(11)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(32)
TESTES

Sense strand
CCGGGTCTTGTCCGCTGCCCCGTCAAGGGGTCATAAGAAGGCGTCTCGAGGTGCCATGGGATTTGTAGTTCCCTCCGTTTGCCGCGGAGCGCCGGGCCCCGGGCTCTGGGCGGGGCGGAAAGTGTGGTGGCCGCCCGGGCAGCTAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGGAGGGAAACCAAGGACTGACAAACTCGAGTCGGCTCATGAACTACAACTCCCAGCAGCTCAGGGGGCGG
........................................................................((((((((.((((((.((((((((((((.((((((((((((.((..........))..))))))))..))))....)).)))))..)))))......)))))).))))))))..................................................................
....................................................................69.................................................................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGC...................................................................... 25 1 31.00 31.00 17.00 6.00 4.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCG..................................................................... 26 1 27.00 27.00 14.00 3.00 2.00 - 3.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.............................................................................................................................................GCTAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGC.................................................................................. 27 1 10.00 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGG.................................................................... 27 1 8.00 8.00 - 2.00 - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGGA................................................................... 28 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GTAGAGCATTGCGGGAGGCG..................................................................... 20 1 6.00 6.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CGGCCTGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCG..................................................................... 31 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................AACCAAGGACTGACAAACTCGAGTCGGC................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGG....................................................................... 24 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................................................................................................................................................................................AAACCAAGGACTGACAAACTCGAGTCGGC................................... 29 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGC.................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGA......................................................................... 22 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TAAGAAGGCGTCTCGAGGTGCCATGGG.............................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAG........................................................................ 23 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CGGCCTGAGGCGTAGAGCATTGC............................................................................. 23 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TCCGTTTGCCGCGGAGCGCCGGGC......................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGACAAACTCGAGTCGGCTCATGAAC........................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGAACTACAACTCCCAGCAGCTCAGG...... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGt.................................................................... 27 t 2.00 27.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGa.................................................................... 27 a 2.00 27.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCATTa.............................................................................. 29 a 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GGAGCGCCGGGCCCa...................................................................................................................................................... 15 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCAa................................................................................ 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................AGAAGGCGTCTCGAGGTGCCATGGGc............................................................................................................................................................................................. 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGCCATGGGATTTGTAGTTCCCTCCGTT........................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCTTGTCCGCTGCCCCGTCAAGGGGTCA......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................TAAGAAGGCGTCTCGAGGTGCCATGGGA............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGG.................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GCTCATGAACTACAACTCCCAGCAGC........... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAAGGGGTCATAAGAAGGCGTCTCGAG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ACTGACAAACTCGAGTCGGa................................... 20 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................AGGTGCCATGGGATTTGTAGTTCCCT................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCATTG.............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CATGAACTACAACTCCCAGCAGCTCAG....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................AACCAAGGACTGACAAACTCGAGTCGG.................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGACAAACTCGAGTCGGCTCATGAACTAC........................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GAAGGCGTCTCGAGGTGCCATGGGATTT.......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCca................................................................................ 27 ca 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CGCCGGGCCCCGGGCgc................................................................................................................................................ 17 gc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAG................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGGGATTTGTAGTTCCCTCCGTTTGC........................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ACCAAGGACTGACAAACTCGAGTCGGC................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCATT............................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGGGTCATAAGAAGGCGTCTCGAGGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCATT............................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCGGGTCTTGTCCGCTGCCCCGTCAAGGGGTCATAAGAAGGCGTCTCGAGGTGCCATGGGATTTGTAGTTCCCTCCGTTTGCCGCGGAGCGCCGGGCCCCGGGCTCTGGGCGGGGCGGAAAGTGTGGTGGCCGCCCGGGCAGCTAAGAGGCGGCCTGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGGAGGGAAACCAAGGACTGACAAACTCGAGTCGGCTCATGAACTACAACTCCCAGCAGCTCAGGGGGCGG
........................................................................((((((((.((((((.((((((((((((.((((((((((((.((..........))..))))))))..))))....)).)))))..)))))......)))))).))))))))..................................................................
....................................................................69.................................................................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.........................................................................................................................................GCTAAGAGGCGggtg.................................................................................................. 15 ggtg 12.00 0.00 - - 2.00 - - - 7.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................GAGGGAAACCAAGGACTGACAAACTC........................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................AACTACAACTCCCAGCAGCTCA........ 22 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGAGGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGGA................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGGGTCATAAGAAGGCGTCTCGAGGTGCCA.................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ACTACAACTCCCAaagg................ 17 aagg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTCCGCTGCCCCaatt..................................................................................................................................................................................................................................... 18 aatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GCCTGAGGCGTAGAGCATT............................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AACTCGAGTCGGCTCATGAACTA......................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TCTCGAGGTGCCATGGGATTTGTA....................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
......CTTGTCCGCTGCCCCGTCAAGGGGTCA......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GGCGTCTCGAGGTGCCATGGGATTTGTA....................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GGCGTAGAGCATTGCGGGAGGCGGAGGGAA.............................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GCTAAGAGGCGggcg.................................................................................................. 15 ggcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CGTCTCGAGGTGCCATGGGATTTGTA....................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................CTCGAGGTGCCATGGGATTTGTA....................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CAAACTCGAGTCGGCTCATGAACTA......................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GCTAAGAGGCGggag.................................................................................................. 15 ggag 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GTCTCGAGGTGCCATGGGATTTGTA....................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GTCGGCTCATGAACTACAACTCCCA................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CATGAACTACAACTCCCAGCAGCTCA........ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GAACTACAACTCCCAGCAGtggc............ 23 tggc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -