(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(47)
TESTES

Sense strand
AATTTGTAAATACCGTACCTACCAAAGGATTTAACACTGAGAAAATTAAGGTAACCTTGGGCAATTCCAAAACAGTCACTTTTCACTTCTGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGTCATACACCCGATGCACAGATGGTATTGTGTTTGTGGTGGACTCTGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAACTTCATAAAATAACTAGGATATCCGAAAATCAGGGAGT
...................................................................................................((((((............))))))..(((...((...(((((((.((((((......))))))))).))))...(((.(((....))).)))......))..)))..............................................
...................................................................................................100............................................................................................................210......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
.........................................................................................................................................................GTATTGTGTTTGTGGTGGACTCTGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCAA............................................. 52 1 54.00 54.00 54.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAG....................................................................................................................... 27 1 11.00 11.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAA........................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 - 3.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGT........................................................................................................................................ 25 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAAGACCACTGTGGAAGTCATACACCC............................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAACTT................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - -
.....................................TGAGAAAATTAAGGTAACCTTGGGCAA.......................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGA....................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CCAAAACTGAACTTCATAAAATAACTAGGAT.................. 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGTC..................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGAAAATTAAGGTAACCTTGGGCAATT........................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TCACTTCTGGGATGTAGGTGGTCAA............................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTCTGGGATGTAGGTGGTCAAGAGA........................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCC............................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAAC..................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGT...................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGGACTCTGTCGATGTTGAGAG............................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCAAA............................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CAAAACTGAACTTCATAAAATAACTAGGATA................. 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAAC.......................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAAATTAAGGTAACCTTGGGCAA.......................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGTGTTTGTGGTGGACTCTGTCGAa.................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAAGACCACTGTGGAAGTCATACACC.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................AACAGTCACTTTTCACTTCTGGGATG.......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TTCACTTCTGGGATGTAGGTGGTCAAGAGA........................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGT...................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGtt...................................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AACTAGGATATCCGAAAATC....... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGAAGTCATACACCCGATGCACAGATG................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GTGGTGGACTCTGTCGATGTTGAGAGA........................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........................................................................................................................CACTGTGGAAGTCATACACCCGATGC........................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TAAGACCACTGTGGAAGTCATACAC............................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAG....................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CTGGGATGTAGGTGGTCt................................................................................................................................................ 18 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................................TGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGTTAAGt................................................................................................................................... 30 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAAg..................................... 29 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GATGCACAGATGGTATTGTGTTTGTGGTGGA.............................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................AGACCACTGTGGAAGTCATACACCCGA........................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCACTTTTCACTTCTGGGATGTAGGTGGTC................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CTGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAA.......................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................TAACACTGAGAAAATTAAGGTAACCTTGG.............................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCTGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGT........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................................................TCTGGGATGTAGGTGGTCAAG.............................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGCACAGATGGTATTGTGTTTGTGGTGGAC............................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TTAAGACCACTGTGGAAGTCATACA................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGGTATTGTGTTTGTGGTGGACTCTGTCGAT.................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AAGACCACTGTGGAAGTCATACACCCG............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CAAAACTGAACTTCATAAAATAACTAG..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.........................................................................................TGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGTT....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TTGTGTTTGTGGTGGACTCTGTCGATGTT................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................CAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAa....................................................................................................................... 27 a 1.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCACTGTGGAAGTCATACACCC............................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCA.............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AAGACCACTGTGGAAGTCATACACCCGAT.......................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCA.............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ACTCTGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGC................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTTAACACTGAGAAAATTAAGGTAACCTT................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AAGACCACTGTGGAAGTCATACACCCc............................................................................................................ 27 c 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AAGACCACTGTGGAAGTCATACACCCGA........................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................ACTGAGAAAATTAAGGTAACCTTGGGCAATTC....................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TGTGGTGGACTCTGTCGATGTTGAGAGAAT......................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAACTTC.................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCAtt............................................ 31 tt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TACCAAAGGATTTAACACTGAGAAAATTAAGt....................................................................................................................................................................................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCTGGGATGTAGGTGGTC................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGTTAAG.................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAACT.................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GGACTCTGTCGATGTTGAGAGAATGG....................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCAA............................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AGATGGTATTGTGTTTGTGGTGGACa............................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................CTCTGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGC................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAAC.......................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGTCATA.................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AAGGATTTAACACTGAGAAAATTAAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAA........................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AAACAGTCACTTTTCACTTCTGGGATG.......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
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..............................................................................................................................................................................................................................TAACTAGGATATCCGAAAATCAGGGAGT 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAG................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAACT.................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................ACTGTGGAAGTCATACACCCGATGCAC...................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTCTGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGTT....................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGCACAGATGGTATTGTGTTTGTGGTG................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................ACTTCTGGGATGTAGtgc.................................................................................................................................................... 18 tgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................AGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGTC..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
........................................................................................................CAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGTCA.................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGAAGTCATACACCCGATGCACAGATGGT............................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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....................................................................................................................................................AGATGGTATTGTGTTTGTGGTGGACTCTGT........................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GACTCTGTCGATGTTGAGAGAATGG....................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCC............................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ATGTAGGTGGTCAAGAGAAGTT....................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAAGGATTTAACACTGAGA................................................................................................................................................................................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGATTTAACACTGAGAA............................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GTTTGTGGTGGACTC........................................................................... 15 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AATTTGTAAATACCGTACCTACCAAAGGATTTAACACTGAGAAAATTAAGGTAACCTTGGGCAATTCCAAAACAGTCACTTTTCACTTCTGGGATGTAGGTGGTCAAGAGAAGTTAAGACCACTGTGGAAGTCATACACCCGATGCACAGATGGTATTGTGTTTGTGGTGGACTCTGTCGATGTTGAGAGAATGGAAGAAGCCAAAACTGAACTTCATAAAATAACTAGGATATCCGAAAATCAGGGAGT
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...................................................................................................100............................................................................................................210......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509279(GSM509279)
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mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
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SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
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cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
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Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
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16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
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GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................................................................................................................ATAAAATAACTAGGAagaa................... 19 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GTGGACTCTGTCGtga...................................................................... 16 tga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -