(1)
OTHER.ip
(10)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(4)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(34)
TESTES

Sense strand
TGACCGAGGCCCCCCTGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGCAGGTATGCTTGAGCCGGGACCTTGCCTCCCCTTGGGCGTGACGAGTCATTTTGTGTTGTGCCTCATTTCCTGACATTCAAGCGTTTCTTTGGTGTTTCTAGGGTTCTGTTCCTCTTCTCCTGGCATTTCCTCCCTGAAGCCTCCAGGTTTCTGTTTGCGTTTCTGCTTGCGTTCTGTTCTTTTTTTCTTCACACATCACATTTGTGGCATGCAGCATGCAGAGTGTGGGTGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGCTACTCACTCACTCAGGTGTTCTTTGTCTTTCCACAGATAATGTTTGAAACCTTCAATACCCCAGCCATGTACGTGGCCATTCAGGC
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((((((..(((((.((((.............)))).)))))..))))).)))))...................................................
................................................................................................................................................................................................................................................................................273............................................................336................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGa...................................................................................... 23 a 5.00 2.00 1.00 - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGat..................................................................................... 24 at 3.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGt...................................................................................... 23 t 3.00 2.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGTGTTCTTTGTCTTTCCACAG.................................................. 23 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGaa..................................................................................... 24 aa 3.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGtaa.................................................................................... 25 taa 3.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTG....................................................................................... 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGtaat................................................................................... 26 taat 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTa....................................................................................... 22 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTaaa..................................................................................... 24 aaa 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTTCTGTTCCTCTTCTCCTGGC...................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGAT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 8 1.25 1.25 - - 0.25 0.25 - 0.12 0.25 - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - 0.12 - - - - - - - -
.....................CCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGCAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTACGTGGCCATTCAGGCgggg 24 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................AAGCTAACAGAGAGAAGATGACtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTata..................................................................................... 24 ata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGtta.................................................................................... 25 tta 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGGCTCAGGGCCCCTGCga.................................................................................... 23 ga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGtag.................................................................................... 25 tag 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GATGACGCAGGTATGCTTGAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGg........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 g 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTtt...................................................................................... 23 tt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................ATTCAAGCGTTTCTTTGGTG.................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGat........................................................................................... 18 at 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACAGATAATGTTTGAAACCTTC................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTaaat.................................................................................... 25 aaat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTCTTTGTCTTTCCACAGta................................................ 22 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGCTAACAGAGAGAAGATGACGCAGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGtttt................................................................................... 26 tttt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTTCTTTGTCTTTCCACAGt................................................. 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGta..................................................................................... 24 ta 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGttt.................................................................................... 25 ttt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GTTTCTGTTTGCGTTTCTGCTTGCGTT..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACAGAGAGAAGATGACGCAGatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 att 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 8 1.00 1.00 - - 0.75 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................AACAGAGAGAAGATGACGCAGaatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 aatt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTATGCTTGAGCCGGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGACGCAGGTATGCTTGAGCCG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................GGGTTCTGTTCCTCTTCTCCTGGCATTTC................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGGAGGCTCAGGGCCCCata...................................................................................... 23 ata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTGGGCGTGACGAGTCATTTTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTATGCTTGAGCCGGGACCTTa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TTGCCTCCCCTTGGGCaccc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 accc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 8 0.88 0.88 - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - -
.............CCTGAACCCCAAAGCTAACAGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 8 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................AACAGAGAGAAGATGACGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 9 0.67 0.67 - 0.56 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 8 0.62 0.62 - - 0.12 - - - 0.38 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CTGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 8 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.12 - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CCTGAACCCCAAAGCTAACAGAGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 8 0.38 0.38 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CAAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 9 0.33 0.33 - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - -
..............CTGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - -
.............CCTGAACCCCAAAGCTAACAGAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATACCCCAGCCATGTACGTGG.......... 23 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 8 0.25 0.25 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - -
.....................CCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11
.....................CCAAAGCTAACAGAGAGAAGATG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 10 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACGTGGCCATTCAGG. 16 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGTTTGAAACCTTCAATACCCCAGCCATGT................ 32 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - -
..............CTGAACCCCAAAGCTAACAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATAATGTTTGAAACCTTCAATACCCCAGC..................... 29 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CCTGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 33 8 0.12 0.12 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CCCTGAACCCCAAAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 16 0.12 0.12 - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GGCCCCCCTGAACCCCAAAGCTAAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 -
..ACCGAGGCCCCCCTGAACCCCAAAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - -
............................TAACAGAGAGAAGATGACGCAGatat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 atat 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - -
............................TAACAGAGAGAAGATGACGCAGatca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 atca 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TAACAGAGAGAAGATGACGCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 9 0.11 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CAAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 9 0.11 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAGGCCCCCCTGAACCCCAAAGCTAAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AAGCTAACAGAGAGAAGATGACGCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGCTAACAGAGAGAAGATGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 9 0.11 0.11 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - -
..........................GCTAACAGAGAGAAGATGACG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CAGAGAGAAGATGACGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 10 0.10 0.10 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CCCAAAGCTAACAGAGAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................GAGAGAAGATGACGCAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 17 12 0.08 0.08 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAATGTTTGAAACCTTC................................ 17 13 0.08 0.08 - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGACCGAGGCCCCCCTGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGCAGGTATGCTTGAGCCGGGACCTTGCCTCCCCTTGGGCGTGACGAGTCATTTTGTGTTGTGCCTCATTTCCTGACATTCAAGCGTTTCTTTGGTGTTTCTAGGGTTCTGTTCCTCTTCTCCTGGCATTTCCTCCCTGAAGCCTCCAGGTTTCTGTTTGCGTTTCTGCTTGCGTTCTGTTCTTTTTTTCTTCACACATCACATTTGTGGCATGCAGCATGCAGAGTGTGGGTGTGGGAGGCTCAGGGCCCCTGCTACTCACTCACTCAGGTGTTCTTTGTCTTTCCACAGATAATGTTTGAAACCTTCAATACCCCAGCCATGTACGTGGCCATTCAGGC
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((((((..(((((.((((.............)))).)))))..))))).)))))...................................................
................................................................................................................................................................................................................................................................................273............................................................336................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
....................AAGCTAACAGAGAGAAacat.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 acat 4.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CAGAGAGAAGATGACagtc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 agtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........CCCTGAACCCCAAAGCTAACAGAa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GAGGCCCCCCTGAACCCCAAAGCTAa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCACAGATAATGTTTGAAACCTTCAA.............................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGCGTTTCTGCTTGCGTTCTGTTCTTT............................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCATGCAGAGTGTGG.............................................................................................................. 19 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GCCCCCCTGAACCCCAAAGCTAACAa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 a 0.38 0.00 - - - - - - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CCCCCCTGAACCCCAAAGCTAACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 8 0.38 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - 0.12 - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATACCCCAGCCATGTACGTGGCCATTCA... 28 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTTGAAACCTTCAATACCCCAGCCA................... 27 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTTGAAACCTTCAATACCCCAGCCA................... 26 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGTTTGAAACCTTCAATACCCCAGCCA................... 29 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CCTGAACCCCAAAGCTAACAGAGAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - -
..........CCCCCTGAACCCCAAAGCTAACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - -
........GCCCCCCTGAACCCCAAAGCTAACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CCCCTGAACCCCAAAGCTAACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 8 0.12 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CCTGAACCCCAAAGCTAACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - -
......................CAAAGCTAACAGAGAGAAGATGACGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 9 0.11 0.11 - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -