| Gene: Pgs1 | ID: uc007moj.1_intron_8_0_chr11_117881047_f.3p | SPECIES: mm9 |
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|
(1) OTHER.ip |
(3) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(8) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(35) TESTES |
| GAACCAGGCAGGATCGGTACCGGCCTAGTCACACTGTAGGTAGGGCTACACCTGCAGGAGCAGCGCCACAGCTGCCAGGATCCACTTGGCTGCCTTCTCTTTGGTCTTCAGGTTAAAAGTCCAGACATAGGTGGGTCCTCGGATACGCGTCTTGTATACGGGGCATTCATAGATGTTCTTGGTCTCCATTCGGTCCACAGGAATGGCCTTGATGAAGATGACGGGCATGACTGGGGTCAGATCCTTCAAC ...........................................................................................((((....(((((.(((........))).)))))...))))(((((((((.(((((.....))))).))))).)))).................................................................................. ..........................................................................................91..................................................................................175......................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................................................................................................................................TGATGAAGATGACGGGCATGACTGGG............... | 26 | 1 | 33.00 | 33.00 | 5.00 | - | 5.00 | 5.00 | 5.00 | 4.00 | - | 4.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................TGATGAAGATGACGGGCATGACTGG................ | 25 | 1 | 15.00 | 15.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGACGGGCATGACTGGGGT............. | 25 | 1 | 7.00 | 7.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TAGTCACACTGTAGGTAGGGCTACACCTG.................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................TGATGAAGATGACGGGCATGACTGGGG.............. | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TTGATGAAGATGACGGGCATGACTGG................ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TTGATGAAGATGACGGGCATGACTGGt............... | 27 | t | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................TGATGAAGATGACGGGCATGACTGGGGT............. | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................TGATGAAGATGACGGGCATGACTGGGt.............. | 27 | t | 3.00 | 33.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................CCTTGATGAAGATGACGGGCATGACT.................. | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TAGTCACACTGTAGGTAGGGCTACACCTGC................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGACGGGCATGACTGGGGTC............ | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TAGGTAGGGCTACACCTGCAGGAGC............................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TAGTCACACTGTAGGTAGGGCTACACCT..................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TCTCTTTGGTCTTCAGGTTAAAAGTCC................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................CCTAGTCACACTGTAGGTAGGGCTAC......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................TACGCGTCTTGTATACGGGGCATTCATA............................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................TAGATGTTCTTGGTCTCCATTCGGTCC...................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TAGTCACACTGTAGGTAGGGCTACACC...................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................TAGATGTTCTTGGTCTCCATTCGGTC....................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................TAAAAGTCCAGACATAGGTGGGTCCTC.............................................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................TGATGAAGATGACGGGCATGACTG................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TTGATGAAGATGACGGGCATGACTGGG............... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................CCACAGGAATGGCCTTGATGAAGATGAC............................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................CTTGATGAAGATGACGGGCATGACTG................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TTGATGAAGATGACGGGCATGACTG................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TCTTTGGTCTTCAGGTTAAAAGTCCAG.............................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................TGCCTTCTCTTTGGTCTTCAGGTTA....................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TTGATGAAGATGACGGGCATGACTGGGt.............. | 28 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGGAATGGCCTTGATGAAGATGACGGt......................... | 28 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................CCTTGATGAAGATGACGGGCATGACTtt................ | 28 | tt | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGACGGGCATGACTGGGGg............. | 25 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TACCGGCCTAGTCACACTGTAGGTAG............................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................GTCACACTGTAGGTAGGGCTACACCTGC................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TCGGATACGCGTCTTGTATACGGGGCA..................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TACCGGCCTAGTCACACTGTAGGTA................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TAGGTAGGGCTACACCTGCAGGAGCAGC.......................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TCTTTGGTCTTCAGGTTAAAAGTCCAGA............................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............CGGTACCGGCCTAGTCACACTGTAGG.................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TAGGTAGGGCTACACCTGCAGGAGCAGCG......................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TTGATGAAGATGACGGGCATGACTGt................ | 26 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TAGGGCTACACCTGCAGGAGCAGCGCCAC..................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................TCACACTGTAGGTAGGGCTACACCTGC................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................GTCCAGACATAGtaag.................................................................................................................... | 16 | taag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGGAATGGCCTTGATGAAGATGACGGGC........................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................TAAAAGTCCAGACATAGGTGGGTCCT............................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................TGATGAAGATGACGGGCATGACTGGtt.............. | 27 | tt | 1.00 | 15.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TTGTATACGGGGCATTCATAGATGT.......................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TACCGGCCTAGTCACACTGTAGGTAGG.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGGAATGGCCTTGATGAAGATGACGG.......................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGACGGGCATGACTGGGGTCAGA......... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................GGATACGCGTCTTGTATACGGGGCATT................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................AGATGACGGGCATGACTGGGGTCAG.......... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TTGTATACGGGGCATTCATAGATGTT......................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................GACATAGGTGGGTCCTCGGATACGCGTC................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TAGGGCTACACCTGCAGGAGC............................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................GACGGGCATGACTGGGGTCAGATCCTTa... | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TCGGTACCGGCCTAGTCACA......................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGACGGGCATGACTGGGGTCA........... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................TCTTGTATACGGGGCATTCATAGA............................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................GGTGGGTCCTCGGATACGCGTC................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................CGGCCTAGTCACACTGTAGGTAGGGCT........................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TCCAGACATAGGTGGGTCCTCGGATA......................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TCGGTACCGGCCTAGTCACACTGTAG................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ........................................TAGGGCTACACCTGCAGGAGCAGCGCCACAGC.................................................................................................................................................................................. | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GAACCAGGCAGGATCGGTACCGGCCTAGTCACACTGTAGGTAGGGCTACACCTGCAGGAGCAGCGCCACAGCTGCCAGGATCCACTTGGCTGCCTTCTCTTTGGTCTTCAGGTTAAAAGTCCAGACATAGGTGGGTCCTCGGATACGCGTCTTGTATACGGGGCATTCATAGATGTTCTTGGTCTCCATTCGGTCCACAGGAATGGCCTTGATGAAGATGACGGGCATGACTGGGGTCAGATCCTTCAAC ...........................................................................................((((....(((((.(((........))).)))))...))))(((((((((.(((((.....))))).))))).)))).................................................................................. ..........................................................................................91..................................................................................175......................................................................... |
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| .................TACCGGCCTAGTCACACT....................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ......................................................................................................................................................................TCATAGATGTTCTTGGTCTCCATTCGGTCCA..................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................TGCCTTCTCTTTGGTCTTCAGGTTAAA..................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............ATCGGTACCGGCCTAGTCACACTGTAGGT................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .................................................................................................................................GTGGGTCCTCGGATACGCGTCTTGTATACt........................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCTTTGGTCTTCAGGTTAAAAGTCCAGACAt........................................................................................................................... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GGCATTCATAGATGTTCTTGGTCTCCA.............................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................AGGTGGGTCCTCGGATACGCGTCTTGTATAt............................................................................................ | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................ATAGGTGGGTCCTCGGATACGCGTCTTGTA.............................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ...............GGTACCGGCCTAGTCACACTGTAGGTA................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................TCTCCATTCGGTCCACAGGAATGGCC.......................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CGCCACAGCTGCCAtctt............................................................................................................................................................................. | 18 | tctt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................CTTGGTCTCCATTCGGTCCAC.................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................TTCTCTTTGGTCTTCAGGTTAAAAGTCCAGA............................................................................................................................. | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TCGGTACCGGCCTAGTCACACTGTAGGTA................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |