(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(32)
TESTES

Sense strand
GCCTCTTATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGAGGTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGCTAGGTAATCTCGGGGGAGAGGTGTTAGGTCGCCCTGTGGCTGAAGGTCTCCCAGTTCTTCCCCTCCAGAGGCAACCTGTATCACGGAGATGTCGATGATGATGG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
..................................................GTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGG......................................................................................................... 23 1 12.00 12.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................ACCGACGTAGAGAAAAGGGAGagg............................................................................................................................. 24 agg 8.00 0.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAACC.................................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 - - - - 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGAGa............................................................................................................................... 27 a 5.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGATGATGATGG 26 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - -
..................................................GTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGC........................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGTATCACGGAGATGTCGATGATGATG. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................................GTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGCT....................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........TAGCTAACCGCGTCGGGAACCGACGT............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGGCAACCTGTATCACGG.................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGAG................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGATGATGATG. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGAG................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGATGATGATGGg 27 g 2.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGATGATGAT.. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GGAGGTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGCT....................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCACGGAGATGTCGATGATGtt.. 22 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................CAACCTGTATCACGGAGATGTCGATG....... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GAGGCAACCTGTATCACGGAGATGTC........... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CGGCTAGGTAATCTCGGGGGAGAGGTGT................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CCGACGTAGAGAAAAGGG.................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GAACCGACGTAGAGAAAAGGGAG................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGATGATGATGtc 27 tc 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GACGTAGAGAAAAGGGAG................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAACCG................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GAACCGACGTAGAGAAAAGGGAGagg............................................................................................................................. 26 agg 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AACCTGTATCACGGAGATG............. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGA......... 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGATGATGATGGtt 28 tt 1.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACCTGTATCACGGAGATGTCGATGt...... 25 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................GAGAAAAGGGAGGTGAGCACTTGGA................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................ACCGACGTAGAGAAAAGGGAGaggc............................................................................................................................ 25 aggc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CCGACGTAGAGAAAAGGGAGaggc............................................................................................................................ 24 aggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................................................................................................................AGATGTCGATGATGAgag 18 gag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................ACCGACGTAGAGAAAAGG................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACCTGTATCACGGAGATGTCGATG....... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCCAGAGGCAACCTGTATCACGGAGATGT............ 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TCTTATCTTAGCTAACCGCGTCGGGt..................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
......................................................................................................................................................TGTATCACGGAGATGTCGATGATGAaggc 29 aggc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTATCTTAGCTAACCGCGTCGGGcacc.................................................................................................................................................. 27 cacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGCTAGG.................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....CTTATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAACC.................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGCTAG..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGA................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGA................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAACC.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGATGATGATGtctt 29 tctt 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGAGGTG............................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CCGACGTAGAGAAAAGGGAGa............................................................................................................................... 21 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAAC................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CAACCTGTATCACGGAGATGTCGAT........ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGAAGGTCTCCCAGTTCTTCCCCTCCA..................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGCTAACCGCGTCGGGAA.................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
........................CGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGG.................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGCaga..................................................................................................... 27 aga 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AACCGACGTAGAGAAAAGGGAG................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TATCACGGAGATGTCGAT........ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......TATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAACCGAC............................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................ACGTAGAGAAAAGGGAG................................................................................................................................ 17 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GCCTCTTATCTTAGCTAACCGCGTCGGGAACCGACGTAGAGAAAAGGGAGGTGAGCACTTGGAGCGGGGGCGGCTAGGTAATCTCGGGGGAGAGGTGTTAGGTCGCCCTGTGGCTGAAGGTCTCCCAGTTCTTCCCCTCCAGAGGCAACCTGTATCACGGAGATGTCGATGATGATGG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
...............................................................................................................................GTTCTTCCCCTCCAGAGGCAACCTGTA........................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
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...............................................................................................................................................CAACCTGTATCACGgt................... 16 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGAAGGTCTCCCAGTTCTTCCCCTCCA..................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -