| Gene: Gpr137b | ID: uc007pmc.1_intron_0_0_chr13_13451691_r.3p | SPECIES: mm9 |
|
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|
(8) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(8) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(40) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) |
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| .......................................TAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCAGT........................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 8.00 | 8.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................................................TAGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAGA........................................................................................................................................................ | 27 | 2 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCA.......................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................................................TAGGCCTGAAGACGCAGGTGTGTTGCTt......................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................TAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCc.......................................................................................................................................................................................... | 25 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................................................................................CCAGACTACTATGATTGGGGACAACAAA............... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGATTGGGGACAACAAAATAACAGCTTC.... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................AGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCAGT........................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TATGATTGGGGACAACAAAATAACAGCT...... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................GAAAATGGGCAAGATgat.................................................................................................................................................... | 18 | gat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................GTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCAGT........................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................TACTATGATTGGGGACAACAAAATA............ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................AGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCAGg........................................................................................................................................................................................ | 29 | g | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCAGTG....................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................AAGTTTTGCTCCAGACTACTATGATTG.......................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TTCTAAACTCTGCGGGGTTCAGTAGAC.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TATGATTGGGGACAACAAAATAACAG........ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................AGAAAATGGGCAAGATgata................................................................................................................................................... | 20 | gata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................TCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAG............................................................................................................................................................................................ | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GACTACTATGATTGGGGACAACAAAAT............. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGtaat........................................................................................................................................................................................ | 27 | taat | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................TAGGCCTGAAGACGCAGGTGTGTTGCT.......................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TGAATTCAGGCTGGCAGCAGTGTGC.................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................AGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAGA........................................................................................................................................................ | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................TAGAAAATGGGCAAGATACTAGGCCT.............................................................................................................................................. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGATTGGGGACAACAAAATAACAGC....... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TTGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGG................................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................AGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAGATAC..................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGa................................................................................................................................................ | 27 | a | 0.50 | 7.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................TAGAAAATGGGCAAGATACTAGGCCTG............................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................GTTTGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGG................................................................................................................................................. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................CATAGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAA.......................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................TCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGg........................................................................................................................................................................................... | 28 | g | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGCCT.............................................................................................................................................. | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TTCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCA............................................................................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................GTTTGGTAGAAAATGGGCAAGATACT.................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................AGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAG............................................................................................................................................................................................ | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TTCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGC.............................................................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................AGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAG......................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGt................................................................................................................................................ | 27 | t | 0.50 | 7.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGCt............................................................................................................................................... | 28 | t | 0.50 | 16.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TAGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCA........................................................................................................................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TTCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGC........................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................CGGGGTTCAGTAGACTTGAATTCAGGCT................................................................................................................................................................................................. | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................AGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAGATA...................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................GTTTGTTTGTTTAAAGTTTTGCTCCAGA...................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................TTTGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGG................................................................................................................................................. | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................GTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCcg......................................................................................................................................................................................... | 27 | cg | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................GTTTGTTTGTTTAAAGTTTTGCTCCAGAC..................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................GCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAG......................................................................................................................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGTTTGTTTGTTTAAAGTTTTGCTCCA........................................ | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................GTTCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGC.............................................................................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................TCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCA............................................................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TTGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGt................................................................................................................................................ | 28 | t | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................AGTTTGGTAGAAAATGGGCAAGATAC..................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................TGTGCATAGCAGTTTGGTAGAAAATGGGC............................................................................................................................................................ | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TAGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAGATAC..................................................................................................................................................... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................TGCAATACCCTGTGTCAAGCCACTGAAC......................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................TTTGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGCCT.............................................................................................................................................. | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................ATATGCAATACCCTGTGTCAAGCCACT............................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TAGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAca......................................................................................................................................................... | 26 | ca | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................TGTGCATAGCAGTTTGGTAGAAAATG............................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TTGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGCC............................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGATTGGGGACAACAAAATAACAGCTTCCT.. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TAGACTTGAATTCAGGC.................................................................................................................................................................................................. | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TGGTAGAAAATGGGC............................................................................................................................................................ | 15 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GTTCTGTAGTTGCAAACTTCTAAACTCTGCGGGGTTCAGTAGACTTGAATTCAGGCTGGCAGCAGTGTGCATAGCAGTTTGGTAGAAAATGGGCAAGATACTAGGCCTGAAGACGCAGGTGTGTTGCTAAAATCCACATATGACATATATGCAATACCCTGTGTCAAGCCACTGAACTGGTTTTGTTTGTTTGTTTAAAGTTTTGCTCCAGACTACTATGATTGGGGACAACAAAATAACAGCTTCCTGG ..........................................................................(((((..((.......((((..........))))...((((((((.(((((((.......................))))))))))))))).....))..)))))....................................................................... ..................................................................67....................................................................................................................185............................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................................................................................GAACTGGTTTTGTTTGTTTGTTTActt..................................................... | 27 | ctt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................GAACTGGTTTTGTTTGTTTGTTT...................................................... | 23 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.40 | - |
| ..............................................................................................................................................................................AACTGGTTTTGTTTGTTTGTT....................................................... | 21 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 |