chr12:77550498 77550747 +
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(1)
PIWI.mut 		(43)
TESTES

Sense strand
TTAACATTTATTTATTTAGTGTATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAGTGCATCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCAACTCCATGGTTTCTTTTGCAGGATTCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGTACGCACTGGGCATG
......................................................................................................(((..(((((........(((((......((((((((((.....)))))))..)))))))))))))...)))............................................................................
..............................................................................................95....................................................................................181...................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGTA............. 28 1 58.00 58.00 23.00 6.00 8.00 8.00 3.00 - - 3.00 3.00 - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGTAC............ 29 1 16.00 16.00 2.00 - 6.00 4.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGATTCACGATGACTGGAGATT............................. 26 1 14.00 14.00 3.00 6.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTG............... 26 1 13.00 13.00 5.00 6.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCAAGACCTTGTACGCACTGGGCATG 26 1 12.00 12.00 1.00 - 2.00 4.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGATTCACGATGACTGGAGATT............................. 27 1 11.00 11.00 5.00 2.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGG............................................................................................................................ 27 1 9.00 9.00 3.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGT.............. 27 1 9.00 9.00 3.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATATGGTTGATGGAAATTGAACTCA.............................................................................................................................. 25 1 8.00 8.00 4.00 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGATTCACGATGACTGGAGATTT............................ 27 1 6.00 6.00 - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGAC................... 29 1 6.00 6.00 - - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGTACG........... 30 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGG.......................................................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TAATCAAGACCTTGTACGCACTGGGCATG 29 1 5.00 5.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................ATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggct.......................................................................................................... 30 ggct 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTGCAGGATTCACGATGACTGGAG................................ 26 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GATGACTGGAGATTTAATCAAGACCTT................ 27 1 4.00 4.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATATGGTTGATGGAAATTGAACTCAG............................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGA......................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................................................................................TGAGTCACCATATGGTTGATGGAAATTG.................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................................ATATGGTTGATGGAAATTGAACT................................................................................................................................ 23 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAGTCACCATATGGTTGATGGAAATTGA................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCagca................................................................................................. 32 agca 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CGATGACTGGAGATTTAATCAAGACC.................. 26 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................AAGACCTTGTACGCACTGGGCATG 24 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TAATCAAGACCTTGTACGCACTGGGC... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTGCAGGATTCACGATGACTGGA................................. 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGACC.................. 29 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGATTCACGATGACTGGAGAT.............................. 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGccga..................................................................................................................................................................................................... 27 ccga 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGATTCACGATGACTGGAGA............................... 24 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGATTCACGATGACTGGAGATT............................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGA.................... 28 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGG............................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGAC................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGt.......................................................................................................................................... 29 t 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGATTCACGATGACTGGAGATTTAATCA....................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGATTCACGATGA...................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGG.......................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGTACGt.......... 31 t 2.00 5.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TAACATTTATTTATTTAGTGTATATGAGT............................................................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGcaa.............................................................................................................. 24 caa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGACC......................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGTACGC.......... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................ATCAAGACCTTGTACGCACTGGGCATG 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGATTCACGATGACTGGAGATTTA........................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGcaga............................................................................................................. 25 caga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CGATGACTGGAGATTTAATCAAGACCT................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GTGTATATGAGTACACTGTAGCTGTatgg........................................................................................................................................................................................................... 29 atgg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGA......................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAGTCACCATATGGTTGATGG.......................................................................................................................................... 22 2 2.00 2.00 - 0.50 - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GATGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTG............... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CATATGGTTGATGGAAATTGAACTCA.............................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGaga................................................................................................... 30 aga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTAATCAAGACCTTGTACGCACTG...... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGATTCACGATGACTGGAGATa............................. 26 a 2.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGATTCACGATGACTGGAGAT.............................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTAATCAAGACCTTGTACGCACTGGGC... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGATTCACGATGACTGGAGA............................... 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGTTGATGGAAATTGAACTCAGG............................................................................................................................ 24 10 1.40 1.40 0.30 0.60 - - - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGTTGATGGAAATTGAACTaa.............................................................................................................................. 22 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGAAA....................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACCCCAag............................................................................................................................................................................................... 31 ag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................ACGATGACTGGAGATTTAATCAAGACC.................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCcata......................................................................... 28 cata 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgtta.......................................................................................................... 29 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................ATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgtaa.......................................................................................................... 30 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTGCAGGATTCACGATGA...................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGA............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGGAta................................................................................................................. 28 ta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ATGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTa............... 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CAGTCAGTGCTCTTAACCACaaaa....................................................................................... 24 aaaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GCAGGATTCACGATGACTGGAGATT............................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgca........................................................................................................... 27 gca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGAA........................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGATTCACGATGACTGGAGATTT............................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATATGGTTGATGGAAAT...................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGt......................................................................................................................................... 30 t 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGAC.......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TCTCATTACAGATGGTata............................................................................................................................................................... 19 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCAAGACCTTGTACGCACTGGGCA.. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TATGGTTGATGGAAATTGAACTCA.............................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGACCT................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAGTCACCATATGGTTGATGGAAAT...................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCTTTTGCAGGATTCACGATGACTGG.................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGcgtc............................................................................................................. 25 cgtc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TACAGATGGTTGTGAGTCAaaaa..................................................................................................................................................... 23 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TTCAGACACCCCAGAAGAGTt......................................................................................................................................................................................... 21 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGATTCACGATGACTGGAGAct............................. 27 ct 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGGTTTCTTTTGCAGGATTCACGAT........................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TAATCAAGACCTTGTACGCACTGGGCAT. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTgta........................................................................................................ 29 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACtgta............... 26 tgta 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGATTCACGATGA...................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTTGCAGGATTCACGATGACTGGAGAT.............................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................ATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGG............................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgcaa.......................................................................................................... 28 gcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGgct...................................................................................................................................................................................................... 31 gct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCAAGACCTTGTACGCAC........ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGgaaa........................................................................................................ 30 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGACC.................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TTTAATCAAGACCTTGTACGCAC........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................TGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGAagt..................................................................................................................................................................................................... 28 agt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................CACCATATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGG............................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCCATGGTTTCTTTTGCAGGATTCACG.......................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGGAAATTGAACTCAGGACCTCTccct.................................................................................................................. 27 ccct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................ATATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGAC.......................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGA......................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TCTCATTACAGATGGTTGTGtgtg.......................................................................................................................................................... 24 tgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................ATTACAGATGGTTGTGAGTtgta....................................................................................................................................................... 23 tgta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGtt............................................................................................................... 30 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CACGATGACTGGAGATTTAATCAAGACC.................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCATTACAGATGGTTGTcaga........................................................................................................................................................... 21 caga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggtg.......................................................................................................... 28 ggtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGcgct.......................................................................................................................................................... 29 cgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCCATGGTTTCTTTTGCAGGATTCAC........................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TATGGTTGATGGAAATTGAACT................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGGTTTCTTTTGCAGGATTCACGATG....................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGA............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTac.............. 27 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GTTGATGGAAATTGAACTCggga........................................................................................................................... 23 ggga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggct.......................................................................................................... 29 ggct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGaa............. 27 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CGATGACTGGAGATTTAATCAAGACCTT................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGATTCACGATGACTGGAGctt............................. 27 ctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGACTGGAGATTTAATCAAGACCT................. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGA........................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TACAGATGGTTGTGAGTCACCATATatt................................................................................................................................................ 28 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCAGATCTCATTACAGATGGTaga............................................................................................................................................................... 24 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................ACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCcta.................................................................................................. 26 cta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCgaga.......................................................................................................... 28 gaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTTCTTTTGCAGGATTCACGATGACT.................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCACGATGACTGGAGATTTAATCAA...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGcaa.............................................................................................................. 25 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCggta.......................................................................................................... 29 ggta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................TATATGAGTACACTGTAGCgga............................................................................................................................................................................................................... 22 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................ATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGAT............................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGG.................................................................................................................... 28 9 0.89 0.89 - 0.11 - - - 0.22 - - 0.22 - - - - 0.11 - - - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................CCCAGAAGAGTGCATCAGATCTCATTACAG....................................................................................................................................................................... 30 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 -
......................................................................................................TGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGAC.......................................................................................................................... 26 9 0.44 0.44 0.11 0.22 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GTTGATGGAAATTGAACTCAGG............................................................................................................................ 22 12 0.42 0.42 0.08 0.25 - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTG..................................................................................................................... 27 12 0.42 0.42 - 0.17 - - - - 0.08 0.08 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AGACACCCCAGAAGAGTGCATC..................................................................................................................................................................................... 22 8 0.38 0.38 0.12 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TATGGTTGATGGAAAT...................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGGA................................................................................................................... 29 9 0.33 0.33 - 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGA........................................................................................................................... 25 10 0.30 0.30 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10
.....................................................CCCAGAAGAGTGCATCAGATCTCATTACA........................................................................................................................................................................ 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GTTGATGGAAATTGAACTCAGGACCTC....................................................................................................................... 27 8 0.25 0.25 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AGACACCCCAGAAGAGTGCATCAGATCTC.............................................................................................................................................................................. 29 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGACC......................................................................................................................... 27 9 0.22 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CACCCCAGAAGAGTGCATCAGATCTCAT............................................................................................................................................................................ 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CACCCCAGAAGAGTGCATCAGATCTCATTA.......................................................................................................................................................................... 30 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GTTGATGGAAATTGAACTCAGGACCT........................................................................................................................ 26 10 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AGACACCCCAGAAGAGTGCATCAGATC................................................................................................................................................................................ 27 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CACCCCAGAAGAGTGCATCAGA.................................................................................................................................................................................. 22 10 0.20 0.20 - 0.10 - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAGTGCA....................................................................................................................................................................................... 30 5 0.20 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................CCCAGAAGAGTGCATCAGATCT............................................................................................................................................................................... 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCT...................................................................................................................... 26 12 0.17 0.17 - - - - - 0.08 - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCAGACACCCCAGAAGAGTGC........................................................................................................................................................................................ 21 13 0.15 0.15 - - - - - - - - 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AGACACCCCAGAAGAGTGCATCAG................................................................................................................................................................................... 24 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTTCAGACACCCCAGAAGAGTGCATCAGA.................................................................................................................................................................................. 29 7 0.14 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCATTACAGATGGTTGTGAGTCACCATA.................................................................................................................................................... 28 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TCATTACAGATGGTTGTGAGTCACCATAT................................................................................................................................................... 29 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAGTG......................................................................................................................................................................................... 28 7 0.14 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TTCAGACACCCCAGAAGAGTGCATCA.................................................................................................................................................................................... 26 8 0.12 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GTTGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCT...................................................................................................................... 28 8 0.12 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGA................................................................................................................ 31 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - -
...............................................AGACACCCCAGAAGAGTGCATCA.................................................................................................................................................................................... 23 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCT...................................................................................................................... 27 9 0.11 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TCTTCAGACACCCCAGAAGAGTGCA....................................................................................................................................................................................... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGG.................................................................................................................... 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GTTGATGGAAATTGAACTCAGGACC......................................................................................................................... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCAGACACCCCAGAAGAGTGCAT...................................................................................................................................................................................... 23 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCAGACACCCCAGAAGAGTGCA....................................................................................................................................................................................... 22 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAGTGC........................................................................................................................................................................................ 27 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................ATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGA................................................................................................................ 30 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGt.................................................................................................................... 28 t 0.08 0.42 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AGACACCCCAGAAGAGTGC........................................................................................................................................................................................ 19 13 0.08 0.08 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTGATGGAAATTGAACTCAGG............................................................................................................................ 21 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCAGACACCCCAGAAGAGTG......................................................................................................................................................................................... 20 15 0.07 0.07 - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATGGAAATTGAACTCAGGACC......................................................................................................................... 23 15 0.07 0.07 - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGATGGAAATTGAACTCAGGACCT........................................................................................................................ 24 15 0.07 0.07 - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CACCCCAGAAGAGTGCA....................................................................................................................................................................................... 17 15 0.07 0.07 - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGTTGATGGAAATTGAACTCAG............................................................................................................................. 23 19 0.05 0.05 - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTAACATTTATTTATTTAGTGTATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAGTGCATCAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGTCACCATATGGTTGATGGAAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCAACTCCATGGTTTCTTTTGCAGGATTCACGATGACTGGAGATTTAATCAAGACCTTGTACGCACTGGGCATG
......................................................................................................(((..(((((........(((((......((((((((((.....)))))))..)))))))))))))...)))............................................................................
..............................................................................................95....................................................................................181...................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
......................................................................................................................CTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGaa...................................................................................................... 30 aa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TAGCTGTCTTCAGACACCCCAgaga................................................................................................................................................................................................. 25 gaga 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AGCCATCTCTCCAGCCCaaaa........................................................................ 21 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GTACACTGTAGCTGTCTTCAGACActaa...................................................................................................................................................................................................... 28 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATCAGATCTCATTACccta......................................................................................................................................................................... 19 ccta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGCATCAGATCTCATTACAaat........................................................................................................................................................................ 22 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCTTCAGACACCCCAGAtt............................................................................................................................................................................................... 19 tt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TATATGAGTACACTGTAGCTGTCTgttt............................................................................................................................................................................................................. 28 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAat.............................................................................................................................................................................................. 26 at 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACgaaa........................................................................................... 27 gaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GGAAATTGAACTCAGtaga............................................................................................................................. 19 taga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAcgg......................................................................................................... 27 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................GGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCatt................................................................................................... 30 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................CACTGTAGCTGTCTTCAGACACCCCAcg................................................................................................................................................................................................. 28 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAcacc.................................................................................................................. 24 cacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCtttt.......................................................................... 29 tttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGAtg........................................................................................................................................................................................................ 30 tg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAaaaa.............................................................................................................................................................................................. 28 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AGAAGAGTGCATCAGATCTCATTACaa......................................................................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCAAttaa...................................................................... 32 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AGTGCATCAGATCTCATTACAgaa........................................................................................................................................................................ 24 gaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GTAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAtttt............................................................................................................................................................................................ 31 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAaaat.............................................................................................................................................................................................. 28 aaat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AGTGCATCAGATCTCATTACAGAttca...................................................................................................................................................................... 27 ttca 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAaaat......................................................................................................... 29 aaat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................AGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGttt...................................................................................................... 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AGAGTGCATCAGATCTCATTACAgc........................................................................................................................................................................ 25 gc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAatc............................................................................................................................................................................................ 26 atc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CTGTCTTCAGACACCCCAGAatt............................................................................................................................................................................................... 23 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGatt............................................................................................................ 27 att 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAtgt.............................................................................................................................................................................................. 26 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCAat....................................................................... 30 at 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAcaaa................................................................................................ 30 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGAACTCAGGACCTCTGGAAttta.................................................................................................................. 24 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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