(5)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(34)
TESTES

Sense strand
AAGAGGACCTGATCCCGGTGTATCATGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGTACTGCTCCCGTGCCTGTCTCCCAGCTTTGTGAATACATGGGCACAGCTATCATGGCGGCTTCACAGGGTCTAGGTTTGAAGTTTTGTTACTGTCTGTGACTGCCTAGAAATCACGACCATGAACGTTTCAGAAACAGGACAGAGAAGAGCCATCGGTGCCACTGTCGTGACCTCCCTGACCATGCCTCTTGGCACATGGCCTTTATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGCTCGGCAGGCTTTACAGACATCTCTCTCCCTGTCACTTGTGAGGAGCTCTCAGGGGTCCTGGTTTGAGCTGGGGTGCACACTCCTTTCTCCAGGACCCCTGCACGCTCCAGCCCTCTACAGAGAAACTGCACCCTGGCGAGGGTGAGCACTGCCTTGATCTCTCCCTGTTAGGCTTCCCGGGCCCCAGAGGTGACCTATGAGGCAGACAAGGATTCCTTGTG
...............................................................................................................................................................................((...........((((...((((.(((((..((((((....((((...........)))).....)))))))))))))))...)))).(((((......)).))).))..........................................................................................................................................................................................................................
..............................................................................................................................................................................175...........................................................................................................285.......................................................................................................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
..............................................................................................................................................................................................................................................................TTATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGC............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 14.00 14.00 - 3.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCTTTATAGTTCAGCTCTCAGGACA.................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 8.00 8.00 - 2.00 2.00 - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 8.00 8.00 - 1.00 1.00 - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCTTTATAGTTCAGCTCTCAGGAC................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 - 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 c 7.00 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCAGAAACAGGACAGAGAAGAGCCATC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TATCATGGCAATGAAGTGACTCCGACC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGAACGTTTCAGAAACAGGACAGAGAAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGAACGTTTCAGAAACAGGACAGAGAAGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TTATAGTTCAGCTCTCAGGAC................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TTATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAG.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGATCCCGGTGTATCATGGCAATGAAGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGGACAGCAGCTCGGCAGGCTTT................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGACAGCAGCTCGGCAGGCTTTA................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGATCCCGGTGTATCATGGCAATGAAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGAACGTTTCAGAAACAGGACAGAGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGac................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 ac 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................TGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGct................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ct 2.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGC............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TTATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGCTCGG......................................................................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCAGCTCGGCAGGCTTTACAGACA.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................AGGACAGAGAAGAGCCATCGGTGCCACT............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CCACTGTCGTGACCTCCCTGACCATtt......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TTATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGa............................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GAGCCATCGGTGCCACTGTCGTGACCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCACGACCATGAACGTTTCAGAAACAGGAC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ATCATGGCAATGAAGTGACTCCGACC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTATGAGGCAGACAAGGATTC...... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...............CGGTGTATCATGGCAATGAAGTGACgcc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 gcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TAGAAATCACGACCATGAACGTTTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGAATACATGGGCACAGCTATCATGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCACGACCATGAACGTTTCAGAAACAGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATCCCGGTGTATCATGGCAATGAAGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGCTCGG......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TATCATGGCAATGAAGTGACTCCGACCG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGAACGTTTCAGAAACAGGACAGAGAAGt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAAGTGACTCCGACCGAGGTACTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AAGTGACTCCGACCGAGGTACTGCTCC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCATGGCAATGAAGTGACTCCGACC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................................................................ATGAACGTTTCAGAAACAGGACAGAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAAGTTTTGTTACTGTCTGTGACTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCACGACCATGAACGTTTCAGAAACAGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCTCTCAGGACAGCAGCTCGGCAGG..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGCAGGCTTTACAGACATCTCTCTCCCT............................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGATCCCGGTGTATCATGGCAATGAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATCCCGGTGTATCATGGCAATGAAGTGAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CCATGAACGTTTCAGAAACAGGACAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTCTCAGGACAGCAGCTCGGCAGG..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTTCTCCAGGACCCCTGCACGCTC.................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................ATCATGGCAATGAAGTGAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GGACCTGATCCCGGTGTATCATGGCAAT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGATCCCGGTGTATCATGGCAATGAAGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TATCATGGCAATGAAGTGACTCCGACCGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................AGCCATCGGTGCCACTGTCGTGACCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CAGAGAAGAGCCATCGGTGCCACTGTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ATGGCAATGAAGTGACTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGTGACTGCCTAGAAATCACGACCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGTGACCTATGAGGCAGACAAGGATT....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TCGGTGCCACTGTCGTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCTCTCAGGACAGCAGCTCGGCA....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................TTTATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCA............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCCCGGTGTATCATGGCAATGAAGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTCAGAAACAGGACAGAGAAGAGCCAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGTCACTTGTGAGGAGCTCTCAGG........................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGGCAATGAAGTGACTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TCGGTGCCACTGTCGTGACCTCCCTG................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................ACGACCATGAACGTTTCAGAAACAGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGacc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 acc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGCTC........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................................................................TTGAAGTTTTGTTACTGTCTGTGACTGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................TCATGGCAATGAAGTGACTCC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AACAGGACAGAGAAGAGCCATCGGTGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGTGACTGCCTAGAAATCACGACCATG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGCTCG.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGTGAATACATGGGCACAGCTATCATGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTCAGAAACAGGACAGAGAAGAGCCATC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GACCATGAACGTTTCAGAAACAGGACAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAAGTTTTGTTACTGTCTGTGACTGCCT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAGGACAGCAGCTCGGCAGGCTT.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACAGACATCTCTCTCCCTGTCACTTG....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TTTCAGAAACAGGACAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAGAGGACCTGATCCCGGTGTATCATGGCAATGAAGTGACTCCGACCGAGGTACTGCTCCCGTGCCTGTCTCCCAGCTTTGTGAATACATGGGCACAGCTATCATGGCGGCTTCACAGGGTCTAGGTTTGAAGTTTTGTTACTGTCTGTGACTGCCTAGAAATCACGACCATGAACGTTTCAGAAACAGGACAGAGAAGAGCCATCGGTGCCACTGTCGTGACCTCCCTGACCATGCCTCTTGGCACATGGCCTTTATAGTTCAGCTCTCAGGACAGCAGCTCGGCAGGCTTTACAGACATCTCTCTCCCTGTCACTTGTGAGGAGCTCTCAGGGGTCCTGGTTTGAGCTGGGGTGCACACTCCTTTCTCCAGGACCCCTGCACGCTCCAGCCCTCTACAGAGAAACTGCACCCTGGCGAGGGTGAGCACTGCCTTGATCTCTCCCTGTTAGGCTTCCCGGGCCCCAGAGGTGACCTATGAGGCAGACAAGGATTCCTTGTG
...............................................................................................................................................................................((...........((((...((((.(((((..((((((....((((...........)))).....)))))))))))))))...)))).(((((......)).))).))..........................................................................................................................................................................................................................
..............................................................................................................................................................................175...........................................................................................................285.......................................................................................................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTaaa................................................................................................................... 18 aaa 55.00 0.00 34.00 - - 17.00 - - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTgaa................................................................................................................... 18 gaa 7.00 0.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGACCCCTGCACGCTaa................................................................................................................... 18 aa 4.00 0.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTcaa................................................................................................................... 18 caa 3.00 0.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTaac................................................................................................................... 18 aac 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCACGCTCCAGCCCTCTACAGAGAA................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTaag................................................................................................................... 18 aag 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGACCCCTGCACGCTac................................................................................................................... 18 ac 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTata................................................................................................................... 18 ata 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACCCCTGCACGCTtgaa................................................................................................................... 18 tgaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGACTGCCTAGAAATCACGACCATGAa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GTTTTGTTACTGTCTGTGACTGCCTAGAA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GACCATGAACGTTTCAGAAACAGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACCCCTGCACGCTtaca................................................................................................................... 18 taca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGACAGCAGCTCGGCAGGCTTTACA.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTcac................................................................................................................... 18 cac 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTaga................................................................................................................... 18 aga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................GGACAGCAGCTCGGCAGGCTTTACAGA............................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCTGTGACTGCCTAGAAATCACGACCATGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTgac................................................................................................................... 18 gac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTaca................................................................................................................... 18 aca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCACGCTCCAGCCCTCTACAGAGAA................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACCCCTGCACGCTCCAGCCCTCTACA...................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGATTCCTTGTgct. 17 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGCTCCAGCCCTCTACAGAGAA................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACCCCTGCACGCTccc................................................................................................................... 18 ccc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -