(1)
OTHER.ip
(7)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(43)
TESTES

Sense strand
CCGTCAGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGTATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCCCCAGAAGCCCTAGGGATCTGCTCAGGAAGGGTGCTTCAAAGGTGGTTCCTGAGCAGGTCACCTTCCCACCTGAGTGGCAAGCATTGTCAGAAGCCCTTGTCACAGGCTGAGCCCCCAGTGGTAGCACTGGTATAGGTAGAGGCTTGGGGACATGGCAGAG
......................................................................((.(((.(((.....)))...)))...))...((((((((((((((((...((((.....)))).)))))))))))))).))..................................................................................................
..................................................51...................................................................................................152................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...........TTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCC.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 33.00 33.00 9.00 5.00 7.00 - 6.00 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCC.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 18.00 18.00 6.00 6.00 - - 4.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAAC.............................................................................................................................................................................................................. 29 1 16.00 16.00 3.00 6.00 4.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAG........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 11.00 11.00 4.00 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAA............................................................................................................................................................................................................... 28 1 11.00 11.00 2.00 2.00 4.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAA.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 10.00 10.00 4.00 - 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGC..................................................................................................................................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 3.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGC........................................................................................................................................................................... 28 1 9.00 9.00 - - - 2.00 - 2.00 - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGA................................................................................................................................................................................................................ 27 1 9.00 9.00 4.00 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGA......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 - 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................TGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGCA.......................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAG................................................................................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TAGGTAGAGGCTTGGGGACATGGCA... 25 1 6.00 6.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATT...................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGC........................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCA................................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 2.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCTTGAAACTGGACAGACA........................................................................................................................................................................................................................... 19 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAA.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00
................................................TTGTATGTATGATTGAGAATAAGGAC................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAA.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....AGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGA......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGCA.......................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGcaa.................................................................................................................................................................................................... 30 caa 3.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................TGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGT...................................................................................................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGA......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCA................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................AACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATT........................................................................................................................................................................................................ 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCA................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTG................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTCAAAGGTGGTTCCTGAGCAGGTC..................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGGTAGCACTGGTATAGGTAGAGGCT................ 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGC........................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTG....................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................TTGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCC................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................................TGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGt.................................................................................................................................................................. 31 t 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAG........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TAGGTAGAGGCTTGGGGACATGGCAGA. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGGACTGAGCAAATTCTGCCCCCAGAAG......................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAG........................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......TGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAGA....................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAAC.............................................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAAT....................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................ATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGC........................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ATTCTTGAAACTGGACAGA............................................................................................................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAAGGACTGAGCAAATTCTGCCCCCAGA........................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TTGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCT.................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACA............................................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGGTAGCACTGGTATAGGTAGAGGCTTGG............. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TTGTATGTATGATTGAGAATAAGGACTG.............................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGT...................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAA.......................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTATGTATGATTGAGAATAAGGACTG.............................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....CAGTGAATTCTTGAAACTGGACAGAC............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAGGGATCTGCTCAGGAAGGGTGCTT............................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGt................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGCACTGGTATAGGTAGAGGCTTGG............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAATTCTTGAAACTGGACAGACAca......................................................................................................................................................................................................................... 26 ca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGGTATAGGTAGAGGCTTGGGGA.......... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGTCAGAAGCCCTTGTCACAGGCTGAGa................................................ 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CTTGAAACTGGACAGACAGA......................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCCC............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGtt........................................................................................................................................................................................................................ 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAt.................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................ACTGAGCAAATTCTGCCCCCAGAAGC........................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TCAGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGA......................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAAaa............................................................................................................................................................................................................. 31 aa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCC................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTATGATTGAGAATAAGGACTG.............................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CAGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAG.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGA................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGCTCAGGAAGGGTGCTTCAAAGGTGG................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGGTAGCACTGGTATAGGTAGAGGCTT............... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGTATGATTGAGAATAAGGA................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AGCAAATTCTGCCCCCAGAAGCCCTAGG.................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAA............................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGt......................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAAC.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAt................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 10.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGc...................................................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................AGCAAATTCTGCCCCCAGAAGCCCTAGGG................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGACAGACAGAGAGCCAAGAA............................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAGACAGAGAGCCAAGAACAAA........................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AGGTAGAGGCTTGGGGACATGGCAGA. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCACAGGCTGAGCCCCCAGa......................................... 20 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TTCAAAGGTGGTTCCTGAGCAGGT...................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ATTGTATGTATGATTGAGAATAAGGACTG.............................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GAGCAAATTCTGCCCCCAGAAGCCCT..................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGGACTGAGCAAATTCTGCCCCCAGAAGCCC...................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAa................................................................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACA............................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TTCCTGAGCAGGTCACCTTCCCACCT......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAG................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGCACTGGTATAGGTAGAGGCTTG.............. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCt................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 18.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AATTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGC..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TAGGTAGAGGCTTGGGGACATGGt.... 24 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GTGAATTCTTGAAACTGGACAGACA........................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAGt....................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 11.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAA............................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTATGTATGATTGAGAATAAGGACT............................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TTGTATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAG............................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................AGGGATCTGCTCAGGAAGGGTGCTTCAAA........................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AGCATTGTCAGAAGCCCTTGTCACAGGCT.................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGC..................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....CAGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGA......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATcct.................................................................................................................................................................... 29 cct 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TAGGTAGAGGCTTGGGGACATGGCAac. 27 ac 1.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................AGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCCCCAGA........................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TGTCAGAAGCCCTTGTCACAGGCTGA.................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGTATGT.................................................................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGC..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................ATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCC................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTGAAACTGGACAGACAGAGAGCC.................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACA............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATT...................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TAGGGATCTGCTCAGGAAGGGTGCaa............................................................................................................................ 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAA.................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCC................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCC.................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGTA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATGATTGAGAATAAGGACTGAGC........................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAtc.............................................................................................................................................................................................................. 29 tc 1.00 9.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................AACTGGACAGACAGAGAGCCAAGA................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGc...................................................................................................................................................................................................... 30 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AATTCTTGAAACTGGACAGAC............................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGcaaa................................................................................................................................................................................................... 31 caaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTG................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGAGCAGGTCACCTTCCCACCTGAGTGGCA................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....AGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACA........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACt............................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 16.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AGCACTGGTATAGGTAGAGGCTTGGa............ 26 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGc...................................................................................................................................................................................................... 31 c 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TCAGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACA........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCCCC.............................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCGTCAGTGAATTCTTGAAACTGGACAGACAGAGAGCCAAGAACAAAATTGTATGTATGATTGAGAATAAGGACTGAGCAAATTCTGCCCCCAGAAGCCCTAGGGATCTGCTCAGGAAGGGTGCTTCAAAGGTGGTTCCTGAGCAGGTCACCTTCCCACCTGAGTGGCAAGCATTGTCAGAAGCCCTTGTCACAGGCTGAGCCCCCAGTGGTAGCACTGGTATAGGTAGAGGCTTGGGGACATGGCAGAG
......................................................................((.(((.(((.....)))...)))...))...((((((((((((((((...((((.....)))).)))))))))))))).))..................................................................................................
..................................................51...................................................................................................152................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
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Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
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SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
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AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..................................................................................TTCTGCCCCCAGAAGCCCTA.................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..........................................................................................................................................................CCCACCTGAGTGGCAAGCATTGTCAGA..................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -