| Gene: Dus1l | ID: uc007mur.1_intron_2_0_chr11_120651195_r.3p | SPECIES: mm9 |
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|
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(6) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(9) PIWI.ip |
(1) PIWI.mut |
(28) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
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| .................TTCCAGAGGTCTTGAGTTCAATTCata.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | ata | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TTCCAGAGGTCTTGAGTTCAATTaa................................................................................................................................................................................................................ | 25 | aa | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................TATATAATCAATCTTTGTAGAGGTG................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................................................................................................................................................................................................TATGCCAAGTGTGACCAGTGTGGAAA................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TCCCAGCAACCATGACTAATGAGATGT........................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................TATATAATCAATCTTTGTAGAGGTGG............................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............TCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAATaa................................................................................................................................................................................................................. | 26 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................TGAGTTCAATTCCCAGCAACCATta.................................................................................................................................................................................................... | 25 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................TTCCAGAGGTCTTGAGTTCAAcac................................................................................................................................................................................................................. | 24 | cac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .........GCTCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAAgtct.................................................................................................................................................................................................................... | 29 | gtct | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAATTCCCAaa.............................................................................................................................................................................................................. | 31 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CACTGGTTGCTCTTCCAGAGGTctca............................................................................................................................................................................................................................... | 26 | ctca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........TGCTCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAATcca................................................................................................................................................................................................................... | 30 | cca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........TGCTCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAAta.................................................................................................................................................................................................................... | 28 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................TCTTCTGGTATTCAGACACACATGCAA...................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CTCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAAtatt.................................................................................................................................................................................................................... | 28 | tatt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ..............................TTCAATTCCCAGCAACCATaga...................................................................................................................................................................................................... | 22 | aga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| .......................TCTTGAGTTCAATTCCCAGCAAtca.......................................................................................................................................................................................................... | 25 | tca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................GGTCTTGAGTTCAATTCCCAGCAcccg........................................................................................................................................................................................................... | 27 | cccg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TTCAATTCCCAGCAACCATaa...................................................................................................................................................................................................... | 21 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........GCTCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAggaa..................................................................................................................................................................................................................... | 28 | ggaa | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TTCCAGAGGTCTTGAGTTCAtc..................................................................................................................................................................................................................... | 22 | tc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................ATGCAAACAGAACACTGTATATATA................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |