(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(47)
TESTES

Sense strand
TGCACAAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAGGCTGAGCAACTCCCTGAGGTGGGGTCCCTGGAGGGATTGTGTTTCTCCTCATATGTGAAGACTTTTTCTCTGGTACTGGGATGGTGAGTCTCACAGTGCAGCTAGGGAATATGGGTGAGTGTGAGTGTCAGTGTTATTGTCACTTCTCTGTATGCCCTTTCCTTCTAGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTCA
........................................................................................................((((((((((.....))))..))))))..((((((((...(((((((...(((((.((((...)))).)))))))).....)))).))))..))))..................................................
...............................................................................................96......................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCT............. 30 1 223.00 223.00 2.00 17.00 17.00 47.00 16.00 - 15.00 6.00 19.00 5.00 15.00 20.00 24.00 4.00 1.00 1.00 8.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 28 1 155.00 155.00 41.00 10.00 5.00 11.00 10.00 - 7.00 17.00 1.00 3.00 6.00 1.00 - 5.00 5.00 3.00 1.00 3.00 8.00 - 4.00 1.00 2.00 2.00 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTT............ 31 1 153.00 153.00 - 22.00 13.00 28.00 24.00 - 7.00 2.00 18.00 6.00 5.00 7.00 12.00 3.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCC.................. 25 1 111.00 111.00 50.00 7.00 11.00 - 3.00 - 12.00 1.00 - 6.00 4.00 - - 4.00 - 1.00 - - - 6.00 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCC................. 26 1 99.00 99.00 22.00 5.00 13.00 - 7.00 - 9.00 1.00 - 6.00 3.00 - - 5.00 - 7.00 - 7.00 - 2.00 6.00 1.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................TCTGGTACTGGGATGGTGAGTCTCACAGTGCAGCTAGGGAATATGGGTGAGT.................................................................................................. 52 1 89.00 89.00 - - - - - 89.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 29 1 86.00 86.00 6.00 8.00 6.00 9.00 8.00 - 2.00 5.00 6.00 - 1.00 4.00 1.00 4.00 9.00 1.00 2.00 2.00 5.00 - - - 1.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACC................... 24 1 59.00 59.00 32.00 2.00 5.00 - 2.00 - 4.00 5.00 - 1.00 - - - 3.00 - - - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCG................ 27 1 36.00 36.00 7.00 5.00 7.00 - - - 2.00 - - 2.00 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGt............... 28 t 28.00 36.00 12.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTAC.................... 23 1 19.00 19.00 9.00 1.00 1.00 - - - 4.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTC. 26 1 16.00 16.00 6.00 5.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 31 1 10.00 10.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 30 1 9.00 9.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 32 1 9.00 9.00 - 1.00 - - 2.00 - - - 3.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGC........................ 22 1 7.00 7.00 5.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCt................ 27 t 7.00 99.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGt............... 32 t 6.00 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTa............ 31 a 6.00 223.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCT............. 27 1 6.00 6.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAt........................... 19 t 6.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTAC.................... 26 1 6.00 6.00 1.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTA..................... 22 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCT.. 25 1 5.00 5.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCt................ 31 t 5.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACC................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCC................. 30 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTT............ 30 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGTGCCC...... 29 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCG................ 31 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTAC.................... 25 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 32 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCT............. 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTA..................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCC................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AAGCTTCTTCAAGGATGACCAA............................ 22 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCG................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 25 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGt........................ 28 t 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCa............. 30 a 3.00 86.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCt.............. 29 t 3.00 155.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGT.......... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTT............ 28 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGC........................ 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATG......................... 21 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCC.................. 28 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCT....................... 20 2 2.50 2.50 1.50 - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAGGCTG...................................................................................................................................................................................................................... 28 2 2.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
.........................................................................................AAGACTTTTTCTCTGacc............................................................................................................................................... 18 acc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGC... 24 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTA..................... 30 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTA..................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCtt............. 30 tt 2.00 155.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTCTAGAAGCTTCTTCAAGGATGACC.............................. 30 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTT............ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTT............ 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTCA 24 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCcct.............. 29 cct 2.00 99.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTa. 26 a 2.00 5.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................AATGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTC. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCG................ 30 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCC................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGGATGACCAAATGCTTACCC.................. 22 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCc............. 30 c 2.00 86.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCt................. 26 t 2.00 111.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAA............................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ATGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGTGCCC...... 30 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCT............. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AAGACTTTTTCTCTGacca.............................................................................................................................................. 19 acca 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATG......................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGTGt........ 27 t 2.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAGGC........................................................................................................................................................................................................................ 26 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 0.50 -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGt............... 31 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCcca 27 cca 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTCA 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCC................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CCAAATGCTTACCCCGCCT............. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCat............. 30 at 1.00 155.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CTTCTCTGTATGCCCTTTCCTTCa.................................................... 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGtt.............. 33 tt 1.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGATGACCAAATGCTTACCCC................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCacct............. 30 acct 1.00 99.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GACCAAATGCTTACCCCG................ 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGTGC........ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGATGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCtcgc............... 32 tcgc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAG.... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCtc................. 26 tc 1.00 59.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACtcc................. 26 tcc 1.00 19.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCcc............... 27 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AAGGATGACCAAATGCTTACCCttc............... 25 ttc 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCC.................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCC.................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GCTTCTTCAAGGATGACCAAt........................... 21 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCa.................. 25 a 1.00 59.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCA..... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGGATGGTGAGTCTCACAGTGCAGCTAGt................................................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATG................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGACCAAATGCTTACCCCGCC.............. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTCTAGAAGCTTCTTCAAGGATGAC............................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCt.............. 31 t 1.00 9.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCtcc.............. 29 tcc 1.00 99.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTTCAAGGATGACCAAATGCTTAa.................... 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCttt............ 31 ttt 1.00 155.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAAT.......................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAA............................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGtct............. 30 tct 1.00 36.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCtgc............... 30 tgc 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGCTTCTTCAAGGATGACCAActgc........................ 27 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGT.......... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGC........................ 19 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACC................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCtcct............. 29 tcct 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTA..................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GCTTCTTCAAGGATGACCAAA........................... 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCaa............. 30 aa 1.00 155.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GGATGACCAAATGCTTACC................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAA........................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................CCGCCTTGTGCCCAGCTC. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTTCAAGGATGACCAAAT.......................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCT....................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ATGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGT.......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ATGACCAAATGCTTACCCCGCCTT............ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCT............. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CACAAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAaa......................................................................................................................................................................................................................... 31 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATG......................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGa............... 32 a 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGTGAAGACTTTTTCTCTGGTACTG............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATGAC............................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGt........................ 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGGTGAGTCTCACAGTGCAGCTAGGGt.............................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTCTAGAAGCTTCTTCAAGGATGACt.............................. 30 t 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCat............ 31 at 1.00 86.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCttt.............. 33 ttt 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTTt........... 32 t 1.00 153.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTAC.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAGGCat...................................................................................................................................................................................................................... 28 at 1.00 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATG......................... 18 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGC........................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACC................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTCtttt 30 tttt 1.00 16.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATG......................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCAAGGATGACCAAATGCTTACCC.................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................AGTGTCAGTGTTATTGTCACTTC........................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAtt.......................... 20 tt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACtt.................. 29 tt 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTt. 26 t 1.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCa................ 31 a 1.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CAAATGTAGAACCTAGCCAGAtggt............................................................................................................................................................................................................................. 25 tggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCcc............... 28 cc 1.00 99.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..CACAAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAG.......................................................................................................................................................................................................................... 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AGCTTCTTCAAGGATGAC............................... 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACC................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCC.................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTc............ 31 c 1.00 223.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCccc.............. 29 ccc 1.00 99.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAt........................... 25 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GTGTTTCTCCTCATATGTGAAGACTTT......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCtgc............... 31 tgc 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCgcct.............. 29 gcct 1.00 111.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTCTTCAAGGATGACCAAATGCT....................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TCTCTGGTACTGGGATGGTGAGTCTC.............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGATGACCAAATGCTTACCCCGC............... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCT....................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTcacc................... 31 cacc 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCtcct............. 30 tcct 1.00 99.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCacgc............... 32 acgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTGCAGCTAGGGAATATGGGTGA.................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CAAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTC............................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TAGAACCTAGCCAGAGGGTCAGGCTGA..................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTgcct................... 24 gcct 0.50 2.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTCAAGGATGACCAAATGCTT...................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CAAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAGGCT....................................................................................................................................................................................................................... 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCA........................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CACAAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTC............................................................................................................................................................................................................................ 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTC............................................................................................................................................................................................................................ 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGTAGAACCTAGCCAGAGGG.............................................................................................................................................................................................................................. 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25

Antisense strand
TGCACAAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCAGGCTGAGCAACTCCCTGAGGTGGGGTCCCTGGAGGGATTGTGTTTCTCCTCATATGTGAAGACTTTTTCTCTGGTACTGGGATGGTGAGTCTCACAGTGCAGCTAGGGAATATGGGTGAGTGTGAGTGTCAGTGTTATTGTCACTTCTCTGTATGCCCTTTCCTTCTAGAAGCTTCTTCAAGGATGACCAAATGCTTACCCCGCCTTGTGCCCAGCTCA
........................................................................................................((((((((((.....))))..))))))..((((((((...(((((((...(((((.((((...)))).)))))))).....)))).))))..))))..................................................
...............................................................................................96......................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
......................................................................................................................TCACAGTGCAGCTAGaacc................................................................................................................. 19 aacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AAATGTAGAACCTAGCCAGAGGGTCA........................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -