(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(40)
TESTES

Sense strand
AGTAGAGGGAGGAGCTTCCGGCAGTCAAGGCCTATCCCCCTAACAGGTTCAAAGCCAGCCATGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAAGGGGGAAGGGAAGGAACAGGGGCATAGGATGCCTTTCCTAACAGAGTGAAATATGTCTCAATCAGACTGTGGCTCTAAGGAGCTAATGGCTGGCTCTGGCTTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAGCTGGAAGCTCTCAGCAGGAAGCTGAT
..........................................................((.....((((.............((((((((((......(((((...((((((...)))))))))))..((((((.......((((.....))))..((((((....)))))).......)))))).)))))))))))))).....))...........................................
........................................................57.....................................................................................................................................................208........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGA.................................... 26 1 65.00 65.00 16.00 12.00 10.00 - 11.00 5.00 1.00 4.00 1.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAA................................ 26 1 30.00 30.00 5.00 4.00 10.00 1.00 5.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGA................................. 25 1 27.00 27.00 4.00 5.00 3.00 1.00 5.00 - 1.00 1.00 2.00 - 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAGC......................... 28 1 20.00 20.00 - - 1.00 8.00 - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGG..................................... 26 1 13.00 13.00 2.00 3.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAAGG................................................................................................................................................................. 28 1 13.00 13.00 1.00 - - 4.00 - 3.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGG..................................... 25 1 12.00 12.00 - 1.00 2.00 1.00 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGA................................. 26 1 12.00 12.00 3.00 4.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAA............................... 26 1 11.00 11.00 3.00 2.00 1.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGA........................... 26 1 11.00 11.00 1.00 2.00 - 3.00 - - 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.......................................................................................................................................................................................TGGCTTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAG........................................ 27 1 11.00 11.00 - - - 2.00 - - 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAG................................... 27 1 10.00 10.00 3.00 2.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACG............................ 25 1 10.00 10.00 3.00 - - 2.00 - - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAAG.................................................................................................................................................................. 27 1 9.00 9.00 - - - 1.00 - 2.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGA.................................... 27 1 8.00 8.00 3.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGG.................................. 28 1 8.00 8.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAG.......................... 27 1 8.00 8.00 1.00 2.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGG.................................. 25 1 7.00 7.00 - - 1.00 - 2.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAAC............................. 26 1 7.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - 3.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGG.................................. 24 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACG............................ 27 1 5.00 5.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAA................................ 25 1 5.00 5.00 - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAA............................... 27 1 5.00 5.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAGC......................... 30 1 5.00 5.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGTCTCAATCAGACTGTGGCTCTAAGG................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGt.................................. 28 t 4.00 10.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TGGCTCTGGCTTCCTTTCTGTAGGACT.............................................. 27 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAAC............................. 29 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAA.............................. 27 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAAC............................. 28 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAA.............................. 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGt.................................... 26 t 3.00 12.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAt............................... 27 t 3.00 30.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAa.......................... 27 a 2.00 11.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCCTAACAGAGTGAAATATGTCTCAATC.................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAAGGG................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAA................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAtagg..................................... 26 tagg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGG.................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGt.................................... 27 t 2.00 13.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................CTTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGA.................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTCAAAGCCAGCCATGAACTACATAAAa............................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGt................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GCTTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAG........................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TAAACAGAAAGAAGGAAGGGGGAA............................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAG................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TCAGACTGTGGCTCTAAGGAGCTAATGGCT........................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGAAATATGTCTCAATCAGACTGTGGC.......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAc.......................... 26 c 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TAAACAGAAAGAAGGAAGGGGGAAGt.......................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TAACAGAGTGAAATATGTCTCAATCAGACTGT............................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGA....................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGGCTTCCTTTCTGTAGGACTCGGAA......................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCCTAACAGAGTGAAATATGTCTCAATC.................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAtt.............................. 29 tt 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGt........................... 28 t 1.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................AAGGGAAGGAACAGGGGC............................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AAACGAGCTGGAAGCTCTCAGCAGGA....... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAa.......................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAt............................... 26 t 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................AACGAGCTGGAAGCTCTCAGCAGGA....... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGA........................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GAAATATGTCTCAATCAGACTGTGGCT......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAt................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAAGGt................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 13.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGGCTTCCTTTCTGTAGG................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAA................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGA................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAg............................... 24 g 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAt................................ 26 t 1.00 27.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGAGGAAAACGAGCTGGAAG................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TAAACAGAAAGAAGGAAGGGGGAAGG.......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACt............................ 30 t 1.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAG................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TACATAAACAGAAAGAAGGAAGGGGG.............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGcgc......................... 28 cgc 1.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGG.................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TAAGGAGCTAATGGCTGGCTCTGGC............................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAat.................................. 28 at 1.00 65.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAt.............................. 28 t 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAAt............................. 26 t 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGttt.................................. 28 ttt 1.00 12.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAt................................... 27 t 1.00 65.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTCTGTAGGACTCGGAAGAGG..................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGt................................. 26 t 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAGCT........................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGG.................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGGCTTCCTTTCTGTAGGACTCGGA.......................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAAGGGG............................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGTAGAGGGAGGAGCTTCCGGCAGTCAAGGCCTATCCCCCTAACAGGTTCAAAGCCAGCCATGAACTACATAAACAGAAAGAAGGAAGGGGGAAGGGAAGGAACAGGGGCATAGGATGCCTTTCCTAACAGAGTGAAATATGTCTCAATCAGACTGTGGCTCTAAGGAGCTAATGGCTGGCTCTGGCTTCCTTTCTGTAGGACTCGGAAGAGGAGGAAAACGAGCTGGAAGCTCTCAGCAGGAAGCTGAT
..........................................................((.....((((.............((((((((((......(((((...((((((...)))))))))))..((((((.......((((.....))))..((((((....)))))).......)))))).)))))))))))))).....))...........................................
........................................................57.....................................................................................................................................................208........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................................................................................AGGGGCATAGGATGCCTTTCCTAACAGAGTG................................................................................................................... 31 1 9.00 9.00 - - - - - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACTGTGGCTCTAAGagct.................................................................................... 18 agct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
............................................................................................................................................................................ATGGCTGGCTCTGGCTTCCTTTCTGTA................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTGTGGCTCTAAGGAaaca.................................................................................. 19 aaca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
......................AGTCAAGGCCTATCCCCCT................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -