chr12:70259698 70260033 -
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(48)
TESTES

Sense strand
CAGCTCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCTTGGTGAGGAGCGGGTTGTGGAGACCGCGGTTAGAGGGAAGGGCCATTGTTGGTGACTGGGTGTCGGAAATTCAAGGCCCGCGGGCGGCGCGCAGGGCGTTCGGTGCTGCCGTCGCCATTACGGGCTTAGCTAGGCCGGGCCGGGCGGGCCCTGCTGCGGGTGGTGGGGAAGCTGAGGAGTGCTGTACCTTACTGTGGCGGCTCCATTAAGGCCATCTCCTTGTCCTTCCTCCTCCCAGCCGCGTCTGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 8 92.38 92.38 35.88 31.00 12.00 1.62 3.00 3.75 0.12 0.75 0.50 0.75 - 0.25 - - - - 0.38 0.25 - - 0.25 - 0.12 0.12 0.25 0.12 0.25 - 0.12 0.12 - 0.12 - 0.12 - - - - 0.12 - - - - 0.25 0.12 - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 8 42.00 42.00 12.25 10.88 10.88 - 3.75 3.12 - 0.25 0.25 - - - - - - - 0.12 - - - - - 0.12 - 0.12 0.12 - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 8 24.12 24.12 6.50 5.50 1.50 0.25 0.25 0.88 0.38 0.50 0.50 1.75 0.38 - 0.25 0.38 0.38 0.38 0.62 0.25 - 0.62 0.12 - 0.12 0.38 0.25 0.12 0.25 - 0.12 0.38 0.12 0.12 - 0.12 - 0.12 - - 0.38 - - 0.12 - - - - 0.12 - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 8 19.12 19.12 5.88 5.50 2.50 - 1.25 0.88 - 0.62 0.25 0.50 - 0.12 - - - 0.25 0.50 - 0.12 - - - - - 0.25 0.12 - - 0.12 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCA............... 28 3 9.00 9.00 0.67 0.67 0.33 2.33 - 0.33 0.67 0.67 - - 1.00 - 0.33 - 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - 0.33 - - 0.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 t 8.62 92.38 2.00 5.50 0.38 - 0.25 0.38 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAAT............ 28 2 8.00 8.00 0.50 0.50 - - - - 4.00 - - - - - 2.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACA 26 3 7.67 7.67 3.00 2.67 1.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 9 6.67 6.67 1.89 2.33 0.78 0.78 - 0.22 - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - 0.22 - - - - - - 0.11 - - - - - 0.11 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAA............. 27 2 6.00 6.00 0.50 0.50 - 1.50 - - 1.50 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAA.............. 29 3 6.00 6.00 0.67 0.33 0.33 3.00 - - - 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGC................ 27 3 6.00 6.00 0.33 1.00 - 1.00 0.33 - 1.00 - - - 0.33 - 0.33 - - - 0.33 0.67 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 8 5.88 5.88 2.00 1.88 1.25 - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 8 5.12 5.12 1.38 1.38 1.38 0.38 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 8 4.88 4.88 1.12 1.88 0.25 0.38 0.25 0.12 - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 8 4.88 4.88 1.50 1.38 0.12 0.50 - 0.12 - 0.12 0.12 - - - - - - - 0.12 - - - - - 0.12 - 0.38 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - -
.....................................................AGGAGCGGGTTGTGGAGA......................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACAtt 28 tt 3.33 7.67 1.33 0.67 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGTCTGATCCGCAAATACGGGC...... 23 3 3.33 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - 2.33 - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 3.12 24.12 1.50 0.88 0.12 - 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CTGCTGCGGGTGGTGGGGAAGCTGAG................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGC...... 29 3 2.67 2.67 0.33 1.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAATAC.......... 30 2 2.00 2.00 - 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCACGGAAGTTCGGCCtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGAGCGGGTTGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAAaatg 28 aatg 2.00 0.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GCGGTTAGAGGGAAGGGC..................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAAT............ 31 2 2.00 2.00 - - 0.50 - - - - 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGGCTGAACAtgtt 28 tgtt 2.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CGGGTGGTGGGGAAGCTG.................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAATA........... 29 2 2.00 2.00 - 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGGAGCGGGTTGTGGAGAC........................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAA.............. 26 3 1.67 1.67 - - 0.67 - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAA............. 30 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 9 1.44 1.44 0.33 0.11 0.22 0.33 - - - - - - - - - - 0.11 - 0.11 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 9 1.33 1.33 0.11 0.22 0.44 0.22 0.22 - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.33 1.44 0.22 0.67 0.11 - - 0.22 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.25 19.12 0.50 0.12 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 10 1.20 1.20 0.10 - - - - 0.10 0.10 - - - 0.10 - - - 0.10 - 0.10 0.40 - - 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.12 4.88 0.38 0.25 - 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................GAGTGCTGTACCTTACTG.............................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGGGa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGTGGGGAAGCTGAGGAGTGCTGTAC..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CGCGGGCGGCGCGCAGGGCGTTCG.......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GAAATTCAAGGCCCtagc............................................................................................................................................................................................................. 18 tagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCcaat............ 28 caat 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCTTGGTGAGGAGCGGGTTGTGGAGACCGC..................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGa....... 29 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGGTCTGATCCGCAAATACGG........ 22 4 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAca............. 27 ca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGTTGGTGACTGGGTGTCGGAAATTC........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGGGGAAGCTGAGGAGTGCTGTACC.................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATACGGGCTGAACttt 16 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCtcaa.............. 26 tcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 8 1.00 1.00 0.12 0.25 0.12 0.12 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCcaa............. 27 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCtctc................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 tctc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTaggc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 aggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAta............. 27 ta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTTGTCCTTCCTCCcagt.................................................... 22 cagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCTCCTTGTCCTTCCTCCcat..................................................... 24 cat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCTTt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGGCTGAACAtgtc 28 tgtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAcc............. 28 cc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CGGGTGGTGGGGAAGCTGAGG............................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............AGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGtt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCcg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCt................. 26 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAACCGCCACGGTCTGATCCGt................ 23 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................TGTACCTTACTGTGGCGGCTCCcttt................................................................................ 26 cttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATCCGCAAATACGGGCTGAAaatg 25 aatg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CGGGTGGTGGGGAAGCTGAGGAGTG........................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GTGTCGGAAATTCAAGGC................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGt........ 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GGGAAGGGCCATTGTTGGTGACTGGGTGTCGG.............................................................................................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGTCTGCTCCAACCGCCACGGTCTt...................... 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 8 0.88 0.88 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 9 0.78 0.78 0.33 0.11 - - - - - 0.11 - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGC...... 20 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 0.75 4.88 - 0.12 - - 0.25 0.25 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGGCTGA... 21 4 0.75 0.75 - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAAC. 25 4 0.75 0.75 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 8 0.75 0.75 0.38 - 0.12 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTCTGATCCGCAAATACGGG....... 21 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 9 0.67 0.67 - - - - - - - - 0.11 - - - - - 0.33 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCG................. 26 3 0.67 0.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTCTGATCCGCAAATACGGGCTGA... 25 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACAtgc 29 tgc 0.67 7.67 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACAtgtt 30 tgtt 0.67 7.67 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGT......................... 18 3 0.67 0.67 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 a 0.62 24.12 0.50 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 8 0.62 0.62 0.38 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGtt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 0.62 4.88 0.38 - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAAT............ 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCAAATACGGGCTGA... 18 4 0.50 0.50 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAAT............ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tt 0.50 24.12 - 0.38 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCGCCACGGTCTGATCCGCAAAT............ 25 4 0.50 0.50 - - - - - - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAATAC.......... 33 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 t 0.44 6.67 0.11 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 9 0.44 0.44 0.22 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 8 0.38 0.38 - - - - - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 8 0.38 0.38 0.25 - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 8 0.38 0.38 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 0.38 4.88 0.12 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 t 0.38 42.00 - - 0.25 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 tt 0.33 1.44 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCAAATACGGGCTGAACA 19 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCC.................. 27 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCTGAA.. 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACAtaa 29 taa 0.33 7.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGC...... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATC................... 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 9 0.33 0.33 - - - 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGTCTGCTCCAACCGCCACGGTCTG...................... 27 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAACCGCCACGGTCTG...................... 17 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCT..... 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCTGAAC. 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATACGGGCTGAACA 15 6 0.33 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTCTGATCCGCAAATACGGGCTGAA.. 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGC...... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCTG.... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCT..... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCTGA... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCca.............. 29 ca 0.33 6.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCCAACCGCCACGGTCTGAT.................... 23 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACAttt 29 ttt 0.33 7.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGC...... 28 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTCTGCTCCAACCGCCACGGTCTG...................... 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCTt.... 28 t 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGC................ 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCA............... 29 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 9 0.33 0.33 - 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 10 0.30 0.30 - - 0.20 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGtc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tc 0.25 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACgt 27 gt 0.25 0.75 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGG........ 27 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCGGCCAGGGTTCCCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 8 0.25 0.25 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGt....... 28 t 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGccc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ccc 0.25 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 8 0.25 0.25 - 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGAcgg 26 cgg 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGG....... 27 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCGCAAATACGGGCTGA... 19 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCAAATACGGGCTGAAC. 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGG....... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGGCT..... 19 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAAATACGGGCTGAAC. 17 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGG........ 26 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGGC...... 18 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACGGGCTGA... 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGGCTG.... 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCGTCTGCTCCAACCGC............................... 19 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGGCTGAAC. 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 a 0.22 0.33 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGtt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 0.22 0.44 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 9 0.22 0.22 - - - - 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 0.22 6.67 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 t 0.22 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.22 0.33 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATCCGCAAATACG......... 17 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCACGGTCTGATCCGCA............... 18 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 10 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATCCGCAAATACGGG....... 17 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATACGGGCTGAACAtgtt 19 tgtt 0.17 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATACGGGCTGAACAttt 18 ttt 0.17 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAATACGGGCTGAAC. 16 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 0.12 0.88 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 at 0.12 24.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 a 0.12 19.12 - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGtt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 tt 0.12 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGgc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 gc 0.12 4.88 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGttt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ttt 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 0.12 4.88 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 8 0.12 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tt 0.12 1.00 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AAGTTCGGCCAGGGTTCCCGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CCCACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 8 0.12 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGtct............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tct 0.12 4.88 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGtc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 tc 0.12 4.88 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 8 0.12 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 t 0.12 1.00 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGtcca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 tcca 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 t 0.12 0.12 - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 aa 0.12 24.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 g 0.12 19.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCTTG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 -
.....CTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 8 0.12 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGacc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 acc 0.12 1.00 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGgc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 gc 0.12 4.88 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 8 0.12 0.12 - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................ACCCACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 t 0.12 5.88 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGtcc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tcc 0.12 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 aa 0.11 0.67 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 0.11 0.44 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 c 0.11 0.44 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCttt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 ttt 0.11 0.67 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 at 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGtc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 tc 0.11 0.33 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAttt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ttt 0.11 6.67 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 0.11 0.78 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGGGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - -
..........GGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGtt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 tt 0.11 0.33 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGgct............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 gct 0.11 0.33 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTtggc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tggc 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGCTCTACTGGAGTCACCCACGGAAGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGCTCTACTGGAGTCACCCACGGAAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGCTCTACTGGAGTCACCCACGGAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - -
.AGCTCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 10 0.10 0.10 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TACTGGAGTCACCCACGGAAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 10 0.10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 0.10 1.20 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTCTACTGGAGTCACCCACGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAGTTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTtggg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 tggg 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTACTGGAGTCACCCACGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGAGTCACCCACGGAAGTTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGGAAGTTCGGCCAGGGTTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 11 0.09 0.09 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAGCTCTACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCTTGGTGAGGAGCGGGTTGTGGAGACCGCGGTTAGAGGGAAGGGCCATTGTTGGTGACTGGGTGTCGGAAATTCAAGGCCCGCGGGCGGCGCGCAGGGCGTTCGGTGCTGCCGTCGCCATTACGGGCTTAGCTAGGCCGGGCCGGGCGGGCCCTGCTGCGGGTGGTGGGGAAGCTGAGGAGTGCTGTACCTTACTGTGGCGGCTCCATTAAGGCCATCTCCTTGTCCTTCCTCCTCCCAGCCGCGTCTGCTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAAATACGGGCTGAACA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
.....................................................................................................................................................................................GCCGGGCCGGGCGGGCCC......................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGTCCTTCCTCCTCCCAGC................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GCAGGGCGTTCGGTGCTGC................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CGTCGCCATTACGGGCTTAGCT............................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TTCGGTGCTGCCGgga................................................................................................................................................................................. 16 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTTGTCCTTCCTCCTC...................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................CATTAAGGCCATCTCCTTGTCCTTCCT.......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AGCTAGGCCGGGCcag.................................................................................................................................................... 16 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCAACCGCCACGGTCTGATCCGCAA.............. 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAACCGCCACGGTCTGATCCGCA............... 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTGGAGTCACCCACGGAAGTTCGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GAAGTTCGGCCAGGGTTCCCGCTCTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACGGTCTGATCCGCAA.............. 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -