(10)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(41)
TESTES

Sense strand
CTCCTTCCTCCCGAGGAGCGTTTCCAGTGACTTGAGCTTGGTTGGCCCAGGTATGTCAATCCTTGGGGGTGGGACGGTGACCTGAGGCCGACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACCCGCCCGAGGTGGGTGCAGCCCCGTACCAGACAGCCCGACCTTGACCTAAAGTAAAATCCCAGAGGAGGAGGAACCTCTTCCCTGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCTAGCAGCA
.....................................................................................((.((...((((((....((....)).((.(((((((((((((...))))))))))))).))..))))))....)).))......................................................................................
.....................................................................................86...............................................................................167.................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGC............................................................................................................................................... 17 1 146.00 146.00 34.00 18.00 - 18.00 10.00 3.00 1.00 21.00 16.00 4.00 6.00 13.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAG................................................................................................................................................. 15 2 141.50 141.50 101.00 0.50 - - 1.00 - - - - 15.00 21.00 - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACCCGCCCGAGGTGGGTGCAG............................................................................................................ 52 1 81.00 81.00 - - 78.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACAT.......... 23 1 55.00 55.00 1.00 - - - 1.00 1.00 10.00 - - 1.00 - - 6.00 13.00 - 1.00 2.00 4.00 - - - 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 2.00 - 2.00 - 1.00 2.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGC.................................................................................................................................... 28 1 44.00 44.00 1.00 16.00 - 14.00 1.00 - 3.00 - - - 1.00 - 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTG...................................................................................................................................... 26 1 36.00 36.00 2.00 5.00 - 2.00 - 5.00 1.00 3.00 3.00 1.00 - 6.00 1.00 - 2.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGG................................................................................................................................................ 16 2 28.50 28.50 9.50 5.50 - - 2.00 2.00 - 2.00 4.00 0.50 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCT.............................................................................................................................................. 18 1 25.00 25.00 4.00 1.00 - - 6.00 - 2.00 9.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTG.......................................................................................................................................... 22 1 25.00 25.00 2.00 7.00 - - 1.00 3.00 - - 1.00 7.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACA........... 22 1 21.00 21.00 2.00 - - 2.00 1.00 - 3.00 - - - - - - 4.00 - 1.00 1.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGG..................................................................................................................................... 27 1 20.00 20.00 - 2.00 - - - 5.00 5.00 - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCT................................................................................................................................... 29 1 15.00 15.00 - 6.00 - 2.00 - 4.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCC........ 25 1 13.00 13.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGAC............ 21 1 13.00 13.00 2.00 - - - - - 2.00 - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCT........................................................................................................................................... 21 1 12.00 12.00 - 3.00 - - - 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCC............................................................................................................................................ 20 1 12.00 12.00 1.00 3.00 - - - 4.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGT......................................................................................................................................... 23 1 12.00 12.00 - 1.00 - 4.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACAT.......... 22 1 11.00 11.00 1.00 - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGT................................................................................................................................. 31 1 10.00 10.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTA................................................................................................................................ 32 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - 4.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGT....................................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATC......... 24 1 8.00 8.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTG........................................................................................................................................ 24 1 7.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATt......... 24 t 6.00 55.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACATCC........ 24 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGACA........... 33 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGA............. 20 1 5.00 5.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACCCG............................................................................................................................ 36 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATa......... 24 a 5.00 55.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGG................... 21 1 4.00 4.00 - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGg................................................................................................................................. 31 g 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGG.............. 26 1 4.00 4.00 - 1.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CAGTAACAGGTGTGGACATCCTAGCAG.. 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAcg................................................................................................................................................. 15 cg 4.00 0.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACCCGC........................................................................................................................... 37 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTG.................................................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGGTG................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCt........ 25 t 3.00 8.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGACAGCCCGACCTTGACC................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGa..................................................................................................................................... 27 a 2.00 36.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGG................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGG................... 25 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ATTTGCAGTAACAGGTGTGGACA........... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGG.............. 30 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATtt........ 25 tt 2.00 55.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGG.............. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGga................................................................................................................................ 32 ga 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GACGGTCTGGGAAAAGGCT.............................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACAa.......... 23 a 2.00 21.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCCCTGGGGTTAGAATTTGC............................ 20 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GGGGTTAGAATTTGCAGTA........................ 19 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................ACAGGTGTGGACATCCTAGCAGC. 23 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACCCGCC.......................................................................................................................... 38 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGGTTAGAATTTGCAGTAACAGG................... 23 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACAaa......... 24 aa 2.00 21.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGGT.................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTG............... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ATTTGCAGTAACAGGTGTGGACAT.......... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GACGGTCTGGGAAAAGGC............................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCTAG..... 35 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCAGTGACTTGAGCTTGGTTGGC............................................................................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GGTTAGAATTTGCAGTAACAGG................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTG............... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACt........... 22 t 1.00 13.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGAa............ 21 a 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AGCCCCGTACCAGACAGCCCGAC....................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTAtccg............................................................................................................................ 36 tccg 1.00 10.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACA........... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GACGGTCTGGGAAAAGG................................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACATa......... 23 a 1.00 11.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGCAGTAACAGGTGTGGA............. 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GTGTGGCTGTACCCGCCCGAGGT.................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CGGTCTGGGAAAAGGC............................................................................................................................................... 16 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCTt...... 27 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGTGACTTGAGCTTGGTTGGCCCAGGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................GTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTG.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CTGTGTGGCTGTACCCG............................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGGTTAGAATTTGCAG.......................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTtg..................................................................................................................................... 27 tg 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CGACGGTCTGGGAAAAGG................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGAaa........... 22 aa 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGTGGCTGTACCCGCCCGAGGTGG.................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTGGACATCCTAGCAGCA 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GGTTAGAATTTGCAGTAACAGGT.................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CAGTAACAGGTGTGGACA........... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCat...... 26 at 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCg....... 26 g 1.00 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................................................................AACAGGTGTGGACATCCTAGCAGCA 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CAGGTGTGGACATCCTAGCA... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACAaag........ 25 aag 1.00 21.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACC.............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGAat........... 21 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGACTTGAGCTTGGTTGGC............................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CAGAGGAGGAGGAACCTCTTCCCTGGGGTTAGAATTTG............................. 38 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACC.............................................................................................................................. 34 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CAGGTGTGGACATCCTAG..... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGACAT.......... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................AATTTGCAGTAACAGGTGTGGACATC......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCCTGTGTGGCTGTACCCG............................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CCCGTACCAGACAGCCCG......................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................AGGTGTGGACATCCTAGCAGC. 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCg........ 25 g 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ATTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCC........ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCTGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGGTG................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCT....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GAGGAGGAGGAACCTCTTCCCTGGGGTTAGAA................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ATTTGCAGTAACAGGTGTGGACAgaat....... 27 gaat 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTG............... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGaa................................................................................................................................... 29 aa 1.00 20.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTttt...................................................................................................................................... 26 ttt 1.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCCCTGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGG................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTCCCTGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAG.................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ATTTGCAGTAACAGGTGTGGAC............ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTC............................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGA............. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACATg......... 23 g 1.00 11.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATat........ 25 at 1.00 55.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATag........ 25 ag 1.00 55.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACATtc........ 24 tc 1.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTa.................................................................................................................................. 30 a 1.00 15.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ATTTGCAGTAACAGGTGTGGACATt......... 25 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTGGACATCCTAGCAGC. 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGcaa............ 21 caa 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GGGGTTAGAATTTGCAGTAACAG.................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACATat........ 24 at 1.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACAa.......... 22 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCa....... 26 a 1.00 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTTGCAGTAACAGGTGTGGACctat........ 25 ctat 1.00 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCa................................................................................................................................... 29 a 1.00 44.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGACA........... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................GTGGACATCCTAGCAGC. 17 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................GTGTGGACATCCTAGCAGC. 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CAGGTGTGGACATCCTAGCAG.. 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGAC............ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................ACCAGACAGCCCGACCTTGACCTAAAGT.......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CTTCCCTGGGGTTAGAATTTGCAG.......................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGACTTGAGCTTGaaga.............................................................................................................................................................................................................. 17 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AAGTAAAATCCCAGAGGAGGAGGAAC.................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................ACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTAC............................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGCAGTAACAGGTGTGGACATC......... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GGTGTGGACATCCTAGCAGC. 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGGTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGACAT.......... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TTGACCTAAAGTAAAATCCCAGAGG............................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTG........................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTGGACATCCTAGCAG.. 17 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCCTAGCAGC. 16 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................CCAGAGGAGGAGGAACCT.................................................. 18 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCCTTCCTCCCGAGGAGCGTTTCCAGTGACTTGAGCTTGGTTGGCCCAGGTATGTCAATCCTTGGGGGTGGGACGGTGACCTGAGGCCGACGGTCTGGGAAAAGGCTCCTGTGTGGCTGTACCCGCCCGAGGTGGGTGCAGCCCCGTACCAGACAGCCCGACCTTGACCTAAAGTAAAATCCCAGAGGAGGAGGAACCTCTTCCCTGGGGTTAGAATTTGCAGTAACAGGTGTGGACATCCTAGCAGCA
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AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
..................................................................................................................................GGGTGCAGCCCCGTACgcgc.................................................................................................... 20 gcgc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CCCTGGGGTTAGAATTTGCAGTAACA..................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -