chr14:56259358 56259853 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(1)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(45)
TESTES

Sense strand
GCTCTGTGCTGTGCTTGGTGTGGGCGCCCAGTTCCTGGCCCTTGGCACTGGTGAGGGGATATGAATTGCTCTCAGGGTAGCAGATAGGTCATTAGAAAAGTTCAGTGAGCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCTGGAAAAAAAAAACAAAAACAAAACAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTTCAGTGGATTTCCTCTTGTGTTCAAGGTGAGAAAGAGACCTAAGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGATGTGTGTGGGTTTTCCTGACTCCAGTAGAACTAGGAAAATCACCTGAGGGACCTGGGTTAAGGGGGATGATTTCTCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTGAGGCCTAACTGGAGCTTTCCACTACTACCTTACAGGCATTATTGTCATGGCGTTGCTTGGCATGTTCAACGTGCACCGTCACGGG
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((.((((((((......))).........))))).)))).))...((((((.(((((((((((....)).))))..))))).))))))......................................................
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................347................................................................................................446................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 ttt 21.00 0.00 2.00 1.00 6.00 5.00 2.00 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ttt 12.00 0.00 - - - - - - 1.00 8.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCTCTAGTGCGGATGTGTGTGGG............................................................................................................................................................................... 25 1 10.00 10.00 - - - - - 1.00 - - 8.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 tta 10.00 0.00 3.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttt 6.00 0.00 1.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 ttt 6.00 0.00 2.00 - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tttt 6.00 0.00 - 1.00 - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTG..................................................................................... 26 1 5.00 5.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCttta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttta 4.00 0.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtttt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tttt 3.00 0.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttc...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttc 3.00 0.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGG.......................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tttt 3.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 ttt 3.00 0.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGGCACTGGTGAGGGGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGA......................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 tgta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACccag..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ccag 2.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGATG....................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tttt 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTagaa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 36 agaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttta..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ttta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAGGTCATTAGAAAAGTTCAGTGAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaga............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 taga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGG....................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ttt 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ttt 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTGA.................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TTAGAAAAGTTCAGTGAGCCGGGCATG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGCGGATGTGTGTGGGTTTTCCT........................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 tta 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 taat 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TAGAAAAGTTCAGTGAGCCGGGCATG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tttt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTTTAAaaa...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 aaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGACTCCAGTAGAACTAGGAAAATC................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TTAGAAAAGTTCAGTGAGCCGGGCAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGG.......................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TAGAAAAGTTCAGTGAGCCGGGCAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgagc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 gagc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCgtta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gtta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TAGCAGATAGGTCATTAGAAAAGTTC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGGGGATGATTTCTCTGAGGTCGAG................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCG........................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCGGGCATGGTGGCGggca................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 ggca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATTTCTCTGAGGTCGAGAAGAGGT............................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTTTtt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGT...................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAACTAGGAAAATCACCTGAGGGACCTG.................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 ttg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCTCTGAGGTCGAGAAGAGGagtt......................................................................................... 26 agtt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTTga.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTaaa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 taaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCAaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 aaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTGTGCTGTGCTTGGTGTGGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTAGAACTAGGAAAATCACCTGAGG........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAACAAAACAAAAAAAAAAAAGAtat................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.............................................................................................................................................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtatt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCcgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 cgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgata.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 gata 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCgcaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gcaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGCGGATGTGTGTGGGTTTTCCTG....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtata................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCata............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGAT........................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGtttc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 tttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAACTAGGAAAATCAC.............................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGcgt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 cgt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAACTAGGAAAATCACCTGAGGGACC.................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TCAGTGGATTTCCTCTTGTGTTCAAG.................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTt..................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tatt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 taaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................ACAGCCAGGGCTATACAGAGttt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTGTGCTGTGCTTGGTGTGGGCGCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGT...................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGTAGCTCTAGTGCGGATGTGTGTt................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................ACAGCCAGGGCTATACAGAGttat................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ttat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAACTAGGAAAATCACCTGAGGGA...................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATGATTTCTCTGAGGTCGAGAAGAGG............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 tta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGAa........................................................................................................................................................................................ 26 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTa..................................................................................... 26 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCGGTAGCTCTAGTGCGG.......................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGctt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtgta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tgta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTGA.................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtttt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 tttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGATGTG..................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgaaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcggg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 cggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................AATTGCTCTCAGGGTAGCAGATAGGTt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGTCGAGAAGAGGTGTTG........................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcaga..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 caga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCATTATTGTCATGGCGTTGCTTGG......................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGGTGTGGGCGCCCAGTTCCTGGCCCTa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCttat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtcc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 tcc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GCATGGTGGCGCACGCCTTaaac........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 aaac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCATTATTGTCATGGCGTTGCTTGGt........................ 27 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtta...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGtca.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTTa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGtag...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGCCGGGCATGGTGGCGCACGCCata........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtagt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tagt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................CAGCCAGGGCTATACAGAcca..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtaat..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 taat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TGGATTTCCTCTTGTGTTCAAGGcatt............................................................................................................................................................................................................................. 27 catt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgat................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGCGGATGTGTGTGGGTTTTCCTGA...................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTAAGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGG.......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TTTAATCCAGCTTGGTCTACAAAGTGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTtt.................................................................................... 27 tt 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCctt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ctt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTTTtta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 tta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCGGGCATGGTGGCGCACGCCTaaa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 aaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgct........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 tgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGA......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttat................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 ttat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCac............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 34 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAATTGCTCTCAGGGTAGCAGATAGGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TACAGAGAAACCCTGTCTCTGGAAA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 -

Antisense strand
GCTCTGTGCTGTGCTTGGTGTGGGCGCCCAGTTCCTGGCCCTTGGCACTGGTGAGGGGATATGAATTGCTCTCAGGGTAGCAGATAGGTCATTAGAAAAGTTCAGTGAGCCGGGCATGGTGGCGCACGCCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCTGGAAAAAAAAAACAAAAACAAAACAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTTCAGTGGATTTCCTCTTGTGTTCAAGGTGAGAAAGAGACCTAAGGGACTCGGTAGCTCTAGTGCGGATGTGTGTGGGTTTTCCTGACTCCAGTAGAACTAGGAAAATCACCTGAGGGACCTGGGTTAAGGGGGATGATTTCTCTGAGGTCGAGAAGAGGTGTTGGTGAGGCCTAACTGGAGCTTTCCACTACTACCTTACAGGCATTATTGTCATGGCGTTGCTTGGCATGTTCAACGTGCACCGTCACGGG
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((.((((((((......))).........))))).)))).))...((((((.(((((((((((....)).))))..))))).))))))......................................................
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................347................................................................................................446................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
......................................................................................................................................CAGCTTGGTCTACAAAGTGAaca................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 aca 7.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gaa 4.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GCCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAAAGTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATCCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 a 3.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 8 2.50 2.50 - - - - - - - - 1.75 - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CACGCCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAAA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGGTAGCTCTAGTGCGGATGTGTGT.................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAgatt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gatt 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAata............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 ata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................AAGTTCAGTGGATTTCCTCTTGTGTTCA.................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CAGCTTGGTCTACAAAGTGAta................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGGTGGCGCACGCCTTTAATCCAGcga.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGaga............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtcta......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tcta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................ACGCCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GTGGCGCACGCCTTTAATCCAa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAagaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 35 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAggga............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ggga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAAAGTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAga............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGgggt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CATGGTGGCGCACGCCTTTAATCaaa....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CAGCTTGGTCTACAAAGTGAGacg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 acg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAacaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 acaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAgggg...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAaca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 aca 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................GCACGCCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 35 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgca.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGgaac......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gaac 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................AAAAGTTCAGTGGATTTCCTCTTGTGTTCA.................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GCTTGGTCTACAAAGTGAGTTcga................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 cga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................GCGCACGCCTTTAATCCAGCTTGGTCTACAAA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAtta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATAgaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 gaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AATCCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
.......................................................................................................................................TCCAGCTTGGTCTACAAAGTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 11 0.36 0.36 - - - - - - - - - - - - - - 0.18 - - 0.09 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCCAGCTTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 ca 0.12 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGAGGCCTAACTG.......................................................................... 15 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCCAGCTTGGTCTACAAAGTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08
...................................................................................................................ATGGTGGCGCACGCCTTTAATCCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 18 0.06 0.06 - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -