chr12:77550770 77551182 +
(9)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(2)
PIWI.mut 		(37)
TESTES

Sense strand
CTAGCCCTTTTATTTTGATTTGTGATAAAAATTGCAACATCTTGATCCAGGTTGGTTTCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGGCTTATGGTCACCATACCCAGTCATGGATTTTTAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAAGTGATACTAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGATTATATTCATACCAGAAGTCTATGTTATTCTGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAATAAGCTGCATTCAGTTCAACTCTCCATCATTGAGCCCCCATGGGAGGTGCTTAGAAAGACAAATAACATTTGCTTTTTACAATTGCAGATCCTATAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCAAAGCTGTTCATGTGGTTA
.........................................................................................................................................................(((((..((((((((((.((((.....))))...)))))))))).....((((((......))))))...))))).........................................................................................................................................................................................
...............................................................................................................................................144.................................................................................................244.......................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................................................TAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGCTT................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 43.00 43.00 18.00 10.00 3.00 1.00 - - 3.00 3.00 1.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAAGT.................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 24.00 24.00 10.00 5.00 - - - 3.00 - 4.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TACTGTGGATTATATTCATACCAGAAGTC............................................................................................................................................................................. 29 1 15.00 15.00 3.00 - - 3.00 - - 3.00 2.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAATTGCAGATCCTATAGCCTAACA.................................. 27 1 14.00 14.00 1.00 - 2.00 2.00 4.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGTTT.......................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 13.00 13.00 5.00 1.00 - - - - 3.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGCTTT............................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 12.00 12.00 - 3.00 - 2.00 - - 2.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAA...................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 12.00 12.00 3.00 1.00 - - 1.00 2.00 - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCA....................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 2.00 - - - 5.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGG.................................................................................................................................................................................................. 29 1 11.00 11.00 3.00 3.00 - - - - - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAATA........................................................................................................................................ 27 1 9.00 9.00 - - 1.00 1.00 1.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGA................................................................................................................................................................................................. 27 1 9.00 9.00 1.00 4.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCAA................. 27 1 8.00 8.00 - - 4.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGAT................................................................................................................................................................................................ 28 1 8.00 8.00 4.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACAATTGCAGATCCTATAGCCTAAC................................... 27 1 7.00 7.00 - - - 2.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAAAATTGCAACATCTTGATCCAGGTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 7.00 7.00 - - - 4.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACAATTGCAGATCCTATAGCCTAACA.................................. 28 1 7.00 7.00 - - - 1.00 - 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGTGCTTAGAAAGACAAATAACATT.................................................................... 30 1 6.00 6.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTC........................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 6.00 6.00 - 1.00 - - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGTGCTTAGAAAGACAAATAAC....................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACAGGAAGGGAAGGACCCAAAGCTG............ 27 1 5.00 5.00 - 1.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAAG..................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAAAATTGCAACATCTTGATCCAGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGCTT................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACAGGAAGGGAAGGACCCAAAGC.............. 25 1 5.00 5.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTATATTCATACCAGAAGTCTAT.......................................................................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 - - - 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAACAGGAAGGGAAGGACCCAAAGCT............. 26 1 4.00 4.00 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGGATTTTTAAACCTGGAAGTGACTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTTTACAATTGCAGATCCTATAGC........................................ 28 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTATATTCATACCAGAAGTCTATGTTATT.................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TTTTAAACCTGGAAGTGACTCATAAA..................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAATTGCAGATCCTATAGCCTAAC................................... 26 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTATATTCATACCAGAAGTCTA........................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGG.................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAAAATTGCAACATCTTGATCCAGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCAAAG............... 29 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTATATTCATACCAGAAGTCTATGTTAT..................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAGAA................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGTG................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TACTGTGGATTATATTCATACCAGAAGT.............................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAGAATA............................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TGGTGCTTTGATATTCAAGTGATACT.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGATAAAAATTGCAACATCTTGATCCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGGCTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TACTAATAAGAAATCTTCACAACGTACT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCAAA................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCACTATGTAGTCCAGGGCTGGTCTTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATTGCAGATCCTATAGCCTAACAG................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCAGATCCTATAGCCTAACAGGAAG............................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................................................................TGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 2.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTACAATTGCAGATCCTATAGCC....................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGAT................................................................................................................................................................................................ 31 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATTGCAGATCCTATAGCCTAACAGt................................ 27 t 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTATATTCATACCAGAAGTCTATGTT....................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAATTGCAGATCCTATAGCCTAACAG................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................GAAGTCTATGTTATTCTGAAGTCAGT......................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGTGCTTAGAAAGACAAATAACAT..................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TACTGTGGATTATATTCATACCAGAAG............................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................TGTTATTCTGAAGTCAGTGTAATTCA................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGGATTTTTAAACCTGGAAGTGACTCATA....................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTACAATTGCAGATCCTATAGCCTA..................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TACCAGAAGTCTATGTTATTCTGAAGT............................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAATAA....................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GAATAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATT......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................GTCTATGTTATTCTGAAGTCAGTGT....................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACAATTGCAGATCCTATAGCCTAA.................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................TCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAATTGCAGATCCTATAGCCTAACAGG................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGATT............................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTTTACAATTGCAGATCCTATAG......................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AAAATTGCAACATCTTGATCCAGGTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGGTC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGACTCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGT.................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTTGATATTCAAGTGATACTAATAAGA....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACC.................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAATAAGC..................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................................................................................................................................TATTCAAGTGATACTAATAAGAAATCTT................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................AGTGACTCATAAAAGAATAGGTTTGTTGG..................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTATATTCATACCAGAAGTCTATGTT....................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAATTGGGGCTTATGGTCACCATACC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TGGTGCTTTGATATTCAAGTGATAC............................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTATAGCCTAACAGGAAGGGAAGG....................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCg....................................................................................................................................................................................................................................... 26 g 1.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TTTTATTTTGATTTGTGATAAAAATT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTATATTCATACCAGAAGTCTATGTTATTC................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGTCACCATACCCAGTCATGGATTTTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGGATTTTTAAACCTGGAAGTGACTCAT........................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CACAACGTACTGTGGATTATATTCATA...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCAGATCCTATAGCCTAACAGGAA.............................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCcaa................ 28 caa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTTCAACTCTCCATCATTGAGCCC..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGGTCTTGAATTGGGGCTTATGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGGCa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................TATGTTATTCTGAAGTCAGTGTAATT................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TTTTATTTTGATTTGTGATAAAAATTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AGGGCTGGTCTTGAATTGGGGCTTATGGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCAA................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCAGTTCAACTCTCCATCATTGAGCtcc.................................................................................................... 29 tcc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTTTACAATTGCAGATCCTATAGCC....................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGCTTTG.............................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAAGTG................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAAATAAGCTGCATTCAGTTCAACT..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TGGTGCTTTGATATTCAAGTGATACTAA............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TACCCAGTCATGGATTTTTAAACCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGGACCCAAAGCTGTTCATGTGGT.. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................CTAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGG.................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTACAATTGCAGATCCTATAGCCT...................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGTGCTTAGAAAGACAAATAACA...................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAAAAGAATAGGTTTGTTGG..................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TACCAGAAGTCTATGTTATTCTGAA............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TACTGTGGATTATATTCATACCAGAAGTCTA........................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TACCAGAAGTCTATGTTATT.................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................AATAAGCTGCATTCAGTTCAACTCTCC................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAAATAAGCTGCATTCAGTTCAAC...................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTATAGCCTAACAGGAAGGGAAGGA...................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TAAAAATTGCAACATCTTGATCCAGGc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.TAGCCCTTTTATTTTGATTTGTGATA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGC.................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGt................................................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TTGTTGGTGCTTTGATATTC........................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCATTCAGTTCAACTCTCCATCATTGA......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGAAGGGAAGGACCCAAAGCTGTTCAT....... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGt................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCA.................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TATTCTGAAGTCAGTGTAATTCAATTAA............................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGAATTGGGGCTTATGGTCACCATAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTG................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGGTTTGTTGGTGCT................................................................................................................................................................................................................................................. 16 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCC................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGTTTG......................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.TAGCCCTTTTATTTTGATTTGTGATAAAAAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAATAAGAAATCTTCACAACGTACTG..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCATTGAGCCCCCATGGGAGGTGCTT...................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATAGCCTAACAGGAAGGGAAGGAC..................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATTGCAGATCCTATAGCCTAACAGG................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGCT................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCAAAGt.............. 30 t 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTAAACCTGGAAGTGACTCA......................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................TTCTGAAGTCAGTGTAATTCAATTA............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................GTCTATGTTATTCTGAAGTCAGTGTA...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TATTCATACCAGAAGTCTATGTTATTCTGA................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGA................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGATCCTATAGCCTAACAGGAAGGGA.......................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCATTGAGCCCCCATGGGAGGTG......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTATATTCATACCAGAAGTCTATGTTA...................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GTGACTCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGT.................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTACAATTGCAGATCCTATAGCCT...................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................AGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCATTGAGCCCCCATGGGAGGTGCTTA..................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTACTGTGGATTATATTCATACCAGAAGTC............................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TACCCAGTCATGGATTTTTAAACCTGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGGTCTTGAATTGGGGCTTATGGTCAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTACAATTGCAGATCCTATAGCCTAAC................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAATc........................................................................................................................................ 27 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TGTGGATTATATTCATACCAGAAGTCT............................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAAACCTGGAAGTGACTCATAAAA.................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TTTCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGGATTTTTAAACCTGGAAGTGACTCA......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CCTGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAAGT.................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TAAAATAAGCTGCATTCAGTTCAACTC.................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCTTTTTACAATTGCAGATCCTATAGCCT...................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTATATTCATACCAGAAGTCTATGTgatt.................................................................................................................................................................... 29 gatt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TGGTGCTTTGATATTCAAGTGATACTAATAA......................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TATTCATACCAGAAGTCTATGTTATTCT.................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAGAAT................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGGGGCTTATGGTCACCATACCCAGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TACTAATAAGAAATCTTCACAACGTAC....................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TATATTCATACCAGAAGTCTATGTTATT.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGC.................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AGAAATCTTCACAACGTACTGTGGATT............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AATAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAAGT.................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGGTCTTt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAAT......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TTAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAta.................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................ATGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................AAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGA................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAA.......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCACTATGTAGTCCAGGGCTGGTCTT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................TAAAATAAGCTGCATTCAGTTCAACTCT................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATCATTGAGCCCCCATGGGAGGTGC........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TTGGTGCTTTGATATTCAAGTGATAC............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGAAGGACCCAAAGCTGTTCATGTGGT.. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................ACCTGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGTTT.......................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGaat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aat 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TATTCATACCAGAAGTCTATGTTATTCTGAA............................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TTGTTGGTGCTTTGATATTCAAGTG................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TACCCAGTCATGGATTTTTAAACCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GACTCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGt.................................................................................................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCACTATGTAGTCCAGGGCTGGTCTTt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAATTGCAGATCCTATAGCCTcac................................... 26 cac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAA........................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTAGCCCTTTTATTTTGATTTGTGATAAAAATTGCAACATCTTGATCCAGGTTGGTTTCCAACTCACTATGTAGTCCAGGGCTGGTCTTGAATTGGGGCTTATGGTCACCATACCCAGTCATGGATTTTTAAACCTGGAAGTGACTCATAAAAGAATAGGTTTGTTGGTGCTTTGATATTCAAGTGATACTAATAAGAAATCTTCACAACGTACTGTGGATTATATTCATACCAGAAGTCTATGTTATTCTGAAGTCAGTGTAATTCAATTAAAATAAGCTGCATTCAGTTCAACTCTCCATCATTGAGCCCCCATGGGAGGTGCTTAGAAAGACAAATAACATTTGCTTTTTACAATTGCAGATCCTATAGCCTAACAGGAAGGGAAGGACCCAAAGCTGTTCATGTGGTTA
.........................................................................................................................................................(((((..((((((((((.((((.....))))...)))))))))).....((((((......))))))...))))).........................................................................................................................................................................................
...............................................................................................................................................144.................................................................................................244.......................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...................................................................................TCTTGAATTGGGGCTga......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTAATTCAATTAAAAgggg.......................................................................................................................................... 19 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -