| Gene: Prelid1 | ID: uc007qql.1_intron_1_0_chr13_55424440_f.5p | SPECIES: mm9 |
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(1) OTHER.ip |
(5) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(8) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(31) TESTES |
| ATCAGACCATGACCACCTTCACCTGGAACATCAACCATGCCCGGCTGATGGTGAGACTTCCTTTGCTCCCTCAAAATAGTTGCCCTTCAGATTTCAGGCAAGAGAGTTGTGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGCCTAAAATACCAATGAGCTGCATCTCTAGAGTTCTGCCCTTAGATTGGTCTACCCTTTCGATTGGTCAGATTCTCTGGGACTGTCCCTTGGCTCTCAGATGGTGGGGAAAGACAC ..............................................................................................................(((..((((((....)))))).(((((............(((((..........)))))............))))).)))............................................................ ........................................................................................................105..................................................................................190.......................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .............................................................................................................TGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGCCTA............................................................................................................... | 30 | 1 | 6.00 | 6.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGCC................................................................................................................. | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGCCT................................................................................................................ | 29 | 1 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................TCAGATTTCAGGCAAGAGAGTTGTGGG......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TTCAGATTTCAGGCAAGAGAGTTGTG........................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................TCACCTGGAACATCAACCATGCCCGGCT............................................................................................................................................................................................................ | 28 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| .................TTCACCTGGAACATCAACCATGCCCGGC............................................................................................................................................................................................................. | 28 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................TGGGACTGTCCCTTGGCTCTCAGATGG............. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TGCCCTTCAGATTTCAGGCAAGAGAGT............................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................TCAGATTTCAGGCAAGAGAGTTGTGGGA........................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................TGCCCGGCTGATGGTGAGACTTCCTT........................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................GTTGTGGGAACTTCTGTGGCCAGAGG....................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................TCAGATTTCAGGCAAGAGAGTTGTGGGt........................................................................................................................................ | 28 | t | 2.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TAAAATACCAATGAGCTGCATCTCTAGA..................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TCTAGAGTTCTGCCCTTAGATTGGTCT................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................GATTGGTCAGATTgtct....................................... | 17 | gtct | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................TTTCGATTGGTCAGATTCTCTGGG.................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................TGGGACTGTCCCTTGGCTCTCAGATGGT............ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TCTAGAGTTCTGCCCTTAGATTGG................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................TCAGATTTCAGGCAAGAGAGTTGTGGt......................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................GTTGTGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGC...................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGGAACATCAACCATGCCCGGCT............................................................................................................................................................................................................ | 23 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................GACTGTCCCTTGGCTCTCAGATGGTG........... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAG.................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGG................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................................................................TTCGATTGGTCAGATTCTCTGGGACTG................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TTCACCTGGAACATCAACCATGCCCGGCTGt.......................................................................................................................................................................................................... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................................................................................................TGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGgc................................................................................................................. | 28 | gc | 1.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGC.................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................TTTCGATTGGTCAGATTCTCTGGGA................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................TACCCTTTCGATTGGTCAGATTCTCT....................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................CTAAAATACCAATGAGCTGCAT............................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................GGGACTGTCCCTTGGCTCTCAGATGGT............ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................GAGTTGTGGGAACTTCTGTGGCCAGAGG....................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TACCAATGAGCTGCATCTCTAGAGTTC................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................TAGAGTTCTGCCCTTAGATTGGTCTACC............................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TCTCTAGAGTTCTGCCCTTAGATTGGTC................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TACCAATGAGCTGCATCTCTAGAGT................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................TTTCGATTGGTCAGATTCTCTGGGACTGT............................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................TCAACCATGCCCGGCTGATGGTGgtg.................................................................................................................................................................................................. | 26 | gtg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................TTTCGATTGGTCAGATTCTCTGGGAC.................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................GGGACTGTCCCTTGGCTCTCAGATGGTG........... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGg.................................................................................................................. | 27 | g | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................TGGAACATCAACCATGCCCGGC............................................................................................................................................................................................................. | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGGAACATCAACCATGCCCGGCTGATGGTG..................................................................................................................................................................................................... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CTGGAACATCAACCATGCCCGGCTGA.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGGAACATCAACCATGCCCGG.............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TTCACCTGGAACATCAACCATGCCCGG.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TTCACCTGGAACATCAACCATGCCCGGCT............................................................................................................................................................................................................ | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................ACCTGGAACATCAACCATGCCCGGCTG........................................................................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................TCAACCATGCCCGGCTGAT......................................................................................................................................................................................................... | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........ACCACCTTCACCTGGAACATCAACCATGCC................................................................................................................................................................................................................. | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |
| .TCAGACCATGACCACCTTCACCTGGAA.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GACCATGACCACCTTCACCTGGAACATCAAC....................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TCTACCCTTTCGA...................................................... | 13 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 |
| ATCAGACCATGACCACCTTCACCTGGAACATCAACCATGCCCGGCTGATGGTGAGACTTCCTTTGCTCCCTCAAAATAGTTGCCCTTCAGATTTCAGGCAAGAGAGTTGTGGGAACTTCTGTGGCCAGAGGCAGGCCTAAAATACCAATGAGCTGCATCTCTAGAGTTCTGCCCTTAGATTGGTCTACCCTTTCGATTGGTCAGATTCTCTGGGACTGTCCCTTGGCTCTCAGATGGTGGGGAAAGACAC ..............................................................................................................(((..((((((....)))))).(((((............(((((..........)))))............))))).)))............................................................ ........................................................................................................105..................................................................................190.......................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........GACCACCTTCACCTGGAACATCAACCA..................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 3 | 2.67 | 2.67 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..AGACCATGACCACCTTCACCTGGAACAa............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........GACCACCTTCACCTGGAACATCAct......................................................................................................................................................................................................................... | 25 | ct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CATGACCACCTTCACCTGGAACATCAa......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........ATGACCACCTTCACCTGGAACATCA......................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GCTGCATCTCTAGAGTTCTGCCCTTA......................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........ACCACCTTCACCTGGAACATCAACCA..................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...CCATGACCACCTTCACCTGGAACAaaa............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | aaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....ACCATGACCACCTTCACCTGGAACATCA......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CAGACCATGACCACCTTCACCTGGAA.............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....ACCATGACCACCTTCACCTGGAACA............................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CCATGACCACCTTCACCTGGAACATCA......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGACCACCTTCACCTGGAACATCAACCA..................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGACCACCTTCACCTGGAACATCA......................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |