| Gene: 2610204M08Rik | ID: uc007pes.1_intron_21_0_chr12_113850816_f.5p | SPECIES: mm9 |
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(5) OTHER.mut |
(6) PIWI.ip |
(1) PIWI.mut |
(26) TESTES |
| CCCTGATTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCAGTGAGGTATGTATGCAGCCTGGCTTGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGTTCCGGGGCCTCAGCCTGCTGCCTGGCCCTCCTGAGCACTAACCTAGCTTGTCTCCAGCCCTCTCGGGATACCAGTAAACCCCTCCCTTGGCTCATGGTGGTGGTGCCTCTGCTGTGCTGCCTTGTTAGAGAAGGCCTGGCTGCCGAGCCTTGCCT ............................................................((((.((.....(((.(((..((..(((((((((((..((((((.(((....)))...))))))..........))))).))).)))..)).(((....))).....))).))).....))..))))............................................................... ...........................................................60................................................................................................................................190.......................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ................................................................TGGCTTGTGTTGACTAATGATGACAGC............................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 81.00 | 81.00 | 25.00 | 17.00 | 6.00 | 7.00 | 7.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ..........................................................................TGACTAATGATGACAGCGGGTTCCGGG..................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 59.00 | 59.00 | 26.00 | 14.00 | 5.00 | - | 3.00 | 8.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTG........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 25.00 | 25.00 | 10.00 | 9.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTG.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 19.00 | 19.00 | 5.00 | 2.00 | 1.00 | - | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTG........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 18.00 | 18.00 | 7.00 | 9.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGT....................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 16.00 | 16.00 | 2.00 | 4.00 | - | 5.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGT................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 13.00 | 13.00 | 2.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TGACTAATGATGACAGCGGGTTCCGG...................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 13.00 | 13.00 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGTT.......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 12.00 | 12.00 | 3.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGATTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 11.00 | 11.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 7.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TGTTGACTAATGATGACAGCGGGTTCC........................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 11.00 | 11.00 | 4.00 | 5.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TGACTAATGATGACAGCGGGTTCCG....................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 10.00 | 10.00 | 1.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGCTTGTGTTGACTAATGATGACAGCG.............................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 4.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TGTTGACTAATGATGACAGCGGGTTC......................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 9.00 | 9.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCT......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 7.00 | 7.00 | 2.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGCTTGTGTTGACTAATGATGACAGCGG............................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 7.00 | 7.00 | 4.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGT....................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 6.00 | 6.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................TGTTAGAGAAGGCCTGGCTGCCGAGCC...... | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTG.................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TTGTGTTGACTAATGATGACAGCGGG............................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................TGTTAGAGAAGGCCTGGCTGCCGAGC....... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................TAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCC.............................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGT..................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................TGCAGCCTGGCTTGTGTTGACTAATG....................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGT....................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TGACTAATGATGACAGCGGGTTCCGGGG.................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGT........................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................TCCTGAGCACTAACCTAGCTTGTCTCC.................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATC............................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGAT................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGATTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGG........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTG.................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGATTCTGATGATATTAAGGCAAAAAG............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATC............................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGTGCTGCCTTGTTAGAGAAGGCCT.................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................................................................TGACTAATGATGACAGCGGGTTCCGGt..................................................................................................................................................... | 27 | t | 2.00 | 13.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGA................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGTGCTGCCTTGTTAGAGAAGGCCTG................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................GGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCAGT........................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TGACTAATGATGACAGCGGGTTCCGGGt.................................................................................................................................................... | 28 | t | 2.00 | 59.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................TAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATC............................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................TGTGTGTGATCCAGTGAGGTATGTATGC.............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................AAGGCTGTGTGTGATCCAGTGAGGTA..................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
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| ..........GATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGT....................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ....................................................................TTGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGTT.......................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGTTCC........................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGG........................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................TGCAGCCTGGCTTGTGTTGACTAATGATG.................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................TGTATGCAGCCTGGCTTGTGTTG.............................................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TCGGGATACCAGTAAACCCCTCCCTTGGC................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................TGAGGTATGTATGCAGCCTGGCTTGT.................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................TTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCAG............................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................CTGGCTTGTGTTGACTAATGATGACAGC............................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................ACCTAGCTTGTCTCCAGCCCTCTCGGt........................................................................................ | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................CTTGTGTTGACTAATGATGACAGCGG............................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................TTGTTAGAGAAGGCCTGGCTGCCGAGCC...... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCC.............................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TGGTGGTGGTGCCTCTGCTGTGCTGCCT................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGTGCTGCCTTGTTAGAGAAGGCCTGtc............... | 31 | tc | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TAATGATGACAGCGGGTTCCGGGGCC.................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................TTAGAGAAGGCCTGGCTGCCGAGCC...... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................CCTGGCTTGTGTTGACTAATGATGAC.................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTGATCCAGTGAGGTATGTATGCA............................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| .CCTGATTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGT................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................ATCCAGTGAGGTATGTATGCA............................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................TGCCTCTGCTGTGCTGCCTTGTTAGA.......................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGT................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTGATCCAGTGAGGTATGTATGCAGCC.......................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................TGACAGCGGGTTCCGGGGC................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................TGAGCACTAACCTAGCTTGTCTCCAGC................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGT..................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................AGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCAG............................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................GCTTGTGTTGACTAATGATGACAGCGG............................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TGATGACAGCGGGTTCCGGGGCCTC................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGAT................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................TAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCAG............................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................TGTATGCAGCCTGGCTTGTGTTGAC............................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................TCTGCTGTGCTGCCTTGTTAGAGAAGGC.................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGATCCAGTGAGGTATGTATGCAGCCT......................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................TGACAGCGGGTTCCGGGGCCTCAGC............................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ...........................................................................GACTAATGATGACAGCGGGTTCCGGGG.................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TAATGATGACAGCGGGTTCCGGGGCCTC................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TAATGATGACAGCGGGTTCCGGGGCCT................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTGATCCAGTGAGGTATGTATGCAGC........................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TTGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGT........................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................TGCAGCCTGGCTTGTGTTGACTAATGA...................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGTGCTGCCTTGTTAGAGAAGGCCTGGCT.............. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................AGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCt............................................................................................................................................................................................................. | 25 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTG...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTTGACTAATGATGACAGCGGG............................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................GATCCAGTGAGGTATGTATGCAGCCTG........................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................CTTGTGTTGACTAATGATGACAGCGGG............................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................GTGTTGACTAATGATGACAGCGGGTTC......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGCTTGTGTTGACTAATGATGACAGCa.............................................................................................................................................................. | 28 | a | 1.00 | 81.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................AGGCTGTGTGTGATCCAGTGAGGTA..................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................AGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCAGT........................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGTTC......................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGGCTTGTGTTGACTAATGAT..................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| .......................................GATCCAGTGAGGTATGTATGCAGC........................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTG........................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TGTTGACTAATGATGACAGCGGGTT.......................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................CCCTCTCGGGATACCAGTAAACCCCTC....................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTG.................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGATCCAGTGAGGTATGTATGCAGC........................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGATTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCT......................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................GTTAGAGAAGGCCTGGC............... | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................AGAGAAGGCCTGGCTGC............ | 17 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CCCTGATTCTGATGATATTAAGGCAAAAAGGCTGTGTGTGATCCAGTGAGGTATGTATGCAGCCTGGCTTGTGTTGACTAATGATGACAGCGGGTTCCGGGGCCTCAGCCTGCTGCCTGGCCCTCCTGAGCACTAACCTAGCTTGTCTCCAGCCCTCTCGGGATACCAGTAAACCCCTCCCTTGGCTCATGGTGGTGGTGCCTCTGCTGTGCTGCCTTGTTAGAGAAGGCCTGGCTGCCGAGCCTTGCCT ............................................................((((.((.....(((.(((..((..(((((((((((..((((((.(((....)))...))))))..........))))).))).)))..)).(((....))).....))).))).....))..))))............................................................... ...........................................................60................................................................................................................................190.......................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) |
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