chr13:12339643 12340209 -
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(2)
PIWI.mut 		(43)
TESTES

Sense strand
GACACTTTCTGTCTCCCCATCTGTGGAAAGGCCAGATTATAGGAACATCAGTAAGTATTCACATACAACCACAGACCTTGGGGAAGTGCTTCAGTAATGTACAAGTGAGACCCCAGAAATGTGTGACTGTACCTGTGTCAAGGGCCTACTGTAGTGCCTGCAGTGCTCACAAGTTAGCTACTGTTCTTACTTGGGCTTGCTTTCAGTTTTTTGTTTTTTTTTGGTTTTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGACCTCAGAGCTGGCTCACCTGTGAGAAGCCCAGGACGAGTGGCAGCAGTTTAGGAGCAACCTTGCTGCAAATCTCCTTACATTGCATTTGGTTCCTGGCGTGCTATCCACTGTGTTTTTAACCATCATTAGTTCACAAGTGCCAGGCTTGAGCTTGGTACACCCTGGTGTCATTCTGAGGTGCGGGTTTCTGACGCGCTGGCCGTGATTTGTTTTTTGCAGCATTTGATGAGCTTGTTGACGCATACCAGGAGCAGGCCAAGGGACTGCTG


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCaa................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 aa 49.00 0.00 28.00 1.00 - 9.00 3.00 5.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCag................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 ag 10.00 0.00 - 8.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 10.00 10.00 2.50 3.00 - 1.00 2.00 - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGtt............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 8.00 0.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 aa 7.00 0.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCagga................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 agga 7.00 0.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 2 7.00 7.00 1.00 4.00 - 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCga................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 ga 6.00 0.00 - 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TTTCTGTCTCCCCATCTGTGGAAAGGCCAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 6.00 6.00 - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGACa............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 a 5.00 10.00 2.50 - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGaga................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 aga 5.00 0.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCcat............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 cat 4.00 0.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 4.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCtta................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 tta 4.00 0.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................GTAGATCAGGCTGGCCTCGAtt............................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 tt 4.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTGGAAAGGCCAGATTATAGGAACA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCaga................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 aga 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaaaa.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 aaaa 3.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 aa 3.00 0.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGag.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 ag 3.00 0.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGta...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ta 3.00 0.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGta............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ta 3.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAta............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 ta 2.00 0.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAtt............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 tt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGaag................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 aag 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGggc..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 ggc 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TTTCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTttt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 ttt 2.00 0.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCgaa................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 gaa 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGccc............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 ccc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................AACTCACTTTGTAGATCAGGCTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 ttt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGaac................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 aac 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAgca........................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 gca 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCatt............................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 att 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGat.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 at 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGACaaa.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 aaa 1.50 10.00 - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGATCAGGCTGGgg.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 gg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaat............................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCcata............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 cata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGtaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGttcg................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 ttcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGccc............................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 ccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGtaaa................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaa................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTtta................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGcaa............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TTTCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTaaa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTGGAAAGGCCAGATTATAGGAAC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCgcgt.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 gcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGct............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ct 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCccca.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 ccca 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCgggc................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 gggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCtgca............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 tgca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCtccg............................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tccg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTtttg.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 tttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCggga................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ggga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGtggc.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGtga.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tga 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGGAAa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ATCTGTGGAAAGGCCAGATTATAGGAA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGaag................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TTTCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTgtat............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 gtat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTGGAAAGGCCAGATTATAGGAACATCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTggag............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ggag 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................AACTCACTTTGTAGATCAGGCaat.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTtaa................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGATCAGGCTGGCCTCGAttt........................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ttt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGat.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TTTCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTtaa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGta................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCag................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 ag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaaaa.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 aaaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGATCAGGCTGGacta................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 acta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGGAAAGGCCAGATTATAGGAACATCAc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGtcta................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 tcta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaa................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaagt.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCAGAct..................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAtat........................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGATCAGGCTGGCCTCGACCTCAGA....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTGGAAAGGCCAGATTATAGGAACAa....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTttta.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGgta............................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaat............................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGtatt.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGta............................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 ta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGATCAGGCTGGCtac................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 tac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGGAAa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCAaga.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 33 aga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACTTTGTAGATCAGGCTtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...............................................................................................................................................................................................................................................TTTCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTtata............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 tata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaat............................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTtta................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGATGAGCTTGTTGACGCATACCAGG.................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAgaaa.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGCTGGCCTCGACCTCAGA....................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTAGATCAGGCTGtcta................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 tcta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTcgt................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 cgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGGAACTtta..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGag.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCcac............................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 cac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................CACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGttt............................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGtttt........................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGACCTCAGAa...................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTGGAAAGGCCAGATTATAGGAACAT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCaac............................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGaaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCAGg....................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 g 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCatta.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 atta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CAGATTATAGGAACATCAcatt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 catt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTttt................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTGGAAAGGCCAGATTATAGGAA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGccct........................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ccct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGgga................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCaga............................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 aga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTGGAAAGGCCAGATTATAGGAACATa...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAgt............................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 gt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGATTATAGGAACATCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGACaa........................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 aa 0.50 10.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGATCAGGCTGGCCTCGACa............................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 a 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGATCAGGCTGGCCTCGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14

Antisense strand
GACACTTTCTGTCTCCCCATCTGTGGAAAGGCCAGATTATAGGAACATCAGTAAGTATTCACATACAACCACAGACCTTGGGGAAGTGCTTCAGTAATGTACAAGTGAGACCCCAGAAATGTGTGACTGTACCTGTGTCAAGGGCCTACTGTAGTGCCTGCAGTGCTCACAAGTTAGCTACTGTTCTTACTTGGGCTTGCTTTCAGTTTTTTGTTTTTTTTTGGTTTTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGACCTCAGAGCTGGCTCACCTGTGAGAAGCCCAGGACGAGTGGCAGCAGTTTAGGAGCAACCTTGCTGCAAATCTCCTTACATTGCATTTGGTTCCTGGCGTGCTATCCACTGTGTTTTTAACCATCATTAGTTCACAAGTGCCAGGCTTGAGCTTGGTACACCCTGGTGTCATTCTGAGGTGCGGGTTTCTGACGCGCTGGCCGTGATTTGTTTTTTGCAGCATTTGATGAGCTTGTTGACGCATACCAGGAGCAGGCCAAGGGACTGCTG


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
..........CCCCATCTGTGGAAgaaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 gaaa 5.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCActca......................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ctca 5.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCActa......................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 cta 4.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCActt......................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ctt 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAagaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 agaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAta............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCActtt......................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 cttt 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACTTTGTAtgta............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 tgta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTGGAACTCACTTTGTAccag............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 ccag 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTGGAACTCACTTTGTAcggg............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 cggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGctt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCGACCTCAGAgggg....................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 gggg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAc............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTGTAGCCCAGGCTGTCCTGGAAt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTata................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTagaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 agaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GTTTTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAaat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 aat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAGATCAGGCTGGCCTCGACCTCAGAga....................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 ga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTGGAACTCACTTTGTAGATCAcgcc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 cgcc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................GGGTTTCTCTGTGTAGCCCAGga...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGACCTCAGA....................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGGCCTCGACCTCAGAagcc....................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 agcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAGATCAGGCTGGCCTCGcc............................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTGGAACTCACTTTGTAGATCAggta.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAaatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aatt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAgaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTtat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 tat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCGACCTCAGAcggt....................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 cggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCActag......................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 ctag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGGCCTCGACCTCAGAagtt....................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 agtt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................GCCCAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................CCCAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAaaga............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AACTCACTTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGaa............................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GTTTTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTGaat.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 aat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtacc............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTCGACCTCAGAgagc....................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 gagc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGGCCTCGACCTCctct.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 ctct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................CCCAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAg............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 g 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TCCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCtt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GCTGTCCTGGAACTCACTTTGgagc................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 gagc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAacc............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 acc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGcgt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 cgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 taa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TTTCCGAGACAGGGTTTCTCTGTGttt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAgat............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGGCCTCGACCTCAGAtgcc....................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 tgcc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTTTCCGAGACAGGGTTTCTCgaat.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 gaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTCGACCTCAGAgagt....................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 gagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTGGAACTCACTTTGTAcaga............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 caga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTGGCCTCGACCTCAtct......................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 tct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTGGCCTCGACCTCAtt......................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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