(1)
OTHER.ip
(5)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(38)
TESTES

Sense strand
TGTCTACTGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGGATTGATACTGGTCATTAGGGGAGAGCCAGCCTAGCAAATGGGTGTTGGGGGGAAGAGAGTAGAGCTGACCAGGGACCTGAGCAGAGTGAGCATCTGTCACTCATTCCTGCCTCGGAAGGAGCTTTGGACCTATTAGTGTCTGTCACTTGGGCTGTTCTCCTGTTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGTCAGCGTGCCCTGGAG
............................................................................................(((((...((((((((....((.((((((.......))))))..(((.((.((....)).))...))).......))....))).)))))...)))))............................................................
............................................................................................93................................................................................................191.........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGT.................... 29 1 94.00 94.00 23.00 19.00 6.00 14.00 13.00 7.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGC...................... 27 1 50.00 50.00 4.00 2.00 15.00 3.00 - - 7.00 4.00 7.00 - - - - - - - - 4.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTA................... 30 1 23.00 23.00 - - 1.00 - - - - - - 8.00 - - 8.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TACTGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGG........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 12.00 12.00 4.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACA................. 26 1 8.00 8.00 1.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGTC.............. 28 1 8.00 8.00 3.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGGATTGATACTGGTCATTAGGGGA.................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAG................ 26 1 5.00 5.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGCACC............................. 27 1 5.00 5.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTAC.................. 31 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGGAT........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCG..................... 28 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGG.......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAG....................... 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TACTGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTG............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGGA......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCG..................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAG................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGCACC............................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACA................. 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGTCA............. 29 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGGATT....................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGT.................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGACCAGGGACCTGAGCAGAGTGAGC............................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGC................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TATTAGTGTCTGTCACTTGGGCTGT............................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGACCAGGGACCTGAGCAGAGTGAGCATC............................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TAGAGCTGACCAGGGACCTGAGCAG...................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGTtt............. 29 tt 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAGGAGCTTTGGACCTATTAGTGTCTGT........................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACA................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TTGATACTGGTCATTAGGGGAGAGC................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGT.................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGT............... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGCAt.............................. 28 t 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGT............... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGGATTGATACTGGTCATTAGGGG..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TATTAGTGTCTGTCACTTGGGCTGTT.............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TACAGTCAGCGTGCtggg... 18 tggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......................................................................................................GGGACCTGAGCAGActtt................................................................................................................................. 18 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................GAGTAGAGCTGACCAGGGACCTGAGC........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAggc...................... 27 ggc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TCATTAGGGGAGAGCCAGt............................................................................................................................................................................................ 19 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................TTAGTGTCTGTCACTTGGGCTGTTCT............................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CACCTGGAAGCGTACAGTCAGCGT......... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................TCTGTCACTCATTCCTGCCTCGGAAG.................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGGAAGCGTACAGTCAGCGTGCCC..... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............TGTGCTCTGCAGGGGCTGGGATTGA..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GCAAATGGGTGTTGcttt....................................................................................................................................................................... 18 cttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..........................................................................................GTAGAGCTGACCAGGGACCTGAGCAG...................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AAGAGAGTAGAGCTGACCAGGGACa............................................................................................................................................. 25 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGCACC............................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTA................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGt...................... 27 t 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GAGTAGAGCTGACCAGGGACCTGAGa........................................................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TCGGAAGGAGCTTTGGACCTATTAGT................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTtgt.......................................................................................................................................................................................................................... 25 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................TGATACTGGTCATTAGGGGAGAGCCAGC............................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TACTGCAATGTGCTCTGCAGGGctgg............................................................................................................................................................................................................................ 26 ctgg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTA................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TCCTGCCTCGGAAGGAGCTTTGGACC........................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGGATTGATACTGGTCATTAGG....................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TTCCTGCCTCGGAAGGAGCTTTGGAC......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GAAGGAGCTTTGGACCTATTAGTGTC.............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGAGCAGAGTGAGCATCTGTCACTCA................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TACTGCAATGTGCTCTGCAGGGGCcgg........................................................................................................................................................................................................................... 27 cgg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGc............... 28 c 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGATACTGGTCATTAGGGGAGAGCCAG............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGGAAGCGTACAGTCAGCGTGCCCTGG.. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
................................................................................................................................................................................................TGTTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGCA............................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TTCCTGCCTCGGAAGGAGCTTTGG........................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTt................... 30 t 1.00 94.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGTCAG............ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................................TGACCAGGGACCTGAGCAGAGTGAGCAT............................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................AGCAAATGGGTGTTGGGGGGgggc.................................................................................................................................................................. 24 gggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGGAAGCGTACAGTCAGCGTGCCCTGGA. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTAC.................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGCTGACCAGGGACCTGAGCAGAGT................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGGATTt...................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TACTGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGG.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGGGCTGTTCTCCTGTTTCAGTTGAGAT........................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGGAAGCGTACAGTCAGCGTGCCCTa... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................................TGCCTCGGAAGGAGCTTTGGACCTAT..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGCAGGGGCTGGGATTGATACTGGTC............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTACTGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTG............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTAt.................. 31 t 1.00 23.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGAGTAGAGCTGACCAGGGACCTGAGC........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTCTGCAGGGGCTGGGATTGATACTG................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGGAa........................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCCTGTTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGC................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGGGGGGAAGAGAGTAGAGCTGACCAGG................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGTCTACTGCAATGTGCTCTGCAGGGGCTGGGATTGATACTGGTCATTAGGGGAGAGCCAGCCTAGCAAATGGGTGTTGGGGGGAAGAGAGTAGAGCTGACCAGGGACCTGAGCAGAGTGAGCATCTGTCACTCATTCCTGCCTCGGAAGGAGCTTTGGACCTATTAGTGTCTGTCACTTGGGCTGTTCTCCTGTTTCAGTTGAGATTTGGAAAAAGCACCTGGAAGCGTACAGTCAGCGTGCCCTGGAG
............................................................................................(((((...((((((((....((.((((((.......))))))..(((.((.((....)).))...))).......))....))).)))))...)))))............................................................
............................................................................................93................................................................................................191.........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)