| Gene: Sec24c | ID: uc007skg.1_intron_13_0_chr14_21509243_f.3p | SPECIES: mm9 |
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(1) OTHER.ip |
(8) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(6) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(36) TESTES |
| AAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTTGAGAGAGAGAGAGAAACCCTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGGAGAGAAAGAAATGCAAGGTGGGCAAAGCTATTTGACATTTCTTCTCTTCCCTTTCAGACTCTGTTTCAGCCTCAGACAGGTACCTATCAGACTCTGGCCAAAGAGTG .......................................................................................................................................((((.(((((((.((((((((((((...(((...))).)))).))))))))))))))).)))).................................................... ...................................................................................................................................132.................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) |
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| ...................................................................................................................................................................................ATTTCTTCTCTTCCCTTTCAGt................................................. | 22 | t | 8.00 | 0.00 | - | - | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................................................................................AAGAAAAGGGAGAGAAAGAAATG.............................................................................................. | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........CAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt..................................................................................................................................................................................................................... | 26 | tttt | 3.00 | 0.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt..................................................................................................................................................................................................................... | 27 | tttt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtta...................................................................................................................................................................................................................... | 29 | tta | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................CAGCCAGGGCTATACAGAcca..................................................................................................................................................................................................................... | 21 | cca | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGcgt...................................................................................................................................................................................................................... | 29 | cgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttt.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | ttt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........CAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt...................................................................................................................................................................................................................... | 25 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ACAGCCAGGGCTATACAGAGttt.................................................................................................................................................................................................................... | 23 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................CTCAGACAGGTACCTATCAGACTCTG........... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ACAGCCAGGGCTATACAGAGttat................................................................................................................................................................................................................... | 24 | ttat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............AGGACAGCCAGGGCTATACAGAGttat................................................................................................................................................................................................................... | 27 | ttat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGTTTCAGCCTCAGACAG............................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCac............................................................................................................................................................................................................... | 34 | ac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| AAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTTGAGAGAGAGAGAGAAACCCTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGGAGAGAAAGAAATGCAAGGTGGGCAAAGCTATTTGACATTTCTTCTCTTCCCTTTCAGACTCTGTTTCAGCCTCAGACAGGTACCTATCAGACTCTGGCCAAAGAGTG .......................................................................................................................................((((.(((((((.((((((((((((...(((...))).)))).))))))))))))))).)))).................................................... ...................................................................................................................................132.................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaa......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | gaa | 4.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAgatt.......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | gatt | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAggt............................................................................................................................... | 28 | ggt | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................TTTGACATTTCTTCTCTTCCCTTTCAG.................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAgggg...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | gggg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| .........GGACAGCCAGGGCTATACAGgaac......................................................................................................................................................................................................................... | 24 | gaac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgca.................................................................................................................................................................................................................... | 28 | gca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtcta......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | tcta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GGACAGCCAGGGCTATACAGAGAAAgaa.................................................................................................................................................................................................................... | 28 | gaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaaa......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | gaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTCCAGGACAGCCAGGGCTATAgaa............................................................................................................................................................................................................................ | 25 | gaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................CATTTCTTCTCTTCCCTTTC.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........GGACAGCCAGGGCTATACAGgggt......................................................................................................................................................................................................................... | 24 | gggt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |