(7)
OTHER.mut
(4)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
CGGAAAAGCGCGCCCTCTACCGGCGGGGTGAAGAAGCCTCACCGCTACAGGTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACTTGGCCGCCGGCTTGCGGGCGGGCGCTCTCTCCCTTCTCCCTGACCGTTGACGCCTTCCTTCTTCTGGTGACTGCAGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAATCGACTG
...................................................((((.((((((..((((....((.((((.((((......)))).)))))).))))..)))))).))))...((...((((...........))))...))....................................................
..................................................51....................................................................................................153................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACTTGGCCGCCGGCTTGCGGGCGGGCGC..................................................................................................... 52 1 32.00 32.00 - - - - 21.00 - - - 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACTTGGC.......................................................................................................................... 31 1 25.00 25.00 3.00 22.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CCTTCTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 20 1 13.00 13.00 9.00 - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTTCTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 19 1 9.00 9.00 - - 8.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCCTTCTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 21 1 6.00 6.00 3.00 - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGAC............................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - - - 2.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTCCTTCTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 22 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAG......................... 28 2 4.50 4.50 - - 4.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACT.............................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................................................................................AGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGA............................ 24 2 3.00 3.00 2.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TTCTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 18 1 3.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TCTTCTGGTGACTGCAGGC................................................ 19 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TACCGGCGGGGTGAAGAAGC...................................................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAA...................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGGAACAATGACTTGGC.......................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATC...................... 31 2 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAG........................... 23 2 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAG......................... 23 2 2.50 2.50 - - 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGT................ 32 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACTT............................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGCAGAGGGCTGGGAACAATG................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTT............... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTC.................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATG................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTT............... 31 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTTCCTTCTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAAT.................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTTCCTTCTTCTGGTGACTGCA................................................... 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GGTGACTGCAGGCCAGGGA.......................................... 19 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTT............... 33 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GCAGAGGGCTGGGAACAATG................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTC.................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................TGAAGAAGCCTCACCGCTACcgcc....................................................................................................................................................... 24 cgcc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTTCTTCTGGTGACTGCAGG................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCAGGGACCGTGGCTCTGA.............................. 21 2 1.50 1.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGAGAGAGATCCGTCGTT............... 18 2 1.50 1.50 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CTGAGAGAGATCCGTCGT................ 18 2 1.50 1.50 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGAc....................... 30 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CCTTCCTTCTTCTGGTGACTGCcggc................................................ 26 cggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CCGTCGTTACCAGAAATCG.... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGGAACAATGACTTGGCCGCCGGCTT................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTTCCTTCTTCTGGTGACTGCAGa................................................. 24 a 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ATCCGTCGTTACCAGAAA....... 18 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AGGGCTGGGAACAATGACTTGGCCGCCGG.................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTA.............. 33 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GCAGAGGGCTGGGAACAA................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGCGGGCGGGCGCTCTCTCCCTTCTCC....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................ATGACTTGGCCGCCGGCTTGC............................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......................................................................................................................................................AGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGT................... 33 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGCGCGCCCTCTACCGGCGGGGTGA............................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCG.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................GTCGTTACCAGAAATCGA... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGT................ 33 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCCGTCGTTACCAGAAATCGAC.. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGCCTCACCGCTACAGGTAGGCAGAGGGCTGGG........................................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGT................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....................GGCGGGGTGAAGAAGCCTCACCGCTACAG......................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTTCTTCTGGTGACTGCAGa................................................. 20 a 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ATCCGTCGTTACCAGAAATCGA... 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GAGAGAGATCCGTCGTTACC............ 20 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAATC..... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TCTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AGAGAGATCCGTCGTTACCAG.......... 21 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GACCGTGGCTCTGAGAG........................... 17 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................AGAGAGATCCGTCGTTAt............. 18 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAAT...... 27 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCCCTGACCGTTGACGCC........................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TACAGGTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATG................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................CGGGCGCTCTCTCCCTTCTCCCTGACCGT............................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAGGCAGAGGGCTGGGAACAA................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGCGGGGTGAAGAAGCCTCACC................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CGCCGGCTTGCGGGCGGGCGCT.................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GAGAGATCCGTCGTTACCAGAAATC..... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATt...................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACTTG............................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAt....... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CCTTCTTCTGGTGACTGCAGaa................................................ 22 aa 1.00 13.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTC.................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGA................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAtt........................ 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATC...................... 29 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGg........................ 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACTTGGCC......................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAATC..... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCC..................... 30 2 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATt...................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTt.................. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ACCGGCGGGGTGAAGAAGCCTC................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GAGGGCTGGGAACAATGAaa.............................................................................................................................. 20 aa 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGACTGCAGGCCAGGGACCG....................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GAGGGCTGGGAACAATGA................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCG................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CTTGCGGGCGGGCGCTC................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTA.............. 36 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGGTGACTGCAGGCCAGGGACCGTG..................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CTTCTGGTGACTGCAG.................................................. 16 9 0.89 0.89 0.22 - - - - 0.11 - - - 0.33 0.11 - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAA........ 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGA......... 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CTGAGAGAGATCCGTCGTT............... 19 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCA........... 25 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGA........................ 24 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAA....... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCC..................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGGACCGTGGCTCTGA.............................. 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ATCCGTCGTTACCAGAA........ 17 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGA......... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
...........................................................................................................................................................................GAGAGAGATCCGTCGTT............... 17 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGAG........................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GAGAGAGATCCGTCGTTAC............. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CTGAGAGAGATCCGTCGTTAC............. 21 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGA............................ 23 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAA....... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTT............... 25 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGAT....................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGGCTCTGAGAGAGATCCGTC.................. 22 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGA............................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
.........................................................................................................................................................GCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATC...................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GAGAGATCCGTCGTTACC............ 18 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GACCGTGGCTCTGAGAGAGA........................ 20 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCAG.......... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GAGAGAGATCCGTCGTTt.............. 18 t 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
................................................................................................................................................................................AGATCCGTCGTTACCAGAA........ 19 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAGGCCAGGGACCGTGGCTC................................. 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGCAGAGGGCTGGGAACA.................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGA............................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GACCGTGGCTCTGAGAGAGATC...................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCC..................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAG............................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............................................................................................................................................................AGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATC...................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GTGACTGCAGGCCAGGGA.......................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CCAGGGACCGTGGCTCTGAGA............................ 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGA.......................... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AGAGATCCGTCGTTACCA........... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
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...........................GTGAAGAAGCCTCACCGCTA............................................................................................................................................................ 20 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - -

Antisense strand
CGGAAAAGCGCGCCCTCTACCGGCGGGGTGAAGAAGCCTCACCGCTACAGGTAGGCAGAGGGCTGGGAACAATGACTTGGCCGCCGGCTTGCGGGCGGGCGCTCTCTCCCTTCTCCCTGACCGTTGACGCCTTCCTTCTTCTGGTGACTGCAGGCCAGGGACCGTGGCTCTGAGAGAGATCCGTCGTTACCAGAAATCGACTG
...................................................((((.((((((..((((....((.((((.((((......)))).)))))).))))..)))))).))))...((...((((...........))))...))....................................................
..................................................51....................................................................................................153................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
..........................................CGCTACAGGTAGGCAGAGGGCTGGG........................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -