(1)
OTHER.ip
(5)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(40)
TESTES

Sense strand
CCTACATGTTCCAGGGCGCGGACTACCAAGCTGGCAAATCAGGTTCCCGGTCCATGAAAAGCCCCTGGGAGGAGAATCGAGCGATCTTTTTGGAAGTCCAGAAGAAGGTATTTCTTCAAGCAAGTCTAATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACAAATCCTCCAGGAGGCAAAGAAAGTGGGGGATCTTCGATGAATCAACTCCTGTGGAAACTC
........................................................................................................................................((........(((((((.....)))))))..............((..(((((....)))))..))..)).............................................
............................................................................................................................125.................................................................................209.......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACC.............................................................................................. 27 2 82.00 82.00 24.50 19.00 5.00 5.50 4.00 5.00 4.50 3.50 2.00 1.00 2.50 - 1.00 0.50 0.50 0.50 - 0.50 - 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - 0.50 - - -
.............................................................................................................................................TAATATTTTCGGACCAACTGAAGAACC.................................................................................. 27 2 19.50 19.50 - - 6.50 5.50 4.50 - - - - 0.50 1.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGAC............................................................. 30 2 17.50 17.50 5.00 4.50 0.50 0.50 - 3.00 1.50 - 1.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGGAC............................................................................................... 26 2 17.50 17.50 6.50 5.00 0.50 1.00 0.50 1.00 2.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACCAAC........................................................................................... 30 2 17.50 17.50 2.00 1.50 2.00 0.50 1.50 3.00 1.50 - 0.50 1.00 1.50 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGGCATCTAATATTTTCGGACCAACTG......................................................................................... 27 2 15.00 15.00 9.00 3.00 - - - 0.50 2.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACCA............................................................................................. 28 2 13.50 13.50 1.50 2.50 1.00 1.00 4.00 - 0.50 - - 1.00 1.00 - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAG................................................................ 27 2 13.50 13.50 2.50 3.50 1.00 0.50 1.00 0.50 0.50 - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 2.00 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
..............................................................................................................................TAATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGAC............................................................................................... 29 2 10.50 10.50 3.00 1.00 - - - 1.00 - - 3.00 0.50 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGG............................................................... 28 2 7.50 7.50 1.50 1.00 0.50 1.00 1.00 0.50 - 1.00 - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACCAA............................................................................................ 29 2 5.50 5.50 - 0.50 0.50 0.50 1.50 0.50 - - - - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACA............................................................ 29 2 5.50 5.50 2.00 0.50 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGAC............................................................. 28 2 4.00 4.00 0.50 - - 0.50 - 0.50 0.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACA............................................................ 31 2 3.50 3.50 - - 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAATAGGATGGCATCTAATATTTTCGG................................................................................................. 27 2 3.50 3.50 1.00 - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAATAGGATGGCATCTAATATTTTCG.................................................................................................. 26 2 3.50 3.50 0.50 1.50 - - - - - 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGA................................................................. 26 2 3.50 3.50 0.50 - 0.50 0.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAATATTTTCGGACCAACTGAAGAAC................................................................................... 26 2 3.50 3.50 - - 2.00 - - 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGA................................................................................................ 28 2 3.00 3.00 - 1.50 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TACCCAAGAGGACAAATCCTCCAGGAGGC............................................. 29 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACC.............................................................................................. 30 2 2.50 2.50 - 0.50 - - - - - - 0.50 - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGA.............................................................. 29 2 2.50 2.50 0.50 - 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TAAAAACATACCCAAGAGGACAAATCCTCCA................................................... 31 2 2.50 2.50 0.50 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TAAAAACATACCCAAGAGGACAAATCCTCC.................................................... 30 2 2.50 2.50 1.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGAAC................................................................................... 28 2 2.50 2.50 - - 0.50 1.00 - - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CTAATATTTTCGGACCAACTGAAGgcat.................................................................................. 28 gcat 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGAC............................................................. 31 2 2.00 2.00 - - 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATAT....................................................................................................... 18 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATGGCATCTAATATTTTCGGACCAACTG......................................................................................... 28 2 1.50 1.50 - 0.50 - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGGAtc.............................................................................................. 27 tc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGCATCTAATATTTTCGGACCAACTGt........................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGGAta.............................................................................................. 27 ta 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CCCAAGAGGACAAATCCTCCAGGAGGCAA........................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGGATGGCATCTAATATTTTCGGACCAACT.......................................................................................... 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAATATTTTCGGACCAACTGAAGAACCT................................................................................. 28 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGGAGAATCGAGCGATCTTTTTGGAAG.......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACAA........................................................... 29 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AAAGTGGGGGATCTTCGgacc.................... 21 gacc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CCCAAGAGGACAAAaaa....................................................... 17 aaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGAACC.................................................................................. 29 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGA.............................................................. 28 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGtacc.............................................................................................. 27 tacc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTTTCGG................................................................................................. 24 2 1.00 1.00 - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGA................................................................. 29 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAATATTTTCGGACCAACTGAAGAcac.................................................................................. 27 cac 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAa................................................................ 27 a 1.00 3.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CCAACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAG.................................................................. 30 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
...................................................................................................................................GGATGGCATCTAATATTTTCGGACCAAC........................................................................................... 28 2 1.00 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGGCATCTAATATTTTCGGACCAACT.......................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACA............................................................ 30 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TACCCAAGAGGACAAATCCTCCAGGAGG.............................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GAATCGAGCGATCTTTTTGGAAGTCC....................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATGGCATCTAATATTTTCGGACCAACT.......................................................................................... 27 2 1.00 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CCCAAGAGGACAAATCCTCCAGGAGGCA............................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGA..................................................................................... 26 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAATATTTTCGGACCAACTGAAGcatc.................................................................................. 27 catc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGGATGGCATCTAATATTTTCGGACC.............................................................................................. 26 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................AGAGGACAAATCCTCCAGGAGGCAAAGga....................................... 29 ga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................GAGGACAAATCCTCCAGGAGGCAAAGga....................................... 28 ga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................AGAGGACAAATCCTCCAGGAGGCAAAGgt....................................... 29 gt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GATGGCATCTAATATTTTCGGACCAACT.......................................................................................... 28 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GCATCTAATATTTTCGGACCAACTGAAG...................................................................................... 28 2 1.00 1.00 - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAATATTTTCGGACCAg............................................................................................ 17 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAG................................................................ 30 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAATAGGATGGCATCTAATATTTTagg................................................................................................. 27 agg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................ACCAACTGAAGAACCTAAAAACATACCC..................................................................... 28 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TATTTTCGGACCAACTGAAGAACCTAAA.............................................................................. 28 3 0.67 0.67 - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGt.............................................................. 29 t 0.50 7.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TCTAATATTTTCGGACCAACTGAAG...................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGAC............................................................. 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGAC............................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGG............................................................... 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAGGATGGCATCTAATATTT..................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................ACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGA................................................................. 28 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGAACa.................................................................................. 29 a 0.50 2.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGa............................................................... 28 a 0.50 13.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GATGGCATCTAATATTTTCGGACCAAC........................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TTGGAAGTCCAGAAGAAGGTATTTCTTCAA................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGGCATCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGc..................................................................................... 31 c 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GATGGCATCTAATATTTTCGGACCAACTG......................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CATCTAATATTTTCGGACC.............................................................................................. 19 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AATAGGATGGCATCTAAT......................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACAA........................................................... 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGA................................................................. 27 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................ATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACCA............................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAATATTTTCGGACCAACTGAAGAA.................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GCATCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGAA.................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGGAAGTCCAGAAGAAGGTATTTCTTCAA................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................ACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAG................................................................ 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGGCATCTAATATTTTCGGACCAACTGAAG...................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACt............................................................ 31 t 0.50 17.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TAAAAACATACCCAAGAGGACAAATCCTCCAGt................................................. 33 t 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CCAACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGG............................................................... 33 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
........................................................................................................................................................................TAAAAACATACCCAAGAGGACAAATCCTCCAG.................................................. 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGA.............................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................ATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACC.............................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
......................................................................................................................................TGGCATCTAATATTTTCGGACCAAC........................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GAAGAACCTAAAAACATACCCAAGA................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATGGCATCTAATATTTTCGGACCAAC........................................................................................... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGt............................................................... 28 t 0.50 13.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GGATGGCATCTAATATTTTCGGACCA............................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACC.............................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACA............................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TTCGGACCAACTGAAGAACCTAAAAAC........................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GGACCAACTGAAGAACCTAAAAACATA........................................................................ 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33
.................................................................................................................................................ATTTTCGGACCAACTGAAGAAC................................................................................... 22 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAAGTCCAGAAGAAGGTATTTCTTCAAGCA................................................................................................................................ 30 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - -
................................................................................................................................................TATTTTCGGACCAACTGAAGAACCTAA............................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCTACATGTTCCAGGGCGCGGACTACCAAGCTGGCAAATCAGGTTCCCGGTCCATGAAAAGCCCCTGGGAGGAGAATCGAGCGATCTTTTTGGAAGTCCAGAAGAAGGTATTTCTTCAAGCAAGTCTAATAGGATGGCATCTAATATTTTCGGACCAACTGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACAAATCCTCCAGGAGGCAAAGAAAGTGGGGGATCTTCGATGAATCAACTCCTGTGGAAACTC
........................................................................................................................................((........(((((((.....)))))))..............((..(((((....)))))..))..)).............................................
............................................................................................................................125.................................................................................209.......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
..............................................................................................................................................................................................CTCCAGGAGGCAAAcctt.......................................... 18 cctt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CTCCAGGAGGCAAAGAtt........................................ 18 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTCCAGGAGGCAAAGAcccc........................................ 20 cccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGAAGAACCTAAAAACATACCCAAGAc................................................................. 27 c 1.00 3.50 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTCCAGGAGGCAAAGcctt......................................... 19 cctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTCCAGGAGGCAAAGAcctt........................................ 20 cctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CTCCAGGAGGCAAAGAat........................................ 18 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AAGAACCTAAAAACATACCCAAGAGGACA............................................................ 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -