(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(35)
TESTES

Sense strand
ACCTTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGTACCAGCAAAGAACCTGTGTTCCCAGGACATTTGGGGGGTGGGGGTGGGGTTGGAATCAGAGGGCTGCTGGGGTTTGAGTGGGAAGCTGAAGTGCCTGGCAATATTGAAGCCCTAGCATCTGGGGCTGCTGCTTGGGGGTCACATTTCAAACTCTAGCCCAGCCTGAGAGCCCTCTAGCGTCTAGCGTGGGGTAGGGAG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 15.00 15.00 3.00 2.00 2.00 2.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGAT.................................................................................................................................................................................................................. 21 1 14.00 14.00 5.00 3.00 2.00 - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATC........................................................................................................................................................................................................... 28 1 12.00 12.00 2.00 - - 4.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGT........................................................................................................................................................................................................................ 30 1 9.00 9.00 1.00 - 2.00 2.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCT.......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 - - - 4.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGT........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 - - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGA................................................................................................................................................................................................................... 20 1 6.00 6.00 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGAATCAGAGGGCTGCTGGGGTTTGAGTGG..................................................................................................................... 31 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATC................................................................................................................................................................................................................. 22 1 5.00 5.00 1.00 - 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGt.................................................................................................................................................................................................................... 26 t 5.00 0.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGG.................................................................................................................................................................................................................... 19 1 5.00 5.00 - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................TGCTGCCAGCTTTCCTGT........................................................................................................................................................................................................................ 18 1 4.00 4.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATC................................................................................................................................................................................................................. 29 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAG..................................................................................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCC........................................................................................................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCC........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TGAGTGGGAAGCTGAAGTGCCTGGCA.................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCC................................................................................................................................................................................................................ 23 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGt.................................................................................................................................................................................................................... 19 t 3.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTT............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGa.................................................................................................................................................................................................................... 19 a 3.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTG......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGG.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGG.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTT............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAAGCTGAAGTGCCTGGCAATATTGAAt......................................................................................... 28 t 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTCAAACTCTAGCCCAGCCTGAGAGCCC.......................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCA............................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCAT............................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCC............................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTT.............................................................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATCCA......................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATC........................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAA...................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGTAAGGATCCCCATCCAGGTggt................................................................................................................................................................................................... 24 ggt 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........ATGTAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCC................................................................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGt.................................................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 0.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTG......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCC................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGAAGTGCCTGGCAATATTGAAGCCCTA.................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCT.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TAGCGTCTAGCGTGGGGTAGGGAGggt 27 ggt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACCTGTGTTCCCAGGACATTTGGGGGGTG.............................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GCAAAGAACCTGTGTTCCCAGGACAT........................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGcc..................................................................................................................................................................................................... 25 cc 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTCCTGTAAGGATCCtta............................................................................................................................................................................................................. 18 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGTAAGGATCCCCATCCAG........................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGAAGTGCCTGGCAATATTGAAGCCCT..................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................GGGGTCACATTTCAAACTCTAGCCCAGC.................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATC........................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TTGAGTGGGAAGCTGAAGTGCC....................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCC........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTT.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGAATCAGAGGGCTGCTGGGGTT............................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTG......................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CATTTCAAACTCTAGCCCAGCCTGAGA.............................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGT........................................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGTAAGGATCCCCATCCAGGcc..................................................................................................................................................................................................... 22 cc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTt....................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 18 2 1.00 1.00 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTa......................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................GGGGTCACATTTCAAACTCTAGCC........................................ 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAt..................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGC................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGTggt................................................................................................................................................................................................... 29 ggt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCAGCTTTCCTGTAAGGATC................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGT........................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCAGCTTTCCTGTAAGGATtt................................................................................................................................................................................................................ 21 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CTGCCAGCTTTCCTGTAAGGAT.................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAt..................................................................................................................................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGT........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CTGAAGTGCCTGGCAATATTGAAGCCCT..................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATCC.......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTgagt.................................................................................................................................................................................................................... 28 gagt 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GCCCTAGCATCTGGGGCTGCTGCTTGt............................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCTTTCCTGTAAGGATCCCCAT............................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCCAGGTACCAGCAAAGAACCTGTGTT.................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CCTGGCAATATTGAAGCCCTAGCAT................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCC.............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................TTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGc...................................................................................................................................................................................................... 25 c 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................GGGGTCACATTTCAAACTCTAGCCCA...................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAAGGATCCCCATCCAGGTACCAGCAA.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TAGCGTCTAGCGTGGGGTA..... 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCC............................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCAGAGGGCTGCTGGGGTTTGAGTGGG.................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCA.................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........AATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAt...................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTAATGTAACTGCTGCCAGC................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGAATCAGAGGGCTGCTGGGGTTT........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTG......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTt............................................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGAT.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TTGAGTGGGAAGCTGAAGTGCCTGGCA.................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCTTTCCTGTAAGGATCCCCtttc.......................................................................................................................................................................................................... 25 tttc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGtt.................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCt............................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCC.............................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGTAAGGATCCCCATCCAGGc...................................................................................................................................................................................................... 21 c 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAATATTGAAGCCCTAGCATCTGGGGCTGCTGC................................................................... 33 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGC.................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGcc..................................................................................................................................................................................................... 27 cc 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGTAAGGATCCCCATCCAGGccct................................................................................................................................................................................................... 24 ccct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGccc.................................................................................................................................................................................................... 28 ccc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGT........................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCCTGTAAGGATCCCCATCCAGG....................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GTAACTGCTGCCAGCTTTC............................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAt........................................................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CTTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAG........................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGAGGGCTGCTGGGGTTTGAGTGGG.................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGG....................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGAATCAGAGGGCTGCTGGG............................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTtt........................................................................................................................................................................................................................ 27 tt 1.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAAGGATCCCCATCCAGGccc.................................................................................................................................................................................................... 21 ccc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGAGAGCCCTCTAGCGTCTAGCGTtgtt....... 28 tgtt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCatc............................................................................................................................................................................................................ 27 atc 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCC................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCA............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAt..................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCT.......................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGcc..................................................................................................................................................................................................... 26 cc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AGCTGAAGTGCCTGGCAATATTGAAGa........................................................................................ 27 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGc...................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGGGGGTCACATTTCAAACTCTAGCCC....................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATCC.......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TACCAGCAAAGAACCTGTGTTCCC............................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....TGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCt........................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 15.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CACATTTCAAACTCTAGCCCAGCCT.................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGAGAGCCCTCTAGCGTCTAGCGTGGt........ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATat................................................................................................................................................................................................................ 29 at 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAAGGATCCCCATCCAGcaa..................................................................................................................................................................................................... 20 caa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TGAGTGGGAAGCTGAAGTG......................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACTGCTGCCAGCTTTCCT.......................................................................................................................................................................................................................... 18 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ACCTTGTTAATGTAACTGCTGCCAGCTTTCCTGTAAGGATCCCCATCCAGGTACCAGCAAAGAACCTGTGTTCCCAGGACATTTGGGGGGTGGGGGTGGGGTTGGAATCAGAGGGCTGCTGGGGTTTGAGTGGGAAGCTGAAGTGCCTGGCAATATTGAAGCCCTAGCATCTGGGGCTGCTGCTTGGGGGTCACATTTCAAACTCTAGCCCAGCCTGAGAGCCCTCTAGCGTCTAGCGTGGGGTAGGGAG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
................GCCAGCTTTCCTGTActgt....................................................................................................................................................................................................................... 19 ctgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCCAGCTTTCCTGTActgg....................................................................................................................................................................................................................... 19 ctgg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CCTGTGTTCCCAGGACA......................................................................................................................................................................... 17 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25