Gene: LOC665622

ID: uc007prn.1_intron_1_0_chr13_21900511_r.5p

SPECIES: mm9

chr13:21901464 21901713 -

(1) OTHER.ip

(12) OTHER.mut

(2) OVARY

(9) PIWI.ip

(4) PIWI.mut

(46) TESTES

Sense strand

CACGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCTACACTTTCAGCGTAAAAAGCTGTTACACATGCAGGTTCCTTTCACTTTGGGGTAGTGGACGTGGGAGATGTGTTTCTTGTGTGGGTGCGGGTGCCCTGTCCCGGTTCGCAGGCACCTTAGAAGCAGCTCCTAGTGTTTTGCCGAGAG ....................................................................((((.....(((((.((((((....)))))).(((.((....((((.......)))).......)).)))...........)))))..)))).(((..(((((....)))))..)))................................................................. ....................................................................69....................................................................................................................187.............................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)
.........................................................................................................................................................GGTAGTGGACGTGGGAGATGTGTa.........................................................................	24	a	10.00	0.00	10.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................CTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACt....................................................................................................................................................	29	t	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................GCGTAAAAAGCTGTTACACATGC...................................................................................................................	23	2	1.50	1.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAG......................................................................................................................................................................	28	3	1.33	1.33	-	-	-	-	-	0.33	0.33	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................TAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTCT.................................................................................................................................................................	28	4	1.25	1.25	-	-	0.25	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA........................................................................................................................................................................................................	27	7	1.14	1.14	-	-	0.29	0.29	-	0.14	0.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.ACGCGGTGTCGGAGGGCA.......................................................................................................................................................................................................................................	18	9	1.11	1.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TTTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTC..................................................................................................................................................................	29	4	1.00	1.00	-	-	0.25	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................CTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGA..........................................................................................................................................................	23	5	1.00	1.00	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	0.60	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................GCGTAAAAAGCTGTTACACATGCAGG................................................................................................................	26	2	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACC...........................................................................................................................................................................	26	3	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................CCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACgt...................................................................................................................................................	25	gt	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................TCTTTTCAGAGCCACCTAt.................................................................................................................................................	19	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............GGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACt................................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTcacc.................................................................................................................................................................................................................	27	cacc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...GCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCc...........................................................................................................................................................................................................................	28	c	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................AAAAGCTGTTACACATGCAGGTTCCTT..........................................................................................................	27	2	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................TAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTCTTT...............................................................................................................................................................	30	4	1.00	1.00	-	-	-	0.50	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGgaga..................................................................................................................................................................................................................	17	gaga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......GTGTCGGAGGGCACCAt...................................................................................................................................................................................................................................	17	t	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TCCTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCAtt....................................................................................................................................................	31	tt	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................CACCAAGTACACCAGCTa...........................................................................................................................................................................................................	18	a	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................CAAAGGCTCTTTTCAGAGCCccct...................................................................................................................................................	24	ccct	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................GTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAa......................................................................................................................................................................	30	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................CAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACtt...................................................................................................................................................	24	tt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................AGCGTAAAAAGCTGTTACACATGCAG.................................................................................................................	26	2	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TGTCGGAGGGCACCAcg..................................................................................................................................................................................................................................	17	cg	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................CCTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACt....................................................................................................................................................	30	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................AAAGGCTCTTTTCAGAGCCAttt...................................................................................................................................................	23	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................CGTCACCAAGTACACCAGa.............................................................................................................................................................................................................	19	a	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TCACCAAGTACACCAGCTCt..........................................................................................................................................................................................................	20	t	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAA.......................................................................................................................................................................	30	3	0.67	0.67	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAGG.....................................................................................................................................................................	29	3	0.67	0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTC..................................................................................................................................................................	31	3	0.67	0.67	-	-	-	0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAA........................................................................................................................................................................	29	3	0.67	0.67	-	-	-	-	-	-	0.33	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................CACTCCTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCT...................................................................................................................................................	35	3	0.67	0.67	0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACC................................................................................................................................................................................................................	28	6	0.67	0.67	-	-	-	-	-	0.33	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAG.......................................................................................................................................................................................................	28	7	0.57	0.57	-	-	-	0.29	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCA.........................................................................................................................................................................................................	26	7	0.57	0.57	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................GGGGTAGTGGACGTGGGA.................................................................................	18	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GTGGACGTGGGAGATGTGTTTCTTGT...................................................................	26	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................GGAGATGTGTTTCTTGTGTGGGTGCG..........................................................	26	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................GTGCCCTGTCCCGGTTCGCAGGCA.................................	24	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GTGGACGTGGGAGATGTGTTTCTTGTGTGGG..............................................................	31	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................TAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTC..................................................................................................................................................................	27	4	0.50	0.50	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCGCAGGCACCTTAGAA.........................	17	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................GCGTAAAAAGCTGTTACACATGCAG.................................................................................................................	25	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................CGCAGGCACCTTAGAAGCA......................	19	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................TACACTTTCAGCGTAAAAAGCTGTT...........................................................................................................................	25	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GTGGACGTGGGAGATGTG...........................................................................	18	2	0.50	0.50	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GTGGACGTGGGAGATGTGTTTCTTG....................................................................	25	2	0.50	0.50	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................TTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTCT.................................................................................................................................................................	29	4	0.50	0.50	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACAC.................................................................................................................................................................................................................	27	6	0.50	0.50	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................GGGTAGTGGACGTGGGAGATG.............................................................................	21	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................AGCGTAAAAAGCTGTTACACATGCAGG................................................................................................................	27	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................AGCGTAAAAAGCTGTTACACAT.....................................................................................................................	22	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................GCGTAAAAAGCTGTTACACATGCAGGTT..............................................................................................................	28	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GTGGACGTGGGAGATGTGTTTCTTGTGTG................................................................	29	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................AGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTT.............................................................................................................................................................................................	27	4	0.50	0.50	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCC..........................................................................................................................................................................................................	25	7	0.43	0.43	-	-	0.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................CCTAACCCAAAGGCTCTTTTC.............................................................................................................................................................	21	5	0.40	0.40	-	-	-	-	0.40	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TCCTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACC....................................................................................................................................................	31	5	0.40	0.40	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................CAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCC..........................................................................................................................................................................................................	28	6	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................TAACCCAAAGGCTCTTTTCAG...........................................................................................................................................................	21	6	0.33	0.33	-	0.17	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCA.........................................................................................................................................................................	28	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................ACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAACTCACACT..................................................................................................................................................................................	33	3	0.33	0.33	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAt......................................................................................................................................................................	31	t	0.33	0.67	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................CCAAGTGAGTTCCTTTAACTCACACTCCT...............................................................................................................................................................................	29	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................TTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAA.......................................................................................................................................................................	28	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................ACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAACTCA......................................................................................................................................................................................	29	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..CGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGG.................................................................................................................................................................................................................................	23	9	0.33	0.33	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......GTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCAC..........................................................................................................................................................................................................................	26	6	0.33	0.33	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................TTCCTTTAACTCACACTCCTAACCC..........................................................................................................................................................................	25	3	0.33	0.33	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........GTCGGAGGGCACCAAGGC................................................................................................................................................................................................................................	18	15	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	0.13	-	-	-	-	-	-	0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAG......................................................................................................................................................................	27	3	0.33	0.33	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GTGGACGTGGGAGATG.............................................................................	16	3	0.33	0.33	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................CAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCT............................................................................................................................................................................................................	26	6	0.33	0.33	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCTAAC............................................................................................................................................................................	25	3	0.33	0.33	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGC....................................................................................................................................................................	29	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTCT.................................................................................................................................................................	32	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTAC...................................................................................................................................................................................................................	25	6	0.33	0.33	-	-	0.17	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCT...............................................................................................................................................................................	22	3	0.33	0.33	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................AGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCC..........................................................................................................................................................................	27	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAA.......................................................................................................................................................................	27	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.............................................................................................................................................................................................................	28	7	0.29	0.29	-	-	-	-	-	-	-	0.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCAAGGCCGTCACCAAGTA....................................................................................................................................................................................................................	21	7	0.29	0.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................ACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.............................................................................................................................................................................................................	27	7	0.29	0.29	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................CACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTC................................................................................................................................................................................................	29	7	0.29	0.29	-	-	-	-	-	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGT......................................................................................................................................................................................................	27	7	0.29	0.29	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................ACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTC..................................................................................................................................................................	25	4	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-
................................CAAGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTT.............................................................................................................................................................................................	29	4	0.25	0.25	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................GTACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTA...........................................................................................................................................................................................	28	4	0.25	0.25	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................TACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTA...........................................................................................................................................................................................	27	4	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-
............................................................TTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTC..................................................................................................................................................................	28	4	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................TCACACTCCTAACCCAAAGGCTCTTTTC.............................................................................................................................................................	28	4	0.25	0.25	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................TAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCT...................................................................................................................................................................	26	4	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................GTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTCC...............................................................................................................................................................................................	32	4	0.25	0.25	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...GCGGTGTCGGAGGGCACCAAGG.................................................................................................................................................................................................................................	22	9	0.22	0.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................CTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAtctt......................................................................................................................................................	27	tctt	0.20	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...GCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................	26	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................ACACTCCTAACCCAAAGGCTCTTTT..............................................................................................................................................................	25	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..CGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................	27	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................TAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACC....................................................................................................................................................	28	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................ACACTCCTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCA......................................................................................................................................................	33	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TGTCGGAGGGCACCAAGG.................................................................................................................................................................................................................................	18	15	0.20	0.20	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TCCTAACCCAAAGGCTCTTTT..............................................................................................................................................................	21	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-
..CGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCACC.........................................................................................................................................................................................................................	31	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..CGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCAC..........................................................................................................................................................................................................................	30	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..CGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCA...........................................................................................................................................................................................................................	29	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...GCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCC...............................................................................................................................................................................................................................	24	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...GCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCA...........................................................................................................................................................................................................................	28	5	0.20	0.20	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCACCAA.......................................................................................................................................................................................................................	28	6	0.17	0.17	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................AACCCAAAGGCTCTTTTCAGA..........................................................................................................................................................	21	12	0.17	0.17	-	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................CAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC...........................................................................................................................................................................................................	27	6	0.17	0.17	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACa................................................................................................................................................................................................................	28	a	0.17	0.50	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........GTCGGAGGGCACCAAGGCC...............................................................................................................................................................................................................................	19	6	0.17	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................ACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC...........................................................................................................................................................................................................	29	6	0.17	0.17	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCt..........................................................................................................................................................................................................	29	t	0.17	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........TCGGAGGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTA....................................................................................................................................................................................................................	29	6	0.17	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCT............................................................................................................................................................................................................	27	6	0.17	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCC..........................................................................................................................................................................................................	29	6	0.17	0.17	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC...........................................................................................................................................................................................................	28	6	0.17	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........CGGAGGGCACCAAGGCCGTCA...........................................................................................................................................................................................................................	21	6	0.17	0.17	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................GCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTC...........................................................................................................................................................................................................	31	6	0.17	0.17	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCACC.........................................................................................................................................................................................................................	26	6	0.17	0.17	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............AGGGCACCAAGGCCGTCA...........................................................................................................................................................................................................................	18	6	0.17	0.17	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................CCAAGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTC................................................................................................................................................................................................	27	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................ACCAAGGCCGTCACCAAGTA....................................................................................................................................................................................................................	20	7	0.14	0.14	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................CTCTTTTCAGAGCCACCTA..................................................................................................................................................	19	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................CGTCACCAAGTACACCAGCTCC..........................................................................................................................................................................................................	22	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................ACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTC................................................................................................................................................................................................	28	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................AAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCT............................................................................................................................................................................................................	25	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCAAGGCCGTCACCAAGTAC...................................................................................................................................................................................................................	22	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................CACCAAGTACACCAGCTCCAAGT......................................................................................................................................................................................................	23	14	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCAAGGCCGTCACCAAGTACACC................................................................................................................................................................................................................	25	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAt........................................................................................................................................................................................................	27	t	0.14	0.57	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCAAGGCCGTCACCAAGTAC...................................................................................................................................................................................................................	20	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................ACCAAGGCCGTCACCAAGTACAC.................................................................................................................................................................................................................	23	7	0.14	0.14	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCAAGGCCGTCACCAAG......................................................................................................................................................................................................................	17	7	0.14	0.14	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCAAGGCCGTCACCAA.......................................................................................................................................................................................................................	18	7	0.14	0.14	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................TAACCCAAAGGCTCTTTT..............................................................................................................................................................	18	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCca........................................................................................................................................................................................................	27	ca	0.14	0.43	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............GGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.............................................................................................................................................................................................................	30	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGC.............................................................................................................................................................................................................	26	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......GTGTCGGAGGGCACCAAGGC................................................................................................................................................................................................................................	20	15	0.13	0.13	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTACACCAGC.............................................................................................................................................................................................................	22	8	0.12	0.12	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................AAGGCCGTCACCAAGTACA..................................................................................................................................................................................................................	19	8	0.12	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................CCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACC....................................................................................................................................................	24	16	0.12	0.12	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................AACCCAAAGGCTCTTTT..............................................................................................................................................................	17	16	0.12	0.12	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.ACGCGGTGTCGGAGGGCACCAA...................................................................................................................................................................................................................................	22	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....GGTGTCGGAGGGCACCAAGGC................................................................................................................................................................................................................................	21	9	0.11	0.11	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................CTCTTTTCAGAGCCACCT...................................................................................................................................................	18	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....CGGTGTCGGAGGGCACCAAG..................................................................................................................................................................................................................................	20	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...GCGGTGTCGGAGGGCACC.....................................................................................................................................................................................................................................	18	9	0.11	0.11	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...GCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGC................................................................................................................................................................................................................................	23	9	0.11	0.11	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..CGCGGTGTCGGAGGGCACCA....................................................................................................................................................................................................................................	20	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..CGCGGTGTCGGAGGGCACCAAG..................................................................................................................................................................................................................................	22	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................GTACACCAGCTCCAAGTGAGT..................................................................................................................................................................................................	21	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.ACGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGG.................................................................................................................................................................................................................................	24	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.ACGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGC................................................................................................................................................................................................................................	25	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................AACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCA......................................................................................................................................................	25	11	0.09	0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................AACCCAAAGGCTCTTTTCAG...........................................................................................................................................................	20	12	0.08	0.08	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................ACCCAAAGGCTCTTTTCA............................................................................................................................................................	18	12	0.08	0.08	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................ACCCAAAGGCTCTTTTCAGA..........................................................................................................................................................	20	12	0.08	0.08	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................AAGTACACCAGCTCCAAGTGAG...................................................................................................................................................................................................	22	13	0.08	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................CCAAGTACACCAGCTCCAAG.......................................................................................................................................................................................................	20	14	0.07	0.07	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................CAAGTACACCAGCTCCAAGTGA....................................................................................................................................................................................................	22	14	0.07	0.07	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................CCAAGTACACCAGCTCC..........................................................................................................................................................................................................	17	14	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................CACCAAGTACACCAGCTCC..........................................................................................................................................................................................................	19	14	0.07	0.07	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................AAGTACACCAGCTCCAAGTGA....................................................................................................................................................................................................	21	15	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TGTCGGAGGGCACCAAGGC................................................................................................................................................................................................................................	19	15	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................CCCAAAGGCTCTTTTCAGA..........................................................................................................................................................	19	16	0.06	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................CCCAAAGGCTCTTTTCAG...........................................................................................................................................................	18	16	0.06	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

CACGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAACTCACACTCCTAACCCAAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCTACACTTTCAGCGTAAAAAGCTGTTACACATGCAGGTTCCTTTCACTTTGGGGTAGTGGACGTGGGAGATGTGTTTCTTGTGTGGGTGCGGGTGCCCTGTCCCGGTTCGCAGGCACCTTAGAAGCAGCTCCTAGTGTTTTGCCGAGAG ....................................................................((((.....(((((.((((((....)))))).(((.((....((((.......)))).......)).)))...........)))))..)))).(((..(((((....)))))..)))................................................................. ....................................................................69....................................................................................................................187.............................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)
.....................................ACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAA..........................................................................................................................................................................................	27	4	4.25	4.25	-	0.50	-	0.75	-	1.00	0.50	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	0.50	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................CACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAA..........................................................................................................................................................................................	26	4	2.00	2.00	-	-	-	0.75	-	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................GCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA........................................................................................................................................................................................................	26	7	1.86	1.86	1.14	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	0.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-
.......................................ACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAA..........................................................................................................................................................................................	25	4	1.75	1.75	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	1.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................GCAGGCACCTTAGAAGCAGCTCCTA...............	25	2	1.50	1.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................TACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAA..........................................................................................................................................................................................	28	4	1.25	1.25	-	-	-	0.25	-	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA........................................................................................................................................................................................................	25	7	1.14	1.14	0.86	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................GCTGTTACACATGCAGGTTCCTTTCACTT....................................................................................................	29	2	1.00	1.00	-	-	-	0.50	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................TGTTACACATGCAGGTTCCTTTCAtctt.......................................................................................................	28	tctt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................CTTTTCAGAGCCACCTACACTTTCA..........................................................................................................................................	25	2	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................GGACGTGGGAGAggg...............................................................................	15	ggg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................TCCCGGTTCGCgcag......................................	15	gcag	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................GTTCGCAGGCACCTTAGAAGCAGCTCCTA...............	29	2	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................CGCAGGCACCTTAGAAGCAGCTCCcacc.................	28	cacc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................CAGGTTCCTTTCACTTTGGGGtatg...............................................................................................	25	tatg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................ACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTA...........................................................................................................................................................................................	26	4	0.75	0.75	-	-	-	-	0.25	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................AAGCTGTTACACATGCAGGTTCCTTTCA.......................................................................................................	28	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................AGCTGTTACACATGCAGGTTCCTTTCA.......................................................................................................	27	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................AAAGGCTCTTTTCAGAGCCACCTACACTTTCA..........................................................................................................................................	32	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................TCTTTTCAGAGCCACCTACACTTTCA..........................................................................................................................................	26	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................TTTCAGCGTAAAAAGCTGTTA..........................................................................................................................	21	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................TGTTACACATGCAGGTTCCTTTCACT.....................................................................................................	26	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................GCTGTTACACATGCAGGTTCCTTTCA.......................................................................................................	26	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................CCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAA..........................................................................................................................................................................................	24	4	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................CGCAGGCACCTTAGAAGCAGCTCCTA...............	26	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................TACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTA...........................................................................................................................................................................................	27	4	0.50	0.50	-	0.25	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................AGCAGCTCCTAGTGTTTTGCCG....	22	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................AAGTGAGTTCCTTTAACTCACACTCCTA..............................................................................................................................................................................	28	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCA...............................................................................................................................................................................................................	29	6	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAACTCAC.....................................................................................................................................................................................	28	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................AGTACACCAGCTCCAAGT......................................................................................................................................................................................................	18	15	0.33	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................ACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAAt..........................................................................................................................................................................................	26	t	0.25	0.00	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TACACCAGCTCCAAGTGAGTTCCTTTAAt..........................................................................................................................................................................................	29	t	0.25	0.00	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................AGCTCCAAGTGAGTTCCTTTA...........................................................................................................................................................................................	21	4	0.25	0.25	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................ACTCCTAACCCAAAGGCTCTTTTCA............................................................................................................................................................	25	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................CCTAACCCAAAGGCTCTTTTCA............................................................................................................................................................	22	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.ACGCGGTGTCGGAGGGCACCAAGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................	28	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GAGGGCACCAAGGCCGTCACCAAGT.....................................................................................................................................................................................................................	25	6	0.17	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GGGCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACC................................................................................................................................................................................................................	28	6	0.17	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................GCACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCA...............................................................................................................................................................................................................	27	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................CGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA........................................................................................................................................................................................................	24	7	0.14	0.14	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................AGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCA.........................................................................................................................................................................................................	27	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-
.....................AAGGCCGTCACCAAGTACACCAGCTCCAA........................................................................................................................................................................................................	29	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................CCGTCACCAAGTACACCAGCTCCA.........................................................................................................................................................................................................	24	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14
..................ACCAAGGCCGTCACCAAGTACACCA...............................................................................................................................................................................................................	25	7	0.14	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................TACACCAGCTCCAAGTGAG...................................................................................................................................................................................................	19	15	0.13	0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................GGCCGTCACCAAGTAC...................................................................................................................................................................................................................	16	8	0.12	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................ACACCAGCTCCAAGTGAGT..................................................................................................................................................................................................	19	9	0.11	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................GTCACCAAGTACACCAGCTCCAAGTGA....................................................................................................................................................................................................	27	14	0.07	0.07	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................CACCAGCTCCAAGTGAG...................................................................................................................................................................................................	17	15	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-