| Gene: AK036683 | ID: uc007qkb.1_intron_1_0_chr13_50357839_f | SPECIES: mm9 | 
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| 
  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (7)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (7)  PIWI.ip  | 
  
  
  (3)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (35)  TESTES  | 
  
  
| TGGACCCAGGCTATAACCCATGCTCTTCTGCACTGCAGTGGATGCCTCCTGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTAAACCAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTCCCTGCTGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAA .............................................(((..((...(((.((((....(((((...(((((.....))))).....)))))....))))))).)).)))..................................................................................... ............................................45..........................................................................121................................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAG..... | 28 | 2 | 64.50 | 64.50 | 11.00 | 12.00 | 10.00 | 4.00 | 0.50 | 4.00 | 13.50 | 2.00 | - | - | 0.50 | 0.50 | 2.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | 2.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTA. | 29 | 2 | 44.00 | 44.00 | 10.00 | 11.00 | 9.00 | 5.50 | - | 5.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGC.... | 29 | 2 | 44.00 | 44.00 | 11.00 | 10.00 | 5.50 | 3.50 | 0.50 | 3.00 | - | 4.00 | - | - | 0.50 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCT.. | 28 | 2 | 35.50 | 35.50 | 9.00 | 10.00 | 4.00 | 6.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCA...... | 27 | 2 | 21.00 | 21.00 | 4.50 | 3.00 | 1.50 | 1.50 | - | 1.00 | 4.00 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | 3.00 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGC....... | 26 | 2 | 15.00 | 15.00 | - | - | - | - | 6.50 | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGC................................................................................................................................. | 25 | 3 | 11.67 | 11.67 | - | - | - | - | 1.67 | - | - | 3.67 | 1.67 | 0.67 | - | 0.67 | - | - | 0.67 | 1.00 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCC... | 27 | 2 | 9.00 | 9.00 | 3.00 | 1.00 | 1.50 | 1.00 | - | 1.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................TGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGAGC............. | 27 | 2 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | 2.50 | - | - | 0.50 | 1.00 | - | - | 1.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCA................................................................................................................................ | 26 | 3 | 4.33 | 4.33 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.67 | 0.33 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCC... | 30 | 2 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 1.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................TGCTGGATCCTCCTCAACTGTGAACTG................ | 27 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................AACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTA. | 27 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................CTCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGC....... | 27 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGC.... | 26 | 2 | 2.50 | 2.50 | 1.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGC........................................................................ | 28 | 3 | 2.33 | 2.33 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................CCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAG..... | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAG..... | 25 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAt | 30 | t | 2.00 | 44.00 | 0.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................TGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGAGCC............ | 28 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TTCTGCACTGCAGTGGATGCCTCCTG........................................................................................................................................................ | 26 | 3 | 1.67 | 1.67 | - | - | 1.00 | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................CAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCT.. | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................CAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTA. | 28 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................TCCTCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGC....... | 29 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................CTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAG..... | 26 | 2 | 1.50 | 1.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTt. | 29 | t | 1.50 | 35.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGa.... | 29 | a | 1.50 | 64.50 | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................CCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGC.... | 28 | 2 | 1.50 | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................CTGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGAGC............. | 28 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTC...................................................... | 25 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................TAAACCAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGA...................................................................................... | 29 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTac................................................................................................................................. | 25 | ac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCATG.............................................................................................................................. | 28 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................TCCTGTAAGCTGTGTCCTCCTcggc.................................................................................................................................... | 25 | cggc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................CTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGC.... | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................TAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGtt................................................ | 29 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................TAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCATGGAGC.......................................................................................................................... | 30 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................CCTCCTGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGa.................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................CAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGC.... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................TGGATCCTCCTCAACTGagcc................... | 21 | agcc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................TCACAGGTGTCCCTGCTGGATCCTCCTg............................ | 28 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................TCTAAACCAAACCCTCATGGGCTAGAGCC........................................................................................ | 29 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................TAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGttg............................................... | 30 | ttg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAcgga | 28 | cgga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAA | 30 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................TAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCATGGA............................................................................................................................ | 28 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................TGGATCCTCCTCAACTGTGAAC.................. | 22 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................TAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCATGG............................................................................................................................. | 27 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGcttg.................................................................................................................................. | 24 | cttg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................TGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAAccag | 27 | ccag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................CTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCC... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................CTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCA...... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCAT............................................................................................................................... | 27 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TACTCTAAACCAAACCCTCATGGGCTAG............................................................................................ | 28 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCT....................................................................... | 29 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................CTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAA | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGaa... | 30 | aa | 0.50 | 64.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................AACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAA | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................CCTCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAG..... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................CCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCC... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCc...... | 27 | c | 0.50 | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................CCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTA. | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................TGCTGGATCCTCCTCAACTGTGA.................... | 23 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCcg..... | 28 | cg | 0.50 | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................AACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGC.... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................CTCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAG..... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................TGCTGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGAGC............. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................ACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTA. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGA............... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................CCCTGCTGGATCCTCCTCAACTGTGAACT................. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................TCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGtc... | 27 | tc | 0.50 | 2.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................CCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGC....... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................TGCTGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGA............... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................CTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCT.. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................TCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCT.. | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................TAAACCAAACCCTCATGGGCTAGAGCC........................................................................................ | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAAggt | 28 | ggt | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTT....................................................... | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGT..................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGTGC................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAAga | 27 | ga | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................TAAACCAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGA.................................................................................... | 31 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................TGCTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTCC............................................ | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TGCACTGCAGTGGATGCCTCCTG........................................................................................................................................................ | 23 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................CTGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTC............................................. | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................TCCTGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTT................................................................................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................CTGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGC................................................................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 
| ...............................................CCTGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGC................................................................................................................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................TCCTGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGC................................................................................................................................. | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................TGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTCCCT.......................................... | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGa........................................................................ | 28 | a | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................AGCCGAGACCATGTGTAAGCTGTGCTGTC............................................................... | 29 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................TGCAGTGGATGCCTCCTGTAAGCTGT................................................................................................................................................ | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........CTATAACCCATGCTCTTCTGCACTGCAGT.................................................................................................................................................................... | 29 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAAaa | 27 | aa | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................TAAACCAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAG..................................................................................... | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 
| ..........CTATAACCCATGCTCTTCTGCACTGC....................................................................................................................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............TAACCCATGCTCTTCTGCACTGCAGTG................................................................................................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAG......................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................TGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTC............................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................TAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGGT................................................ | 29 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................GACCATGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGT........................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................TCCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCT.................................................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTG...................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TGCACTGCAGTGGATGCCTCCTGTAA..................................................................................................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................GGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAG......................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........TATAACCCATGCTCTTCTGCACTGCAGTG................................................................................................................................................................... | 29 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAA | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TTCTGCACTGCAGTGGATGCCTCCTGTA...................................................................................................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................ATGGAGCCCTACTCTAAACCAAACCCTC..................................................................................................... | 28 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................TTCACAGGTGTCCCTGCTGGATCCTC............................... | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGG..................................................................................................................................... | 21 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................CTCTTCTGCACTGCAGTG................................................................................................................................................................... | 18 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................GCATGGAGCCCTACTCTAAACCAAACCCT...................................................................................................... | 29 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| TGGACCCAGGCTATAACCCATGCTCTTCTGCACTGCAGTGGATGCCTCCTGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTAAACCAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTCCCTGCTGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAGGCAGCCTAA .............................................(((..((...(((.((((....(((((...(((((.....))))).....)))))....))))))).)).)))..................................................................................... ............................................45..........................................................................121................................................................................  | 
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................GCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGT..................................................................... | 28 | 3 | 6.33 | 6.33 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.67 | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................TCCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTA................................................................................................................. | 27 | 3 | 1.67 | 1.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................GGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGT..................................................................... | 30 | 3 | 1.67 | 1.67 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................TGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCA..................................................... | 26 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................TGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCA..................................................... | 28 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................AAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGACCA................................................................................. | 28 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................CTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGTa..................................................................... | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................TGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTAAACCAAc........................................................................................................... | 31 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................GTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCA..................................................... | 27 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................GAGCCCTACTCTAAACCAAACCCTCAaaa.................................................................................................... | 29 | aaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................TCCCTGCTGGATCCTCCTCAACTGTGgat..................... | 29 | gat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................AGCCCTACTCTAAACCAAACCCTCAa.................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................CCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTAA................................................................................................................ | 27 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................CTCCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTC................................................................................................................... | 26 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................CCTCCTCAACTGTGAACTGAGCCTAG......... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................GCATGGAGCCCTACTCTAAACCAAAC......................................................................................................... | 26 | 5 | 0.80 | 0.80 | - | - | - | - | - | - | - | 0.60 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................GTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCACA................................................... | 27 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................GGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCT....................................................................... | 28 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................GTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCA..................................................... | 25 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGT..................................................................... | 26 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................ATGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCA..................................................... | 29 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TACTCTAAACCAAACCCTCATGGGCTA............................................................................................. | 27 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................ATGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTC...................................................... | 28 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................CTGCTGGATCCTCCTCAACTGTGAACTGA............... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................GGAGCCCTACTCTAAACCAAACCCTCA.................................................................................................... | 27 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................ACTGCAGTGGATGCCTCCTGTAAGCTGT................................................................................................................................................ | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TCTGCACTGCAGTGGATGCCTCCTGTAA..................................................................................................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................AGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGT..................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................GCTAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCT....................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................ATGGGCTAGAGCCGAGACCATGTGTAA.......................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................CTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTCCCTGC........................................ | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................TAGAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGTtc..................................................................... | 28 | tc | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................GTTGCATGGAGCCCTACTCTAA................................................................................................................ | 22 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................TGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTAAACCAAAC......................................................................................................... | 32 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................AACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGACCAac................................................................................. | 29 | ac | 0.33 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................AACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGACCA................................................................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................CAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGACCAa................................................................................. | 30 | a | 0.33 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................CCAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGA.................................................................................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................CACAGGTGTCCCTGCTGGATCCTCCTCAt........................... | 29 | t | 0.33 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................GTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGTTTC...................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................CCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTA................................................................................................................. | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCA................................................................................................................................ | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................CAAACCCTCATGGGCTAGAGCCGAGACCA................................................................................. | 29 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................CCATGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTG.......................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................GAGCCGAGACCATGTGTAAGCTGTGC................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................AGCTGTGCTGTCCTGTGTTTCACA................................................... | 24 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................GAGACCATGTGTAAGCTGTGCTGTCCTGTGT......................................................... | 31 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................CTCCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCT.................................................................................................................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................TCCTGGGTTGCATGGAGCCCTACTCTAA................................................................................................................ | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................CACAGGTGTCCCTGCTGGATCCTCCTCA........................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................GTAAGCTGTGTCCTCCTGGGTTGCA................................................................................................................................ | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................GGTTGCATGGAGCCCTACTCTAAACCAA........................................................................................................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................GCTGTCCTGTGTTTCACAGGTGTCCCTGCTGG..................................... | 32 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................ACAGGTGTCCCTGCTGGATCCT................................ | 22 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | 
| .......................................................................TGCATGGAGCCCTACTCTAAACCAAAC......................................................................................................... | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................GCCCTACTCTAAACCAAACCCTCA.................................................................................................... | 24 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |