chr14:59853856 59854105 +
(1)
OTHER.ip 		(6)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(38)
TESTES

Sense strand
CTTGACTTAGGGAAACCTTGCTTTTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTCTCCAGTATCTCTTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAACAGTTCCCAGTTAATAAACAAAGGCCTCTCCCTGTTCTTGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATCAATCATTTGACAGAAGT
......................................................(((((..((((((....((((((.((((...))))))))))....((.(((..((((((....((((.((((..(((((((.(((....))).))))).........)).))))))))..))))))..))).))...)))))))))))................................................
..................................................51.....................................................................................................................................................202..............................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGG........................................................................................................................................................................ 27 1 512.00 512.00 181.00 166.00 73.00 63.00 3.00 6.00 2.00 7.00 - 3.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGT....................................................................................................................................................................... 28 1 358.00 358.00 125.00 130.00 49.00 37.00 - - - 11.00 - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGA.............................................................................................................................................................................................. 26 1 241.00 241.00 75.00 73.00 29.00 38.00 5.00 3.00 1.00 6.00 3.00 - - 2.00 2.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTG......................................................................................................................................................................... 26 1 68.00 68.00 23.00 24.00 6.00 4.00 5.00 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAT............................................................................................................................................................................................. 27 1 64.00 64.00 10.00 15.00 17.00 11.00 - 2.00 - 4.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATC................. 29 1 62.00 62.00 15.00 12.00 6.00 5.00 5.00 3.00 4.00 7.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTC...................................................................................................................................................................... 29 1 59.00 59.00 9.00 10.00 4.00 2.00 5.00 11.00 2.00 1.00 9.00 1.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGT.............................................................................................................................................................................. 21 1 32.00 32.00 - - - - 10.00 8.00 7.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGAC.......................................................................................................................................................................................... 26 1 27.00 27.00 - - - - 5.00 1.00 2.00 - - 2.00 5.00 7.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATC................. 27 1 24.00 24.00 2.00 1.00 1.00 - 8.00 2.00 3.00 - 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTG............................................................................................................................................................................................... 25 1 17.00 17.00 5.00 2.00 1.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAA...................................... 26 1 17.00 17.00 - 1.00 - - 3.00 1.00 3.00 - - 2.00 2.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TTGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGAT............................................... 26 1 14.00 14.00 2.00 6.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGA.............................................................................................................................. 26 1 13.00 13.00 - - 2.00 2.00 3.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTG....................................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 2.00 2.00 - - 2.00 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCAT.................. 28 1 13.00 13.00 4.00 3.00 1.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................................TAAGAGAGTTGGGATGAGGGACTAGC..................................................................................................................... 26 1 12.00 12.00 - - - - 1.00 3.00 2.00 - - 2.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTT................................................................................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 - 1.00 - 3.00 - - - 1.00 2.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGT....................................................................................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 4.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCA................... 27 1 10.00 10.00 3.00 - - - 4.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGCTTTTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGC............................................................................................................................................................................................................ 28 1 9.00 9.00 1.00 - 1.00 - 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAaa............................................................................................................................................................................................ 28 aa 8.00 241.00 4.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTC...................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGA.............................................................................................................................................................................................. 28 1 7.00 7.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGA....................................... 27 1 7.00 7.00 - 3.00 - - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGTTTTCTGATGACACGGTTTGAG................................................................................................................................................................................ 25 1 7.00 7.00 2.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGT........................................................................................................................................................................................................ 27 1 7.00 7.00 - - - - 1.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTT.................................................................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................GGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGG........................................................................................................................................................................ 32 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATC................. 28 1 6.00 6.00 1.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGA................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 3.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGt........................................................................................................................................................................ 27 t 6.00 68.00 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATG............................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 - 1.00 - - 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGC.................... 26 1 6.00 6.00 - - - - - 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAG............................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TCTTGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGG................................................. 26 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGT........................................................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGA........................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGA....................................... 25 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGt.............................................................................................................................................................................................. 26 t 5.00 17.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCT.......................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 1.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTG............................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 1.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGACACGGTTTGAGGTATCTGGTCTCC................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGT..................................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGA....................................... 28 1 4.00 4.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAAT..................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAa............................................................................................................................................................................................. 27 a 3.00 241.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCT................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGTT.................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TCTTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGG................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGg....................................................................................................................................................................... 28 g 3.00 512.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGAT................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TAAGAGAGTTGGGATGAGGGACTAG...................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAG........................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGA.............................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGG............................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATC........................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGGT.............................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAT............................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AGAGTTGGGATGAGGGACTAGCTGA.................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGaa...................................................................................................................................................................... 29 aa 2.00 512.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGG...................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAACAGTT......................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTTCTGATGACACGGTTTGAGGTATC........................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCCAGTATCTCTTCTGGGAAGGGTAA............................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................CTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGA.............................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACAC........................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATG............................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTC................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAACAG........................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGAC.......................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TCTTGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGAT............................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGG.................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATCA................ 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAACA............................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGt...................................................................................................................................................................................................... 29 t 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTt...................................................................................................................................................................... 27 t 2.00 10.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TAAGTTTTGCATCAATCATTTGACAGA... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGTT.................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGa........................................................................................................................................................................ 27 a 2.00 68.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TCTCTTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGa................................................................................................................................... 28 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAG................................................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAGG............................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAAC............................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TTTTACTCTGCTCTGgac................................................................................................................................................................................................................... 18 gac 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGt.............................................................................................................................................................................................. 28 t 2.00 5.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTC...................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TTGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGA................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................TCTGCTCTGAGTAGAAGGCA........................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - -
........................................GAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGAC.......................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATa............................................................................................................................................................................................ 28 a 2.00 64.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGT..................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTt...................................................................................................................................................................... 29 t 2.00 358.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGA....................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTtg........................................................................................................................................................................ 27 tg 2.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCAT.................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACA......................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATa............................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAG........................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATC................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGCTTTTACTCTGCTCTGAGTAGAAGG............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGGTCTCCAGTATCTCTTCTGGGAAGGG............................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAa............................................................................................................................. 27 a 1.00 13.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAG........................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTctga................................................................................................................................................................................................ 24 ctga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTta.............................................................................................................................................................................................. 26 ta 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GGGTAAGAGAGTTGGGATGAGGGAC......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTG................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGG......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..TGACTTAGGGAAACCTTGCTTTTACTCT............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TCCCTGTTCTTGTTTTTGTTGTATttt....................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGACACGGTTTGAGGTATCTGGTCTCCA.................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAaaa........................................................................................................................................................................................... 29 aaa 1.00 241.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTtata............................................................................................................................................................................................ 28 tata 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TCTTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGG.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTC................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGa....................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 512.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGAGAGTTGGGATGAGGGACTAGCTG................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTC................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGG...................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTc......................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAaa............................................................................................................................ 28 aa 1.00 13.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATCc................ 30 c 1.00 62.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGcttt............................................. 27 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCT................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTt....................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TTCTGATGACACGGTTTGAGGTATCc.......................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CCCTGTTCTTGTTTTTGTTGTATGTG....................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GGTAAGAGAGTTGGGATGAGGGAC......................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATtac.......................................................................................................................................................................................... 26 tac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTGAGTAGAAGGCAGG......................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTTCTGATGACACGGTTTGAGGTA............................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................................................................................TGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTGC................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTTAAGTTTTGCATCAATCATTTGACA..... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TCTCTTCTGGGAAGGGTAAGAGAGT...................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCCCAGTTAATAAACAAAGGCCTCTCCCT............................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCT.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGcg....................................................................................................................................................................................................... 27 cg 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TCCCTGTTCTTGTTTTTGTTGTATttg....................................................... 27 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGG......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATGTGTCCAGGATTTAGAAaaat..................................... 26 aaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGG...................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................TGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGgt.................................................................................................................................................................................................... 25 gt 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAGt............................................................................................................................ 28 t 1.00 6.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CTTGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGG................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATatgg........................................................................................................................................................................ 27 atgg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGTTTTCTGATGACACGGTTTGga................................................................................................................................................................................ 25 ga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAc............................................................................................................................................................................................. 27 c 1.00 241.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCA................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AGAAGAATTCTGCTTTAAGTTT....................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGATTT............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGGTCTCCAGTATCTCTTCTGGGAAGGGT.............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGCTTTTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGt............................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTTAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTT...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TTCTGATGACACGGTTTGAGGTATC........................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGGTATCT.......................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTGCT............................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGA....................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGTT.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCA................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTtgt....................................................................................................................................................................... 28 tgt 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTT.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGGaat............................................................................................................................................................................ 28 aat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGaatc................. 29 aatc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAtgtg....................................................................................................................................................................................................... 27 tgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAACAGT.......................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGCTTTAAGTTTTGCATCAATCATTT......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTG....................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACG....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGGTCTCCAGTATCTCTTCTGGGAAGG................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAaa............................................................................................................................................................................................ 30 aa 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TAAACAAAGGCCTCTCCCTGTTC......................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGAaat........................................................................................................................................................................................... 29 aat 1.00 241.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTa.................................................................................................................................................................................................. 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGT..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTC................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGGTA............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAGa............................................................................................................................ 28 a 1.00 6.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATGACACGGTTTGAGGTATCTGG........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTC................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGtt............................................................................................................................................................................................. 27 tt 1.00 17.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAG.......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGACACGGTTTGAGGTATCTGGTCTC.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGggtc........................................................................................................................................................................... 24 ggtc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGTT.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGtc.......................................................................................................................................................................................... 26 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TAAGAGAGTTGGGATGAGGGACTA....................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACG....................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAGGGA.......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGt........................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGT..................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAGGGAAACCTTGCTTTTACTCTGCTC........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGATTTAGAAGAATTCTGCTTTAAGT......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGc..................................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAAT..................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGAaaa........................................................................................................................................................................................ 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGAtaca....................................................................................................................................................................................... 29 taca 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGAa.......................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGAT............................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................TACTCTGCTCTGAGTAGAAGGa............................................................................................................................................................................................................ 22 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTGCT............................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATt............................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAA...................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TCTTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGA................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CAGTATCTCTTCTGGGAAGGGTAAGA.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGc....................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 512.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTTCTGATGACACGGTTTGAGGTATCT.......................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGCTTTAAGTTTTGCATCAATCATTTGACA..... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGA.............................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAA...................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTGAGTAGAAGGCAGGT........................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAATAAACAAAGGCCTCTCCCTGTTC......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTG................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATG............................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAATAAACAAAGGCCTCTCCCTGTT.......................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATCAATC............. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAtgaa...................................... 28 tgaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GTTGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAACAG........................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGA................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGGTGGTTTTCTGATGACACGGTTT................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTa...................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATCAATC............. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGATGACACGGTTTGAGGTATCcg......................................................................................................................................................................... 26 cg 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAG........................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCA................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GAGAGTTGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAAC............................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGA.......................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AAGAGAGTTGGGATGAGGGACTAGC..................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATGTGTCCAGGATTTAGAAG........................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGAGAGTTGGGATGAGGGACTAGCTGA.................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTGa................................ 27 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTca.............................................................................................................................................................................................. 26 ca 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TAAGAGAGTTGGGATGAGGGACTAGg..................................................................................................................... 26 g 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TTTTTGTTGTATGTGTCCAGGATTTA............................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AGGCAGGTGGTTTTCTGAT............................................................................................................................................................................................. 19 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTTGACTTAGGGAAACCTTGCTTTTACTCTGCTCTGAGTAGAAGGCAGGTGGTTTTCTGATGACACGGTTTGAGGTATCTGGTCTCCAGTATCTCTTCTGGGAAGGGTAAGAGAGTTGGGATGAGGGACTAGCTGAGAAACAGTTCCCAGTTAATAAACAAAGGCCTCTCCCTGTTCTTGTTTTTGTTGTATGTGTCCAGGATTTAGAAGAATTCTGCTTTAAGTTTTGCATCAATCATTTGACAGAAGT
......................................................(((((..((((((....((((((.((((...))))))))))....((.(((..((((((....((((.((((..(((((((.(((....))).))))).........)).))))))))..))))))..))).))...)))))))))))................................................
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small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
..................................................................................................................................................................TCTCCCTGTTCTTctca....................................................................... 17 ctca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AAGGCCTCTCCCTGgagt............................................................................ 18 gagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCTCCCTGTTCTTGTctc..................................................................... 18 ctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -