(8)
OTHER.mut
(3)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(29)
TESTES

Sense strand
CAGGCGGGCTCCCATGAGTCCTTGCTGCATCTCGTCCAATGGGGTTCGAGGTGAGTGGCTTCCGCCCGGATGAATAGTAGTAGTCCAAGGTTCGGGTAGGCGAGATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGCTGACCTCTGGGTGACTTCTTCACGGGAGCCTCGGTGGTTTCCCACTCCCACAAATGTAATCAAATCTTGCAAGCAACCAGTAAGTTTGTCACAATGAAGGAACGAAGATGGA
......................................................((.(((((.(((((((((.(((...((...((........))...))....))).)))).))))).))..))).))........................................................................................................................
....................................................53...............................................................................134..................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
..................................................................................GTCCAAGGTTCGGGTAGGCGAGAT................................................................................................................................................ 24 1 10.00 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGTGAC........................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTGGGCTGAGTGGTGAC........................................................................................................................ 19 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GTTCTTGCTGACCTCTGG...................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGTAGTCCAAGGTTCGGGTAGGCGAGATG............................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATGTGCATTGTGGGCTGAG............................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................................................................................GATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGTG.......................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................................................GAGATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGTGA......................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGTGAC........................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGGTGACGTTCTTGCTGA............................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGCATTGTGGGCTGAGTGGTGACGT...................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TTGCTGACCTCTGGGTGACTTCTTCAC......................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTGTCACAATGAAGGAACGAAGATGG. 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GTTCGGGTAGGCGAGATG............................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTGCATTGTGGGCTGAGTGG............................................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GCTTCCGCCCGGATGAATAGT............................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTGTCACAATGAAGGAACGAAGATG.. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AAGGTTCGGGTAGGCGAGATG............................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GCATTGTGGGCTGAGTGGTG.......................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTAATCAAATCTTGCAAGCAACCAG................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GTGGGCTGAGTGGTGACG....................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGTGGGCTGAGTGGTGACGTTCT................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTGCATTGTGGGCTGAGTGGTGACG....................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GTTCGGGTAGGCGAGATGTG............................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTGGGCTGAGTGGTGACGTTCTT.................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................................................................TAGGCGAGATGTGCATTGTGGGC................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGCATTGTGGGCTGAGTGG............................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................AGGCGAGATGTGCATTGTGGGCTGA................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGCTGAC............................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................ATTGTGGGCTGAGTGGTG.......................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................ACGTTCTTGCTGACCTCTG....................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................AGATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGT........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................GAGATGTGCATTGTGGGCTGAG............................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGTAGTAGTCCAAGGTTCGGGT......................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................AAGGTTCGGGTAGGCGAGATGTG............................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GAGATGTGCATTGTGGGCTG................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGCTGA............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................................................................................GTCCAAGGTTCGGGTAGGCGAGATG............................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGGTTCGGGTAGGCGAGATGT.............................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...............................................................................................................TTGTGGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGC................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.......................................................................................................GATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGT........................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GTGGGCTGAGTGGTGACGTTC.................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GAGATGTGCATTGTGGGCT.................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGCTGACCTCTGGGTGACTTCTT............................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GCATTGTGGGCTGAGTGGT........................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................AGGCGAGATGTGCATTGTGGGCTGAG............................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGT........................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGCTG.............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGCTGACCT.......................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGTGGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGaa............................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................GTCACAATGAAGGAACGAAGATGGA 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AATGAAGGAACGAAGATG.. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GAGATGTGCATTGTGGGCTGAGT.............................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GACGTTCTTGCTGACCTC......................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................AGGTTCGGGTAGGCGAGATG............................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GAATAGTAGTAGTCCAAGGTTCGG........................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................TTCGGGTAGGCGAGATGTGCATTG........................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGTCACAATGAAGGAACGAAGATGG. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTGGGCTGAGTGGTGA......................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -

Antisense strand
CAGGCGGGCTCCCATGAGTCCTTGCTGCATCTCGTCCAATGGGGTTCGAGGTGAGTGGCTTCCGCCCGGATGAATAGTAGTAGTCCAAGGTTCGGGTAGGCGAGATGTGCATTGTGGGCTGAGTGGTGACGTTCTTGCTGACCTCTGGGTGACTTCTTCACGGGAGCCTCGGTGGTTTCCCACTCCCACAAATGTAATCAAATCTTGCAAGCAACCAGTAAGTTTGTCACAATGAAGGAACGAAGATGGA
......................................................((.(((((.(((((((((.(((...((...((........))...))....))).)))).))))).))..))).))........................................................................................................................
....................................................53...............................................................................134..................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
.......................................................CTTCCGCCCGGATaca................................................................................................................................................................................... 16 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................CTTCCGCCCGGATtcat................................................................................................................................................................................... 17 tcat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GCTTCCGCCCGGATgcca................................................................................................................................................................................... 18 gcca 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTGAGTGGTGACGTTCTTGCTGACCTC......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -