(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(4)
OVARY
(9)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(45)
TESTES

Sense strand
AGGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCCACTTTCTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCAGTTTTACCCAGAAGCAGATGACAGGTGCTTATAAATCTTAAAGGCAGTGGGATACTTTTAGCTTAATTTCAGTCTTGGTTACATTTAGCTACAACCATTTTGTTGGGAGAAAAAA
........................................................(((((((((..........((((((....)))))).....(((((.....))))).))))))).))................................................................................................................................
..................................................51...........................................................................128........................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGt....................................................................................................................................................................................... 27 t 7.00 3.00 3.00 - - 1.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGC......................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................TCCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCC.............................................................................................................................................................................................. 28 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGT............................................................................................................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGA....................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCG........................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCC.............................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................AGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTA........................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCG........................................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCG............................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................AGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTt........................................................................................................................................................................................... 27 t 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAG.......................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGAGAGCTGTGGTAGAA.............................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAt...................................................................................................................................................................................... 28 t 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TCTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAACA............................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCA................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................................................GAATTCCAAAGGCTCTTTTCAG................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAA...................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GTAGCGAATTCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCAC............................................................................................................................................................. 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCT................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTC............................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA..................................................................................................................................................................................................................... 27 7 1.14 1.14 0.29 0.29 - 0.29 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TCTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAG................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTt........................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGtt...................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGa............................................................................................................................................................................................ 29 a 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGTACACCAGCTCCAAGTGATCCTGC........................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAtt......................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CCAAGTACACCAGCTCCAAGTGATCCTG............................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACgt........................................................................................................................................................... 25 gt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAA.............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TCTCAAAGAGAGAGCTGTGG................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AAGAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTT..................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTA........................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AAGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCCA................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTC.................................................................................................................... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACt............................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................CCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAATTC................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTt........................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTcacc.............................................................................................................................................................................................................................. 27 cacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCC................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AGAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGT...................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................AGTGATCCTGCCAAGTAAGCCT................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GTAGCGAATTCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCta.............................................................................................................................................................. 32 ta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGt....................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GTTCAGTTTTACCCAGAAGC.................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAA...................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GTAGAACAGTGCGTTCAGTTTTACa........................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGT............................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................AGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAt.......................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGACAGGTGCTTATAAAaa.............................................................................. 19 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCAG.................................................................................................................. 36 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCAG.................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAt.......................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GCCTCCGTAGCGAATTCCAAAGGt............................................................................................................................................................................ 24 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCa............................................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................AAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTA........................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................AGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGT............................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CTCAAAGAGAGAGCTGTGGTA................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCC.............................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGagtt..................................................................................................................... 26 agtt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AGTGCGTTCAGTTTTACCCAGAAGCAGATGACAG........................................................................................... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTT..................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................CCTCCGTAGCGAATTCCAAAGGC............................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTTCTCAAAGAGAGAGCTGTGG................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGATCCT............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGC......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGca........................................................................................................................................................................................... 26 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGGTAGAACAGTGCGTTCAGTTTT.............................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGgaga............................................................................................................................................................................................................................... 17 gaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGAGAGCTGTGGTAGAACA............................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CACCAAGTACACCAGCTa........................................................................................................................................................................................................................ 18 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CAAAGGCTCTTTTCAGAGCCccct........................................................................................................................................................... 24 ccct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TCTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAAC............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTT..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCC.................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTTCTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAA.............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACtt........................................................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCAGT................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTA........................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCAAGTGATCCTGCCAAG....................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGAGCTGTGGTAGAACAGTGC........................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCAGTTT............................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACgtt.......................................................................................................................................................... 27 gtt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTa.................................................................................................................... 28 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAAC............................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................AAAGGCTCTTTTCAGAGCCAttt........................................................................................................................................................... 23 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................AGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCCAAAG.............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACACCAGCTCCAAGTGATCCTtt........................................................................................................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAACAG........................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGCCTCCGTAGCGAATTCCAAAGGCTC.......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CGTCACCAAGTACACCAGa.......................................................................................................................................................................................................................... 19 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GCCAAGTAAGCCTCCGTAGC......................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................ATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAAT..................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCACCAAGTACACCAGCTCt....................................................................................................................................................................................................................... 20 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................AGCGAATTCCAAAGGCTCTTT....................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCAGT................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGC.................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACC............................................................................................................................................................................................................................. 28 6 0.67 0.67 - 0.17 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAG.................................................................................................................................................................................................................... 28 7 0.57 0.57 0.29 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCA...................................................................................................................................................................................................................... 26 7 0.57 0.57 - 0.14 - - - - 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACAC.............................................................................................................................................................................................................................. 27 6 0.50 0.50 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCC....................................................................................................................................................................................................................... 25 7 0.43 0.43 - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14
......................................................................CCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCC........................................................................................................................................................... 25 8 0.38 0.38 - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCC....................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCT......................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.33 0.33 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTAC................................................................................................................................................................................................................................ 25 6 0.33 0.33 - - - 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.......................................................................................................................................................................................................................... 28 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CACCAAGGCCGTCACCAAGTA................................................................................................................................................................................................................................. 21 7 0.29 0.29 - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.......................................................................................................................................................................................................................... 27 7 0.29 0.29 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - -
............CCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGT................................................................................................................................................................................................................... 27 7 0.29 0.29 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGAGAGCTGTGGTAG................................................................................................................................ 16 5 0.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGAGAGCTGTGGTAGAA.............................................................................................................................. 17 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC........................................................................................................................................................................................................................ 27 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGTTTTACCCAGAAGC.................................................................................................... 16 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACa............................................................................................................................................................................................................................. 28 a 0.17 0.50 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC........................................................................................................................................................................................................................ 29 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCt....................................................................................................................................................................................................................... 29 t 0.17 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCT......................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCC....................................................................................................................................................................................................................... 29 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC........................................................................................................................................................................................................................ 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC........................................................................................................................................................................................................................ 31 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACCAAGGCCGTCACCAAGTA................................................................................................................................................................................................................................. 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CGTCACCAAGTACACCAGCTCC....................................................................................................................................................................................................................... 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - -
........AAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCT......................................................................................................................................................................................................................... 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CACCAAGGCCGTCACCAAGTAC................................................................................................................................................................................................................................ 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CACCAAGTACACCAGCTCCAAGT................................................................................................................................................................................................................... 23 14 0.14 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CACCAAGGCCGTCACCAAGTACACC............................................................................................................................................................................................................................. 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAt..................................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.14 0.57 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCAAGGCCGTCACCAAGTAC................................................................................................................................................................................................................................ 20 7 0.14 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACCAAGGCCGTCACCAAGTACAC.............................................................................................................................................................................................................................. 23 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCAAGGCCGTCACCAAG................................................................................................................................................................................................................................... 17 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CACCAAGGCCGTCACCAA.................................................................................................................................................................................................................................... 18 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAGAGCTGTGGTAGAA.............................................................................................................................. 16 7 0.14 0.14 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCca..................................................................................................................................................................................................................... 27 ca 0.14 0.43 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.......................................................................................................................................................................................................................... 30 7 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.......................................................................................................................................................................................................................... 26 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTACACCAGC.......................................................................................................................................................................................................................... 22 8 0.12 0.12 - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AAGGCCGTCACCAAGTACA............................................................................................................................................................................................................................... 19 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACC............................................................................................................................................................ 24 16 0.12 0.12 - - - - - - 0.06 - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CCAAGTACACCAGCTCCAAG.................................................................................................................................................................................................................... 20 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CAAGTACACCAGCTCCAAGTGA................................................................................................................................................................................................................. 22 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CCAAGTACACCAGCTCC....................................................................................................................................................................................................................... 17 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CACCAAGTACACCAGCTCC....................................................................................................................................................................................................................... 19 14 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGTACACCAGCTCCAAGTGA................................................................................................................................................................................................................. 21 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GCTCTTTTCAGAGCCACCC........................................................................................................................................................... 19 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGAGCTGTGGTAGAA.............................................................................................................................. 15 16 0.06 0.06 - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGATCCTGCCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCCACTTTCTCAAAGAGAGAGCTGTGGTAGAACAGTGCGTTCAGTTTTACCCAGAAGCAGATGACAGGTGCTTATAAATCTTAAAGGCAGTGGGATACTTTTAGCTTAATTTCAGTCTTGGTTACATTTAGCTACAACCATTTTGTTGGGAGAAAAAA
........................................................(((((((((..........((((((....)))))).....(((((.....))))).))))))).))................................................................................................................................
..................................................51...........................................................................128........................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..............................................................................................................................GTGCGTTCAGTTTTACCCAGAAGCA................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA..................................................................................................................................................................................................................... 26 7 1.86 1.86 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - 1.14 - - 0.14 - - - - - - - 0.29 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - -
............CCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA..................................................................................................................................................................................................................... 25 7 1.14 1.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - 0.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - -
...................................................TAAGCCTCCGTAGCGAATTCC.................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GTAGCGAATTCCAAAGGCTCTTTTCA.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CAGCTCCAAGTGATCCTGCCAAGTA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................CCAAGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCCA................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ACTTTTAGCTTAATTTCAGTCTTGGTTA.................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGAT................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................TCCGTAGCGAATTCCAAAGGCTCTTTTCA.................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CTCCGTAGCGAATTCCAAAGGCTCTTTTCA.................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AGCTCCAAGTGATCCTGCCAAGTAc..................................................................................................................................................................................................... 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................AGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCCAA................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TCAGAGCCACCCACTTTCTCAAAGAGA............................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AAGTAAGCCTCCGTAGCGAATTCCAA................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCA............................................................................................................................................................................................................................ 29 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGTACACCAGCTCCAAGT................................................................................................................................................................................................................... 18 15 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACC............................................................................................................................................................................................................................. 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCA............................................................................................................................................................................................................................ 27 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA..................................................................................................................................................................................................................... 24 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCA...................................................................................................................................................................................................................... 27 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA..................................................................................................................................................................................................................... 29 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 -
............CCGTCACCAAGTACACCAGCTCCA...................................................................................................................................................................................................................... 24 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCA............................................................................................................................................................................................................................ 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGCCGTCACCAAGTAC................................................................................................................................................................................................................................ 16 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGA................................................................................................................................................................................................................. 27 14 0.07 0.07 - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -