| Gene: Arl16 | ID: uc007msv.1_intron_0_0_chr11_120327136_r | SPECIES: mm9 | 
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| 
  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (9)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (6)  PIWI.ip  | 
  
  
  (3)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (39)  TESTES  | 
  
  
| TCTGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTGCTCTACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCACCACTTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTGACCTACCCTGTTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGGC .......................................................(((((...(((((..((((....((((((....((((....)))))))))).))))....))))).))))).(((.........(((((.(((((.(((..((((......))))...)))..))))).)))))..((((.....))))..)))..................................................... ..................................................51..............................................................................................................................................................211.................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | 
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| ...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGGC | 27 | 1 | 48.00 | 48.00 | 17.00 | 10.00 | 5.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 
| .......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 18.00 | 18.00 | - | 5.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGC............................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................TCTAAGGGCTGGGtcgg............................................................................................................................................................................................ | 17 | tcgg | 10.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAt................................................................................................................................................................................. | 26 | t | 9.00 | 8.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGG................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................TCTAAGGGCTGGGtcg............................................................................................................................................................................................. | 16 | tcg | 8.00 | 0.00 | - | - | - | - | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCA.................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 8.00 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGG. | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................TGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGC...................................................................................... | 29 | 1 | 6.00 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCA.............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..TGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGT......................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| .......................................................GGTCTAAGGGCTGGGtcgg............................................................................................................................................................................................ | 19 | tcgg | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGG...................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| ........................................TCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................AGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGC...................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................GGTCTAAGGGCTGGattt............................................................................................................................................................................................. | 18 | attt | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................TGTTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTC........... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGG.................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................TTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTG................................................ | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............TGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTCA........................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................TTCTTCAACTACAGTGACCTt........................................... | 21 | t | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................TAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAG.............................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................................TACATGACCATGGAGGAAATGAAGTC........... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| ............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGG................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................CTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................CAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTG.................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGG............................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTG................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................TTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGT................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................GTCTAAGGGCTGGatt.............................................................................................................................................................................................. | 16 | att | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................................................TGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTG....... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGTC................................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................TGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGC.................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................GCAAGGTATCCCAAGGGGTTGCTCTAC.......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGGtcgg............................................................................................................................................................................................ | 21 | tcgg | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCT................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................AAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTG................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................TAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCtat............................................................................................................. | 26 | tat | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTG.................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................AAGCCTCCGTCCTCATACTCTTC............................................................................................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGt................................................................................................................................................................................... | 24 | t | 1.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAtgc | 27 | tgc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................TGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTG........................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGG..................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGG................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................GAAGTGCTTCTTCAACTACAGT................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCA................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................TGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGT......................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAA................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGt.................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................CAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGC.................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................GGGTAGAACAACggat.......................................................................................... | 16 | ggat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGGtcg............................................................................................................................................................................................. | 20 | tcg | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................TCTTCAACTACAGTGACCTACCCTGT..................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................TGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCAC................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................TCCCAAGGGGTTGCTCTACTTGAGTAC.................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTGC............................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..TGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGTC........................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................TGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTGACC............................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................CTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGC.................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................AATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAG............................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTT................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................CAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGC...................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .CTGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGT......................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAAATGAAGTCATTGATtagg. | 26 | tagg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................................TTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTC........... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCAC................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................GTCTAAGGGCTGGat............................................................................................................................................................................................... | 15 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGtgtc................................................................................................................................ | 29 | tgtc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCG..................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................GGTCTAAGGGCTGGat............................................................................................................................................................................................... | 16 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................................................TGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTGA...... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................TGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCACCcc............................................................................. | 30 | cc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................CCATAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTG................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGT................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................TACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGG.................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................TTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGG..................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGA........................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................TAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGt............................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................TAAGGGCTGGGCAGGATGAAGa..................................................................................................................................................................................... | 22 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................GGTCTAAGGGCTGGatt.............................................................................................................................................................................................. | 17 | att | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................CAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCG..................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................TGTTACATGACCATGGAGGAAATGAA.............. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................AAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGC............................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................GTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGC................................................................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................TCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGt.................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............TGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTC............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................TGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTt................................................................................................................................................................ | 27 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................TAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAGCT............................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGG................................................................................................................................................................................................ | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................TGGGTCTAAGGGCTGGGt............................................................................................................................................................................................... | 18 | t | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| TCTGCAGAAGAACTTGAAAAAGCCTCCGTCCTCATACTCTTCAATAAAATGTATGGGTCTAAGGGCTGGGCAGGATGAAGGGCAAGGTATCCCAAGGGGTTGCTCTACTTGAGTACAGCCAAGACCATAGGGTCTGCAGCGGGGAGGTGCAGCTGTGGGTAGAACAACTTTGTGGCGAGCACCACTTTGACGAAGTGCTTCTTCAACTACAGTGACCTACCCTGTTACATGACCATGGAGGAAATGAAGTCATTGATGAGGC .......................................................(((((...(((((..((((....((((((....((((....)))))))))).))))....))))).))))).(((.........(((((.(((((.(((..((((......))))...)))..))))).)))))..((((.....))))..)))..................................................... ..................................................51..............................................................................................................................................................211.................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .....................................................................................................GCTCTACTTGAGTACAGCCAAGACCA....................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |