chr12:21422943 21423414 -
(9)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(5)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(44)
TESTES

Sense strand
AAAGCAGATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGCTGCAACAGCCGCCGCGAGGTACCGAGGCCGGGTTGGCGGAGCACGGTCCTCATATCTGCTAGGCTACCGCGCGCCTGAGGTTCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCGGCACCAACGGCCGCTTCCATCTTGGGCCGGGTGGGGCCCGCGCTCCGGCCTTGGGGAGGCGCGGCGGGCGGGCCGGAGGGCGCGGGCGGAAGGCGGCGGCCCCGTGAGAGGCCGGAGGACGCGCCGCCTCGTGCGCTGAGACAAAGCGGGCGTCCGGCTGCATTGTCTGACGCGCTCTCTCCTCGCTCCTTTTTGTCCTCGCCGGCGCCGCCCCGCCCCGCCCCTCGCGGCTCTCAGGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCTCGCCCTCGCTCGCCATGGAGAAGA
..................................................(((((((.((((...((((((...(((((((.((....)).))))).))...(((....))).....))))))...)))).))).)).))............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51.........................................................................................142........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
...................................................TGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 14.00 14.00 - 2.00 - 1.00 - 3.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 11.00 11.00 - - - - - - - - - - - 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 10.00 10.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 10.00 10.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - - - - - 6.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 7.00 7.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGC......................... 27 4 6.50 6.50 - 0.25 - - - 1.00 0.25 - 1.25 - - - 2.00 - - - - - - 0.75 0.25 - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - -
..AGCAGATCAAAGTGGTGGGACTCGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCAAAGTGGTGGGACTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - - - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CGGAGACTAGAAGGTGAGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 6.00 6.00 - - 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 2 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGCGGCTGCGGAGACTAGAAGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 2 4.50 4.50 3.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTAGAAGGTGAGTGCGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................................TGCGGAGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 4.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CGGACACAGCTCTGGGACTGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GAGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 2 3.50 3.50 - - - - - - - - - 1.50 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCAAAGTGGTGGGACTCG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CGGACACAGCTCTGGGACTGCGGCT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AGACTAGAAGGTGAGTGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTAGAAGGTGAGTGCGGACA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GCTTCCATCTTGGGCCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGC......................... 26 4 3.00 3.00 - 0.25 - - - 0.25 - - 0.50 - - - 1.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 2 2.50 2.50 - - - 1.00 - - - - - 0.50 - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CAGCTCTGGGACTGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 17 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGCGGAGACTAGAAGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGGACA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...................................................TGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTtc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tc 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCAAAGTGGTGGGACTCG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 34 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................GAGACTAGAAGGTGAGTGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GACTAGAAGGTGAGTGCGGACACAGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAAGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACAGCTCTGGGACTGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCGGAGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGTGCGGACACAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCTGACGCGCTCTCTCC......................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGTTCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 1.50 1.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 1.50 1.50 - 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 1.50 1.50 - - 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CGGAGACTAGAAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 2 1.50 1.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAAGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 2 1.50 1.50 - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGC........................... 24 4 1.50 1.50 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 2 1.50 1.50 - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCGGCTGCGGAGACTAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 2 1.50 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCTC....................... 28 3 1.33 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CAGATCAAAGTGGTGGGACTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGCGGAGACTAGAAGGTGAttg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CAGCTCTGGGACTGCGGCTGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACAGCTCTGGGACTGCGGCTGCAAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GCCGGGTTGGCGGAGCACGGTCCTCATAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTGGGACTCGCGTCGCGGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGgga............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 gga 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GAGACTAGAAGGTGAGTGCGGACACAGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGTTCGGGCTGGGACGGGAAGGTGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGGCGTCCGGCTGCATTGTCTGACGCGaaa.............................................................................................................. 31 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GCTCTGGGACTGCGGCTG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGCGGAGACTAGAAGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGCT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAAAGCGGGCGTCCGGCTGCATTG.......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGGAGGACTCCGGATCCGGCTC.............................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................ACACAGCTCTGGGACTGCGGCTGCAAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TTCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCGGCACC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGGGCGTCCGGCTGCATTGTCTGA..................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACAGCTCTGGGACTGCGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGCCCCTCGCGGCTCTCAGa................................................. 22 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAAGTGGTGGGACTCGCGTCG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGAGGACTCCGGATCCGGCTCGG............................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGTGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCGGCTGCGGAGACTAGAAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCCCCGCCCCGCCtgga............................................................. 20 tgga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGTTCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCGa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 ta 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GAGGCCGGGTTGGCGGAGCACGGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCTGACGCGCTCTCTCCTCG...................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GCGGACACAGCTCTGGGACTGCG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGAGGACTCCGGATCCGGCTC.............................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGCGTCCGGCTGCATTGTCTGA..................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGAGGTTCGGGCTGGGACGGGAAGata................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGAAGGTGAGTGCGGACACAGCTCTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.AAGCAGATCAAAGTGGTG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGCGGACACAGCTCTGGGACTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GCGGACACAGCTCTGGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGtt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............GTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTGCATTGTCTGACGCGCTCTCTCCT........................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GCAGATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 36 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGATCCGGCTCGaagg......................... 16 aagg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GACACAGCTCTGGGACTGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGCGGAGCACGGTCCTCATATCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGGACA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGGGACGGGAAGGTGCGGCACCAACGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCGCGGGCGGAAaa.................................................................................................................................................................................................. 17 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGCGGAGACTAGAAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCGGAGACTAGAAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGCAGATCAAAGTGGTGGGACTCG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTAGAAGGTGAGTGCGGACACAGCTCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AGATCAAAGTGGTGGGACTCGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACTAGAAGGTGAGTGCGGAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGCGGACACAGCTCTGGGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GAGGTTCGGGCTGGGACGGGA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGAGGTTCGGGCTGGGACGGGA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGgct........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGAGGCCGGAGGACGCGCCGCC............................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCGGCTGCATTGTCTG...................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GACTAGAAGGTGAGTGCGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAAAGCGGGCGTCCGGCTGt.............................................................................................................................. 21 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGGACTGCGGCTGCAACAGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCCCGTGAGAGGCCGGA........................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCATTGTCTGACGCGCT............................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CGGGCTGGGACGGGAAGGTGCGGCAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................ATCTGCTAGGCTACCGCGCGCCTGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CAGCTCTGGGACTGCGGCT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCAGGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCG.......................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................GGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGgggg........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCAAAGTGGTGGGACTCGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCTCGgc.................... 31 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGCT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GACTAGAAGGTGAGTGCGGACACAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGTGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CTGCGGAGACTAGAAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AAGCAGATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGC......................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGGACAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGAatgc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 atgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GTCGCGGCTGCGGAGACa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGATCCGGCTCGaagg......................... 17 aagg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTCGCTCCTTTTTGTCCTCGCC.................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 gc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................TGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCGGCTGCGGAGACTAGAA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTAGAAGGTGAGTGCGGACACAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGGAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GCGGACACAGCTCTGGGACTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCGCCCCTCGCGGCTCTCAGt................................................. 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGAAGGTGAGTGCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GCAGATCAAAGTGGTGGGACTCGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTCGGCGCTgcag.................... 16 gcag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GCTGCGGAGACTAGAAGGTGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGGGACTCGCGTCGCGGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAGAAGGTGAGTGCGGACACAGCTCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCT........................ 27 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCGCGTCGCGGCTGCGGAGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
.....................ACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCT........................ 25 4 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCGGCTGCGGAGACTAGAAGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AAGTGGTGGGACTCG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 15 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.......................TCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCGGCTGCGGAGACTAGAAGGgga.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 gga 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ACTCGCGTCGCGGCTGCGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCTC....................... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGATCCGGCTCGGCGCTCGCCCT.................. 25 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCTC....................... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCGCTCGCCATGGAGAA.. 19 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCT........................ 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCCGGATCCGGCTCGGCGCT........................ 22 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCGGATCCGGCTC.............................. 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGC......................... 25 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCG.......................... 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGACTCCGGATCCGGCTCGGC........................... 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACTCCGGATCCGGCTC.............................. 18 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGGACTCCGGATCCGGCTC.............................. 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCa........................ 28 a 0.25 6.50 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCCGGATCCGGCTCGG............................ 18 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACTAGAAGGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAAGCAGATCAAAGTGGTGGGACTCGCGTCGCGGCTGCGGAGACTAGAAGGTGAGTGCGGACACAGCTCTGGGACTGCGGCTGCAACAGCCGCCGCGAGGTACCGAGGCCGGGTTGGCGGAGCACGGTCCTCATATCTGCTAGGCTACCGCGCGCCTGAGGTTCGGGCTGGGACGGGAAGGTGCGGCACCAACGGCCGCTTCCATCTTGGGCCGGGTGGGGCCCGCGCTCCGGCCTTGGGGAGGCGCGGCGGGCGGGCCGGAGGGCGCGGGCGGAAGGCGGCGGCCCCGTGAGAGGCCGGAGGACGCGCCGCCTCGTGCGCTGAGACAAAGCGGGCGTCCGGCTGCATTGTCTGACGCGCTCTCTCCTCGCTCCTTTTTGTCCTCGCCGGCGCCGCCCCGCCCCGCCCCTCGCGGCTCTCAGGAGGACTCCGGATCCGGCTCGGCGCTCGCCCTCGCTCGCCATGGAGAAGA
..................................................(((((((.((((...((((((...(((((((.((....)).))))).))...(((....))).....))))))...)))).))).)).))............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
..................................................51.........................................................................................142........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................GCGGAGCACGGTCCTCATATCTGCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GGCGGAGCACGGTCCTCATATCTGCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTCGCTCCTTTTTGTCCTCGCC.................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCGGCTGCATTGTCTGA..................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGCCGGAGGGCGCGGGCGG...................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGAGGACGCGCCGCCTCGTGCG........................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTCCGGCTGCATTGTCT....................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCTCCTCGCTcaaa.................................................................................................... 18 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGATCCGGCTtcgg............................... 15 tcgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAAAGCGGGCGTCCGGCTGCAatc............................................................................................................................. 25 atc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCGTCCGGCTGCATTGTCT....................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCGCTCCTTTTTGTCCT........................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTTGGCGGAGCACGGTCCTCATATCTGCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGATCCGGCTtaaa............................... 15 taaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAGCGGGCGTCCGGCTGCATT........................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGACAAAGCGGGCGTCCGGCTG............................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GGCGCGGCGGGCGGG....................................................................................................................................................................................................................... 15 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -