(6)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(34)
TESTES

Sense strand
GCTGAGCAGCAGGTGGCCACTTGGTGCTCAACTACTCCACCCGAAGCCAAGTTTGGTGGGCACTCAGCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTCCAGTTCCACCCGTCCCAAGGCCTGGTCTGCCCGGCCCAGTGCCTACAGGGCTAGAATCGGGAGCTTTGTGATTCACCCTTGAAGCCTCAACCGTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTAGTTTCAGGCCAGTGAAAACCTGCCGGGCTTAGACCGTC
........................................................................................................((((..((((((((.((....)).)))).))))...))))..((((((.((...)).))))))......(((((.............)))))......................................................
....................................................................................................101................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029038(GSM433290)
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SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
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18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.......................................................................................AAAGTCCAGTTCCACCCGTCCCAAGGCCTGGTCTGCCCGGCCCAGTGCCTAC............................................................................................................... 52 1 53.00 53.00 53.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CCAAGCACTGAACGCGACAGAAAG............................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGAATCGGGAGCTTTGTGATT.................................................................................... 22 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00
...........................................................................TGAACGCGACAGAAAGTCCAGTTCCACCCGTC............................................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAACGCGACAGAAAGTCCAGT......................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCTCAACTACTCCACCCGAAGCCAAGT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAACGCGACAGAAAGTCCAGTTCCACCCGT................................................................................................................................................ 31 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGGGCACTCAGCCAAGCACTGAACGCGACA.................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGAATCGGGAGCTTTGTGATTCACCCTTGt........................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGTGGGCACTCAGCCAAGCACTGAACGt........................................................................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGCCTACAGGGCTAGAATCGGGAGCTTTGT........................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GGCTAGAATCGGGAGCTTTGTGATTC................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGCCTCAACCGTCTTTGCTTCTCAGt................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTCCAG.......................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGTGGGCACTCAGCCAAGCACTGAACGCGA...................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CTGAACGCGACAGAAAGTCCAGTTCCACC................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTCCA........................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TCGGGAGCTTTGTGATTCACCCTTGAAGCC....................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AGCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTCC............................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGAATCGGGAGCTTTGTGATTC................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCTCAACTACTCCACCCGAAGCCAAGTT..................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGAATCGGGAGCTTTGTGATTCACCCTT............................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTCTCAGGTGCTGTCCTTAGTTTCAGGCC............................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGAAAACCTGCCGGGCTTAGACCGTC 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CGGGAGCTTTGTGATTCACCCTTGAAGC........................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCAGCCAAGCACTGAACGCGACAGAAA................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAACGCGACAGAAAGTCCAGTTCCA..................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTCCA........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AGCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGT.............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGATTCACCCTTGAAGCCTCAACCGTCTT............................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................ACTGAACGCGACAGAAAGTCCAGT......................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................ACAGGGCTAGAATCGGGAGCTTTGTGA...................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................ACTGAACGCGACAGAAAG............................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAACGCGACAGAAAGTCC............................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCAGCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTC............................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CCTCAACCGTCTTTGCTTCTCAGGT................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................AGAATCGGGAGCTTTGTGATTCACC................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
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................................................................................................................................................................................GCCTCAACCGTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGT........................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...............................................................................................................................................................................AGCCTCAACCGTCTTTGCTTCTCAGGTGC.............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGTGGGCACTCAGCCAAGCACTGAACGC........................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGTGCTGTCCTTAGTTTCAGGac............................ 25 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GTGCTGTCCTTAGTTTCAGGCCAGTGA....................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCAACCGTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCC......................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGGGCACTCAGCCAAGCACTGAACGCGAC..................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GCTGAGCAGCAGGTGGCCACTTGGTGCTCAACTACTCCACCCGAAGCCAAGTTTGGTGGGCACTCAGCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTCCAGTTCCACCCGTCCCAAGGCCTGGTCTGCCCGGCCCAGTGCCTACAGGGCTAGAATCGGGAGCTTTGTGATTCACCCTTGAAGCCTCAACCGTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTAGTTTCAGGCCAGTGAAAACCTGCCGGGCTTAGACCGTC
........................................................................................................((((..((((((((.((....)).)))).))))...))))..((((((.((...)).))))))......(((((.............)))))......................................................
....................................................................................................101................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
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SRR029040(GSM433292)
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mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR363957(GSM822759)
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SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
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cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
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GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
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testes_rep3. (testes)
..........................................................................................................................................................................................TCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTA...................................... 26 1 11.00 11.00 - 4.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTA...................................... 27 1 8.00 8.00 - 3.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GCTTCTCAGGTGCTGTCCTTAGTTTCA................................ 27 1 7.00 7.00 - - 2.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - -
.........................GCTCAACTACTCCACCCGAAGCCAA........................................................................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................CTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTA...................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCCAAGCACTGAACGCGACAGAAAGTCCA........................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
................................................................CAGCCAAGCACTGAACGCGACAGAAA................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTTCCACCCGTCCCAAa........................................................................................................................................... 17 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CGTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTT....................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTAG..................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCAGGTGCTGTCCTTAGTTTCAGGCCAa........................... 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GCTTCTCAGGTGCTGTCCTTAGTTTCAGG.............................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGGTGCTGTCCTTAGTTTCAGGCCA........................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CTCCACCCGAAGCCActg......................................................................................................................................................................................................... 18 ctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCCGGCCCAGTGCCTACAGGGCTAGA...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TCAGCCAAGCACTGAACGCGACAGAA................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTGCCCGGCCCAGTGCCTACAGGGCTA........................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CCGTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCC......................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGGCCACTTGGTGCTCAACTAC....................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACTCAGCCAAGCACcga............................................................................................................................................................................... 17 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CCGTCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTA...................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCCGGCCCAGTGCCTACAGGGCTA........................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCGGCCCAGTGCCTACAGGGCTAGAA..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ACCCTTGAAGCCTCAtgct.................................................................... 19 tgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GTCTGCCCGGCCCAagcg....................................................................................................................... 18 agcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................................................................................TCTTTGCTTCTCAGGTGCTGTCCTTAGTT................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -