAAGATGCTGGTTCCAGCTCAGT................ 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTG............................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGagt............................................................................................................................ 28 agt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTGAa 29 a 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCA................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTGTC................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AACCAAGATGCTGGTTCCAGCTCAGT................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAA....... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCT.. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................ATGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGA........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCTG............................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTattt............................................................................................................................................................................................. 28 attt 1.00 23.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TTTTTCAGGCTGGACACTGTGGGg................................................................................................................................................. 24 g 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTaa..................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCAACCAAGATGCTGGTTCCAGCTCAG................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTt........................................................................................................................................................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGA................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCT................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGT.......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTa................................................................................ 27 a 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TCAGGCTGGACACTGTGG................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTC...................................................................................... 25 4 0.75 0.75 - - - 0.25 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGTGTCTTCACTCTTT............................................................................... 18 3 0.67 0.67 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33
.............................................................................................................................................TGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCA..................................................................................... 24 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCA..................................................................................... 25 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCAa.................................................................................... 27 a 0.33 2.67 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCca.................................................................................... 27 ca 0.25 0.75 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................CACTGTGGGATTAGT............................................................................................................................................ 15 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AAAGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTG......................................................................................................... 26 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGCTAAGTGGCCTTTTATAAGTTCTTCTGCCCATGAGGCTCAAGACTCAGGTGAGGTTAACTTGAGTTCAAGAGCCCTGTCTTTTTCAGGCTGGACACTGTGGGATTAGTTAGTAGCCAAAAGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTTCACTCTTTCTATAGAAGGTGTCCCTCCTCACCCAGAACACTAACCAACCAAGATGCTGGTTCCAGCTCAGTTGTGTGGAAAGGCTGA
......................................................................................(((((((.(((((...((.(((.....)))))...))))).)).....)))))...((((.((((.(((........(((.((((.....)))))))........))).))))))))...............................................
......................................................................................87......................................................................................................................207.........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)