(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(39)
TESTES

Sense strand
TCTGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTGCTCTACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCACCACTTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTGACCTACCCTGTTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGGC
.......................................................(((((...(((((..((((....((((((....((((....)))))))))).))))....))))).))))).(((.........(((((.(((((.(((..((((......))))...)))..))))).)))))..((((.....))))..))).....................................................
..................................................51..............................................................................................................................................................211.................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGGC 27 1 48.00 48.00 17.00 10.00 5.00 3.00 - - 1.00 2.00 1.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00
.......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... 27 1 18.00 18.00 - 5.00 4.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - -
............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGC............................................................................................................................................................................................... 27 1 12.00 12.00 - - 1.00 - 2.00 - 1.00 2.00 - 2.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCTAAGGGCTGGGtcgg............................................................................................................................................................................................ 17 tcgg 10.00 0.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAt................................................................................................................................................................................. 26 t 9.00 8.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGG................................................................................................................................................................................................ 26 1 9.00 9.00 - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................TCTAAGGGCTGGGtcg............................................................................................................................................................................................. 16 tcg 8.00 0.00 - - - - 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCA.................................................................................................................................................................................. 25 1 8.00 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGG. 26 1 6.00 6.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGC...................................................................................... 29 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCA.............................................................................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGT......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.......................................................GGTCTAAGGGCTGGGtcgg............................................................................................................................................................................................ 19 tcgg 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGG...................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........................................TCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGC...................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GGTCTAAGGGCTGGattt............................................................................................................................................................................................. 18 attt 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGTTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTC........... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGG.................................................................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTG................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTCA........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TTCTTCAACTACAGTGACCTt........................................... 21 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAG.............................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TACATGACCATGGAGGAAATGAAGTC........... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGG................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................CTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTG.................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGG............................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTG................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGT................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................GTCTAAGGGCTGGatt.............................................................................................................................................................................................. 16 att 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTG....... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGTC................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGC.................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GCAAGGTATCCCAAGGGGTTGCTCTAC.......................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGGtcgg............................................................................................................................................................................................ 21 tcgg 1.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCT................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................AAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTG................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCtat............................................................................................................. 26 tat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTG.................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................AAGCCTCCGTCCTCATACTCTTC............................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGt................................................................................................................................................................................... 24 t 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAtgc 27 tgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTG........................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGG..................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGG................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GAAGTGCTTCTTCAACTACAGT................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCA................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGT......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAA................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGt.................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGGTAGAACAACggat.......................................................................................... 16 ggat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGGtcg............................................................................................................................................................................................. 20 tcg 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCTTCAACTACAGTGACCTACCCTGT..................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCAC................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TCCCAAGGGGTTGCTCTACTTGAGTAC.................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTGC............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGTC........................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTGACC............................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGC.................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAG............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTT................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGC...................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.CTGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGT......................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATtagg. 26 tagg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTC........... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCAC................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GTCTAAGGGCTGGat............................................................................................................................................................................................... 15 at 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGtgtc................................................................................................................................ 29 tgtc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCG..................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GGTCTAAGGGCTGGat............................................................................................................................................................................................... 16 at 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTGA...... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCACCcc............................................................................. 30 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................................................................................................................CCATAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTG................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGT................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGG.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGG..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGA........................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGt............................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGa..................................................................................................................................................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GGTCTAAGGGCTGGatt.............................................................................................................................................................................................. 17 att 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCG..................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGTTACATGACCATGGAGGAAATGAA.............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGC............................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGC................................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGt.................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTC............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTt................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAGCT............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGG................................................................................................................................................................................................ 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGGt............................................................................................................................................................................................... 18 t 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTGCTCTACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCACCACTTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTGACCTACCCTGTTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGGC
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..................................................51..............................................................................................................................................................211.................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
.....................................................................................................GCTCTACTTGAGTACAGCCAAGACCA....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -